邓恩桉遗传多样性的ISSR分析_邓紫宇
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ISSR分子标记技术在家蚕遗传研究上的应用进展吴凡;李德臣;赵春晓;陈登松【期刊名称】《湖北农业科学》【年(卷),期】2015(54)24【摘要】The basic principle and characteristics of Inter-simple Sequence Repeat (ISSR) was described. The application of ISSR in silkworm genetics was summarized. The application future in the study of silkworm was prospected.%概括了ISSR 分子标记技术的基本原理和特点,综述了其在家蚕相关领域中应用的研究进展,并展望了其在家蚕遗传研究上的应用前景。
【总页数】3页(P6124-6126)【作者】吴凡;李德臣;赵春晓;陈登松【作者单位】湖北省农业科学院经济作物研究所,武汉 430064;湖北省农业科学院经济作物研究所,武汉 430064;安康市蚕桑研究所,陕西安康 725019;湖北省农业科学院经济作物研究所,武汉 430064【正文语种】中文【中图分类】S881.2【相关文献】1.ISSR、RAPD和SRAP分子标记技术在姬松茸菌株鉴定上的应用比较 [J], 林戎斌;张慧;林陈强;郑力;陈济琛2.SSR分子标记技术在杂交水稻研究上的应用进展 [J], 王昌华;张燕之;夏永胜;郑文静;赵家铭3.ISSR和RAPD分子标记技术在不同君子兰品种遗传多样性上的应用 [J], 郑玉红;钱美华;李莹;顾永华;彭峰4.ISSR分子标记技术在香蕉分类上的应用 [J], 刘绍钦;黄上志;梁张慧;陈芸芸5.分子标记技术及在水稻遗传研究中的应用 [J], 吕瑞玲;吴小凤;刘敏超因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
遗传多样性研究及其生态学意义分析遗传多样性是指生物种群或物种内所存在的遗传差异,它是生物进化中的一个重要概念。
在野生动植物的保护和利用中,遗传多样性的研究至关重要。
本文将从遗传多样性的定义、研究方法、生态学意义等方面来进行分析。
一、遗传多样性的定义遗传多样性是指个体间、种群间、物种间及生态系统内所遗传相关的基因型和表型的变异性。
个体间的遗传多样性是由于基因重组和突变等原因造成的遗传差异,而种群间和物种间的遗传多样性则是由于地理和生物障碍分离、哥尼氏效应、选择效应、基因漂移等原因造成的。
二、遗传多样性的研究方法遗传多样性的研究方法有许多,比较常用的方法包括DNA分子标记技术、核酸测序技术、基因芯片技术等。
其中,DNA分子标记技术是研究遗传多样性最常用的工具之一,包括随机增殖DNA多态性(RAPD)、简单重复序列(SSR)、单核苷酸多态性(SNP)等。
这些方法通过测量多个标记位点上个体或群体的遗传差异来估计遗传多样性。
三、遗传多样性的生态学意义1、维护生态平衡遗传多样性是生物的适应和演化的基础,它可以提供物种的适应性和生物多样性的保障。
研究表明,一个物种的遗传多样性越高,它在生态系统中的角色就越具有代表性,它对环境的适应性也更强。
2、保障资源利用野生动植物资源是人类的重要经济资源,保护野生动植物的遗传多样性能够保障人类可持续地利用这些资源。
从红树林到高山草甸,从国产药材到果蔬粮食,都与遗传多样性有着密切联系。
对于重要经济野生动植物的保护,研究其遗传多样性和多样化利用至关重要。
3、调整生态环境生态系统是由各种生物体和它们的环境组成的,而生物的生境本质上也取决于基因。
研究遗传多样性还可以将物种的适应性与生境因子相关联,探究物种异质性适应策略的演化机制和后果,为调整生态环境提供科学依据。
四、结语遗传多样性的研究不仅关乎野生动植物的保护与利用,更对整个生态系统的平衡与稳定产生着重要的影响。
未来,我们需要借助先进的技术方法,深入研究各种生物的遗传多样性,保护生物多样性和维护生态平衡。
遗传多样性分析一、引言遗传多样性是指表现在个体、种群和物种层面上的遗传差异。
通过对遗传多样性的分析,可以帮助我们了解物种的演化历史、生态适应性以及种群的健康状况等重要信息。
本文将探讨遗传多样性的分析方法,以及它在生物学研究、自然保护和人类健康等领域的应用。
二、遗传多样性的分析方法1. 核酸序列分析核酸序列分析是研究遗传多样性的重要方法之一。
通过分析DNA或RNA的序列,可以揭示不同个体或群体之间的遗传差异。
常用的核酸测序技术包括Sanger测序、下一代测序等。
这些技术能够高效地产出大量的序列数据,为遗传多样性的分析提供了基础。
2. 分子标记技术分子标记技术是基于DNA片段的遗传标记,可以通过PCR扩增等方法来建立遗传图谱。
这些标记可以用来分析种群的结构、亲缘关系以及种群之间的迁移和遗传流动。
常用的分子标记技术包括RAPD、AFLP、SSR等。
这些技术具有高通量、高灵敏度和高可重复性的特点,适用于大规模的遗传多样性研究。
3. 表型分析除了分析遗传物质的差异,遗传多样性的研究还可以通过对个体的表型特征进行分析。
表型是个体对外界环境的适应性反应,它可以受到遗传和环境因素的影响。
通过对表型的测量和分析,可以更加全面地了解个体和种群的遗传多样性,并揭示其与环境因素之间的关系。
三、遗传多样性的应用1. 生物学研究遗传多样性的分析在生物学研究中具有重要的应用价值。
它可以帮助我们了解物种的起源和演化历史,揭示了不同种群之间的亲缘关系和遗传交流情况。
此外,遗传多样性的研究还可以为物种的分类和鉴定提供依据,促进生物多样性的保护和管理。
2. 自然保护保护和维护物种的遗传多样性是自然保护的重要任务之一。
通过对物种的遗传多样性进行监测和评估,可以及时发现种群数量下降、遗传流动受限等问题,并采取相应的保护措施。
遗传多样性的保护还可以提高物种的适应性和生存能力,增加物种的抵御病害和环境变化的能力。
3. 人类健康遗传多样性的分析对于人类健康也具有重要的意义。
邓氏马先蒿遗传多样性的ISSR分析
夏婧;郭友好
【期刊名称】《植物科学学报》
【年(卷),期】2006(024)006
【摘要】运用ISSR-PCR分子标记技术对邓氏马先蒿(Pedicularis dunniana)云南中甸以及四川木格措两个自然居群的遗传分化以及遗传多样性进行研究.结果表明:物种水平上邓氏马先蒿遗传多样性水平较高(PPB=62%),但居群平均水平很低,云南中甸居群多态性位点百分率只有23%.四川居群也仅仅是27%,AMOVA分析结果表明,居群间基因分化系数Fst=0.7462,即遗传变异绝大部分来源于两居群间,居群间表现出强烈的遗传分化.自交的交配方式以及小居群产生的遗传漂变效可能是造成邓氏马先蒿目前遗传结构的主要原因.
【总页数】4页(P565-568)
【作者】夏婧;郭友好
【作者单位】武汉大学生命科学学院植物系统与进化生物学研究室,武汉,430072;武汉大学生命科学学院植物系统与进化生物学研究室,武汉,430072
【正文语种】中文
【中图分类】Q943
【相关文献】
1.头花马先蒿和管花马先蒿的化学成分 [J], 杨佳倩;贺文军;谭宁华;褚洪标;张玉梅;梅文莉;戴好富
2.万马奔腾──高原马先蒿的花季(上) [J], 江珊
3.云南省西花蓟马种群遗传多样性ISSR分析 [J], 蒋兴川;蒋秀云;李志华;程鹏;王晓晴;干春霞;桂富荣
4.万马奔腾\r──高原马先蒿的花季(下) [J], 江珊
5.四川卧龙国家级自然保护区马先蒿属一新种——熊猫马先蒿 [J], 林红强;程跃红;刘荣;尹民;郁文彬
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自然降温过程中邓恩桉渗透调节物质的动态变化邓紫宇;周维;郭东强;陈健波;项东云【期刊名称】《广西林业科学》【年(卷),期】2015(044)004【摘要】以引种邓恩桉(Eucalyptus dunnii)为材料,测定自然降温过程中叶片可溶性蛋白、可溶性糖及脯氨酸含量的动态变化,探讨邓恩桉渗透调节物质与抗寒性关系.结果表明:自然降温过程中,渗透调节物质含量随着温度的下降而升高,其中可溶性糖含量与脯氨酸含量变化明显,与对照相比,分别增加了75.27%和86.26%,而可溶性蛋白含量变化不明显,与对照相比,只增加了4.42%.渗透调节物质的增加是邓恩桉应对低温胁迫的响应.【总页数】4页(P404-407)【作者】邓紫宇;周维;郭东强;陈健波;项东云【作者单位】广西壮族自治区林业科学研究院国家林业局中南速生材繁育实验室广西优良用材林资源培育重点实验室,南宁530002;广西壮族自治区林业科学研究院国家林业局中南速生材繁育实验室广西优良用材林资源培育重点实验室,南宁530002;广西壮族自治区林业科学研究院国家林业局中南速生材繁育实验室广西优良用材林资源培育重点实验室,南宁530002;广西壮族自治区林业科学研究院国家林业局中南速生材繁育实验室广西优良用材林资源培育重点实验室,南宁530002;广西壮族自治区林业科学研究院国家林业局中南速生材繁育实验室广西优良用材林资源培育重点实验室,南宁530002【正文语种】中文【中图分类】S792.39【相关文献】1.自然降温过程中3种樟树渗透调节物质的动态变化 [J], 姚方;吴国新;梅海军2.自然降温过程中不同结缕草品种电解质渗透率的动态变化 [J], 杜永吉;于磊;孙吉雄;鲁为华;韩烈保3.自然降温过程中南方红豆杉叶片水分、渗透调节物质的动态变化与低温半致死温度的关系 [J], 谢吉容;谈锋4.自然降温过程中云锦杜鹃抗寒适应性研究--水分、渗透调节物的动态变化与低温半致死温度的关系 [J], 鲍思伟5.短期降温-回温过程中银杏部分渗透调节物质的动态变化 [J], 郁万文;曹福亮;汪贵斌;张往祥因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
生物技术进展 2023 年 第 13 卷 第 6 期 919 ~ 924Current Biotechnology ISSN 2095‑2341研究论文Articles不同居群北柴胡ISSR 遗传多样性分析闫晓睿 , 薛帼珍 , 杨晓霞 , 王宇 , 杜晨晖 , 张朔生 , 刘计权 *山西中医药大学中药与食品工程学院,山西 晋中 030619摘要:利用简单重复间序列(inter -simple sequence repeat, ISSR)分子标记技术对10个不同居群的北柴胡样品进行遗传多样性分析,为进一步开展北柴胡优良种质的选育提供依据。
以不同居群的北柴胡新鲜叶片为材料,用植物组织DNA 提取试剂盒提取北柴胡样品DNA 。
利用单因素梯度实验研究最佳ISSR -PCR 反应体系,将不同居群的DNA 扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,利用NTSYS -pc 软件分析不同居群北柴胡的遗传多样性。
结果发现,10个居群的北柴胡遗传相似系数介于0.142 8~1.000 0。
经聚类分析,10个不同居群的北柴胡分为3大类,第1类为甘肃北柴胡;第2类包括5个北柴胡样品,分别为陵川、河南、闻喜、平陆、襄汾北柴胡,均属于山西省晋南居群;第3类包括4个北柴胡样品,分别为内蒙古、临汾、浑源、广灵北柴胡,类属于山西省北部居群及内蒙古居群;10个居群的北柴胡存在比较丰富的遗传多样性,且与其地理环境有一定的关联性。
研究结果可为北柴胡种质资源保护及优良种质选育提供理论依据。
关键词:北柴胡;ISSR ;PCR 扩增;聚类分析;遗传多样性DOI :10.19586/j.20952341.2023.0084 中图分类号:Q37,R932 文献标志码:AISSR Genetic Diversity Analysis of Bupleurum chinense from Different PopulationsYAN Xiaorui , XUE Guozhen , YANG Xiaoxia , WANG Yu , DU Chenhui , ZHANG Shuosheng ,LIU Jiquan *College of Chinese Medicine and Food Engineering , Shanxi University of Chinese Medicine , Shanxi Jinzhong 030619, ChinaAbstract :The genetic diversity of 10 different populations of Bupleurum chinense was studied by inter -simple sequence repeat (ISSR ) molecular marker technique , in order to provide basis for further breeding of B. chinense . The DNA of Bupleurum chi⁃nense samples from fresh leaves of different populations was extracted by the plant tissue DNA extraction kit. The single factor gradient experiment was used to study the optimal ISSR -PCR reaction system. The DNA amplification products of different populations were subjected to agarose gel electrophoresis , and the genetic diversity of different populations of B. chinense was analyzed byNTSYS -pc software. The results showed that the genetic similarity coefficient of 10 populations ranged from 0.142 8 to 1.000 0. 10 different populations were divided into three categories by cluster analysis , with the first category being Gansu. The second category included five samples of B. chinense , Lingchuan , Henan , Wenxi , Pinglu , and Xiangfen , all belonging to the Jinnan population in Shanxi Province. The third category included four samples , namely Inner Mongolia , Linfen , Hunyuan , and Guangling , belonging to the northern population of Shanxi Province and Inner Mongolia. The 10 populations of B. chinense have relatively abundant genetic diversity and are related to their geographical environment. The results could provide theoretical basis for germplasm resources protection and elite germplasm breeding of B. chinense.Key words :Bupleurum chinense ; ISSR ; PCR amplification ; cluster analysis ; genetic diversity收稿日期:20230615; 接受日期:20231016基金项目:山西省自然基金面上项目(20210302123233;20230602324694);山西道地药材品质形成机制创新团队项目(2022TD2009);山西中医药大学中药资源学科建设项目(2023XKJS -24);山西中药材产业技术体系项目(CZ2023018); 山西中医药大学太行本草专项(2022PY -TH -30)。
邓恩桉种源试验林生长性状遗传变异及选择卢晨升;陈健波;梁机;郭东强;项东云【摘要】为筛选出邓恩桉(Eucalyptusdunnii)优良遗传材料,对6年生邓恩桉种源试验林的适应性及生长性状进行调查测定并统计分析.结果表明:试验林保存率为52.56%,各种源的整体适应能力差异显著;试验林平均树高为18.3 m,平均胸径为16.4 cm,平均单株材积为0.1875 m3,各生长性状种源间差异极显著,3个生长性状在种源和单株水平上受中等强度以下遗传控制.构建多性状综合指数方程,按照标准选出3个优良种源及75个优良单株,其中优良种源树高、胸径、材积的遗传增益分别为2.89%、3.98%、9.11%,优良单株树高、胸径、材积的遗传增益分别为4.66%、8.56%、16.01%,选优效果明显.%The adaptability and growth traits of 6-year-old Eucalyptus dunnii provenances plantation were in-vestigated and statistical analyzed in order to screen the excellent genetic materials. Results showed that the overall retention rate of experimental plantation was 52.56%,and the overall adaptability of various sources was significantly different.The average of tree height(H),diameter at breast height(DBH)and stem volume (V)was 18.3 m,16.4 cm and 0.187 5 m3,respectively.There were extremely significant differences among growth traits,and three traits were genetically controlled below medium intensity at the level of provenance and single plant.By building traits composite index equation,three super provenances and 75 superior individuals were selected according to the standard. The genetic gains in height,DBH and volume of these three super provenances were 2.89%,3.98% and9.11%,respectively;and for the 75 superior individuals,the genetic gainswere 4.66%,8.56% and 16.01%,respectively,which demonstrated distinct selection effect.【期刊名称】《广西林业科学》【年(卷),期】2018(047)001【总页数】6页(P18-23)【关键词】邓恩桉;种源;变异;种源选择【作者】卢晨升;陈健波;梁机;郭东强;项东云【作者单位】广西大学林学院,南宁530004;广西壮族自治区林业科学研究院,南宁530002;广西大学林学院,南宁530004;广西壮族自治区林业科学研究院,南宁530002;广西壮族自治区林业科学研究院,南宁530002【正文语种】中文【中图分类】S792.39邓恩桉(Eucalyptus dunnii)又名邓恩白桉,为桃金娘科(myrtaceae)桉属常绿阔叶乔木,原产于澳大利亚,具有干形通直、生长迅速、抗寒能力强、木材品质优良等优点[1],既可作纸浆材培育,也可作中大径材培育[2-3],是适宜我国中亚热带栽培的优良树种之一[4]。
遗传多样性分析的方法与步骤摘要:本文对生物的遗传多样性进行阐述,并综述了检测遗传多样性的形态学标记、细胞学标记、生物化学标记和分子标记4种遗传标记的发生与发展过程,并比较了各自的优缺点及其应用。
关键词:遗传多样性;形态学标记;细胞学标记;生物化学标记;DNA分子标记Genetic Diversity Analysis Method and StepsAbstract:In this paper, the biological genetic diversity were summarized, and elaborates the detection of genetic diversity morphology mark, cytology mark, biochemical markers and molecular marker and genetic markers of the occurrence and development of the process, and compare their advantages and disadvantages and application.Keywords:genetic diversity; Morphological markers; Cytology mark; Biochemical markers; DNA molecular markers前言遗传多样性是生态系统多样性和物种多样性的基础,任何物种都有其独特的基因库或遗传组织形式[1]。
广义的遗传多样性是指地球上所有生物所携带的遗传信息的总和,但通常所说的遗传多样性是指种内的遗传多样性,即种内不同种群之间或一个种群内不同个体的遗传变异[2]。
遗传多样性的表现形式是多层次的,可以从形态特征、细胞学特征、生理特征、基因位点及DNA序列等不同方面来体现,其中DNA多样性是遗传多样性的本质[3]。
万方数据 万方数据14中南林业科技大学学报第30卷物,然后再对不同的桉树基因组DNA进行全面有效的扩增,以保证实验结果的可靠、科学和高效。
随机选取3个不同的种源,用于筛选全部100条ISSR引物。
1.5ISSR—PCR扩增及数据处理采用筛选出的引物对桉树4个种的模板DNA进行ISSR—PCR扩增。
按照相同迁移位置上有扩增条带记为“l”、无则记为“0”的方法记录每个引物的电泳谱带,且仅记录清晰、重复性好的扩增条带,并将“0”、“1”数据输入Excel表格中用于下一步分析。
应用POPGENE软件计算Nei’S遗传距离和遗传一致度,绘制遗传关系进化树。
最后统计数据,应用软件POPGENE、MVSP32软件以及NTSYS—pc软件对所得数据进行总结分析,并绘制相关图形。
2结果与分析2.1桉树基因组DNA提取及质量检测本实验对18个桉树幼苗进行了基因组DNA抽提,通过纯化后最终用TE缓冲液定容至100pL,并电泳检测(见图1)。
结果表明,所提取的DNA条带清晰,无明显拖带,提取效果较好。
通过DUO一640核酸蛋白分析仪测定分析,所提取的18个桉树幼苗叶片DNA样品的浓度为20~70ng/uL,且纯度R(oD:。
/0D:。
)值在1.7~1.8之间(见表1),表明样品中蛋白质和RNA含量较少,浓度和纯度都满足特异PCR扩增的要求。
为了统一反应体系,最后将18个种源根据测得的浓度相应地稀释成终浓度10ng//.tL。
图1桉树18个样品的基因组DNA的电泳图Fig.1TheeIectrophoresispatternofgenomicDNAfrom18speciesofEucalyptus2.2桉树ISSR—PCR扩增结果利用已经优化的桉树ISSR—PCR扩增体系,对100条合成的UBC随机引物进行筛选,获得12条适合18个桉树样品ISSR扩增反应的引物,编号分别为811、814、818、825、826、827、828、850、864、88l、895、900,该12条引物的扩增条带特异,条带数适中,背景清晰,重复性好(见图2)。
用rep-PCR方法研究细菌遗传多样性的探讨
李洁;熊智
【期刊名称】《西南林业大学学报》
【年(卷),期】2006(026)006
【摘要】对大肠杆菌、枯草杆菌、四联球菌、普通变形杆菌、产气肠杆菌基因组DNA进行repPCR扩增,并在模板样品中混入植物DNA作对照实验.结果表明:用rep-PCR方法分析细菌基因多样性,能在较大范围内避免植物基因的干扰.模板量梯度实验结果显示:扩增产物多态性与模板量相关.
【总页数】3页(P1-3)
【作者】李洁;熊智
【作者单位】西南林学院,资源学院,云南,昆明,650224;西南林学院,资源学院,云南,昆明,650224
【正文语种】中文
【中图分类】Q934.3
【相关文献】
1.芒果细菌性黑斑病病菌rep-PCR遗传多样性 [J], 漆艳香;张贺;蒲金基;张欣;谢艺贤;陆英;喻群芳;张辉强
2.基于BOX-PCR和REP-PCR技术青枯雷尔氏菌遗传多样性分析 [J], 林海云;车建美;刘波;郑雪芳;肖荣凤
3.红掌细菌性疫病病原菌遗传多样性的RAPD和Rep-PCR分析 [J], 陈艳梅;高月荣;尹俊梅;牛俊海
4.利用rep-PCR技术研究我国9省柑橘溃疡病菌遗传多样性 [J], 姚廷山;胡军华;唐科志;冉春;李中安;周常勇
5.陕西省猕猴桃细菌性溃疡病菌(Pseudomonas syringae pv.actinidiae)Rep-PCR的遗传多样性分析 [J], 高小宁;郑州;赵志博;秦虎强;黄丽丽
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四川桉树基因收集及培育技术
李晓清;胡天宇
【期刊名称】《四川林业科技》
【年(卷),期】2004(025)001
【摘要】经过近100年的引种历史,四川共收集了130余种桉树,目前仍保留有近40种桉树.这些树种在四川省的林业建设中发挥了重要作用.在四川具有发展前途的桉树有:巨桉、直干兰桉、柳桉、史密斯桉、邓恩桉、迪恩桉、亮果桉、赤桉、大花序桉、尤曼桉等.根据桉树生物学特性以及四川多年来桉树栽培情况,将四川桉树栽培地区划分为盆地、攀西河谷阶地和干热河谷等三个栽培区.针对不同的栽培区,提出相应的适宜桉树种,并对巨桉、直干蓝桉、赤桉树种不同培育目标的栽培技术进行了总结.
【总页数】6页(P26-31)
【作者】李晓清;胡天宇
【作者单位】四川省林业科学研究院,四川,成都,610081;四川省林业科学研究院,四川,成都,610081
【正文语种】中文
【中图分类】S722.7
【相关文献】
1.“十三五”国家重点研发计划“桉树高效培育技术研究”项目启动——引领桉树高效、科学、可持续发展 [J],
2.四川桉树基因收集及利用 [J], 李晓清;胡天宇
3.桉树大径材和无节材培育技术探究 [J], 莫康克
4.桉树大径材培育技术探讨 [J], 何汉冲
5.桉树扦插育苗技术与丰产林培育技术探讨 [J], 梁炳新
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第43卷第4期2016年12月福建林业科技Jour of Fujian Forestry Sci and TechVol.43No.4Dec.,2016doi:10.13428/j.cnki.fjlk.2016.04.004邓恩桉遗传多样性的ISSR分析邓紫宇1,2,3,郭东强1,2,3,陈健波1,2,3,罗清4,项东云1,2,3(1.广西壮族自治区林业科学研究院,广西南宁530001;2.国家林业局中南速生材繁育实验室,广西南宁530001;3.广西优良用材林资源培育重点实验室,广西南宁530001;4.广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西南宁530001)摘要:探讨邓恩桉亲缘关系及遗传多样性,为其种质资源利用和分子育种提供参考。
利用ISSR分子标记技术分析邓恩桉6个种源遗传多样性。
筛选出8条特异引物共扩增90条清晰条带,其中76条为多态条带,多态性比率为84.44%,平均等位基因观察值为1.8444,平均有效等位基因为1.4928,基因多样性指数为0.2879,Shannon信息指数为0.4306。
6个邓恩桉种源遗传相似系数在0.7271 0.8719之间,平均相似系数为0.7926。
UPGMA聚类分析发现,在相似系数为0.80时邓恩桉6个种源可划分为2个类群。
邓恩桉种源间遗传多样性差异较小,聚类结果与邓恩桉种源地理分布密切相关。
关键词:邓恩桉;遗传多样性;ISSR中图分类号:S792.39文献标识码:A文章编号:1002-7351(2016)04-0017-04Genetic Diversity of Eucalyptus dunnii Based on ISSRDENG Ziyu1,2,3,GUO Dongqiang1,2,3,CHEN Jianbo1,2,3,LUO Qing4,XIANG Dongyun1,2,3(1.Guangxi Forestry ScienceResearch Institute,Nanning530001,Guangxi,China;2.Key Laboratory of Central South Fast-growing Timber Cultivation of State Forestry Administrationof China,Nanning530001,Guangxi,China;3.Guangxi Key Laboratory of Superior Timber TreesResource Cultivation,Nanning530001,Guangxi,China;4.Guangxi Subtropical CropsResearch Institute,Nanning530001,Guangxi,China)Abstract:The paper focused on assess the genetic diversity and variability of Eucalyptus dunnii to provide referents for resource utili-zation and molecular breeding.ISSRmarker was used to study the genetic diversity of6Eucalyptus dunnii provenances.A total of90 bands were amplified by8primers,of which76are polymorphic bands(84.44%of polymorphism).The average value of observed number of alleles,average value of effective number of alleles,Nei's gene diversity and Shannon's information index were1.8444,1.4928,0.2879and0.4306respectively.The Nei's genetic similarity coefficients ranged from0.7271 0.8719with an average of 0.7926.According to the UPGMA method,we made the cluster analysis by using the NTSYS software,6Eucalyptus dunnii prove-nances could be divided into two groups at the similarity coefficient of0.80.The genetic diversity among inter-provenances of Euca-lyptus dunnii was lower,and the geographical distribution of Eucalyptus dunnii was closely related to the cluster result. Keywords:Eucalyptus dunnii;genetic diversity;ISSR邓恩桉(Eucalyptus dunnii)天然分布于澳大利亚新南威尔士州东北部及昆士兰州东南部,由于分布区域有限,天然林面积小,在澳大利亚邓恩桉被列入稀有树种行列[1-2]。
邓恩桉生长快、干形好、材质优、具有较好的抗寒性能,可作为纸浆材和轻型建筑用材[3-4],是我国低海拔夏雨型凉冷地区桉树人工林主要栽培树种。
为追求获得快速的经济利益,我国桉树人工林绝大部分采用短轮伐期经营,造成了一定的生态问题,培育桉树中大径材不仅可以缓解生态压力而且还能提高经济效益,邓恩桉是培育中大径材较好的树种。
收稿日期:2016-01-03;修回日期:2016-03-01基金项目:广西科学研究与计划开发项目(桂科合1347004-3);广西优良用材林资源培育重点实验室自主课题项目(13-A-01-02);广西林科院基本科研业务费项目(林科201408号)第一作者简介:邓紫宇(1984—),男,广西全州人,广西壮族自治区林业科学研究院工程师,硕士,从事林木遗传育种研究。
E-mail:365204914@。
通信作者:项东云(1960—),男,广西扶绥人,广西壮族自治区林业科学研究院教授级高级工程师,从事林木遗传育种研究。
E-mail:1753306481@。
福建林业科技第43卷ISSR(inter-simple sequence repeat )是目前应用较广的分子标记技术,其多态性源于基因组中简单序列重复多态性,克服了RFLP 标记技术限制的同时结合RAPD 和SSR标记的优点,操作简便、快捷,实验稳定,结果可靠。
近年来,我国南方受冬季霜冻影响,桉树人工林损失严重,耐寒桉树种邓恩桉成为桉树育种研究的重点,其研究主要集中在木材性能[5-9]、抗寒性能[10-11]以及植物组织培养[12-13]等方面。
分子标记技术已广泛应用于桉树群体多样性分析[14-17],曾艳玲等[18]对包括邓恩桉在内的8份桉树材料进行ISSR分析,并将邓恩桉与赤桉分为一类,但邓恩桉群体多样性研究未见报道。
因此,笔者对引种的2个邓恩桉天然分布区内6个种源间伐后保存的优良育种群体利用ISSR标记技术探讨其亲缘关系及遗传多样性,为今后从分子水平开展邓恩桉材性和抗寒性能研究及合理保护利用邓恩桉种质资源和良种选育提供参考。
1材料与方法1.1试验材料供试材料取自环江县华山林场雅龙分场2009年建立的邓恩桉种源试验林(表1),参试的6个邓恩桉种源分别来自昆士兰州(2个)和新南威尔士州(4个)。
表1邓恩桉种源基本信息种源地种源号经、纬度海拔/m 昆士兰州(QLD )GED9504152ʎ24'E 、28ʎ17'S 700GED9506152ʎ24'E 、28ʎ04'S 700新南威尔士州(NSW )GED9501152ʎ30'E 、28ʎ18'S 575GED9502145ʎ13'E 、35ʎ01'S 100GED9507152ʎ43'E 、29ʎ59'S 500GED9509145ʎ00'E 、35ʎ28'S901.2样品采集及基因组DNA 提取每个种源选取长势良好的12个单株进行取样,共计72份材料,采集幼嫩叶片立即密封并置于放有冰袋的冰盒中,带回实验室于-72ħ保存备用。
72份材料基因组DNA 的提取采用改良CTAB 法,用1.0%的琼脂糖凝胶电泳初步检测样品DNA 的浓度与纯度(图1),用核酸检测仪进行定量检测并将样品DNA 稀释至50ng ·μL -1,保存于-20ħ。
图1邓恩桉基因组DNA琼脂糖凝胶电泳结果图2引物UBC848扩增结果1.3ISSR-PCR扩增ISSR-PCR反应体系经过比较和优化确定为20μL ,包括1ˑbuffer 、1U Taq 酶、2.0mmol ·L -1MgCl 2、0.1mmol ·L -1dNTP 、0.5mmol ·L -1引物、25ng 模板DNA 。
ISSR-PCR扩增程序为:94ħ预变性3min ,然后进行30个循环,94ħ变性30s ,52ħ复性30s ,72ħ延伸1min ,循环结束后72ħ延伸1min ,最后4ħ保存。
选取2个模板DNA 进行引物筛选,筛选出扩增条带多、条带清晰的引物用于ISSR-PCR扩增,扩增产物用1.5%的琼脂糖凝胶于150V 恒定电压下电泳1h 左右,电泳结果可通过自动凝胶成像系统进行拍照(图2)。
100个ISSR引物选自加拿大大不列颠哥伦比亚大学(UBC )公布的随机引物,引物合成及相关试剂药·81·第4期邓紫宇,等:邓恩桉遗传多样性的ISSR分析品购自生工生物工程(上海)股份有限公司。
1.4数据处理统计电泳条带,按照条带的有无赋值,扩增条带无记为“0”,有记为“1”,记录原始“0/1”矩阵,建立72份材料的ISSR识别卡。
利用POPGENE 32和NTSYS 2.1遗传分析软件对“0/1”矩阵进行种源水平遗传多样性分析,并用UPGMA (非加权算术平均聚类)进行聚类,数据格式输入及软件使用参照说明书。
2结果与分析2.1扩增产物多态性分析8条特异引物共扩增出90条谱带,其中多态性谱带76条,平均每条引物扩增9.5条多态性谱带,多态性比率为84.44%(表2),表明72份材料之间存在遗传差异。