乙型脑炎病毒分型基因芯片的制备_郭欢欢
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乙型脑炎病毒感染U251细胞microRNA表达谱的研究的开题报告一、研究背景和意义乙型脑炎是由乙型脑炎病毒感染引起的一种急性传染病,主要通过蚊子叮咬传播。
该病毒主要靶向中枢神经系统,造成严重的脑炎和炎症反应。
尽管疫苗和药物的开发显著改善了乙型脑炎的治疗和预防,但仍然缺乏有效的治疗方法。
因此,深入了解乙型脑炎病毒感染机制和病理生理学变化,对于预防和治疗该病具有重要的意义。
microRNA (miRNA) 是一类长度约20-25个核苷酸的非编码RNA 分子,能够通过抑制转录或翻译靶基因来发挥重要的调控作用。
已知miRNA在许多疾病的发生和发展中都有着重要的作用。
然而,在乙型脑炎病毒感染过程中,miRNA的调控机制仍然不清楚。
因此,研究乙型脑炎病毒感染过程中U251细胞miRNA表达谱的变化,可以进一步揭示乙型脑炎病毒感染的发病机制,为乙型脑炎的治疗和预防提供新的思路和靶点。
二、研究目的本研究旨在分析乙型脑炎病毒感染U251细胞miRNA表达谱的变化,并进一步研究miRNA与病毒感染过程中相关的信号通路,以期为乙型脑炎的诊断、治疗和预防提供新的理论和实验基础。
三、研究内容和方法(1)U251细胞感染乙型脑炎病毒后,通过高通量测序技术分析miRNA表达谱的变化,筛选出与病毒感染相关的miRNA。
(2)对筛选出来的差异表达miRNA进行生物信息学分析,包括miRNA家族、靶基因预测、通路分析等。
(3)通过qRT-PCR技术验证miRNA的差异表达,并确定miRNA的靶基因。
(4)对miRNA靶基因的信号通路进行分析,揭示与乙型脑炎病毒感染相关的生物学过程。
四、预期结果和意义本研究预计将分析乙型脑炎病毒感染U251细胞miRNA表达谱的变化,并进一步研究miRNA与病毒感染过程中相关的信号通路。
这将有助于深入了解乙型脑炎病毒感染过程,为乙型脑炎的筛查、诊断、治疗和预防提供新的理论和实验基础。
同时,本研究还将提供有关miRNA参与感染机制和信号通路的重要信息,以推动miRNA作为治疗方法的发展,并有望为其他病毒感染的光谱带来新的结果。
2001年复旦大学理科科研光荣榜一、2001年国家科技进步奖(1项)1、二等奖(1项)(1)甲型肝炎减毒活疫苗保护效果及免疫策略研究徐志一汪萱怡李荣成孟宗达张勇李燕婷马景臣龚健赵守军赵玉良二、2001年上海市科技进步奖(共36项)1、一等奖(4项)(1)阿片类物质介导的神经信号转导的调控和耐受成瘾机理研究马兰裴钢向斌范国煌郭骏(2)硅基低维结构材料的研制、物性研究及新型器件制备陆昉蒋最敏王迅龚大卫樊永良(3)基因芯片(微矩阵)的研制和应用研究毛裕民谢毅李瑶裘敏燕楼屹应康陈沁曹跃琼唐榕张俊平郭学青黄燕戴建凉秦红友李险峰(4)上海科技馆工程建设与研究(第五完成单位)朱松等2、二等奖(19项)(1)病毒性心肌炎和扩张性心肌病的发病机理、诊断和治疗研究杨英珍张寄南陈瑞珍荣烨之陈曙霞杨笛刘治全廖玉华李隆贵(2)孤啡肽(OFQ)参与痛觉调制和针刺镇痛及其中枢机制吴根诚王彦青朱崇斌王金兰杨芝兰(3)Genistein抑制乳腺癌细胞生长和浸润及其相关机制的基础研究邵志敏沈镇宙吴炅韩企夏(4)糖尿病肾病发病机制及防治的系列研究林善锬顾勇陈靖马骥陆福明吴永贵黄宇峰祁忠华程梅芬周江华(5)微创冠状动脉搭桥术的临床应用赵强王宜青夏利民唐耀亮姜桢王春生(6)放射性核素心肌脂肪酸代谢显像剂I-123-BMIPP的研制和临床前研究陈绍亮周桢堂许兰文孙晓光庄道玲修雁李文罡石洪成乔伟伟(7)大肠杆菌0157快速检测方法的建立及其在流行病学研究中的应用俞顺章卢林耿张幼辰陈楚良周晓明卫国荣林福云(8)天癸方治疗多囊卵巢综合征高雄激素高胰岛素无排卵症的机理研究俞瑾魏美娟侯景文孙斐王莉杨淑萍周丽蓉张月萍陆利民王静(9)补肾中药调整性早熟儿童青春发育进程和改善骨骼发育的作用及机理研究蔡德培陈伯英施达仁季志英俞彰(10)肝癌诱导肿瘤血管形成的研究及干预治疗孙惠川汤钊猷王鲁周俭叶胜龙马曾辰李晓明牛旗薛琼(11)金属蛋白质的结构-性质-反应-功能关系研究黄仲贤王韵华谢毅夏宗芗吴厚铭(12)微波硫灯的研究与开发陈大华朱同茂左春兰杨秉华刘木清徐炳灿宋贤杰钱美娟李绮珍(13)有限元理论及其在板壳问题中的应用李立康(14)酵母表达人α干扰素的研究和开发李育阳高卜渝霍克克徐伦李宗林谈珉王洪海曹之舫袁汉英王强(15)氮化物新型材料的合成研究李富铭王培南吴嘉达许宁应质峰(16)天臣FDTC-n防伪标识徐良衡孔继烈苏小相邵剑心吴捷陈志忠(17)光华S-Audit安全审计系统张世永吴承荣田朝阳黄伟吴珺陈先国金迪郭巍廖志成(18)城市消防通信指挥系统(第二完成单位)王元彪等(19)面向上海城市社区信息服务示范工程(第三完成单位)胡运发等3、三等奖(13项)(1)基于单元库和IP宏核的自动化设计技术及其推广应用章倩苓任俊彦李宁郑增钰周翔沈磊黄群满(2)毛细管电泳电化学检测技术及其在生物医药中的应用陈刚张鲁雁(3)微侵袭神经外科治疗脑深部和颅底肿瘤周良辅杜固宏毛颖钟平李士其郭欢欢(4)白血病的反义抑制研究单易非王松梅高红阳潘銮凤粟文英汤华张宝春(5)N-乙酰氨基葡萄糖转移酶Ⅴ的调控研究顾建新陈惠黎周大鹏邵东敏江松(6)大肠杆菌耐药性变迁和耐药机制研究汪复张小林朱德妹(7)大鼠间质胶原酶表达质粒对实验性肝纤维化影响的体内外研究王吉耀杨长青郭津生刘建军贺伯明方国汀顾秀英(8)磁共振新技术在脑梗死诊断中的应用研究沈天真周林江陈星荣(9)人类视网膜变性中感光细胞的凋亡徐格致李维英曹安民王文吉钱江(10)超声多普勒血流信号的多参数分析及应用汪源源常才陈斯中王威琪张羽余建国刘智(11)生物塑化工程郑天中刘才栋陈小弟朱克明(12)Internet网上文本信息的分类、检索和摘要系统吴立德黄萱菁郭以昆刘秉伟韦雄观叶丹瑾王文欣(13)21世纪上海企业质量管理发展战略研究(第二完成单位)华宏鸣等二、上海市科技功臣奖(1名)谷超豪三、中国高校科技进步奖(共5项)1、一等奖(2项)(1)高分子链构象及其粘弹性的统计力学理论杨玉良丁建东张红东于同隐(2)建立和完善农村医疗保障制度的政策研究和实践郝模罗力姜晓明张勇尹爱田姚树坤宋金良郑益川王小宁马安宁王志锋章滨云李鹏翔吴延风华颖包江波陈恩东傅鸿鹏邵晶晶(3)不同地理与生态分布植物类群的分子系统发育研究(第二完成单位)钟扬2、二等奖(3项)(1)临床病原菌耐药性变迁的研究及其临床意义汪复朱德妹张婴元李胜利杨帆张小林方渊江华吴湜(2)黄芪治疗病毒性心肌炎杨英珍郭棋陈瑞珍宿燕岗虞勇叶玉蟾陈灏珠彭天庆芮涛(3)反应性星形胶质化的系列研究叶诸榕马国钧李立新朱建辉吴建英四、中华医学科技奖(共6项)1、一等奖(1项)(1)阿片类药物耐受和成瘾的分子机制研究马兰裴钢向斌范国煌陆林郭骏吴亚兰程智洁辛顺妹2、二等奖(2项)(1)肝癌诱导肿瘤血管形成的研究及干预治疗孙惠川汤钊猷王鲁周俭叶胜龙马曾辰李晓明牛旗薛琼钦伦秀(2)糖尿病肾病发病机制及防治的系列研究林善锬顾勇陈靖马骥陆福明吴永贵黄宇峰祁忠华程梅芬周江华3、三等奖(3项)(1)病毒性心肌炎和扩张型心肌病的发病机理、诊断和治疗研究杨英珍张寄南陈瑞珍荣烨之陈曙霞刘治全杨笛廖玉华(2)N-乙酰氨基葡萄糖转移酶Ⅴ的调控研究顾建新陈惠黎周大鹏邵东敏江松敏王俏红姚敏(3)孤啡肽(OFQ)参与痛觉调制和针刺镇痛及其中枢机制吴根诚王彦青朱崇斌王金兰杨芝兰周敏明曹小定张秀琳五、其他省部级科学技术进步奖1、2001年度贵州省科技进步二等奖(1项)(1)恶性虐原虫(海南株)CDNA表达文库的构建及鉴定谢毅等2、2001年度吉林省科技进步一等奖(第三完成单位)(1)中国野生大豆基础生物学研究及其在大豆遗传改良中的应用曹凯鸣等3、2001年度江苏省科技进步三等奖(第二完成单位)(1)慢性胃炎脾虚证分型于临床证方验证(治疗)的现代病理生理学基础张武宁陈一4、1999年度江苏省科技进步三等奖(第二完成单位)(1)脾气虚证慢性胃病肠生化的临床于实验研究张武宁陈一六、上海市发明创造专利奖(9项)1、发明专利奖(4项)⑴一等奖(1项)①一种制备重组链激酶的方法宋后燕⑵三等奖(3项)①一种无粘结剂疏水硅沸石吸附剂的制备方法龙英才②金刚石红外增透滤光窗口及其制备方法应萱同③3-(甲基咪唑基)-甲基-四氢咔唑酮新的合成方法董纪昌2、实用新型奖(2项)⑴二等奖(1项)①一种铺装催化剂球面花板沈伟徐华龙⑵三等奖(1项)①一种眼科用微型角膜切割器褚仁远周行涛3、申请优胜奖(1项)复旦大学4、实施效益奖(1项)复旦大学5、上海市优秀专利工作者奖(1项)吴桂琴七、第七届上海市科技精英1、科技精英(2人)张世永雍炯敏2、科技精英提名奖(2人)丁建东葛均波八、2001年度上海市优秀发明选拔赛(11项)1、一等奖(6项)(1)酵母基因工程人α2a干扰素李育阳(2)苯甲酸甲酯加氢合成无氯苯甲醛沈伟(3)分子计算机的逻辑门材料华中一(4)黑素细胞培养及异体移植治疗白癜风的实验和临床研究郑志忠(5)硅胶面膜通气面罩钮善福(6)抗Titin-ELISA试剂盒的研制及应用陈向军2、二等奖(4项)(1)一种制备镁沸石的方法龙英才(2)高固体分耐刮伤性和自愈性轿车涂料的研制武利民(3)微波硫灯的研究与开发陈大华(4)C肽联合胰岛素治疗对大鼠糖尿病肾病的治疗作用高鑫3、三等奖(1项)(1)一种血管剥脱器陈福真4、优秀组织者王文斌九、2001年度明治乳业生命科学奖(3人)1、生命科学优秀奖(1人)樊嘉2、生命科学科学奖(2人)王建设周国民十、2001年第三届中国国际高新技术成果交易会优秀组织奖复旦大学十一、国家“九五”科技攻关先进个人华中一王家楫十二、2000年度全国先进科技工作者华中一十三、“九五”机械工业优秀科技成果微机械加工工艺技术十四、全国普通高等学校科研管理(自然科学类)先进集体复旦大学科技处十五、国家自然科学基金管理工作先进单位复旦大学科技处十六、高等学校科研管理先进个人陆飞殷南根孙桂芳十七、国家自然科学基金管理工作先进个人孙桂芳十八、2001年全国R&D资源清查优秀个人张茜十九、2001年第四届优秀启明星程训佳二十、国家“八六三”先进工作者突出贡献:闻玉梅重要贡献:薛京伦、李育阳贡献:薛向阳、孙迭篪二十一、上海市产学研工程奖1、一等奖(1项)紫杉醇清洁醇化技术及水溶性紫杉醇的绿色合成陈建民灯(与上海春申江实业总公司合作)2、二等奖(2项)疏水硅沸石及无粘结剂吸附剂龙英才等(与上海复兴新型材料厂合作)MT-5红景天提取物延缓皮肤衰老作用的研究金锡鹏等(与上海家化联合股份有限公司合作)3、三等奖(4项)中高级轿车车灯制造工艺的研究与开发杜国强灯(与上海小系车灯有限公司合作)中分辨率数字照相机样机研制张立明等(与上海海鸥照相机有限公司合作)微波硫灯的研究与开发陈大华灯(与上海真空电子器件股份有限公司合作)硅胶面膜通气面罩钮善福等(与上海中山医疗科技发展公司合作)。
乙型脑炎病毒寡核苷酸基因芯片研究张海燕;马文丽;李凌;吴清华;徐秋林;温颖;郑文岭【期刊名称】《实用医学杂志》【年(卷),期】2005(021)012【摘要】目的:制备检测乙型脑炎病毒寡核苷酸(oligo)基因芯片.方法:应用生物信息学软件设计60-mer oligo探针用于制备基因芯片,乙型脑炎病毒(JEV)基因片段经限制性显示技术扩增标记,用于芯片杂交,清洗和干燥后对芯片进行扫描和数据分析.结果:大部分oligo探针都能特异性与相应样品杂交,呈现阳性荧光信号,而阴性对照和空白对照则基本不能检测到荧光信号.结论:实验中建立的oligo基因芯片检测病原体方法可行,具有应用于临床诊断的前景.【总页数】4页(P1244-1247)【作者】张海燕;马文丽;李凌;吴清华;徐秋林;温颖;郑文岭【作者单位】510515,广州市,南方医科大学分子生物学研究所;510515,广州市,南方医科大学分子生物学研究所;510515,广州市,南方医科大学分子生物学研究所;510515,广州市,南方医科大学分子生物学研究所;510515,广州市,南方医科大学分子生物学研究所;510515,广州市,南方医科大学分子生物学研究所;510010,广州军区广州总医院分子肿瘤学研究所【正文语种】中文【中图分类】R5【相关文献】1.乙型脑炎病毒寡核苷酸探针的化学合成及初步检测 [J], 项秉懿;杨勇峰;刘利兵2.Rb2/p130寡核苷酸基因芯片的制备及肺癌手术标本的检测 [J], 安耀武;于海建;李龙芸3.乙型脑炎病毒与黄热病病毒联合诊断基因芯片的初步实验研究 [J], 张海燕;马文丽;李凌;吴清华;郑文岭4.乙型脑炎病毒可视化分型基因芯片的制备 [J], 薛斐;辛舒;田宇飞;孙文超;温树波;阎富龙;盛媛;王茂鹏;朱羿龙5.伪狂犬病病毒、猪细小病毒和流行性乙型脑炎病毒检测基因芯片的制备 [J], 张焕容;曹三杰;文心田;肖驰因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
[19]中华人民共和国国家知识产权局[12]发明专利申请公布说明书[11]公开号CN 101386892A [43]公开日2009年3月18日[21]申请号200810029988.9[22]申请日2008.08.05[21]申请号200810029988.9[71]申请人广东出入境检验检疫局检验检疫技术中心地址510623广东省广州市珠江新城花城大道66号共同申请人南方医科大学基因工程研究所[72]发明人黄吉城 马文丽 张海燕 相大鹏 幸芦琴钟玉清 郭波旋 胡龙飞 洪烨 师永霞李小波 郑夔 商涛 郑文岭 [74]专利代理机构广州三环专利代理有限公司代理人郝传鑫[51]Int.CI.C12Q 1/70 (2006.01)C12Q 1/68 (2006.01)权利要求书 2 页 说明书 17 页 附图 6 页[54]发明名称一种出入境检疫中常见病毒联合检测分型基因芯片及其检测方法[57]摘要本发明提供了一种出入境检疫中常见病毒联合检测分型基因芯片及其检测方法。
本发明的一种出入境检疫中常见病毒联合检测及分型基因芯片,包括固相载体及固定在固相载体上的寡核苷酸探针,寡核苷酸探针包括流感病毒探针、登革热病毒探针、黄热病病毒探针和乙脑病毒探针。
本发明采用病毒核酸的限制性荧光标记的方法对待检核酸进行处理。
本发明将流感病毒、登革热病毒、黄热病毒、乙脑病毒多种病毒的探针集合在同一芯片的多种病毒联合芯片,能准确检测出各种病毒核酸,同时可以对甲型流感病毒H1N1和H3N2亚型、登革病毒I-IV型作分型。
200810029988.9权 利 要 求 书第1/2页1.一种出入境检疫中常见病毒联合检测分型基因芯片,包括固相载体及固定在固相载体上的寡核苷酸探针,其特征在于:所述寡核苷酸探针包括流感病毒探针、登革热病毒探针、黄热病病毒探针和乙脑病毒探针。
2、如权利要求1所述的一种出入境检疫中常见病毒联合检测分型基因芯片,其特征在于:所述流感病毒探针包括流感病毒H1N1型和流感病毒H3N2型。
乙型脑炎病毒SXBJ07株的分离鉴定及序列分析王韦华;张旭;张彦明;邢福珊;徐彦召【期刊名称】《西北农林科技大学学报(自然科学版)》【年(卷),期】2009(037)004【摘要】[目的]分离鉴定乙型脑炎病毒(JEV),确定分离毒株的基因分型及其E区段氨基酸的序列特征.[方法]采用BHK-21细胞培养法,从猪脑组织标本中分离出1株病毒,对其进行细胞和免疫荧光试验,同时采用RT-PCR扩增并克隆该毒株的PrM、E区段核苷酸序列,利用PrM(456~695位)区核苷酸序列与36株参考序列进行基因分型分析,并对E区核苷酸序列与减毒活疫苗株SA-14-14-2株的相应序列进行比对,分析分离株和疫苗株氨基酸的同源性及关键结构域的差异.[结果]分离出的病毒经细胞病变和直接免疫荧光试验证实为乙脑病毒,命名为SXBJ07;用该病毒感染BHK-21细胞,72 h后所有细胞均发生病变(CPE);用该病毒接种3日龄乳鼠,72 h之内即可导致乳鼠死亡;SXBJ07株PrM(456~695位)区基因分型证实,分离株属于基因Ⅰ型,E区段核苷酸和氨基酸与减毒活疫苗株SA-14-14-2株的同源性分别为87.7%和 97.0%,但在E蛋白的活性关键结构域有13个氨基酸存在差异.[结论]从陕西省境内首次成功分离到1株Ⅰ型乙脑病毒,初步确定了该分离株的分子特征,对乙型脑炎的流行病学研究及其防治具有重要意义.【总页数】7页(P1-6,12)【作者】王韦华;张旭;张彦明;邢福珊;徐彦召【作者单位】西北农林科技大学,动物医学院,陕西,杨凌712100;西北农林科技大学,动物医学院,陕西,杨凌712100;西北农林科技大学,动物医学院,陕西,杨凌712100;西北农林科技大学,动物医学院,陕西,杨凌712100;西北农林科技大学,动物医学院,陕西,杨凌712100【正文语种】中文【中图分类】S852.65+9.6;Q78【相关文献】1.湖南地区Ⅰ型乙型脑炎病毒的分离鉴定及E基因序列分析 [J], 向卫军;杨涛涛;李润成;余兴龙2.日本乙型脑炎病毒分离株E基因的克隆及序列分析 [J], 陈梅;王艳允3.中国首次分离的二株基因Ⅰ型流行性乙型脑炎病毒全基因组序列分析 [J], 冯云;李灿委;章域震;杨卫红;张海林4.1株猪源基因I型乙型脑炎病毒的分离鉴定及遗传进化分析 [J], 侯力丹;王文涛;曹胜波;黄少梅5.乙型脑炎病毒XJ/08/01株的分离鉴定及PrM/E基因的遗传进化分析 [J], 刘昊;金宁一;段纲;尹革芬;鲁会军;屈勇刚;于长勇;张丹;李霄;金扩世;关莎莎因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
伪狂犬病病毒、猪细小病毒和流行性乙型脑炎病毒检测基因芯片的制备张焕容;曹三杰;文心田;肖驰【期刊名称】《中国兽医学报》【年(卷),期】2007(27)5【摘要】对伪狂犬病病毒(PRV)、猪细小病毒(PPV)和流行性乙型脑炎病毒(JEV)检测基因芯片的制备及该芯片的检测技术进行了研究。
选定靶基因最佳点样质量浓度为200 mg/L,用基因芯片点样仪将其点制在氨基化基片上,经干燥、水合、紫外线交联和洗涤后,成功制备了PRV-PPV-JEV检测基因芯片。
以CY3荧光素标记的dCTP经PCR扩增制备探针,对芯片的质量进行了评价。
结果表明,制备的芯片质量好,探针最佳使用质量浓度为3 000μg/L,芯片系统检测灵敏度可达3μg/L。
该芯片可同时检测PRV、PPV和JEV,其灵敏度高、特异性强,芯片可重复使用,室温下至少可保存4个月。
【总页数】4页(P667-670)【关键词】猪伪狂犬病病毒;猪细小病毒;流行性乙型脑炎病毒;基因芯片;制备【作者】张焕容;曹三杰;文心田;肖驰【作者单位】四川农业大学动物科技学院动物传染病与基因芯片实验室【正文语种】中文【中图分类】S852.65;Q78【相关文献】1.多重PCR检测猪瘟病毒、猪细小病毒和猪伪狂犬病病毒的研究--猪瘟病毒、猪细小病毒和猪伪狂犬病病毒多重PCR引物设计 [J], 余丽芸;刘建柱;侯喜林;崔玉东;朴范泽2.多重PCR方法用于检测猪圆环病毒2型、猪细小病毒、猪伪狂犬病病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒诊断方法的建立 [J], 岳丰雄;崔尚金;冉多良;戚亭;周盛华3.同时检测猪圆环病毒2型、猪细小病毒和伪狂犬病毒连接酶检测反应-PCR基因芯片检测方法的建立 [J], 郭瑶;汪平;董沁芳;程菊会;徐辉;丁先锋;郭江峰;姜永厚4.猪伪狂犬病、猪细小病毒病和猪流行性乙型脑炎检测基因芯片的制备及检测方法研究 [J], 张焕容;曹三杰;文心田;肖驰5.同时检测猪圆环病毒2型、猪细小病毒、猪伪狂犬病病毒和猪细环病病毒1型和2型的多重SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR方法的建立[J], Pérez L J;刘丹因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。