ABI7500荧光定量PCR仪标准操作规程
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ABI 7500 FAST荧光定量PCR仪简明操作规程1.双击桌面图标,或从 Start >All Programs > Applied Biosystems >7500 Software > 7500 V2.0 开启软件。
进入主界面后选择Advanced Setup 。
2.默认进入 Setup 下的Experiment Properties 界面2.1输入实验名称(Experiment Name)2.2确认仪器型号2.3在实验类型中,选择 Quantitation-Comparative CT (△△CT)2.4选择试剂种类2.5确认运行模式3.进入 Setup 下的Plate Setup 界面,编辑基因(Target)及样本(Sample);3.1在“define targets and samples”界面中设置基因3.2在“assign targets and samples”中进行样品板的排布。
4.在“Select relative quantitation setting”中设置内参基因及对照样本。
5.进入 Run Method 界面,设定反应条件及反应体积。
6.点击“save”按钮,文件储存成 Experiment Document Single Files(*.eds)格式,然后在 Run 界面按下按钮,反应即开始进行。
7.实验结束后,点击界面右上角的 Analyze 按钮,软件将会显示实验结果:7.1在扩增图中(见上图),可通过更改Plot Settings 来改变扩增图的显示方式。
如果想查看阈值线或基线,请将Threshold 及Baseline 打勾。
7.2查看相对表达量结果时,利用Plot Settings 选项,可以以不同方式显示相对表达量的结果。
7.3对于 SYBR Green 法实验,可以在Melt Curve 界面中查看熔解曲线。
7.4检测 QC Summary 结果,可以快速查看实验中是否有反应孔存在异常情况。
PCR实验室7500SOP【】ABI 7500型核酸扩增荧光检测仪使⽤、维护、校准程序-LAB-SOP-FZSW-0111.⽬的:确保ABI7500仪器的正确使⽤及正常运⾏2.适⽤范围:美国应⽤⽣物系统公司⽣产的ABI7500实时荧光定量PCR仪3.运⾏环境:电源:推荐配备合适的UPS或稳压器。
通风:仪器的通风应该没有阻挡。
温度:推荐实验室配备空调,温度应该控制在10~30℃之间。
湿度:20-80%;对于潮湿的省份,推荐实验室配备除湿机。
空间:易于操作,安全。
4.操作程序:4.1开关机程序:开机顺序:先开电脑,待电脑完全启动后再开启定量PCR仪主机,等主机⾯板上的绿灯亮后即可打开ABI7500系统软件,进⾏实验。
关机顺序:确认实验已经结束后,⾸先关闭ABI7500系统软件,然后关掉定量PCR仪主机的电源,最后关闭电脑。
4.2 创建绝对定量反应板⽂件:4.2.1依次选择 Start > Programs > Applied Biosystems 7500 >Applied Biosystems 7500 SDS Software ( ),以启动 SDS 软件;或在桌⾯双击Applied Biosystems 7500 SDS Software ( )图标。
4.2.2选择 File (⽂件) > New (新建)。
4.2.3在 New Document Wizard (新建⽂件向导)窗⼝中,从 Assay (实验)下拉列表中选择Absolute Quantification (Standard Curve)(绝对定量,标准曲线)。
接受 Container (反应板类型)和 Template (模板)字段中的默认设置(即分别为 96-Well Clear(空⽩96 孔板)和 Blank Document(空⽩反应板))。
4.2.4在 Default Plate Name (默认反应板名)字段中输⼊反应板⽂件名,或接受默认⽂件名。
1、目的规范该型号ABI7500Fast荧光定量PCR仪操作程序,正确使用和维护仪器,保证检测工作顺利进行,操作人员人身安全和设备安全。
2、适用范围适用于ABI7500Fast荧光定量PCR仪的使用操作与维护。
3、职责3。
1 操作人员按照本规程使用仪器,对仪器进行日常维护。
3。
2 保管人员负责对仪器进行定期维护、保养。
3。
3 科室负责人监督检查本操作程序的执行。
4、操作程序4.1启动笔记本电脑,进入Windows XP系统。
4.2待电脑桌面图标出现后,打开ABI7500Fast荧光定量PCR仪主机电源.4。
3待主机电源指示灯亮后,双击电脑桌面7500 SDS图标,打开软件。
4.4新建文件:在Quick Startup document窗口点击Create New Document 按钮,出现New Document Wizard窗口,在Assay菜单中选择Standard Curve (Absolute Quantification),点击Finish按钮后打开一个空白96孔板文件。
4.5探针设置:双击任意一个孔打开Well Inspector窗口.4.6点击Add Detector按钮,打开Detector Manager窗口,选择Detector List中的探针,例如用的是TaqMan—FAM标记探针,在列表中选择Reporter:FAM,Quencher:TAMRA;如果用的是SYBR Green I,则在列表中选择Reporter:SYBR,Quencher:(none).选择所需探针,按住Ctrl键可选择多个探针,再点击Add To Plate Document 按钮,最后点击Done按钮关闭Detector Manager窗口。
此时Well Inspector窗口仍然是打开的。
填样品表:在96孔表中选择有样品的一个或者多个孔,然后在Well Inspector窗口的Sample Name输入样品的名称,在探针列表中的Use项下的方框中打钩选择要用的探针,在Task栏中选择指定样品类型:未知样品选择Unknown,阴性对照选择NTC,标准品选择Standard。
ABI7500实时跟踪荧光PCR仪使用操作规程1. 目的:使ABI 7500 型核酸扩增荧光检测仪能够正确和正常的使用,保证扩增及结果分析的标准化、规范化。
2. 范围:适用于ABI 7500型核酸扩增荧光检测仪使用操作。
3. 职责:操作人按照规程进行仪器的操作使用。
4. 程序:4.1 开机。
连接好所有连线,打开接线板开关,然后依次打开主机开关(在主机侧面),电脑显示器开关(按屏幕下方开关按钮),电脑开关(主机前面按钮)。
使用鼠标双击桌面上一体化仪3.2图标,连机后打开应用程序。
4.2 编辑样品板。
在区域选择界面中进行样品板编辑,同时输入待检样品的相关信息。
4.3 编辑实验程序。
在温度控制界面中进行程序编辑。
4.4 进行实验。
设定完成样品板和实验程序后,将实验样品按样品板设定的位置放入样品槽内,然后将样品槽放入主机内,在程序主界面下点击开始读图标开始运行实验。
实验过程中屏幕的下半部分同步显示实验的运行状态。
4.5 实验中仪器将实时显示每次的样品检测结果:在实验进行中间或实验结束后,均可组合界面中查看实时的检测结果:4.6 定量分析:实验结束后,可以点击定量图标进入定量分析功能。
4.7 打印报告单:定量完毕后,用鼠标单击文件(F)菜单中的刷新病历数据信息,用鼠标单击文件(F)菜单中的打印,系统将自动生成检测报告单,并进行打印。
4.8 关机。
实验全部结束后,可先点击Files菜单Save Data File保存实验结果,然后关闭Opticon Monitor。
依次关闭计算机主机,显示器,ABI 7500主机。
5. 相关文件:无6.相关记录:仪器设备使用、维护保养和清洁记录。
1. 目的为规范使用人正确和正常的使用ABI 7500型核酸扩增荧光定量检测仪,保证扩增及结果分析的标准化、规范化,特制定本规程。
2. 适用范围适用于本公司ABI7500荧光定量PCR仪的操作。
3. 职责3.1使用人员负责本规程的实施。
3.2 设备使用人负责设备维护保养工作;设备责任人负责设备的定期维护保养工作。
3.3 质量监督员负责监督本规程的实施。
4.内容4.1 程序设置4.1.1 打开电脑及仪器电源,待仪器电源项显示power绿色状态。
4.1.2 双击电脑桌面上的7500 software V2.3 图标打开程序,打开程序单击OK,待软件连接仪器并测试校准状态后(若有出现连接失败可尝试重启电脑,检查USB线接口),出现如下界面,单击Design Wizard选项,红色箭头指示位置有个下拉菜单,如下图所示。
下拉菜单中有一个Advanced Setup(高级设置)选项,如箭头所示:点击这个选项,可以进入下面这个界面,①②③如上图所示,红色箭头从上到下指示的分别是①实验名称、②仪器型号和③反应程序类型。
(带*号的必需填)此图是上面图的延续(自己电脑显示不完全),红色箭头从上到下指示的分别是①Plate Setup 选项、②探针类型和③程序应用速度类型,一般使用的探针就是TaqMan 探针,速度类型选择默认就可以了(如果是7500fast 的话则有快速模式可以选择)。
下一步我们可以看到左上角的红色箭头指示的一个Plate Setup 选项,点击这个选项,就可以进入下一个设置界面。
红色箭头①和②指的是设定反应探针和反应样品名称,箭头③处可以填写反应探针名称(如P1,HBV ,HCV )。
箭头⑤是选择报告荧光,一般使用的发光基团是FAM ,箭头⑥是选择粹灭荧光,达安现在使用的是TAMRA 荧光,科华现在使用的是BHQ ,在这个仪器中无此选择项,那么就选择none 。
箭头⑧处可以填写样品名称。
点击箭头④和箭头⑨处可以添加反应探针体系名称和样品名称。
7500荧光定量PCR 仪使用说明注意事项:●实验过程必须戴干净的一次性乳胶手套进行操作。
● PCR 反应所用的96孔板、8联管或单管必须为ABI7500专用,凸盖PCR 管禁止使用。
● 使用8联管两侧需用空管支撑,使用单管四角需用空管支撑,以防止板槽受力不均。
● 实验数据用光盘刻录,禁止U 盘拷取,数据可暂存于本机电脑硬盘中,各实验室D 盘中有指定文件夹,中心外部人员数据存于FUWU 文件夹下的子文件夹中。
操作步骤➢开机➢ 放入反应板注:关闭仪器托盘时,应按一个角度推压托盘的右侧。
(以下过程按字母顺序a →q 进行操作)➢ 创建反应板文件双击电脑桌面上SDS 软件图标打开SDS 软件;a. 从 Assay 下拉列表中选择反应板类型c. 单击Next 反应板文件类型有以下几种:1. Relative Quantification (ddCt) Plate (相对定量)2. Absolute Quantification (Standard Curve)(绝对定量,标准曲线)3. Allelic Discrimination (等位基因鉴别)4. Plus/Minus (阳性/ 阴性实验)d. 选择要添加到反应板文件的探针(引物),单击Add 添加选中探针e. 如果在列表中未列出所需探针,请单击New Detector 创建新探针f. 单击Nextb. 为反应板文件命名➢为反应孔设置样品名g.选取探针相同的反应孔h.点击反应孔对应的探针。
i.单击Task栏的下边指定探针任务。
j.选择Use (使用)。
k.单击Finish (完成)。
ghijkl.选取反应孔,直接输入相应样品名(也可右键,调出反Well Inspector对话框,在Sample Name中进行修改)设定PCR循环参数、运行程序1.实验结束后关闭软件。
(确认反应板文件数据已保存)2.打开拖盘,将反应板取出,关闭拖盘。
3.按下7500仪器电源开关关闭机器。
●目的建立ABI7500型荧光定量PCR仪的标准操作及维护保养规程,为本设备的操作提供标准依据。
●适用范围ABI7500型荧荧光定量PCR仪的操作、维护保养、清洁过程。
●责任与要求质量部人员必须遵照本规程。
●培训对象质量部●内容1.设备信息2.操作流程示意图3.3.1 开机自检3.1.1 按下配套电脑的开机键打开电脑。
3.1.2 按下ABI7500开关,打开仪器,仪器自动进行自检。
待仅有“power”指示灯(绿色)亮时,自检结束。
3.2 样品上机3.2.1 按下托盘按钮,弹出96孔管架托盘,确定所需的96孔管架。
3.2.2 将加好样品的八连管或96孔板放入相应的孔位。
3.2.3 将托盘推入原来位置。
3.3 编辑运行参数3.3.1 双击桌面上7500 Software v2.3软件图标,打开7500 Software v2.3软件。
3.3.2 在弹出的窗口点击“New Experiment”新建实验程序,并对实验参数进行设置:3.3.2.1 在Experiment Name(实验名称)字段中,可以自定义实验名称。
3.3.2.2 在Barcode(条形码)字段中,输入反应板条码。
3.3.2.3 在User Name(使用者姓名)字段中,输入您的姓名。
3.3.2.4 在Comments(备注)字段中,输入您想保存到文件中的任何附加信息。
3.3.2.5 默认选择instrument(仪器)-----7500(96 wells)。
3.3.2.6 默认选择Experiment type(实验类型)----- Quantitation-Standard Curve。
3.3.2.7 默认选择Reagents (试剂)----- TaqMan® Reagents(TaqMan® 试剂)。
3.3.2.8 默认选择Ramp speed(升降温速度)-----Standard(~2 hours to complete a run)。
ABI7500说明书1 4版一中文ABI7500说明书第一章产品简介1.1 产品概述本说明书是ABI7500实时荧光定量PCR仪的详细介绍,旨在帮助用户了解并正确使用该仪器。
1.2 产品特点1.2.1 准确可靠:ABI7500采用先进的光学系统和控制技术,确保高精度和可靠的实时荧光定量PCR结果。
1.2.2 高通量:该仪器支持多通道扩展,满足不同规模实验需求,最多可容纳96孔板。
1.2.3 快速高效:ABI7500具有快速升温和降温功能,大大缩短PCR 反应时间,提高实验效率。
1.2.4 用户友好:仪器操作简便,配备直观的触摸屏界面和友好的软件,使实验操作更加方便快捷。
第二章产品配置2.1 主机及配件ABI7500主机、电源线、数据传输线、安装光盘、用户手册、试剂盖、盖板、96孔板等。
第三章仪器安装与连接3.1 安装步骤1.将ABI7500主机放置在干燥、通风良好的实验室台面上。
2.连接电源线和数据传输线。
3.2 连接示意图(图略)第四章仪器操作4.1 打开仪器按下ABI7500主机上的电源按钮,待仪器启动成功后,进入操作界面。
4.2 设置实验参数根据实验需求,在仪器上设置反应温度、时间、通道数等参数。
4.3 添加样品和试剂按照实验方案,取适量的PCR模板DNA或cDNA,并添加相应的PCR Master Mix等试剂。
4.4 启动PCR反应将PCR反应混合液加入96孔板中,将孔板放入ABI7500中,启动PCR反应程序。
4.5 数据获取与分析待PCR反应结束后,ABI7500会自动采集并记录实时荧光信号。
用户可使用附带软件对数据进行分析和图像处理。
第五章维护与保养5.1 清洁定期清洁仪器表面和孔板槽,使用干净的布擦拭。
5.2 保养定期检查仪器线缆、接口和连接器的牢固性,如有发现损坏或松动,及时修复或更换。
第六章故障排除6.1 仪器无法启动6.1.1 检查电源线是否插入稳定,是否有电源供应。
6.1.2 检查电源开关是否处于开启状态。
文件名称AB7500荧光定量PCR仪使用、维护、校准标准操作规程颁发部门制订人:复核人:批准人:质保部制订日期:复核日期:批准日期:执行日期版本 1.0编号SOP04006制作份数_____份发送部门修订人修订原因修订内容版本修订日期修订记录1. 目的:确保荧光定量PCR仪能够正确和正常的使用,保证扩增及结果分析的标准化、规范化。
2. 范围:适用于AB7500荧光定量PCR仪的使用及维护。
3. 定义:无4. 职责:荧光定量PCR仪使用人员负责本规程的实施。
质保部对本规定的有效执行承担监督检查责任。
5. 内容:5.1 室内温度控制在15~30℃,相对湿度45~75%。
5.2 仪器操作5.2.1 依次打开电脑显示器和电脑主机的电源开关,进入Windows界面。
5.2.2 接着打开AB7500仪器电源开关,预热10分钟。
5.2.3 点击7500 Software v2.3图标,打开软件。
5.2.4 按压仪器托盘上的按压位,待托盘弹出后,将所需检测的8联PCR反应管或者96孔PCR反应板放入检测孔位,记下放置位置。
检测8联PCR反应管用**反应孔模块,检测96孔PCR反应板用**反应孔模块。
(检测8联PCR反应管需放入盖紧管盖的空8联PCR反应管配平,检测96孔PCR反应板无需配平)5.2.5 再次按压托盘使其滑入仪器。
5.2.6 新建扩增参数模板:例如新建一个UG-63-62的模板,扩增参数是95°,10′;(95°,10″;63°,45″)×5 cycles;(95°,10″;62°,35″)×40 cycles,在62°时收集荧光信号(HEX、FAM信号),20μl反应体系。
5.2.6.1 在Setup-Plate Setup-Define Targets and Samples中,将Target Name下的Target1改成FAM;点击Add New Target,将新增的Target1改成HEX,点击Reportee下拉菜单,选择VIC。
编制人:编制日期:年月日颁发部门:品保部
审核人:审核日期:年月日
批准人:批准日期:年月日生效日期:2014年06月01日分发部门:品保部分发号:
1.目的
规范ABI 7500荧光定量PCR仪操作,保证安全操作,延长仪器寿命
2.范围
适用于ABI 7500荧光定量PCR仪
3.职责
操作人负责本规程实施,部门负责人监督实施。
4.规程
4.1 实验程序运行:
4.1.1首先打开电脑,进入操作系统后,打开ABI 7500荧光定量PCR仪电源。
双击桌面上7500 software V2.0.6。
弹出Login对话框,默认的User Name为GUEST,点击Login as GUEST,点击OK运行软件。
4.1.2进入界面,选择Advanced Setup。
4.1.3点击Experiment Properties。
在Experiment Name栏输入实验名称。
4.1.4点击Plate Setup,点击Define Targets as Samples。
设定Target Name的Reporter 为FAM。
4.1.5点击Assign Targets and Samples。
设定96孔板。
4.1.5点击Run Method。
设定反应程序。
4.1.6点击Reaction Setup设定反应体系。
4.1.7点击Run菜单,点击START RUN。
开始运行PCR反应。
ABI7500实时荧光定量操作程序ABI7500实时荧光定量PCR(Polymerase Chain Reaction)操作程序是用于检测目标DNA的数量的一种实验方法。
在该操作程序中,使用ABI7500实时荧光定量PCR系统的仪器和相关试剂来进行PCR反应,然后通过荧光信号的变化,对PCR反应中目标DNA的数量进行定量。
下面是ABI7500实时荧光定量PCR操作程序的详细步骤:1.实验前准备a.准备所需试剂,包括PCR引物、PCR酶、荧光探针等。
b.预备PCR工作站,如PCR工作台、离心机、PCR仪等。
c.准备PCR反应管,标记每管的样品编号。
2.反应体系构建a.准备PCR反应液,根据实验需要,将反应组分如PCR引物、PCR酶、模板DNA、dNTPs等加入PCR反应管中。
b. 加入SYBR Green或荧光探针,用于在PCR反应过程中检测目标DNA。
3.试剂混合与装样a.将PCR反应液和样品混合均匀。
b.装样到ABI7500实时荧光定量PCR系统中的反应孔中,注意避免气泡的产生。
4.设置PCR程序a.打开ABI7500实时荧光定量PCR系统的软件界面,选择合适的PCR 模板。
b.设置PCR程序,包括温度、时间和荧光信号的检测。
5.PCR反应a.开始PCR反应,系统会根据设置的程序进行温度循环,在每个循环中,会记录荧光信号的变化。
b.实时监测荧光信号,根据荧光信号的变化来判断PCR反应的进行情况。
6.数据分析a.实时记录荧光信号的数值,生成实时荧光曲线。
b.通过计算机软件对实时荧光曲线进行数据分析,计算目标DNA的相对定量值。
7.结果解读a.根据相对定量值来判断样品中目标DNA的数量。
b.结果的解读可以通过进行标准曲线法或内部参照法进行。
8.结束实验a.关闭ABI7500实时荧光定量PCR系统。
b.清理和消毒实验区域和实验工具。
总结:ABI7500实时荧光定量PCR操作程序包括实验前准备、反应体系构建、试剂混合与装样、设置PCR程序、PCR反应、数据分析、结果解读和结束实验等步骤。
人民医院基因扩增实验室ABI7500实时荧光定量PCR仪操作、维护及校准操作规程1 ABI7500实时荧光定量PCR仪概述7500型荧光定量PCR仪是特异性靶基因检测与定量的一体化平台。
7500型将PCR热循环,荧光检测和各种应用分析软件结合在一起,可实时定量观察PCR每一循环各反应管中PCR扩增产物的情况。
PCR实验结束后即刻得到定量结果,无需凝胶电泳分析,无需纯化PCR产物,无需进行任何实验操作。
7500型实时荧光定量PCR仪具有节省时间,灵敏度高,准确性好和避免产物污染等优点。
2 主要技术参数样品孔数:96孔样品基座,温度范围:4.0-99.9℃温度显示:经计算机计算的实际样品温度,精确到0.1℃加热冷却速度:平均温度变化速度1℃/秒温度准确性:正负0.25℃,35-100℃范围升降温重现性:任意温度达到时间误差小于5秒3 操作说明3.1 实验程序运行:3.1.1 首先打开电脑,进入操作系统后,打开7500仪器电源;3.1.2 双击桌面上的7500快捷方式,进入以下界面:3.1.3 点击,进入以下操作界面,按照默认设置,直接点击“完成”(Finish):3.1.4 在96孔板中选择所放置样本对应的区域,如下图:3.1.5 点击按钮,在弹出的对话框中选择FAM-TAMRA荧光-淬灭基团,点击“Add To Plate Document”:3.1.6 点击按钮,如图所示,在弹出的对话框中勾选FAM荧光,内参荧光选择,点击“Close”:3.1.7 在选项下,逐个双击所选样本,设置样本类型和标准点定量值:3.1.8 点击选项,按照试剂盒说明书设置相应的扩增程序:3.1.9 点击按钮,为使用结果文件设定保存路径和名称。
3.1.10 点击“Start”开始运行扩增程序。
3.2 实验结果分析:3.2.1 点击按钮,打开使用结果文件;3.2.2 点击选项,进入结果分析操作界面。
点击下面的选项,双击纵坐标,选择Linear项,调整为线性坐标,点击“OK”确定:3.2.3 选取所有样本,手动设定阈值为最大荧光值的5%左右为宜。
1. 目的:确保荧光定量PCR仪能够正确和正常的使用,保证扩增及结果分析的标准化、规范化。
2. 范围:适用于AB7500荧光定量PCR仪的使用及维护。
3. 定义:无4. 职责:荧光定量PCR仪使用人员负责本规程的实施。
质保部对本规定的有效执行承担监督检查责任。
5. 内容:5.1 室内温度控制在15~30℃,相对湿度45~75%。
5.2 仪器操作5.2.1 依次打开电脑显示器和电脑主机的电源开关,进入Windows界面。
5.2.2 接着打开AB7500仪器电源开关,预热10分钟。
5.2.3 点击7500 Software v2.3图标,打开软件。
5.2.4 按压仪器托盘上的按压位,待托盘弹出后,将所需检测的8联PCR反应管或者96孔PCR反应板放入检测孔位,记下放置位置。
检测8联PCR反应管用**反应孔模块,检测96孔PCR反应板用**反应孔模块。
(检测8联PCR反应管需放入盖紧管盖的空8联PCR反应管配平,检测96孔PCR反应板无需配平)5.2.5 再次按压托盘使其滑入仪器。
5.2.6 新建扩增参数模板:例如新建一个UG-63-62的模板,扩增参数是95°,10′;(95°,10″;63°,45″)×5 cycles;(95°,10″;62°,35″)×40 cycles,在62°时收集荧光信号(HEX、FAM信号),20μl反应体系。
5.2.6.1 在Setup-Plate Setup-Define Targets and Samples中,将T arget Name下的T arget1改成FAM;点击Add New Target,将新增的Target1改成HEX,点击Reportee下拉菜单,选择VIC。
5.2.6.2在Setup-Run Method-Graphical View中的Reaction Volume Per Well后面输入20(20μl反应体系)。
ABI 7500型荧光定量核酸扩增仪作业指导书1.目的:使ABI 7500型核酸扩增荧光定量检测仪能够正确和正常的使用,保证扩增及结果分析的标准化、规范化。
2.范围:ABI 7500型核酸扩增荧光检测仪。
3.性能参数:详见说明书4.程序:4.1.依次打开电脑显示器及电脑主机电源,进入windows XP 界面4.2.打开PCR主机电源4.3.点击桌面7500 software V2.0.6 图标,打开软件4.4.主界面点击SET UP 菜单下ADVANCED SETUP4.4.1.在试验属性界面:选择正确的机器型号,试验类型及试剂类型(探针法/染料法)4.4.2.在plate setup 界面,首先设定试验使用的探针,及样品名称,然后按照事先加样的位置顺序设定样品名称、类型,包括待检样本、阴性对照、阳性对照、阳性标准品、阳性室内质控样本。
4.4.3.在run method界面,编辑与试剂盒提供的温度程序相同的温度程序,包括温度与时间,及循环数4.5.将预先加好的0.2ML样品管按照设定顺序放置到仪器里面,进入到RUN界面,点击绿色START 按钮,弹出保存试验对话框,设定保存后,试验立即开始运行。
界面显示运行倒计时。
运行过程中在amplification plot界面可以查看实时的扩增曲线,在temperature plot界面可以查看实时的温度变化情况。
温度循环结束后试验自动结束。
5.结果分析5.1.在analysis setup里面修改各个探针的baseline与threshold数值,点击绿色analyze图标,软件及完成自动分析。
5.2.在amplification plot界面查看所有样品的扩增曲线。
6.整体曲线的观察,将所有曲线选中进行整体观察。
6.1.观察是否存在污染情况(包括标本污染和试剂污染),特别应注意大量曲线在同一 Ct值出现上涨的情况。
6.2.观察是否有光路传导阻滞或电压波动等机器原因形成的异常曲线。
荧光定量PCR标准操作程序ABI 7500荧光定量PCR仪标准操作程序1.打开UPS电源。
2.UPS电源稳定后,依次打开电脑和PCR仪,PCR仪开机时绿、黄、红3个灯全亮,最终绿灯常亮(如果是红灯常亮,则仪器运行不正常需联系仪器维护工程师排除仪器故障)。
3.双击桌面7500Sofeware V2.0.4图标,弹出Login界面,输入用户名,单击OK,进入实验设计主界面。
4.依次Set up→Advanced Setup→Experiment Menu,进入实验手动设计界面。
5.Setup→Experiment Properties→Experiment Name输入实验名称,选择染料类型,(如需选择SYBR Green Reagents,则必须选上溶解曲线选项)。
6.Setup→Plate Setup→Define Targets and samples设定染料探针名称、添加或删除探针和选择染料探针的报告基团和猝灭基团。
→Define s amples选择添加或删除样品。
→Assign Targets and samples 图标,可设定样品(S)、阴性对照(N)和标准品(S),并在右侧的96孔显示界面中设置每管的具体位置,尽量将样品管集中于96孔界面的中央位置。
注意:每管中都需选择加入染料探针。
7.Setup→Run Method→Graphical view设定PCR反应体系总体积、循环次数、添加或删除反应的阶段和步骤,以及反应的各个阶段和步骤的时间和温度。
(注意:由于数据的采集是在实验的延伸阶段,因此延伸阶段一定要选上数据采集图标,并且延伸时间不能少于35s。
)8.设置完毕后,向样品板中加入样品,单个样品管8连管需用专用平盖封好,96孔管用专用封膜封好,轻按样品槽右侧按钮,弹出样品槽,放入样品板,使A1朝向左上角,单手按住样品槽右侧按钮,将样品槽轻轻送进机体即可。
9.单击右上角绿色START RUN图标,开始实验。
1. 目的为规范使用人正确和正常的使用ABI 7500型核酸扩增荧光定量检测仪,保证扩增及结果分析的标准化、规范化,特制定本规程。
2. 适用范围适用于本公司ABI7500荧光定量PCR仪的操作。
3. 职责3.1使用人员负责本规程的实施。
3.2 设备使用人负责设备维护保养工作;设备责任人负责设备的定期维护保养工作。
3.3 质量监督员负责监督本规程的实施。
4.内容4.1 程序设置4.1.1 打开电脑及仪器电源,待仪器电源项显示power绿色状态。
4.1.2 双击电脑桌面上的7500 software V2.3 图标打开程序,打开程序单击OK,待软件连接仪器并测试校准状态后(若有出现连接失败可尝试重启电脑,检查USB线接口),出现如下界面,单击Design Wizard选项,红色箭头指示位置有个下拉菜单,如下图所示。
下拉菜单中有一个Advanced Setup(高级设置)选项,如箭头所示:点击这个选项,可以进入下面这个界面,①②③如上图所示,红色箭头从上到下指示的分别是①实验名称、②仪器型号和③反应程序类型。
(带*号的必需填)此图是上面图的延续(自己电脑显示不完全),红色箭头从上到下指示的分别是①Plate Setup 选项、②探针类型和③程序应用速度类型,一般使用的探针就是TaqMan 探针,速度类型选择默认就可以了(如果是7500fast 的话则有快速模式可以选择)。
下一步我们可以看到左上角的红色箭头指示的一个Plate Setup 选项,点击这个选项,就可以进入下一个设置界面。
红色箭头①和②指的是设定反应探针和反应样品名称,箭头③处可以填写反应探针名称(如P1,HBV ,HCV )。
箭头⑤是选择报告荧光,一般使用的发光基团是FAM ,箭头⑥是选择粹灭荧光,达安现在使用的是TAMRA 荧光,科华现在使用的是BHQ ,在这个仪器中无此选择项,那么就选择none 。
箭头⑧处可以填写样品名称。
点击箭头④和箭头⑨处可以添加反应探针体系名称和样品名称。
箭头⑦和箭头⑩是选择对应探针体系和对应样品的曲线颜色,可选择也可以不选。
(另:探针跟样品设定后可保存,方便以后实验调用,具体是点击箭头①②下面①②③① ②③ ④ ⑤ ⑦ ⑥ ⑧ ⑨ ⑩的Saved Taeget,下次调用则点击Add Saved就可调出。
)为了方便讲解,我假定有1个反应探针DAAN和1个样本HBV1,如上图所示。
设定完成之后,我们点击红色箭头所指的选项,进入下个界面。
在上图,我们可以看到一个类似反应板的界面,黑色箭头①指示的有玫瑰红色下划线那一排在选定反应孔后会显示出样本孔总数,标准品总数和阴性对照总数。
从黑色箭头②可以看出暂时还有48个反应孔空余。
蓝色箭头①和②分别是放大这个孔板界面的按钮,蓝色箭头③是显示大小还原默认设置按钮。
开始设置时,首先我们如红色箭头①所示选定A1孔,红色箭头②指示的是反应探针名称,红色箭头③指示的样品类型,选定反应体系后可以在U——未知样本,S——标准样本,N——阴性样本中选择一个。
红色箭头⑤是个下拉菜单可以选择反应探针,在红色箭头④指示的框里单击鼠标,显示打钩就说明选定了反应体系。
红色箭头⑥指示的是样品名称,红色箭头⑧是个下拉菜单可以选择样品名称。
在红色箭头⑦指示的框里单击鼠标,显示打钩就说明选定了样品名称。
红色箭头⑨指示的参比荧光,仪器默认是ROX,但是产品一般没有添加ROX荧光,所以必须选择None。
红色箭头⑩指示的定量标准品的设置,可根据标准曲线的值从4567升序或是从7654降序的排列,单击可弹出以下界面,具体如下。
①②③④⑤上图中,红色箭头①表示标准品的数量,②表示标准品是否走重复孔,③表示起始的浓度,④表示10×的话则为升序,按照4567的浓度;1:10的话则为降序,按照7654的浓度。
例如:做了4个标准品,每个标准品做1个(即没有做复孔),起始浓度为10000,选择10×,选择箭头⑤的自己选择孔位,点击左下角的Apply,则在第10排按照4567次方的顺序排列。
此外也可以选择鼠标双击类似反应孔板的那个界面,会出现下面这个界面:如上图所示,选定反应孔双击后会出现这样一个界面,红色箭头①指示的Task —样品反应类型,红色箭头②是指示的是Target —反应探针,红色箭头③指示的是Sample —样品名称。
这三个都是下拉菜单,可以选择前面设置好的反应体系和 样品名称。
红色箭头④是个文本框,可以备注样本的详细信息。
按照样本放置的实际情况设置好之后,可以点击红色箭头⑤指示的Run Method 选项进入下个界面。
上图的箭头①是设定反应体系体积的,箭头②是添加反应程序阶段的,箭头③是添加反应程序步骤的,箭头⑤和⑥是制订收集荧光信号的标志,例如箭头⑥所示高亮显示时表示在此步骤收集荧光信号。
(切记,收集荧光只能1个地方,若是出现2个收集荧光信号的,则软件上②①③④⑤③ ①④②⑤⑥⑦会有出现蓝色的错误提示)设定好循环条件,就可以进行模板保存,以便下次实验时调用程序,点击位于软件中间最右方的键(注:这个键是由于本人电脑不是宽屏的(14寸acer。
),如果是AB配的E6500电脑则可以在软件上全部显示,不会出现键或是那些滑动条,但是。
字体会小点,,),选择保存运行的模板,命名。
下次实验使用的时候就不用再在设条件,直接点击open run method,调出你所需要做的实验的扩增条件。
还有上图左方的reaction setup(反应体系设置)和materials list(耗材清单)不需要我们去设置。
点击箭头⑦所指的run进入运行界面。
①②③④⑤直接点击上图中的绿色START按钮,根据提示保存实验文件后开始实验,实验开始后在绿色START按钮右方可出现实验的预计剩余时间。
箭头②表示的是实时的曲线图谱,③表示的是实时的温度曲线图谱,④表示的是实验的条件。
实验结束后按箭头⑤所指的分析,出现以下界面。
做完实验后,曲线会出现在上图,以对数图谱的形式出现,若想换为线性图谱,可点击箭头①所指示的去选择log 或linear ,其次,再点击箭头⑧的分析按钮(有实验数据的话会出现的是analysis ),样本的结果跟CT 会在右边的96孔面板中出现,上面的显示不完全,曲线的基线baseline 跟阈值threshold 设置是在上图数字⑦下面的那个地方(不是箭头⑦所指的地方),进行设置。
箭头③表示的是实验标准曲线的参数。
箭头④⑤表示的是每个孔的原始光谱图。
箭头⑥表示的是一些附加的报警信息,例如重复孔偏差了,荧光偏差了,质控失控了。
箭头⑦表示的是上面4中图谱的集合,可自己选择组合查看。
4.1.3 实验结束后填写《设备使用记录》 4.2 结果分析4.2.1 在analysis setup 里面修改各个探针的baseline 与threshold 数值,点击绿色analyze 图标,软件及完成自动分析。
4.2.2 在amplification plot 界面查看所有样品的扩增曲线。
4.2.3 整体曲线的观察,将所有曲线选中进行整体观察。
4.2.3.1 观察是否存在污染情况(包括标本污染和试剂污染),特别应注意大量曲线在同一 Ct 值出现上涨的情况。
4.2.3.2 观察是否有光路传导阻滞或电压波动等机器原因形成的异常曲线。
4.2.4 对照、质控品、标准品的分析4.2.4.1 阴性对照:试剂中加入与待检标本进行同样处理的已知阴性标本。
①②⑦⑥⑤④③⑧作用:用以监测实验室和前处理过程中是否存在污染。
4.2.4.2 阳性对照:试剂中加入与待检标本进行同样处理的已知阳性标本。
作用:用以监测实验能否正常检出阳性标本,避免假阴性的出现。
4.2.4.3 阳性室内质控品的分析:阳性室内质控品:试剂中加入与待检标本进行同样处理的已知或未知浓度的阳性室内质控血清。
作用:用以监控日常实验的精密度。
4.2.4.4 阳性标准品的分析:各梯度曲线的分布是否均匀,若各梯度曲线均未分开,则表明阳性标准品稀释可能存在问题,提示实验中存在较大人为误差。
4.2.4.5 观察各曲线的Ct 值是否在平日的正常位置:若出现低拷贝标准品做不出,而各曲线Ct 值均后移,则判断是否为试剂扩增效率下降(如试剂过期或保存条件不合格)。
出现低拷贝标准品做不出,而高拷贝曲线Ct 值均正常,则提示可能存在低拷贝阳性标准品的降解情况。
若高拷贝标准品出现Ct 值后移,且能排除上述情况,则判断是否为试剂灵敏度下降。
得出定量结果:调节基线和阈值以得到一较好的标准曲线。
电脑据此曲线给出实验结果值。
4.3 仪器维护4.3.1 注意开机关机顺序,机器开机后即可使用,无需预热。
4.3.2 电脑上使用专用U盘等移动存储设备,建议使用光盘刻录来转移数据。
4.3.3 针对电脑硬盘,进行周期性碎片整理,并将试验数据备份到其他存储设备上(比如光盘)4.3.4 仪器表面与电脑表面应每月用软布擦拭(无需用水,禁用有机溶剂,会溶解机器表面的漆层)。
4.3.5 灯泡更换:在灯泡使用达到寿命后(2000小时),或者意外损坏后需要更换。
机器关闭电脑30分钟后,打开前面上半册面板,取出旧灯泡,在操作过程中需要戴无尘手套操作,注意灯泡高温。
然后将新灯泡,用气吹吹掉表面的灰尘,安装灯泡。
4.3.6 样品孔清洁:样品孔污染后会影响PCR扩增的信号,是的该孔信号高于其他孔,造成假阳性的结果,需要每月执行background校正,针对信号值超过72000的孔,使用棉签与去离子水进行清洁。
清洁时关闭机器电源,打开前面上半面板,将热盖板(黑色面板)推到后面,清洁相应的孔,然后恢复原状,重新执行background校正,直到所有的信号值均低于72000。
4.3.7按照仪器出厂说明书每6个月对仪器进行纯荧光校正和ROI校正。
4.3.8仪器在搬运后需要进行背景校正、纯荧光校正和ROI校正,所有校正通过后才能进行实验。
4.4 维修如出现故障,按照《设备管理制度》实施。
5. 支持文件5.1《设备管理制度》6. 相关记录6.1 《设备使用记录》6.2《设备维护保养计划清单》。