SDS-PAGE凝胶的有效分离范围
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百泰派克生物科技
SDS-PAGE分析
SDS-PAGE(sodium dodecyl sulphate-polyacrylamide gel electrophoresis)十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳是Ulrich K. Laemmli开发的一种不连续电泳
系统,常用于分离和鉴定分子量在250 kDa之内的蛋白质混合物。
十二烷基硫酸钠(SDS,也称为十二烷基硫酸钠)和聚丙烯酰胺凝胶的联合使用可以消除结构和电
荷的影响,使蛋白质仅根据其分子量的差异进行分离,常用于复杂蛋白质混合物的高分辨率分离实验。
SDS-PAGE又称1D SDS-PAGE(一维凝胶电泳),根据蛋白质的相对分子量大小实现
蛋白质的分离,与高分子量蛋白质相比,较低分子量的分子在凝胶中迁移得更快。
因此,电泳结束后高分子质量的蛋白质仍然靠近点样孔。
在1D SDS-PAGE的基础上发展起来的2D SDS-PAGE(二维凝胶电泳)根据蛋白质的等电点和分子质量两个属
性对其进行分离,在2D凝胶电泳中,蛋白质先在固定pH梯度上进行第一维分离,再使用垂直或水平聚丙烯酰胺凝胶电泳进行二维分离,这种分离方法大大提高了蛋白质的分辨率。
SDS-PAGE已广泛应用于蛋白质样品纯度的评估、蛋白质表达的评估、蛋白质的免疫化学鉴定以及定量鉴定等。
百泰派克生物科技使用Bio-Rad Mini-PROTEAN® Tetra凝胶系统,提供基于1D和
2D的 SDS-PAGE分析服务技术包裹,用于多种蛋白质组学分析,包括蛋白质分子量测定、蛋白质鉴定、样品纯度分析、二硫键鉴定以及蛋白质定量等,欢迎免费咨询。
SDS-PAGE电泳问题总结蛋白质条带为什么走到下面逐渐变宽发散?回答:多数情况是因为小分子在胶里的运动不规律,这种情况常发生在高浓度胶或凝固不一致的胶里,你可以加大阴极的缓冲液浓度,可能会有点改善胶凝的快慢不在于TEMED多少,在于APS的量,APS提供自由基,TEMED帮助自由基作用,是催化剂,对凝固速度影响不是太大,可以试试加大APS的量丙烯酰胺在凝胶中的百分比分离胶的分辨范围15 % 15~45 kDa12.5% 15~60 kDa10 % 18~75 kDa7.5% 30~120kDa5 % 60~212kDa来源于《蛋白质技术手册》汪家政每种浓度的变性胶的分离范围不是指能跑出哪个范围分子量的蛋白质,而是指在这个区间内,蛋白质迁移率基本和分子量成正比,也就是线性关系,为了数据的可靠性,大家尽量根据这个来选择自己配胶的浓度。
下层也就是阳极缓冲液的作用当然是导电,用普通TRIS缓冲液做阳极缓冲液,一样跑得好,阴极就不一样了,需要提供离子强度和SDS环境,而在电泳过程中,阴极缓冲液的一些离子损失,而且与样品接触,不适合再次使用<br />至于有些时候跑太大浓度的胶,因为药品,BUFFER配制过程的一些问题,导致会出现蛋白带无法电泳到分离胶的最下方,胶跑得难看情况比较多,一般来说,15%的胶已经能够跑出大约15KDa左右的蛋白,对于普通SDS-PAGE已经几乎到了极限,还跑不出来的MARK带,就不必去追究商品的问题了SDS-PAGE胶的凝结速度受温度影响很大,随着温度的升高,凝结速度越来越快,温度降低则反之。
所以,夏天时胶凝结的比较快,而冬天脚的凝结速度则变慢,甚至不能凝结,解决此类问题较可行的方法是:冬天在原配方的基础上加倍过硫酸铵和TEMED的使用量,可很好的解决胶凝结速度过慢的问题。
做SDS-PAGE的时候,除了蛋白量上样一致,最好体积也一致,这样跑出来的胶各个泳道之间的band能做到一样宽,方便后面的比较,特别是WB。
蛋白质条带为什么走到下面逐渐变宽发散?回答:多数情况是因为小分子在胶里的运动不规律,这种情况常发生在高浓度胶或凝固不一致的胶里,你可以加大阴极的缓冲液浓度,可能会有点改善胶凝的快慢不在于TEMED多少,在于APS的量,APS提供自由基,TEMED帮助自由基作用,是催化剂,对凝固速度影响不是太大,可以试试加大APS的量丙烯酰胺在凝胶中的百分比分离胶的分辨范围15 % 15~45 kDa12.5% 15~60 kDa10 % 18~75 kDa7.5% 30~120kDa5 % 60~212kDa来源于《蛋白质技术手册》汪家政每种浓度的变性胶的分离范围不是指能跑出哪个范围分子量的蛋白质,而是指在这个区间内,蛋白质迁移率基本和分子量成正比,也就是线性关系,为了数据的可靠性,大家尽量根据这个来选择自己配胶的浓度。
下层也就是阳极缓冲液的作用当然是导电,用普通TRIS缓冲液做阳极缓冲液,一样跑得好,阴极就不一样了,需要提供离子强度和SDS环境,而在电泳过程中,阴极缓冲液的一些离子损失,而且与样品接触,不适合再次使用<br />至于有些时候跑太大浓度的胶,因为药品,BUFFER配制过程的一些问题,导致会出现蛋白带无法电泳到分离胶的最下方,胶跑得难看情况比较多,一般来说,15%的胶已经能够跑出大约15KDa左右的蛋白,对于普通SDS-PAGE已经几乎到了极限,还跑不出来的MARK带,就不必去追究商品的问题了SDS-PAGE胶的凝结速度受温度影响很大,随着温度的升高,凝结速度越来越快,温度降低则反之。
所以,夏天时胶凝结的比较快,而冬天脚的凝结速度则变慢,甚至不能凝结,解决此类问题较可行的方法是:冬天在原配方的基础上加倍过硫酸铵和TEMED的使用量,可很好的解决胶凝结速度过慢的问题。
做SDS-PAGE的时候,除了蛋白量上样一致,最好体积也一致,这样跑出来的胶各个泳道之间的band能做到一样宽,方便后面的比较,特别是WB。
蛋白印迹,也称Western,Western blot、Western blotting、Western印迹,是检测蛋白的重要方法之一。
经过PAGE分离的蛋白质样品,转移到固相载体(例如硝酸纤维素薄膜)上,固相载体以非共价键形式吸附蛋白质,且能保持电泳分离的多肽类型及其生物学活性不变。
以固相载体上的蛋白质或多肽作为抗原,与对应的抗体起免疫反应,再与酶或同位素标记的第二抗体起反应,经过底物显色或放射自显影以检测电泳分离的特异性目的基因表达的蛋白成分。
该技术也广泛应用于检测蛋白水平的表达。
(一)蛋白样品的制备可以选用适当的裂解液,裂解贴壁细胞、悬浮细胞或组织样品。
对于某些特定的亚细胞组份蛋白,例如细胞核蛋白、细胞浆蛋白、线粒体蛋白等,可以参考相关文献提取这些亚细胞组份蛋白,也可以使用试剂盒进行抽提。
为确保每个蛋白样品的上样量一致,收集的蛋白样品均应测定其蛋白浓度。
在微量离心管中,用2×SDS加样缓冲液按1:1(v/v)稀释待测蛋白质样品,于100℃煮沸5-10min。
以充分变性蛋白。
使用浓缩的蛋白上样缓冲液可以减小上样体积,在相同体积的上样孔内可以加入更多的蛋白样品。
(二)SDS-PAGE电泳1. SDS-PAGE凝胶配制(1)取出玻璃板,用自来水洗净后,蒸馏水冲洗一次,置37 度烘干或晾干(戴手套操作),梳子应用水洗净,临用前用乙醇擦拭,挥发至干。
组装电泳装置中的玻璃平板夹层,并固定在灌胶支架上,确保不漏胶。
(2)按表1配制分离胶液体并脱气,其中AP和TEMED灌胶前再加入,轻轻摇匀,以免产生气泡。
表1 凝胶的制备按所需分离的蛋白质分子大小配制合适浓度的凝胶(表2),将凝胶溶液平稳地注入两层玻板中(以平稳流速从垫片的边缘注入),缓慢持续注入至液面距梳齿2-3厘米处,再在液面上小心注入一层水饱和异丁醇(厚约1cm),以隔绝空气,静置直至凝胶的形成(聚合后,可见在异丁醇与凝胶的界面间有一清晰的折光线)。
SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
一、材料准备1M Tris-HCl, pH8.8、10% SDS、Ammonnium persulfate (过硫酸铵)和1M Tris-HCl, pH6.8室温保存。
30% Acr-Bis (29:1)和TEMED 4℃避光保存。
过硫酸铵配制成10%溶液后,分装成小管-20℃保存,通常半年内有效。
1.10%十二烷基硫酸钠(SDS):阴离子去污剂,可与蛋白质结合,形成SDS-蛋白质复合物。
由于SDS带有大量负电荷,当与蛋白质形成复合物后好比蛋白质穿上带负电的“外衣”,蛋白质本身带有的电荷则被掩盖,即消除了蛋白质分子之间电荷差异。
作用有四:去蛋白质电荷、解离蛋白质之间的氢键、取消蛋白分子内的疏水作用、去多肽折叠。
配制方法:10g SDS,用双蒸水溶解并定容至100ml,室温保存。
2.10%过硫酸铵(Ap):引发剂。
能产生自由氧基,使丙烯酰胺聚合。
配制方法:0.1 g过硫酸铵溶解于 1ml双蒸水中。
过硫酸铵会缓慢分解,应新鲜配制。
过硫酸铵配制成10%溶液后,应当-20℃保存。
同时应尽量减少室温存放时间,以防失效。
3.N、N、N’、N’-四甲基乙二胺(TEMED):促凝作用,加速聚丙烯酰胺的凝固,其碱基催化AP产生氧自由基,激活单体形成自由基,发生聚合。
TEMED易挥发,使用后请盖紧瓶盖。
另外凝胶凝聚的速度和温度及光照关系密切,可通过适当调节TEMED的用量,控制在不同的室内环境下凝胶凝聚的速度。
配制方法:原液使用。
应使用电泳级TEMED。
4.30%丙烯酰胺凝胶贮液(Arc-Bis贮液) :含有29的丙烯酰胺和1的甲叉基聚丙烯酰胺。
丙烯酰胺单体(Arc)在交联剂作用下形成聚丙烯酰胺。
N,N’-甲叉双丙烯酰胺(Bis),交联剂。
丙烯酰胺与为蛋白质电泳提供载体,其凝固的好坏直接关系到电泳成功与否,与促凝剂及环境密切相关。
试剂:1. 5x样品缓冲液(10ml):0.6ml 1mol/L的Tris-HCl(Tris-HCl缓冲液(0.05mol/L,25℃)50ml 0.1mol/L三羟甲基氨基甲烷(Tris)溶液与x ml 0.1mol/L 盐酸混匀后,加水稀释至100ml)(pH6.8),5ml 50%甘油,2ml 10%的SDS,0.5ml巯基乙醇,1ml 1%溴酚蓝,0.9ml蒸馏水。
可在4℃保存数周,或在-20℃保存数月。
2. 凝胶贮液:在通风橱中,称取丙烯酰胺30g,甲叉双丙烯酰胺0.8g,加重蒸水溶解后,定容到100ml。
过滤后置棕色瓶中,4℃保存,一般可放置1个月。
3. pH8.9分离胶缓冲液: Tris 36.3g ,加1mol/L HCl 48ml,加重蒸水80ml 使其溶解,调pH8.9,定容至100ml,4℃保存。
4. pH6.7浓缩胶缓冲液: Tris5.98g ,加1mol/L HCl 48ml,加重蒸水80ml 使其溶解,调pH6.7,定容至100ml,4℃保存。
5. TEMED(四乙基乙二胺)原液。
6. 10%过硫酸铵(用重蒸水新鲜配制)。
7. pH8.3 Tris-甘氨酸电极缓冲液:称取Tris 6.0g,甘氨酸28.8g,加蒸馏水约900ml,调pH8.3后,用蒸馏水定容至1000ml。
置4℃保存,临用前稀释10倍。
8. 考马斯亮蓝G250染色液:称100mg考马斯亮蓝G250,溶于200ml蒸馏水中,慢慢加入7.5ml 70%的过氯酸,最后补足水到250ml,搅拌1小时,小孔滤纸过滤。
器材电泳仪,电泳槽,水浴锅,摇床。
样品制备将蛋白质样品与5X样品缓冲液(20ul+5ul)在一个Eppendorf管中混合。
放入100℃加热5-10min,离心,取上清点样。
电泳1. 将玻璃板、样品梳、Spacer用洗涤剂洗净,用ddHO冲洗数次,再用乙醇擦2拭,晾干;2. 将两块洗净的玻璃板之间加入Spacer,装好玻璃板;3. 按如下体积配制10%分离胶8.0 ml,混匀;O 3.0 ml ddH21.0 mol/LTris-HCl pH=8.82.1 ml30% Acr-Bis 2.8 ml 10% SDS 80 ul10%AP 56 ul TEMED 6 ul4. 向玻璃板间灌制分离胶,立即覆一层重蒸水,大约20 min后胶即可聚合;5. 按如下体积配制6%浓缩胶3.0 ml,混匀;O 2.0 ml ddH21.0 mol/LTris-HCl pH=6.8 400 ul30% Acr-Bis 600 ul 10% SDS 36 ul10%AP 24 ul TEMED 4 ul6. 将上层重蒸水倾去,滤纸吸干,灌制浓缩胶,插入样品梳;7. 装好电泳系统,加入电极缓冲液,上样20 μl;8. 稳压200V,溴酚蓝刚跑出分离胶时,停止电泳,约需45 min~1hr;9. 卸下胶板,剥离胶放入染色液中,室温染色1~2 hr;加入脱色液,置于80 rpm 脱色摇床上,每20 min更换一次脱色液(10 ml 冰乙酸;45 ml乙醇;45 ml蒸馏水)至完全脱净。
不同浓度的Western blotting方法是一种常见的生物化学技术,它用于检测特定蛋白质在细胞、组织或生物样本中的表达水平。
Western blotting方法的关键步骤包括蛋白质分离、电泳、转膜和特异性抗体探测。
在这些步骤中,蛋白质分离是至关重要的一步,它直接影响Western blotting的检测灵敏度和特异性。
蛋白质分离通常采用SDS-PAGE凝胶电泳技术,该技术能够将不同大小和电荷的蛋白质分离开来。
在SDS-PAGE凝胶电泳中,使用不同浓度的凝胶可以影响蛋白质分离的能力。
一般来说,低浓度的凝胶可以有效分离大分子量的蛋白质,而高浓度的凝胶则可以有效分离小分子量的蛋白质。
1. 低浓度Western gel的分离能力低浓度的Western gel通常是8-10的聚丙烯酰胺凝胶,它适用于分离分子量较大的蛋白质。
在低浓度Western gel中,孔隙大小较大,电泳时蛋白质能够更快地移动,从而有效地分离出大分子量的蛋白质。
这种凝胶的优势在于其较好的分离能力和较短的电泳时间,同时也可以在较大分子量蛋白质的定量上有更好的表现。
2. 高浓度Western gel的分离能力高浓度的Western gel通常是12-15的聚丙烯酰胺凝胶,它适用于分离分子量较小的蛋白质。
在高浓度Western gel中,孔隙大小较小,能够更好地分离出小分子量的蛋白质。
这种凝胶的优势在于其较好的分离能力和较高的分辨率,能够有效地分离出分子量接近的蛋白质,从而有助于提高Western blotting的检测灵敏度和特异性。
3. 不同浓度Western gel的选择选择合适浓度的Western gel对于蛋白质的分离至关重要。
一般来说,如果要分离大分子量的蛋白质,可以选择低浓度的Western gel;如果要分离小分子量的蛋白质,可以选择高浓度的Western gel。
在实际操作中,还可以根据待检测蛋白质的分子量范围进行优化选择,以求得最佳的分离效果。
不连续SDS。
NGE垂直电泳及考马斯亮蓝染色法[实验目的]1.掌提SDS—PAGE的基本原理。
2.掌握垂直扳状凝胶电泳槽的使用和凝胶配制方法。
3.掌握考马斯克蓝法对SDS聚丙烯配胺凝胶染色的方法。
4.了解聚丙烯酰胺凝胶电泳的应用范围。
[实验原理]带电颗粒在电场的作用下,向与其电荷相反的电极方向移动的现象称为电泳(elecbphoKsis)。
电泳的速度与带电颗粒的电荷强弱、分离介质的阻力、电解液的教度和电场强度等因素相关。
生物大分子电泳的速度除上述因素之外,还与分子形状、相对分子质量大小、分子的带电性质和数目等因索有关。
基于各种带电粒子在电场中迁移速度的不同,可将蛋白质、核酸等物质进行分离,此实验技术称为电泳技术。
聚丙烯酰胺凝胶是由丙烯酞胺单体和少量交联剂N,N’—甲叉双丙烯酰胺,在催化剂(化学聚合剂过硫酸铵或光聚合剂核黄素)和加速剂(N,N,N’,N,·四甲基乙二胺)的作用下聚合含酰胺基侧链的脂肪族长链,相邻的两个链通过甲叉桥交联起来而形成三维网状结构的凝胶。
改变单体Acr浓度或单体与交联剂的比例,就可以得到不同孔径的凝胶。
以此凝胶为支持物的电泳称为聚丙烯酰胺凝胶电泳,可用来分离核酸(<3%)和蛋白质(7%—15%)。
待分离分子通过凝胶孔的能力取决于凝胶孔的大小和形状,也取决于被分离分子的形状、大小以及分子所带的电荷等因素。
蛋白质是两性电解质分子,大多数蛋白质的等电点在5左右,在PH 6.8的聚丙烯酰胺凝胶中带有负电荷,在电场中能向正极迁移。
由于相对分子质量的不同和蛋白质形状以及所带静电荷的多少等因素的差异,不同蛋白质分子在聚丙烯酰胺凝胶中的电泳速度也有所差异,从而使不同性质的蛋白质得以分离。
PAGE分离蛋白质基于三种物理效应:1.凝胶对蛋白质样品的分子筛效应:聚丙烯配胺凝胶是三维网状结构的凝胶。
分子量大、形状不规则的分子通过凝胶孔洞的阻力大,移动慢;分子量小、球形的分子移动快。