PubMed检索方法

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主题词检索
检索“阿司匹林引起胃溃疡的文献”
检索步骤: 点击“Mesh Browser”,进入MeSH浏览器的首页 在提问框中输入aspirin,点击[Go]按钮,显 示该主题词的定义。 点击该词 可做如下3种选择: 选择副主题词adverse effects; Restrict Search to Major Topic headings only; Do Not Explode this term 浏览树形结构
4、订购全文 、
Send to-Order 备注:想要集中打印、存盘或订购全文时, 首先点击Send to下拉按钮,选择 Clipboard,将每次检索结果保存,然后 再点击特征栏上的Clipboard即可。
五、链接功能
Related Articles - 链接相关文献 链接NCBI数据库 Necleotide、Protein、Genome、Structure、 Popset、Taxonomy、OMIM、Books、 Probeset、3D Domains Links Books - 链接相关图书 Linkout – 链接外部资源,与生物医学文献出版 商Web站点期刊全文的链接
输入第二个检索词stomach ulcer,点击 [Go] 点击此词,选/SH为chemical induced 选择逻辑符AND,点击[Add]键 点击[PubMed Search]按钮 备注:如果键入的词不规范,MeSH浏览器 将提示该词不是主题词,并显示与之相 对应的MeSH词。
引文匹配
PreMEDLINE
是临时性医学文献数据库,每天接收新数据, 经MeSH词表标引后,每周向medline移加一 次。 记录标注[PubMed - in process]
Publisher Supplied Citation
出版商直接向PubMed递送的电子记录。 记录标注[PubMed - as supplied by publisher] 备注:提供的数据如果超出MEDLINE数据库的收 录范围,如在综合性科学杂志(Science, Nature)上发表的地理学文章等,将不被采用。
备注:想要查验检索词的转换情况,并进行调整和保存 检索策略,可点击“details”按钮
(一)Automatic Term Mapping
2、Journals Translation table New England journal of medicine 转换为 “N Engl J Med”[Journal] 备注: 三种不同的表达方式 刊名全称、MEDLINE刊名缩写格式、ISSN
限定检索
检索“近2年有关细胞凋亡的综述文献” 检索步骤: 在特征栏点击“Limits”键 输入检索词apoptosis 在Limited to栏下,进行如下各种限定:
选择字段、只检带文摘的记录、文献类型 (选择review)、语种、子集、年龄组、人类 或动物实验、性别、录入系统日期(2years)、 文献出版日期
ΠυβΜεδ数据库
(是NCBI的Entrez系统中的数据库之一)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi
(National Center for Biotechnology Information,NCBI)
一、概述
收录范围 1 MEDLINE 2 PreMEDLINE 3 Publisher supplied citations
PubMed Central
四、检索结果
1、结果的显示 、
显示每屏记录条数 Show:默认20(5-500) page: 1 of 13 Next 显示特定记录 Display:显示所有记录 记录前方框:显示标记记录 著者名:该条记录
显示格式选择 Display旁的下拉菜单,选择记录格式: summary默认、brief、Abstract、Citation、 ASN.1、MEDLINE、XML等格式 纯文本格式 Sent to-Text
字段标识符
AB-Abstract LA-Language AD-Affiliation MH-MeSH Terms AU-Authors PMID-PubMed Unique Identifier CY-Country PT-Publication Type DP-Publication Date SO-Source EDAT-Entrez Date TA-Journal Title Abbreviation GS-GeneSymbo TI-Title IS-ISSN UID-Unique Identifiers 备注:检索词[字段标识符]
MEDLINE
收录了全世界70个国家和地区的4600余种生物医 学期刊,起始时间1953年,目前文摘条目1200+ 万篇,年报道量近40万条,英文刊物占90%、 3/4有英文摘要,周更新。 内容涉及:医学、药学、牙医学、护理学、卫生 保健、兽医学等专业。 记录标注[PubMed - indexed for MEDLINE]
(二)短语检索
如果在短语上加双引号,将不执行转换功能 例如: “single cell” “oxygen free radicals”
(三)布尔逻辑运算:
AND、OR、NOT必须大写。
E-coli AND hamburger;vitamin c OR zinc; trace element NOT zinc
例:输入bacter*,检出bacteria、bacterium等 备注:将不执行转换功能; 截词检索只限于单词,对词组无效,
三、检索途径与方法
基本检索 - Basic Search 高级检索 - Advanced Search 限定检索 - Limits Search 期刊检索 – Journal Search 主题词检索 - MeSH Browser 引文匹配 - Citation Matcher 临床查询 – Clinical Queries
基本检索
检索步骤:输入检索词,点[Go]按钮或按回车 检索词的输入形式: 输入单词或短语或表达式,也可用*及“ ” 如,aspirin;stomach ulcer Iddm AND apoptosis asthma Kamada A 或asthma,Kamada A 著者姓名:weng xz、 “ weng xz ”[au] 刊名标题:刊名全称、缩写、ISSN
检索步骤: 点击页面左边的“Single Citation Matcher” ” 按界面提示分别填入所知信息 点击[Search]按钮,可得到相应的特定文 献信息。
临床查询
是专为临床医生设置的 可以检索某一临床主题领域的治疗、诊断、 病因和预后4个方面内容的文献,同时还 可选择强调查全率或是查准率 也可以检索该主题词领域的系统性综述、 元分析等类型文献。
(一)Automatic Term Mapping
3、Phrase List 在前两个表中均未找到,而在短语列表中找到这 个词 Blood sugar
(一)Automatic Term Mapping
4、Author Index 姓(全称)名在后(首字母缩写)smith jc 当一个短语在前三个表中都找不到匹配词,并且 有1或2个字母在词后时,PubMed就在该索引 中查找。
PubMed的特点 的特点
自动词语匹配 链接点多,部分在网上免费获得全文 也可以直接定购原文
二、检索规则
(一)Automatic Term Mapping词汇自动转换
1、 MeSH Translation table Vitamin c 转换为
“ascorbic acid”[Mesh Terms] OR vitamin c[Text Word]
点击“Go”
期刊wenku.baidu.com索
JAMA
期刊编目信息浏览页
机读格式
NLM馆藏情况
检索步骤: 有两种方法检索
基本检索状态下,输入刊名 高级检索状态下,在All Fields中选择Journal 字段,然后输入刊名
期刊数据库Journals Database
输入格式:刊名全称、ISSN、刊名缩写 (MEDLINE、ISO)、NLM ID
Journal of leukocyte biology、J leukoc biol、0741-5400
备注: 刊名后附加字段标识符
刊名与主题词相同的期刊 gene therapy[ta]、science[ta]、cell[ta] 单个词刊名的期刊,Scanning[ta]
带括号刊名的期刊,录入时应将括号省略
J Hand Surg[Am]输入格式为J Hand Surg Am
高级检索
检索“阿尔茨海默病的基因治疗”
检索步骤: 在Search for框中输入alzheimer disease,点击 特征栏的[Preview/Index]按钮 在“All Fields”选择一个检索字段,其右侧输入 框中输入检索词gene therapy,点击[AND], 点击屏幕上部[Preview]开始检索并显示记录条 数,这样可以反复操作;若点击[Go]则显示结 果。
2、排序 、
无序(Sort) 著者(Author) 刊名(Journal) 出版日期(Pub Date)
3、打印或存盘 、
打印:使用浏览器的打印功能, 存盘:点Send to下拉按钮选file 首先选择所要存盘的数据(show),其次 点击display显示所要存盘的格式,然后 点Send to-file即可
如果选择一个检索字段,在提问框中输入检索 词,点击[Index],则系统显示相应字段的索引 词列表。选中一个索引词,点击逻辑符(AND、 OR、NOT),被选中的索引词会自动粘贴在提 问框中,然后点击“Preview”或“Go”按钮 备注:在高级检索界面,可以用逻辑组配符将检 索历史中的序号加以组配。 例,#1 AND english
逻辑符的运算次序是从左至右,括号内的检索 式可作为一个单元,优先运行。 布尔逻辑检索允许在检索词后面附加字段标识
例如:dna[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]
查带文摘的文献
检索词 AND hasabstract 例如,Neoplasms AND hasabstract
(四)截词检索:*
备注:
如果在上述4个表或索引中仍找不到相匹配的词 时,PubMed就将短语劈开,再重复以上顺序 单独分别查找,直到找到相匹配的词。如果仍 找不到匹配词,则用AND 将短语中的单个词 连接起来在全部字段中查找。 例 : pressure point 转 换 为 ((“pressure”[MeSH Terms] OR pressure[Text Word]) AND point[All Fields])
特征栏(Feature Bar) 六、特征栏
Limits preview/index history Clipboard Details