内参即是内部参照
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内参基因内参即是内部参照,它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测基因的表达水平变化时常用它来做参照物。
其作用是校正上样量、上样过程中存在的实验误差,保证实验结果的准确性。
借助检测每个样品内参的量就可以用于校正上样误差,这样半定量的结果才更为可信。
一般要选择一个在处理因素作用的条件下不会发生表达改变的基因作内参。
在进行基因研究的过程中,实时反转录 PCR也和传统的mRNA定量方法如 Northern blot技术等一样, 要求使用参照基因以校正转录效率和 cDNA用量, 弥补制备过程中样本纯度和浓度的差别, 使不同样本之间目的基因的比较成为可能,以期获得真实可靠的结果。
大多数分析方法中这些差别可通过与内参照比较处理消除。
最普通的内参照是内源性参照基因,也叫管家基因。
管家基因:又称持家基因(house-keeping genes)生物体各类细胞中都表达,其产物是对维持细胞基本生命活动所必需的蛋白质编码的基因。
如微管蛋白基因、糖酵解酶系基因与核糖体蛋白基因等。
是为维持细胞基本生命活动所需而时刻都在表达的基因。
管家基因表达水平受环境因素影响较小,而是在个体各个生长阶段的大多数、或几乎全部组织中持续表达,或变化很小。
它的表达只受启动序列或启动子与RNA聚合酶相互作用的影响,而不受其他机制调节。
管家基因高度保守并且在大多数情况下持续表达,因此管家基因常被用于分子技术--多位点基因分析。
内参基因通常是各种看家基因,在细胞内组成稳定性表达,有助于保持细胞的功能。
理想的内参基因应该满足以下条件:1, 不存在假基因(Pseudogene),以避免基因 DNA的扩增; 2,高度或中度表达,排除低表达; 3,稳定表达于不同类型的细胞和组织(如正常细胞和癌细胞),而且其表达量是近似的,无显着性差别;4,表达水平与细胞周期以及细胞是否活化无关;5, 其稳定的表达水平与目标基因相似;6, 不受任何内源性或外源性因素的影响,如不受任何实验处理措施的影响.近年来的研究发现:这些常用内参基因均存在缺陷,在不同类型的细胞和组织细胞增殖和器官发育的不同阶段体外培养各种实验条件等情况下它们的表达量通常变异较大。
内参基因的概念和作用内参即是内部参照 ,它们在各组织和细胞中的表达相对恒定 ,在检测基因的表达水平变化时常用它来做参照物。
其作用是校正上样量、上样过程中存在的实验误差 ,保证实验结果的准确性。
借助检测每个样品内参的量就可以用于校正上样误差 ,这样半定量的结果才更为可信。
一般要选择一个在处理因素作用的条件下不会发生表达改变的基因作内参。
在进行基因研究的过程中,实时反转录 PCR也和传统的mRNA定量方法如 Northern b lot技术等一样, 要求使用参照基因以校正转录效率和 cDNA用量, 弥补制备过程中样本纯度和浓度的差别, 使不同样本之间目的基因的比较成为可能,以期获得真实可靠的结果。
大多数分析方法中这些差别可通过与内参照比较处理消除。
最普通的内参照是内源性参照基因,也叫管家基因。
管家基因:又称持家基因(house-keeping genes)生物体各类细胞中都表达 ,其产物是对维持细胞基本生命活动所必需的蛋白质编码的基因。
如微管蛋白基因、糖酵解酶系基因与核糖体蛋白基因等。
是为维持细胞基本生命活动所需而时刻都在表达的基因。
管家基因表达水平受环境因素影响较小 ,而是在个体各个生长阶段的大多数、或几乎全部组织中持续表达 ,或变化很小。
它的表达只受启动序列或启动子与RNA聚合酶相互作用的影响 ,而不受其他机制调节。
管家基因高度保守并且在大多数情况下持续表达 ,因此管家基因常被用于分子技术--多位点基因分析。
内参基因通常是各种看家基因 ,在细胞内组成稳定性表达 ,有助于保持细胞的功能。
理想的内参基因应该满足以下条件:1, 不存在假基因(Pseudogene) ,以避免基因 DNA的扩增; 2,高度或中度表达 ,排除低表达; 3,稳定表达于不同类型的细胞和组织(如正常细胞和癌细胞) ,而且其表达量是近似的 ,无显着性差别; 4,表达水平与细胞周期以及细胞是否活化无关;5, 其稳定的表达水平与目标基因相似;6, 不受任何内源性或外源性因素的影响 ,如不受任何实验处理措施的影响.近年来的研究发现:这些常用内参基因均存在缺陷 ,在不同类型的细胞和组织细胞增殖和器官发育的不同阶段体外培养各种实验条件等情况下它们的表达量通常变异较大。
在western blot 实验中,内参的使用是个很重要的部分,看到很多站友对内参的选择经常有些疑问,鉴于此,希望能在一个帖子里面综合所有相关问题,展开讨论,共同学习。
我先提几个,抛砖引玉,希望大家继续。
1。
为什么一定需要内参?内参的重要性。
2。
常用的几种内参。
3。
不同的情况如何选择不同的内参。
支持一下!1:用内参照是为了评价你的各个上样孔内蛋白的总量是否基本一致,通常使用一些看家蛋白,比如β-actin、GAPDH等等。
这些蛋白在所有细胞中的表达量基本一致,所以用他们来作为你加样量的对照。
这样western结果中你的目的蛋白经过处理后发生变化,而内参的条带基本均匀一致。
这样才有说服力,表明的确是处理因素造成目的蛋白的变化而不是加样误差或是人为造成目的条带浓度的变化。
严格意义上说,内参事必须做的。
2:常用的内参有:b-actin,GAPDH,近2-3 年,更详细的研究发现,β-Tubulin (球管蛋白),被广泛应用于Western Blotting,β-Tubolin分子量为55KD左右。
3:一般我们选择内参与要检测的目的蛋白的分子量最好相差5KD以上。
因此你要知道你检测的蛋白的分子量来选择合适的内参!个人一些见解,供参考!内参的重要性,必要性:要检测一个基因的表达产物是否正确,或者比较表达产物量的相对变化,首选方法是Western Blot。
因为Western Blot操作相对简单方便,既可以定性分析表达产物,同时还可以指示目的蛋白量的相对变化。
虽然,顺利的时候Western Blot做起来很简单,可不顺的时候也很令人心烦――做不出结果啦、假阳性啦、结果出现多条带啦、到底是一抗有问题还是二抗有问题啦……毕竟,作为一种有活性的生物大分子,抗体和抗原的反应毕竟不象1+1那么明确,而用这种不确定的试剂来测定同样知之甚少的表达产物,确实是有一定的不确定性的。
所以,严谨的Western Blot实验设计中要求有良好的参照体系,对实验结果分析是非常有用。
Western Blot内参要检测一个基因的表达产物是否正确,或者比较表达产物量的相对变化,首选方法是Western Blot。
因为Western Blot操作相对简单方便,既可以定性分析表达产物,同时还可以指示目的蛋白量的相对变化。
虽然,顺利的时候Western Blot做起来很简单,可不顺的时候也很令人心烦――做不出结果啦、假阳性啦、结果出现多条带啦、到底是一抗有问题还是二抗有问题啦……毕竟,作为一种有活性的生物大分子,抗体和抗原的反应毕竟不象1+1那么明确,而用这种不确定的试剂来测定同样知之甚少的表达产物,确实是有一定的不确定性的。
所以,严谨的Western Blot实验设计中要求有良好的参照体系,对实验结果分析是非常有用。
特别是当实验出现问题时,借助参照体系很容易就可以查出问题所在,而不必抓耳挠腮怨天尤人。
良好的参照体系通常包括分子量Marker(用来确定蛋白条带对应的分子量大小),空白载体对照(如果是诱导表达体系还应该有诱导前的对照),已知量标准产物的正对照;另外还有内参。
内参是最容易被忽略的一项。
我们知道,要用Western Blot比较不同条件下或者不同组织中,目的蛋白表达量的相对多少,前提条件是等量的细胞上样,才有比较的基础。
特别表达量不高时,上样量的差别就很可能影响结果的分析。
所以你需要内参。
内参即是内部参照(Internal Control),对于哺乳动物细胞表达来说一般是指由管家基因编码表达的蛋白(Housekeeping Proteins),它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测蛋白的表达水平变化时常用它来做参照物。
在Western Blotting 实验中,除了需要进行蛋白抽提、蛋白定量、等量蛋白上样电泳、转膜、靶蛋白抗体孵育、显色等步骤以外,还需要进行内参的检测,以校正蛋白质定量、上样过程中存在的实验误差,保证实验结果的准确性。
在国外发表的文章中,Western Blotting 实验结果须进行内参校正已成为一种惯例。
目的蛋白内参整膜
目的蛋白、内参和整膜在实验中分别扮演不同的角色。
目的蛋白是实验中想要研究或追踪的特定蛋白质。
通过使用WB(Western Blot)等方法,可以对目的蛋白进行半定量分析,判断不同样品中目的蛋白表达含量的多少。
这取决于内参的标定。
内参即是内部参照,通常是在被检样本中高表达且表达水平相对稳定的蛋白。
在WB实验中,内参抗体是重要的参考,它帮助确定目的蛋白表达量的相对多少。
选择合适的内参在WB实验中是关键的因素。
常用的内参包括GAPDH、Tubulin 和Actin等,它们在各组织细胞中的表达相对稳定,常被用作对照物。
整膜是一种实验技术,可以用来提高膜的机械强度和耐用性,以防止在实验过程中膜发生变形或破裂。
通过整膜技术,可以延长膜的使用寿命并提高实验的可靠性。
以上信息仅供参考,可以查阅与目的蛋白、内参和整膜相关的专业文献或咨询专业人士,获取更全面准确的信息。
内参基因的概念 Document number:PBGCG-0857-BTDO-0089-PTT1998内参即是内部参照,它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测基因的表达水平变化时常用它来做参照物。
其作用是校正上样量、上样过程中存在的实验误差,保证实验结果的准确性。
借助检测每个样品内参的量就可以用于校正上样误差,这样半定量的结果才更为可信。
一般要选择一个在处理因素作用的条件下不会发生表达改变的基因作内参。
在进行基因研究的过程中,实时反转录 PCR也和传统的mRNA定量方法如 Northern b lot技术等一样, 要求使用参照基因以校正转录效率和 cDNA用量, 弥补制备过程中样本纯度和浓度的差别, 使不同样本之间目的基因的比较成为可能,以期获得真实可靠的结果。
大多数分析方法中这些差别可通过与内参照比较处理消除。
最普通的内参照是内源性参照基因,也叫管家基因。
管家基因:又称持家基因(house-keeping genes)生物体各类细胞中都表达,其产物是对维持细胞基本生命活动所必需的蛋白质编码的基因。
如微管蛋白基因、糖酵解酶系基因与核糖体蛋白基因等。
是为维持细胞基本生命活动所需而时刻都在表达的基因。
管家基因表达水平受环境因素影响较小,而是在个体各个生长阶段的大多数、或几乎全部组织中持续表达,或变化很小。
它的表达只受启动序列或启动子与RNA聚合酶相互作用的影响,而不受其他机制调节。
管家基因高度保守并且在大多数情况下持续表达,因此管家基因常被用于分子技术--多位点基因分析。
内参基因通常是各种看家基因,在细胞内组成稳定性表达,有助于保持细胞的功能。
理想的内参基因应该满足以下条件:1, 不存在假基因(Pseudogene),以避免基因 DNA的扩增; 2,高度或中度表达,排除低表达; 3,稳定表达于不同类型的细胞和组织(如正常细胞和癌细胞),而且其表达量是近似的,无显着性差别; 4,表达水平与细胞周期以及细胞是否活化无关;5, 其稳定的表达水平与目标基因相似;6, 不受任何内源性或外源性因素的影响,如不受任何实验处理措施的影响.近年来的研究发现:这些常用内参基因均存在缺陷,在不同类型的细胞和组织细胞增殖和器官发育的不同阶段体外培养各种实验条件等情况下它们的表达量通常变异较大。
内参即是内部参照,它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测基因的表达水平变化时常用它来做参照物。
常用的PCR内参有GAPDH 、β- actin 、18sRNA、28sRNA 、B2M、ACTB、SDHA、HPRT1、ARBP内参基因等正向引物(上游引物)是沿着负链进行不间断延长的反向引物(下游引物)是沿着正链进行一段段延长的正链是含有目的基因的那条链。
RT-PCR 为反转录RCR(reverse transcription PCR)和实时PCR(real time PCR)共同的缩写。
逆转录PCR,或者称反转录PCR(reverse transcription-PCR, RT-PCR),是聚合酶链式反应(PCR)的一种广泛应用的变形。
在RT-PCR中,一条RNA链被逆转录成为互补DNA,再以此为模板通过PCR进行DNA扩增。
由一条RNA单链转录为互补DNA(cDNA)称作“逆转录”,由依赖RNA的DNA聚合酶(逆转录酶)来完成。
随后,DNA的另一条链通过脱氧核苷酸引物和依赖DNA的DNA聚合酶完成,随每个循环倍增,即通常的PCR。
原先的RNA模板被RNA酶H降解,留下互补DNA。
RT-PCR的指数扩增是一种很灵敏的技术,可以检测很低拷贝数的RNA。
RT-PCR广泛应用于遗传病的诊断,并且可以用于定量监测某种RNA的含量。
(检测基因表达的方法,参见Northern Blot法。
RT-PCR的关键步骤是在RNA的反转录,要求RNA模版为完整的且不含DNA、蛋白质等杂质。
常用的反转录酶有两种,即鸟类成髓细胞性白细胞病毒(avian myeloblastosis virus,AMV)反转录酶和莫罗尼鼠类白血病病毒(moloney murine leukemia vrius,MMLV)反转录酶。
RT-PCR有时候也会指代实时PCR(real-time PCR)。
为了与逆转录PCR相区别,通常被写作“定量PCR”(quantitative PCR)或者RTQ-PCR(real-time quantitative PCR)。
内参基因的概念和作用内参即是内部参照,它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测基因的表达水平变化时常用它来做参照物。
其作用是校正上样量、上样过程中存在的实验误差,保证实验结果的准确性。
借助检测每个样品内参的量就可以用于校正上样误差,这样半定量的结果才更为可信。
一般要选择一个在处理因素作用的条件下不会发生表达改变的基因作内参。
在进行基因研究的过程中,实时反转录 PCR也和传统的mRNA定量方法如Northern b lot技术等一样, 要求使用参照基因以校正转录效率和 cDNA用量, 弥补制备过程中样本纯度和浓度的差别, 使不同样本之间目的基因的比较成为可能,以期获得真实可靠的结果。
大多数分析方法中这些差别可通过与内参照比较处理消除。
最普通的内参照是内源性参照基因,也叫管家基因。
管家基因:又称持家基因(house-keeping genes生物体各类细胞中都表达,其产物是对维持细胞基本生命活动所必需的蛋白质编码的基因。
如微管蛋白基因、糖酵解酶系基因与核糖体蛋白基因等。
是为维持细胞基本生命活动所需而时刻都在表达的基因。
管家基因表达水平受环境因素影响较小,而是在个体各个生长阶段的大多数、或几乎全部组织中持续表达,或变化很小。
它的表达只受启动序列或启动子与RNA 聚合酶相互作用的影响,而不受其他机制调节。
管家基因高度保守并且在大多数情况下持续表达,因此管家基因常被用于分子技术--多位点基因分析。
内参基因通常是各种看家基因,在细胞内组成稳定性表达,有助于保持细胞的功能。
理想的内参基因应该满足以下条件:1, 不存在假基因(Pseudogene,以避免基因DNA的扩增; 2,高度或中度表达,排除低表达; 3,稳定表达于不同类型的细胞和组织(如正常细胞和癌细胞,而且其表达量是近似的,无显着性差别; 4,表达水平与细胞周期以及细胞是否活化无关;5, 其稳定的表达水平与目标基因相似;6, 不受任何内源性或外源性因素的影响,如不受任何实验处理措施的影响.近年来的研究发现:这些常用内参基因均存在缺陷,在不同类型的细胞和组织细胞增殖和器官发育的不同阶段体外培养各种实验条件等情况下它们的表达量通常变异较大。
b-actin
b-Actin是指PCR常用的内参,P-Actin抗体是WesternBlot很好的内参指数。
内参即是内部参照(InternalControl),对于哺乳动物细胞表达来说一般是指山管家基因编码表达的蛋口。
它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测蛋口的表达水平变化时常用它来做参照物。
b-actin的蛋白水平通常不会发生改变,因此被广泛用于Western时上样量是否一致的参照,也常被用于免疫染色观察细胞的微丝结构。
在用作Western的参照时,Actin抗体和Tubulin抗体的主要不同之处在于两者所识别蛋白的分子量不同,这样可以选择合适的参照在同一块胶同一张膜上实现同时检测LI标蛋口和参照蛋口。
PCR内参:选还是不选?,PCR内参,RT生物帮> 专题> 实验技术> 分子> PCR内参:选还是不选?导读:内参即是内部参照,它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测基因的表达水平变化时常用它来做参照物。
常用的PCR内参有GAPDH 、β- actin 、18sRNA、28sRNA 、B2M、ACTB、SDHA、HPRT1、ARBP内参基因等。
本专题就PCR实验中遇见的有关于内参的一些问题作出总结,以供读者参考。
PCR内参基因介绍GAPDH简介内参基因β-Actin简介实时荧光定量PCR 中内参基因的选择内参基因的概念和作用PCR内参基因介绍基因表达转录分析中内参基因的选择目前基因表达的转录分析多采用单一看家基因作为内参来校正目标基因的表达量.实验中以人肝癌BEL-7402细胞为研究对象,应用[详细]海带配子体18S rRNA 基因作为内参基因的应用通过基因克隆和序列测定,获得了海带( Laminaria japonica) 配子体的18S rRNA 基因序列,其长度为1 716bp ,GenBank 登录号为EU293553。
以蓝[详细]白纹伊蚊β2肌动蛋白基因片段作为基因表达内参目的获取白纹伊蚊β2肌动蛋白基因序列并探讨其作为基因表达内参照的作用。
方法根据昆虫β2肌动蛋白核苷酸序列[详细]常用的内参基因及其使用范围包括GAPDH 、β- actin(BETA-actin) 、18sRNA、28sRNA 、B2M、ACTB、SDHA、HPRT1、ARBP内参基因等。
[详细]常用的β-actin 引物序列常用的β-actin 引物序列[详细]RT-PCR常用引物序列引物应该用TE稀释。
oligo在酸性条件下是不稳定的,容易降解,如果用水溶解引物,无法保证pH值,如果合成引物纯化不好,造[详细]PCR内参常见问题汇总内参能跑出来但为何我的cDNA总是不稳定?我要做荧光定量试验,师姐做的定性,我能共用RT-PCR电泳照片有问题qPCR 目的基因与内参是不是要在同样体系里扩增斑马鱼的内参基因组怎么选择啊绝对定量需要用到内参基因吗选择内参基因的原则PCR内参常见问题汇总RT-PCR内参基因选择:除了β-actin还能用什么?实时定量PCR试验中,内参对于实验具有重要意义。
Western Blot内参的选择,老司机都不知道这些窍门每日生物评论2017-01-31 21:15:13内参即是内部参照(Internal Control),对于哺乳动物细胞来说一般是指由管家基因编码表达的蛋白(Housekeeping Proteins),它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测蛋白的表达水平变化时常用它来做参照物。
一、为什么要使用内参呢?Western blot除了能证明某样品含有某种蛋白之外,其最为重要的作用是比较不同条件下或者不同组织中,目的蛋白表达量的相对多少。
即为蛋白表达水平最直接的证据。
要衡量蛋白的表达水平,前提条件就是等量的上样量。
然而如果仅将蛋白浓度测定作为规范需相互比较的各种样品间上样量等同的唯一方法,显然是不可取的。
首先各种蛋白质浓度定量方法都存在局限性,不能完全准确的确定各种样品的蛋白浓度。
如UV法直接定量,适合测试较纯净、成分相对单一的蛋白质,相对于比色法来说,操作简单,但是容易受到平行物质如DNA的干扰,且敏感度低,要求蛋白的浓度较高。
比色法测定蛋白浓度一般有BCA、Bradford、Lowry等几种方法。
BCA法与Lowry法都容易受到蛋白质之间以及去污剂的干扰。
Bradford法敏感度最高,且与一些列干扰Lowry、BCA 反应的还原剂(如DTT、巯基乙醇)相溶,但是对去污剂依然是敏感的,其最主要的缺点是不同的标准品会导致同一样品的结果差异较大,无可比性。
另外,蛋白质定量以后进行电泳时需要等量上样,此步骤也存在操作误差。
在Western Blot实验时使用内参,即可简便地对定量和上样步骤产生的误差进行校正。
在Western Blot中使用内参其实就是在WB过程中另外用内参对应的抗体检测内参,这样在检测目的产物的同时可以检测内参的表达,由于内参在各组织和细胞中的表达相对恒定,借助检测每个样品内参的量就可以用于校正上样误差,这样半定量的结果才更为可信。
内参要检测一个基因的表达产物是否正确,或者比较表达产物量的相对变化,首选方法是Western Blot。
因为Western Blot操作相对简单方便,既可以定性分析表达产物,同时还可以指示目的蛋白量的相对变化。
而用这种不确定的试剂来测定同样知之甚少的表达产物,确实是有一定的不确定性的。
所以,严谨的Western Blot实验设计中要求有良好的参照体系,对实验结果分析是非常有用。
分子量Marker(用来确定蛋白条带对应的分子量大小)内参即是内部参照(Internal Control),对于哺乳动物细胞表达来说一般是指由管家基因编码表达的蛋白(Housekeeping Proteins),它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测蛋白的表达水平变化时常用它来做参照物。
在Western Blotting 实验中,除了需要进行蛋白抽提、蛋白定量、等量蛋白上样电泳、转膜、靶蛋白抗体孵育、显色等步骤以外,还需要进行内参的检测,以校正蛋白质定量、上样过程中存在的实验误差,保证实验结果的准确性。
Western Blot 比较不同条件下或者不同组织中,目的蛋白表达量的相对多少,前提条件是等量的蛋白上样,才有比较的基础,特别表达量不高时,上样量的差别就很可能影响结果的分析,所以需要内参。
在Western Blotting中使用内参其实就是在WB过程中另外用内参对应的抗体检测内参,这样在检测目的产物的同时可以检测内参的表达,由于内参在各组织和细胞中的表达相对恒定,借助检测每个样品内参的量就可以用于校正上样误差,这样半定量的结果才更为可信。
此外使用内参可以作为空白对照,检测蛋白转膜情况是否完全、整个Western Blot显色或者发光体系是否正常。
在Western Blotting实验过程中使用内参的方法通常有以下三种:第一种是超级简便的标记内参使用法,只要在二抗孵育时加入HRP标记内参抗体,按照正常操作即可;第二种是普通内参,当目的蛋白的分子量大小与选用的内参蛋白分子量相差不大时,可以先进行目的蛋白的抗体温育显色和检测,然后使用Strip缓冲液洗掉膜上的抗体,重新进行内参蛋白的抗体温育、显色检测。
Western Blot中的内参设定Western Blot(WB)是检测一个基因表达是否正确及表达量多少的首选方法。
WB操作简单,既可以定性分析表达产物,同时还可以指示目的蛋白量的相对变化。
作为一种有活性的生物大分子,抗体和抗原的反应是比较复杂的,因此用来测定表达产物时存在着一定的不确定性。
所以,在WB实验设计中加入良好的参照体系,对实验结果分析是非常有帮助的。
参照体系通常包括分子量Marker(用来确定蛋白条带对应的分子量大小),空白载体对照(如果是诱导表达体系还应该有诱导前的对照),已知量标准产物的正对照,此外还有内参。
内参是最容易被忽略的一项,如果要用WB比较不同条件下或者不同组织中,目的蛋白表达量的相对多少,等量的细胞上样才有比较的基础。
特别表达量不高时,上样量的差别就很可能影响结果的分析,所以此时内参就显得尤为重要。
内参即是内部参照(Internal Control),对于哺乳动物细胞表达来说一般是指由管家基因编码表达的蛋白(Housekeeping Proteins),它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测蛋白的表达水平变化时常用它来做参照物。
在WB实验中,除了需要进行蛋白抽提、蛋白定量、等量蛋白上样电泳、转膜、靶蛋白抗体孵育、显色等步骤以外,还需要进行内参的检测,以校正蛋白质定量、上样过程中存在的实验误差,保证实验结果的准确性。
蛋白浓度测定是比较各种样品间上样量的唯一方法。
然而各种蛋白质浓度定量方法都存在局限性,不能完全准确的确定各种样品的准确蛋白浓度。
如UV法直接定量,适合测试较纯净、成分相对单一的蛋白质,相对于比色法来说,操作简单,但是容易受到平行物质的干扰,如DNA的干扰;且敏感度低,要求蛋白的浓度较高。
比色法测定蛋白浓度一般有BCA,Bradford,Lowry 等几种方法。
BCA法与Lowry法都容易受到蛋白质之间以及去污剂的干扰。
Bradford 法敏感度最高,且与一系列干扰Lowry,BCA 反应的还原剂(如DTT,巯基乙醇)相容。
内参研究报告1. 引言内参研究报告是基于内参数据的详细分析和研究的文档。
内参,即内部参考,是指在内部使用的、不对外公开的资料和信息。
内参研究报告的目的是通过对内部数据的深入研究,揭示其中的规律和趋势,为决策提供科学依据。
本文将以我给的标题为基础,撰写一份内参研究报告,重点分析内部数据并提出研究结论。
2. 背景内参研究报告的背景信息通常包括研究对象、数据来源和研究目的。
在此次研究中,我们的研究对象是某公司的销售数据,数据来源为公司内部的销售系统。
研究目的是通过分析销售数据,找出销售额增长的关键因素,为制定销售策略提供参考。
3. 数据收集与处理为了进行研究,我们首先从内部销售系统中收集了一定时间范围内的销售数据。
数据包括销售额、销售渠道、产品类别、地区等信息。
接着,我们对数据进行清洗和整理,剔除了重复数据、缺失数据和异常数据。
最终得到了一份规范的、可用于分析的数据集。
4. 数据分析与结果在本节中,我们将对收集到的销售数据进行分析,并得出一些重要的结果。
4.1 总体销售趋势首先,我们将分析总体销售趋势。
下图展示了销售额随时间的变化趋势。
销售趋势图从图中可以看出,销售额整体呈上升趋势,但在某些时间段出现了较大的波动。
接下来,我们将进一步探讨这些波动的原因。
4.2 销售渠道分析我们还对销售渠道进行了分析。
下表展示了不同销售渠道的销售额占比。
渠道销售额占比线上销售50%实体店销售30%批发销售10%其他10%可以看出,线上销售是公司销售额的主要来源,占比达到了50%。
实体店销售和批发销售也有一定的贡献。
4.3 产品类别分析除了销售渠道,我们还对产品类别进行了分析。
下图展示了各个产品类别的销售额占比。
产品类别分析图从图中可以看出,A类产品的销售额占比最大,达到了60%;B类产品和C类产品的销售额占比较接近,分别为20%和15%;D类产品的销售额占比最小,仅为5%。
4.4 地区分析最后,我们对销售数据进行了地区分析。
内参,即内部情况、内部参考,是具有中国特色的新闻品种,由新闻机构编辑出版、专门向上级党政领导机关提供具有重要参考价值信息的内部刊物。
长期以来,内参作为党和政府的“耳目”、“参谋”,在反映情况、舆论监督、建言献策等方面发挥了重要作用,受到上级领导的重视。
进入网络时代,内参与其他传统媒体一样,不可避免地受到来自网络的冲击。
适者生存是自然界的法则,适应网络时代的生存法则,内参取向势必需要作出相应调整。
内参面临网络的挑战从某种意义上讲,内参是上级党政领导机关赋予主流媒体的一种“特权”。
像《解放日报情况简报》可直接呈送上海市和中央党政领导机关,毛泽东、周恩来、邓小平、江泽民、朱镕基、胡锦涛、温家宝等党和国家领导人,都曾对《解放日报情况简报》作出重要批示。
赋予这种“特权”是需要,领导希望通过内参了解社情民意,知政之得失;是信任,相信主流媒体能够提供基层一线的真实情况,以利于决策。
在很多人眼里,内参神通广大可“通天”。
于是,基层有什么问题得不到解决,群众有什么冤屈无处申诉,就会想到通过内参向上反映情况,以期得到上级领导的重视和帮助。
不仅如此,内参更让被监督者感到震慑,以至有“不怕公开报道,就怕《情况简报》”之说。
然而,随着网络的崛起,内参拥有的“特权”正在被一点点消解。
网络是信息交流的公共大平台,任何网民都可以自由表达自己的所见所闻所感所思。
反映情况、舆论监督、建言献策等等,□王玲英网络时代的内参取向探析这些内参具有的功能,网络同样无所不能。
两者功能上的趋同,公开化的网络在保密性的内参面前显出强势。
信息来源广。
一家新闻单位,记者不过数以百计;一家网站,网民动辄数以万计。
人员对比上,网络占有绝对优势。
众多网民组成的信息网,可以覆盖到社会的方方面面,凡是网民认为有传播价值的信息,很少会漏网。
传播速度快。
一篇内参从发现线索,到送达目标读者,要经过采访、写作、编辑、审稿、校对、付印、发送等诸多环节,每个环节都有严密的把关措施,耗时甚多。
Western Blot内参的选择,老司机都不知道这些窍门每日生物评论2017-01-31 21:15:13内参即是内部参照(Internal Control),对于哺乳动物细胞来说一般是指由管家基因编码表达的蛋白(Housekeeping Proteins),它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测蛋白的表达水平变化时常用它来做参照物。
一、为什么要使用内参呢?Western blot除了能证明某样品含有某种蛋白之外,其最为重要的作用是比较不同条件下或者不同组织中,目的蛋白表达量的相对多少。
即为蛋白表达水平最直接的证据。
要衡量蛋白的表达水平,前提条件就是等量的上样量。
然而如果仅将蛋白浓度测定作为规范需相互比较的各种样品间上样量等同的唯一方法,显然是不可取的。
首先各种蛋白质浓度定量方法都存在局限性,不能完全准确的确定各种样品的蛋白浓度。
如UV法直接定量,适合测试较纯净、成分相对单一的蛋白质,相对于比色法来说,操作简单,但是容易受到平行物质如DNA的干扰,且敏感度低,要求蛋白的浓度较高。
比色法测定蛋白浓度一般有BCA、Bradford、Lowry等几种方法。
BCA法与Lowry法都容易受到蛋白质之间以及去污剂的干扰。
Bradford法敏感度最高,且与一些列干扰Lowry、BCA反应的还原剂(如DTT、巯基乙醇)相溶,但是对去污剂依然是敏感的,其最主要的缺点是不同的标准品会导致同一样品的结果差异较大,无可比性。
另外,蛋白质定量以后进行电泳时需要等量上样,此步骤也存在操作误差。
在Western Blot实验时使用内参,即可简便地对定量和上样步骤产生的误差进行校正。
在Western Blot中使用内参其实就是在WB过程中另外用内参对应的抗体检测内参,这样在检测目的产物的同时可以检测内参的表达,由于内参在各组织和细胞中的表达相对恒定,借助检测每个样品内参的量就可以用于校正上样误差,这样半定量的结果才更为可信。
起早文稿内参咨询机制
内参,顾名思义就是内部参考。
广义的内参可指任何机构搜集的供内部人员参考的信息资料。
比如这本206页的《弹个车员工成长手册》,公众不但没有看到过,而且恐怕以后很难看到了这几天弹个车正以“以旧换新”的名义,从员工手里回收。
这本手册,承载了弹个车的几乎所有秘密。
不过在我国,社会上谈论的《内参》,更多是指《新闻内参》。
也就是新闻媒体向各级党政机关专门呈送的一种新闻报道,是新闻的一种特殊形式。
与普通的新闻不同的是,新闻内参是一种不进行公开发布的报道。
每个级别的新闻媒体都有《内参》,但赫赫有名,也是坊间流传的默认值,实际上是指《人民日报》社和新华社编发的《内参》。
1、绝密级:《人民日报内参》和新华社《国内动态清样附页》,供中央政治局常委或委员参阅,一般反映极为重大和紧急的事态。
2、机密级:《国内动态清样》和国际《参考清样》,供省部级以上领导参阅,主要反映重要动态、敏感问题和重要建议。
内参即是内部参照,它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测基因的表达水平变化时常用它来做参照物。
常用的PCR内参有GAPDH 、β- actin 、18sRNA、28sRNA 、B2M、ACTB、SDHA、HPRT1、ARBP内参基因等正向引物(上游引物)是沿着负链进行不间断延长的反向引物(下游引物)是沿着正链进行一段段延长的正链是含有目的基因的那条链。
RT-PCR 为反转录RCR(reverse transcription PCR)和实时PCR(real time PCR)共同的缩写。
逆转录PCR,或者称反转录PCR(reverse transcription-PCR, RT-PCR),是聚合酶链式反应(PCR)的一种广泛应用的变形。
在RT-PCR中,一条RNA链被逆转录成为互补DNA,再以此为模板通过PCR进行DNA扩增。
由一条RNA单链转录为互补DNA(cDNA)称作“逆转录”,由依赖RNA的DNA聚合酶(逆转录酶)来完成。
随后,DNA的另一条链通过脱氧核苷酸引物和依赖DNA的DNA聚合酶完成,随每个循环倍增,即通常的PCR。
原先的RNA模板被RNA酶H降解,留下互补DNA。
RT-PCR的指数扩增是一种很灵敏的技术,可以检测很低拷贝数的RNA。
RT-PCR广泛应用于遗传病的诊断,并且可以用于定量监测某种RNA的含量。
(检测基因表达的方法,参见Northern Blot法。
RT-PCR的关键步骤是在RNA的反转录,要求RNA模版为完整的且不含DNA、蛋白质等杂质。
常用的反转录酶有两种,即鸟类成髓细胞性白细胞病毒(avian myeloblastosis virus,AMV)反转录酶和莫罗尼鼠类白血病病毒(moloney murine leukemia vrius,MMLV)反转录酶。
RT-PCR有时候也会指代实时PCR(real-time PCR)。
为了与逆转录PCR相区别,通常被写作“定量PCR”(quantitative PCR)或者RTQ-PCR(real-time quantitative PCR)。
3实时PCR实时PCR(real-time PCR),属于定量PCR(Q-PCR)的一种,以一定时间内DNA的增幅量为基础进行DNA的定量分析。
real time PCR 的定量使用荧光色素,目前有二种方法。
一种是在ds DNA中插入特异的荧光色素,例如SYBR Green荧光染料;另一种使用一种能与增幅DNA序列中特定寡核酸序列相结合的一种荧光探针(probe),如Taqman探针。
两种方法原理不同。
SYBR Green荧光染料游离时不发光,当反应体系中存在双链DNA时,SYBR Green与双链DNA结合,此时才发光。
Taqman探针带有一个荧光基团和一个淬灭基团,荧光基团连接在探针的5’末端,而淬灭基团则在3’末端。
PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,T aq酶的5'-3'外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,此时荧光基团发出的荧光信号可以被检测到。
real time PCR 与reverse transcription PCR 相结合,能用微量的RNA来找出特定时间、细胞、组织内的特别表达的遗传基因。
这两种RT PCR的组合又被称之为“定量RT-PCR(quantitative RT-PCR)”RT-PCR技术相关试剂1oligo: 多聚体,相当于mRNA引物2AMV RT:禽类成髓细胞瘤病毒逆转录酶3MMLV RT:莫洛尼鼠白血病病毒逆转录酶4dNTPs:脱氧核苷酸5RNase:RNA水解酶6PCR Buffer:RT-PCR缓冲液7MgCl2:2价镁离子PCR各步骤的目的5.1预变性破坏DNA中可能存在的较难破坏的二级结构。
使DNA充分变性,减少DNA 复杂结构对扩增的影响,以利于引物更好的和模板结合,特别是对于基因组来源的DNA模板,最好不要吝啬这个步骤。
此外,在一些使用热启动Taq酶的反应中,还可激活Taq酶,从而使PCR反应得以顺利进行。
5.2三种循环8模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;9模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;10引物的延伸:DNA模板--引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA 链互补的半保留复制链。
5.3延伸时间原因11用PCR仪扩增时,(变性.退火,延伸)循环完成后,继续72度延伸了10分钟的原因:12延伸时间取决于待扩增DNA片段的长度。
(当然是在反应体系一定的条件下)例如,使用TaqDNA聚合酶,72度时的碱基掺入率为35-100bp/s,因此延伸速率为1kb/min。
13根据延伸速率推得,扩增1kb以内的DNA片段1min即可,而3-4kb则需要3-4min,依次照推。
通常在最后一轮要适当的将延伸时间延长至4-10min,这样做是使PCR反应完全以提高扩增产量。
14继续72度延伸了10分钟除了可以使PCR反应完全以提高扩增产量外,还有一个作用是:在用普通Taq酶进行PCR扩增时在产物末端加A尾的作用,可以直接用于TA克隆的进行。
5.4PCR引物的选择对靶序列中潜在的引物位点进行分析,这些位点应该不会形成同源多聚体机构,也没有明显的形成二级结构的趋势,不会自身互补,与基因组中的其他序列无显著的同源性。
15依据寡核苷酸引物与其靶序列形成杂合分子的熔解度的计算中提供的公式计算各引物的熔解温度。
16选择一对匹配完好的正向和反向引物。
两条引物的G+C含量相似,将产生一种大小和碱基组成合适的产物。
两条引物与所扩增片段的GC含量都应在40%-60%之间。
17对寡核苷酸的长度和/或位置进行细调。
使得引物的3‘末端核苷酸为G或C。
检查两条寡核苷酸之间有无明显的互补性。
作为一条经验性的规律,一条引物上不该含有三个连续的与另一条引物互补的核苷酸。
5.5注意事项18双链DNA的变性温度是由双链中C+G的含量决定的,C+G含量越高,模板DNA 的溶解温度就越高。
在选择的变性温度下,模板链越长变性所需时间就越长。
如果变性温度过低或变性时间过短,会使仅仅富含A+T区域变性。
当模板DNA的G+C含量超过55%的时需要更高的变性温度。
19复性过程采用的温度至关重要如果复性温度太高,寡核苷酸引物不能与模板很好的复性,扩增效率将会降低。
如果复性温度太低,引物将产生非特异性复性,从而导致非特异性的DNA片段的扩增。
复性通常在比理论计算的引物和模板的溶解温度低3—5℃的条件下进行。
20PCR扩增所需的循环数目决定于反应体系中起始的模板拷贝数以及引物延伸和扩增的效率。
一旦PCR反应进入几何级数的增长期,反应会一直持续下去,直至某一成分成为限制因素。
从这一点上来说,扩增产物中绝大多数应该是特异性的扩增产物,而非特异性的扩增产物应该低到难以检测到的程度。
用TaqDNA聚合酶(效率为0.7)在一个含有10的5次方个拷贝的靶序列的反应体系中进行30个循环后往往可以做到上述的理想情况。
RT-PCR的RNA如何定量设计内参引物,一般来说,是actin基因先确定循环数:设置不通的循环数,用反转录cDNA 为模板进行PCR扩增,以能扩出来条带为循环数均一化模板:不同体积的cDNA为模板,以确定的循环数为扩增循环数,进行PCR扩增,调节模板的量到扩增亮度一致时,cDNA 的量就一样了然后,再用你自己的引物进行扩增,就可以得到理想结果了RT-PCR 技术原理、步骤与注意事项RT-PCR 简介RT-PCR 的指数扩增是一种很灵敏的技术,可以检测很低拷贝数的RNA。
RT-PCR 广泛应用于遗传病的诊断,并且可以用于定量监测某种RNA 的含量。
(检测基因表达的方法,参见Northern Blot 法。
)RT-PCR 有时候也会指代实时PCR(real-time PCR)。
为了与逆转录PCR 相区别,通常被写作“定量PCR”(quantitative PCR)或者RTQ-PCR(real-time quantitative PCR)。
实时PCR 实时PCR(real-time PCR),属于定量PCR(Q-PCR)的一种,以一定时间内DNA 的增幅量为基础进行DNA 的定量分析。
real time PCR 的定量使用萤光色素,目前有二种方法。
一种是在ds DNA(双链DNA)中插入特异的萤光色素;另一种使用一种能与增幅DNA 序列中特定寡核酸序列相结合的一种萤光探针(probe)。
real time PCR 与reverse transcription PCR(反转录PCR) )相结合,能用微量的RNA 来找出特定时间、细胞、组织内的特别表达的遗传基因。
这两种RT PCR 的组合又被称之为“定量RT-PCR(quantitative RT-PCR)” RT-PCR 技术相关试剂oligo: 多聚体,相当于mRNA 引物AMV(M-MLV):逆转录酶dNTP:脱氧核苷酸RNase:RNA 酶抑制剂PCR Buffer:RT-PCR 缓冲液MgCl2:2 价镁离子PCR 各步骤的目的(一)预变性:破坏DNA 中可能存在的较难破坏的二级结构。
使DNA 充分变性,减少DNA 复杂结构对扩增的影响,以利于引物更好的和模板结合,特别是对于基因组来源的DNA 模板,最好不要吝啬这个步骤。
此外,在一些使用热启动Taq 酶的反应中,还可激活T aq 酶,从而使PCR 反应得以顺利进行。
(二)变性--退火--延伸循环:①模板DNA 的变性:模板DNA 经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA 双链或经PCR 扩增形成的双链DNA 解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;②模板DNA 与引物的退火(复性):模板DNA 经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA 单链的互补序列配对结合;③引物的延伸:DNA 模板--引物结合物在T aqDNA 聚合酶的作用下,以dNTP 为反应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA 链互补的半保留复制链。
(三)PCR 仪扩增循环后72 度延伸10 分钟用PCR 仪扩增时,(变性.退火,延伸)循环完成后,继续72 度延伸了10 分钟的原因: 1.延伸时间取决于待扩增DNA 片段的长度。