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目 录第一部分 上海交通大学生物化学考研真题2016年上海交通大学831生物化学考研真题（回忆版）2015年上海交通大学831生物化学考研真题（回忆版）2014年上海交通大学831生物化学考研真题（回忆版）2013年上海交通大学831生物化学考研真题（回忆版）2005年上海交通大学460生物化学考研真题2004年上海交通大学701生物化学（1）考研真题2003年上海交通大学801生物化学考研真题2002年上海交通大学321生物化学考研真题2001年上海交通大学321生物化学考研真题2000年上海交通大学90生物化学考研真题第二部分 上海交通大学分子生物学考研真题2007年上海交通大学616分子生物学考研真题2007年上海交通大学630分子生物学原理考研真题2006年上海交通大学340分子生物学考研真题2006年上海交通大学333分子生物学原理考研真题2005年上海交通大学340分子生物学考研真题2004年上海交通大学340分子生物学考研真题2002年上海交通大学461分子生物学考研真题2001年上海第二医科大学分子生物学考研真题第一部分 上海交通大学生物化学考研真题2016年上海交通大学831生物化学考研真题（回忆版）一、填空（60分，30个）（1）细胞能量代谢有的是分解代谢有的是合成代谢，这类代谢叫______（2）胰岛素序列是______发现的（3）线粒体ATP合成机制的化学渗透假说由______提出。
（4）二羟丙酮磷酸和3-磷酸甘油酸之间重要的酶______（5）磷酸戊糖途径的______对脂质合成很重要（6）western实验检测______（7）溴化氰酶切______氨基酸（8）乙酰基和辅酶A之间用______连接（9）有个酶的倒数图计算Km Vmax（10）河豚毒素和神经细胞的______结合致命（11）凝胶电泳用______染色DNA片段（12）异柠檬酸氧化脱羧（13）合成脂肪酸前体______（14）卡尔文循环与戊糖磷酸途径共同的酶是______。
（三）单糖的构象：·构型相同的分子可由单键旋转产生很多不同形态，分子最终采取的特定形态即构象。
·找到优势构象，即构象分析。
·环己烷构象有椅式和船式两种，主要以椅式存在，两种构象间可互变。
·吡喃型己糖可能有八种无张力环构象：两种椅式和六种船式。
椅式中Ⅰ型常是优势构象。
作业题1、简介：同分异构的类型。
2、简介：D-型甘油醛的Fischer投影式所表达的意义。
3、如何应用RS表示法确定手性碳原子的空间构型？4、以葡萄糖为例，介绍变旋的现象及发生原因。
四．单糖的性质：（一）单糖的物理性质：1．旋光性：鉴定糖的重要指标。
变旋现象。
2．甜度：以蔗糖甜度为基准，相同条件下比较得出其他糖的相对甜度。
3．溶解度：易溶于水，不溶于乙醚、丙酮等非极性有机溶剂。
（二）单糖的化学性质：1．异构化：在弱碱下，葡萄糖、果糖和甘露糖可经烯醇式中间物相互转化；在强碱溶液中很不稳定。
2．单糖的氧化：（1）氧化成醛糖酸：在弱氧化剂作用下。
（2）氧化成醛糖二酸：在较强氧化剂下。
（3）氧化成糖醛酸：在酶作用下。
酮糖的氧化与醛糖有所不同。
第7章蛋白质结构与功能的关一．肌红蛋白的结构与功能：（一）肌红蛋白的三级结构：1、肌红蛋白由一条含153个氨基酸残基的多肽链和一个血红素辅基构成。
2、1963年，英国科学家J.Kendrew等用X-射线晶体衍射法分析抹香鲸肌红蛋白空间结构。
3、多肽链先折叠成8段长度为7到23个氨基酸残基不等的α-螺旋，每两段螺旋拐角处是长度为1到8个氨基酸残基组成的无规则卷曲。
C-端5个氨基酸残基也形成无规则卷曲。
4、肌红蛋白三级结构外观是个扁平菱形的紧密结构，分子内部只能容纳4个水分子。
5、亲水性氨基酸残基几乎都分布在分子表面，疏水性残基几乎全埋在分子内部，因此是水溶性蛋白质。
6、辅基血红素垂直插入分子表面的一个洞穴，经配位键与肽链第93位的组氨酸残基相结合。
（二）辅基血红素：1、血红素由原卟啉和一个Fe2+ 组成。
名词解释1 氨基酸的等电点：在某一PH 溶液中，氨基酸解离城阳离子和阳离子的趋势及程度相等，成为兼性离子，成电中性，此时溶液的PH2 呼吸链：物质代谢过程中脱下的成对氢原子通过多种酶和辅酶所催化的连锁反应逐步传递最终与氧结合生成水，同时释放能量，这个过程在细胞线粒体中进行与细胞呼吸有关。
6 核苷酸的从头途径：是指利用磷酸核糖、氨基酸、一碳单位及二氧化碳等简单物质为原料，经过一系列酶促反应合成核苷酸的过程。
9 核酸变性：核酸分子的双螺旋结构解开，次级键断裂，使双链分解这种现象称为核酸变性。
12 血脂：血浆中的中性脂肪（甘油三酯和胆固醇）和类脂（磷脂、糖脂、固醇、类固醇）的总称，18 DNA的变性：是指核酸双螺旋碱基对的氢键断裂，双链变成单链，从而使核酸的天然构象和性质发生改变。
19 生物氧化：是在生物体内，从代谢物脱下的氢及电子﹐通过一系列酶促反应与氧化合成水﹐并释放能量的过程。
也指物质在生物体内的一系列氧化过程。
21 P/O比值：指物质氧化时，每消耗1个原子氧所消耗无机磷的摩尔数（或ATP摩尔数），即生成ATP的克分子数。
26辅酶：作为酶的辅因子的有机分子，本身无催化作用，但一般在酶促反应中有传递电子、原子或某些功能基团(如参与氧化还原或运载酰基的基团)的作用。
27 辅基：是与酶蛋白共价结合的金属离子或一类有机化合物。
31非竞争性抑制作用：此类抑制剂与酶活性部位以外的部位可逆地结合，并不影响底物与酶的活性部位结合；也不影响酶一底物的复合物与抑制剂的结合。
但其作用是使底物、酶、抑制剂三者结合形成的复合物（EIS）不能生成产物。
这种抑制作用称为非竞争性抑制作用。
32反竞争性抑制作用：有的抑制剂仅与酶和底物形成的复合物结合，使复合物ES的量下降，如此，既阻碍产物生成，又阻止底物游离。
此抑制作用称为反竞争性抑制作用。
35 糖原合成：由葡萄糖(包括少量果糖和半乳糖)合成糖原的过程。
36糖原分解：从糖原解聚生成葡萄糖的细胞内分解过程，由糖原磷酸化酶等催化完成。
Chapter 21. (a) tropomyosin原肌球蛋白70-kd→35-kd (two-stranded)→318 residues (meanresidue mass 110)→477Ǻ(axial distance of per residue in α-helix is 1.5Ǻ)(b)40 residues→36 (4 for hairpin turn) →18 (two-stranded) →63Ǻ(the rise per residue 3.5Ǻin βsheet) motif基序Ǻ mom基基t2. contrasting isomer截然不同的异构体dioxane二噁烷in Leu methyl甲基is attached to γ-C atom, while in Ile it to β-C atom(比较靠近主链α-碳原子,造成立体位阻,阻断α-螺旋的形成)3. Ala＜Val; Ile ＞Gly …Ala……Ile….. with activity (wild type)…Val……Ile……lose activity (mutant type)…Val……Gly… regain activity (double-mutant type)4. shuffle重新洗牌, disulfide-sulfhydryl exchange二硫键-巯基互换; PDI蛋白二硫键异构酶, scrambled ribonuclease杂乱的核糖核酸酶杂乱的核糖核酸酶在PDI作用下由无序变成有序,而胰岛素则由有序变成无序,说明胰岛素结构并非热力学最稳定的形式;因为胰岛素是由(比它多33个残基的)胰岛素原形成的,后者才是热力学最稳定的形式.5.stretching a target使目标(蛋白底物)伸展; protease蛋白水解酶6. Gly has the smallest side chain of AA: tight turns and approaching one another closely7.guanidinium group胍基of Arg (positive): Glu, Asp, and the terminal carbonyl group (negative)8.keratin角蛋白烫发: 加入巯基化合物(作为还原剂)和适当的温度使原来(发型中)的二硫键打断,卷曲头发(至所需型态)并加入氧化剂,使之形成新的二硫键并稳定.Chapter 31.(a)phenyl isothiocyanate (PITC) 异硫氰酸苯酯(b)Dansyl chloride丹黄酰氯(or dabsyl chloride)(c)Urea尿素; β-mercaptoethanol β-巯基乙醇(d)chymotrypsin糜蛋白酶(N)……R-‖-X……(C) R: Phe Trp, Tyr(e)CNBr (N)……Met-‖-X……(C)(f)Trypsin (N)……R-‖-X……(C) R: Arg or Lys2. K=[H+][A－]/[HA] →pH=pK +log [A－]/[HA]3.anhydrous hydrazine无水肼: 处理多肽(蛋白质)发生裂解,羧基末端的氨基酸释放成游离氨基酸,可被鉴定.所有其他氨基酸残基变成酰肼衍生物.4. ethyleneimine乙烯亚胺+ Cys →S-aminoethyl氨乙基derivatives (S-氨乙烯半胱氨酸) →与Lys类似Cys*-‖-X5. incident入射, transmitted透射, εextinction coefficient (molar absorption coefficient)消光系数; I = I0 10－εlc A (log I0/I) =εlc1mg/ml →5.62 x 10－5 M (MW= 17.8 kd) A = 15000 x 5.62 x 10－5 x 1= 0.84 = log10(I0/I) I0/I=6.96 即14.4%的入射光被透射6. tropomyosin原肌球蛋白rod shaped7.s ∝m/f f = 6πηr m ∝r3 →s ∝m2/38. y = kx + b log (MW) = k (RM) + b y—log (MW) MW:molecular weight X—RM: relative mobilitylog 92000 = 0.41 k + blog 30000 = 0.80 k + b k= －1.26 b= 5.465So, the apparent mass of a protein having a mobility of 0.62 is 50 kdChapter 41.5’ GATCAA 3’3’ CTAGTT 5’→5’TTGATC3’(书写自左向右5’→3’)3. 17μm－15μm = 2μm = 20000A÷3.4A = 5800 base pairs4．A(15N) B(14N)Conservative replication: AA→AA+BB (F1)→AA+BB+ BB+ BB(F2)Semiconservative replication: AA→AB+ AB (F1) →AB+ AB +BB+ BB (F2)6. competence感受态Bacillus subtilis枯草芽胞杆菌possible reason: 1.not able to take up DNA 2.having deoxiribonuclease脱氧核糖核酸酶3.not able to integrate fragments of DNA into their genome7. propitious有利的; T2 is used by Hershey and Chase (P78) to separate itself into genetic (DNA) and nongenetic (protein) parts. M13 is not. (它的蛋白外壳将嵌入宿主的内膜,离心后将随细胞沉淀)8. （a）tritiated thymine (or thymidine)(b) dNs-P*~P~P9.5’_______________3’-OH3’-OH_______________5’10. reverse transcriptase逆转录酶deoxythymudylate oligonucleotidetemplate: poly(rA) →primer oligo dT ＋3’…AAAAAAAAAAA…5’TTT(OH)…11.RNA→DNA-RNA hybrid →DNA transcript →double-helical viral DNA(both by reverse transcriptase) ribonuclease核糖核酸酶；polymerase聚合酶; 逆转录酶兼具聚合酶和核糖核酸酶的功能12．Turnip 芜菁Virus →treated with phenol苯酚(to remove protein) →NA (divide into two samples)1. treated with ribonuclease核糖核酸酶2. treated with deoxyribonuclease脱氧核糖核酸酶13．G-C →G-U (by deamination脱氨) →G-C ＋A- U (after one round of replication) →G-C ＋G-C ＋A- U ＋A- T (after two round of replication)14. hydrogen cyanide氰化氢(HCN) pentamer五聚体adenine腺嘌呤(H5C5N5)15. (a) AA AC AG AT 24CA CC CG CTGA GC GG GTTA TC TG TTCHAPTER 51. (a) dATP, dCTP, dGTP, dTTP (for DNA); ATP, CTP, GTP, UTP (for RNA)2.(a) 3’–ATTGCCATGCTA-5’5’-UAACGGUACGAU-3’(b) 5’-UUGCCUAGUGAUUGGAUG-3’N-Leu—Pro—Ser—Asp—Trp—Met-C© 5’-UUACUUACUUACUUACUUACUUAC…-3’Poly(UUAC)N-Leu—Leu—Thr—Tyr--Leu—Leu—Thr—Tyr-C Poly(Leu-Leu-Thr-Tyr)5’-UUACUUACUUACUUACUUACUUAC (3)N- Tyr- Leu- Leu- Thr….. Poly(Tyr-Leu-Leu-Thr)5’-UUACUUACUUACUUACUUA -3’N- Thr - Tyr- Leu – Leu…. Poly(Thr-Tyr-Leu-Leu)ordycepin蛹虫草菌素3’-deoxyadenosine脱氧腺苷It terminates RNA synthesisbecause it lacks a 3’-OH group.5.poly(G)聚鸟苷酸forms a triple-stranded structure三股螺旋结构, therefore it can’tserve as a template for protein synthesis. Poly(A), poly(C) and poly(U) can do as single-stranded RNA.6.5’…TACTACTAC…3’3’… ATGATGATG ATGATGATG…5’↓DNA聚合酶，连接酶5’…TACTACTACTACTACTACTAC…3’3’… ATGATGATGATGATGATGATG…5’RNA polymerase +only UTP, ATP, CTP→only poly(UAC)3’…ATGATGATGATGATGATG…5’5’…UACUACUACUACUAC…3’RNA polymerase +only UTP, ATP, GTP→only poly(GUA)3’…CATCATCATCATCATCAT…5’5’… GUAGUAGUAGUAGUA…3’7. Lys: (AAA or AAG); →(a) Asp: GAU or GAC impossible→(b)Arg: AGA or AGG; Asn: AAU or AAC; Gln: CAA or CAGand Glu, Ile, Met, Thr palatable合口味8.triple entendre三关语5’-AAAUGAGGA-3’ 3 different-polypeptide products:(a). 5’…-AAAUGAGGA-…3’…Lys(stop)(b). 5’-…AAAUGAGGA-…3’…-Asn-Glu-…(c). 5’…-AAAUGAGGA-…3’…-Met-Arg-…9.Highly abundant AA: Leu and Ser: 6 codonsIntermediate ones: His and Cys: 2 codonsLeast abundant ones; Met and Trp: 1 codonBenefits: (a) variation in base composition相同蛋白碱基构成有差异(b) decreases the likelihood that a substitution of a base will change theencoded AA.降低了因为一个碱基替代(突变)而改变（由该密码子编码的）氨基酸的概率由在蛋白中出现频度决定氨基酸对应密码子数与（假定）密码子均匀分布（每个氨基酸3个）相比，前者将(a)和(b)发挥到最大10.Raney nickel拉内镍铝合金5’-UUUUGCCAUGUU UGU GCU-3’N-Phe—Cys—His—Val—Ala*—Ala—C含有UGU反密码子(3’-ACA-5’)的tRNA原本结合14C标记的Cys*, 经拉内镍铝合金化学修饰后变为Ala*.11. GUC and GUG are likely to be used more by the alga藻类from the hot springs热温泉to increase the melting temperature of its DNA, because C≡Gby contrast : GUA and GUU by the alga from an Antarctic bay南极, because A=T 12．(a) the degeneracy of the genetic code, the same AA often corresponds different Nt (especially the third base in codon) 两个不同物种拥有同一功能蛋白，它们的蛋白（氨基酸序列）差异小，而DNA（碱基序列）差异大eon 109年(b) mutations with changed AA are subject to more stringent selection (i.e. difficult tosurvive) 导致氨基酸改变（进而蛋白改变）的突变遭受更为严格的自然选择CHAPTER 61. 5’-GGCATAC-3’2plementary DNA (cDNA): mRNA(成熟)→hybrid (mRNA + cDNA)→single-stranded cDNA→single-stranded hairpin →double-stranded cDNA (P136)(不含内含子)Ovalbumin卵清蛋白genomic DNA→infect E. coli →primary transcript (E. coli lacks the machinery to splice it) 大肠杆菌不具备剪接基因组DNA初级转录物的功能3.(a)human genome: 3 x 106 kb; averaging length of a human gene is 100 kb (＞＞4 kb)(b)chromosome walking→having overlapping fragments →exhaustive digestionwith more restriction enzymes重叠短片段是染色体步查的前提,而重叠短片段是一个以上限制酶对基因组进行彻底消化(所产生)的结果(仅用EcoRI一种限制酶切割形成的是非重叠片段).4.change from GAG to GTG→loss of a restriction site (by MstⅡ: CCTGAGG)→replacement of 2 fragments on the Southern blot by a longer one 一个点突变导致一个限制(酶切割)位点丢失,经DNA印迹,该限制酶(切割突变了的DNA的)产物所在泳道中的条带比正常的少一条(以一条较长的代替了两条较短的).any site mutagenesis within the sequence CCTGAGG will lead to such result(这一序列中任何一个点突变都导致上述结果,故不能说明GAG突变成了GTG)5. ciliate protozoan Tetrahymena纤毛原生动物四膜虫autocatalysis自催化a region in plasmid consists of intron + flanking sequences (present in the precursor rRNA)(1)在E.coli中复制此重组质粒(2)用E.coli RNA polymerase体外转录此DNA (3)产物rRNA在体外进行自我剪接(不存在任何四膜虫的蛋白),此内含子被剪去.6.cassette mutagenesis 盒式诱变用两个不同的限制酶从一对特定的限制位点切去一段DNA后,将另一段具上述(盒)位点互补末端的人工合成寡聚核苷酸与之连接. 此法适应范围广,插入的DNA可具任何所需序列.7.Terra incognita未知领域terrain地带_____________ _____________________________ ________________PCR (1)从基因组消化产物中选取含此片段的DNA(2)将它环化(成环状)(3)按图示方向进行PCR(在两个引物的引导下)8. 此(用PCR方法扩增的)DNA是由四个完全相同的序列重复排列组成的,故可编码含有四个相同的重复片段的蛋白.Chapter 71.(a) W = CV = 87μm3 x 34 g/100ml = 87 x 10―12 ml x 34 g/100ml =2.96 x 10―11g 每个红细胞中血红蛋白的重量(b) MW hemoglobin =6.6 x 104 2.96 x 10―11g ÷6.6 x 104x 6.023 x 1023 =2.71 x 108 每个红细胞中血红蛋白的分子数(c) 87 x 10―18 m3÷(65 x 10―10) 3 m3 = 3.22 x 108立体晶格排列, 每个红细胞含(最大可能的)血红蛋白分子数实际堆积密度是理论状况(立体晶格排列,含最大可能的血红蛋白分子数)的84%,即红细胞中血红蛋白浓度不可能再比这个测得值(2.71 x 108)大得多.2.血红蛋白重量与铁重量的关系(重量比): 每一个分子血红蛋白(含四个亚基)中含四个铁原子(每个亚基含一个血红素即一个铁), 即6.6 x 104/4 x 56该人含血红蛋白总重:70kg x 70ml/kg x 16 g/100ml = 784g该人含铁总重: 784 x (4 x 56 / 6.6 x 104)= 2.65g or 2.65/56 = 4.75 x 10―2 moles3.(a)MW myoglobin =1.78 x 104 (153个残基) 每公斤(人肌肉)含肌红蛋白mole数: 8÷1.78 x104= 4.49 x 10―4即含氧4.49 x 10―4mole(因每一个肌红蛋白分子结合一个氧分子),故4.49 x 10―4 x 32 =1.44 x 10―2g每公斤(人肌肉)含氧气克数.抹香鲸肌红蛋白中,答案是上述数据的十倍(因每公斤抹香鲸肌肉含肌红蛋白克数是人的十倍: 80:8)(b) 4.49 x 10―3÷3.5 x 10―5 = 128 即结合在(每公斤)抹香鲸肌肉肌红蛋白中的氧mole数是直接离解在(每升)组织水中氧mole数的128倍(这就是为什么高等哺乳动物用肌红蛋白而不是组织水作为氧载体)4. (a)平衡常数K=解离速率常数k off / 结合速率常数k onk off = K k on =10―6M x 2 x107M―1 S―1=20 S―1(b)氧合肌红蛋白复合体平均存在时间是解离速率常数的倒数即0.05 S5.(a)增加pH即降低[H+],使血红蛋白的氧亲和力↑(b)增加二氧化碳分压使血红蛋白的氧亲和力↓(c)增加2,3-二磷酸甘油酸浓度使血红蛋白的氧亲和力↓(d)将四聚体离解成单体(使血红蛋白变成与肌红蛋白相似),血红蛋白的氧亲和力↑6.avian鸟类reptilian爬行类turtle海龟stripped of除去G-6-P 6-磷酸葡萄糖inositol hexaphosphate肌醇六磷酸malonate丙二酸lactate乳酸.(2,3BPG含有多重负电荷,与血红蛋白(两条)β链上的多个带正电荷的残基结合)9.血液中一半血红素(位点)被CO饱和的人是致死的,而血红蛋白减量至一半的贫血患者却能正常工作,这似是而非的悖论如何解释?CO与一个血红素结合后会增加氧与同一血红蛋白分子中其它血红素的结合,从而降低从活跃代谢组织中释出的氧气数量(使组织得不到充分的氧供应而致死).即CO能稳定氧合血红蛋白所特有的四级结构(R型). 换言之, CO模仿氧气作为变构效应物.11.(a) Val--His--Leu--Thr--Pro--Glu(Lys) -‖-Glu--Lys--- tryptic peptide胰蛋白酶水解肽GTGCACCTGACTCCTGAGGAGAAG(b) GAG(Glu)→AAG(Lys)(c)此突变的蛋白比HbA(Glu6)和HbS(Val6)带有更多的正电荷(Lys), 所以电泳朝着正极泳动时较慢.(答案“moves more rapidly toward the anode正极”似有误)CHAPTER 81.(a) PPi + H2O→2Pi (by pyrophosphatase焦磷酸酶)2800×10÷900 = 31.1μmole 每毫克酶具有的活性单位(V max)→每毫克酶15分钟内转化的底物μmole数→每毫克酶1秒钟内转化的底物μmole数(b)1×10－3÷(1.2×105) ×106×6 = 0.05μmole 每克→每毫克酶相当mole数(MW为120kd) →化为μmole数→每毫克酶含有的活性部位(每个焦磷酸酶含有6个活性部位) (c) 31.1μmole÷0.05μmole = 622 s－1 每毫克酶1秒钟内转化的底物μmole数→每个活性部位1秒钟内转化的底物数即”反转数”(turnover number),对比P195表8-3, 此值居中.2.penicillinase青霉素酶, β-lactamaseβ-内酰胺酶(a)[penicillin] 10－6M amount hydrolyzed (nanomoles)每分钟纳mole(10－9M/min)Yes(双倒数图呈直线), K M=5.2 x 10－6 M (从横轴截距获得)(b) V max=0.684 x 10－9 =6.84 x 10－10M /min(从纵轴截距获得)(c) 6.84 x 10－10 /60 (每秒生成产物的摩尔数)10－9g/(29.6 x 103)(溶液中酶的摩尔数)6.84x 10－10 /60÷10－9g/(29.6 x 103) = 337s－1 (每秒每个活性部位生成产物的个数,即翻转数turnover number)4. (a)no inhibitor: V max= 47.6μmole/min K M=11 x 10－6 M =1.1 x 10－5M存在竞争性抑制剂的条件下, V max不变, K M增高存在非竞争性抑制剂的条件下, K M不变, V max降低根据表格中的数据(存在抑制剂),在双对数图中得到(see Fig. 8-20): V max不变(即47.6μmole/min), K M= =3.1 x 10－5M(b)所以是竞争性抑制(c)两条直线(有抑制剂和没有抑制剂的)斜率比(也即K M比值)是2.8,即1 + [I]/ K i =2.8; [I]= 2mM =2 x 10－3 M得结合(解离)常数K i=1.1 x 10－3 M(d) f ES= V/V max = [S]/([S]+ K M) = 10/(10+31) =0.243(e) [S]=30μM=30 x 10－6 M,f ES= V/V max = [S]/([S]+ K M) = 30/(30+11) =0.73(无抑制剂)f ES= V/V max = [S]/([S]+ K M) = 30/(30+31) =0.49(存在2mM抑制剂)此比率1.49(0.73/0.49)与[S]=30时两者的反应速率的比率1.49(33.8/22.6)相等5.(a)从双倒数图查得V max=9.5μmole/min K M=1.1 x 10－5 M(与无抑制剂时相等)(b) 所以是非竞争性抑制(c) 从双倒数图查得(或由比值47.6/9.5)V max/ V I max=5 V I max= V max/(1+[I]/ K i) 由[I]=100μM 得K i =2.5 x 10－5 M,(d) f ES= V/V max = [S]/([S]+ K M) = 30/(30+11) =0.73(有或无非竞争性抑制剂存在一样)CHAPTER 91.推断过程: NAG3对溶菌酶稳定,排除A-B和B-C; C位只可能是NAG而非NAM(占空间太大);细菌细胞壁被切割的只可能是NAM-NAG键,排除C-D 和E-F所以结论是(因为此六糖是交替排列的)D-E: (b＞c＞a)G-M-G-M-‖-G-MA B C D E F3..见p212 Fig9-9,图中水用同位素标记,由于被切断的是(D)C1-‖-O(E)键(而不是(D)O-‖- C4(E)键),所以标记O进入C1. 本题中合成的六糖中的D-E间的O用同位素标记, 由于被切断的是C1-‖-O键,所以O进入E,即二糖的C4.5. (a)和(b)In oxyhemoglobin: Fe与五个N原子(4个血红素卟啉环N和一个近侧组氨酸N)和一个氧原子(来自所结合的氧分子)成键, 见Fig 9-26In carboxypeptidase A: Zn与两个N(两个His侧链各一个)两个O(Glu侧链和水分子各一个)成键© Asp; Cys; Met (O,S)6. 为证实Tyr248(TAT)是否在(羧肽酶)催化过程中所必须→将它定点突变成天冬氨酸Asp(TTT,两者密码子仅一个碱基差别)→重组质粒转入酵母细胞表达→(惊人的发现!)突变后形成的酶与天然酶相比:K cat不变, K M值高六倍→显示Tyr248参与结合底物(亲和力突变后大大下降),却不参与催化(反转数不变)→定点突变在揭示蛋白中某一个特定残基的功能中具重要作用8. lysozyme: Glu35(Fig 9-11) ribonuclease A: His119 (Fig 9-21) carboxypeptidase A: the zinc-bounded H20(activated) (Fig 9-27)chymotrypsin: His57 (Fig 9-33,9-34)CHAPTER 102.(a) 协同模型:由Monod, Wyman, Changeux (MWC) 提出的一种变构酶的模型.认为:酶以两种不同的构象形式存在(R型和T型).两者处于相互平衡之中.两者与其底物和效应物分子结合的能力(亲和力)不同.变构酶总是维持分子的总体对称,即一个分子中的不同亚基任何时候都处于相同的构象状态. 与底物和效应物分子结合使平衡从一种形式转换成另一种形式.在协同模型中, 变构酶若有n个底物结合位点, 底物与R型酶和T型酶结合亲和力之比为A, 则(每一分子酶)结合一分子底物后, [R型酶] / [T型酶]的改变为A; 结合n个底物后, [R型酶] / [T型酶]的改变为A n. 因A=100, (每一分子酶)结合一分子底物, △L([R型酶] / [T型酶])=100(b)已知L=10－7(酶未结合底物时), 变构酶的四个结合位点都被底物占据后, △L=1004,所以L=10－7 x 1004 = 10, 即[R型酶] / [T型酶]由未结合底物时的10－7改变为(每一分子酶)结合四分子底物时的10.5.酶原激活; 胃蛋白酶原→胃蛋白酶属于分子内激活, 激活速率与底物(即酶原)浓度无关.(P251): 胃蛋白酶原(包括前体片段和酶)→前体片段中的碱性残基与酶本体的酸性残基之间形成盐桥→进入低pH环境→盐桥断裂→广泛的构象改变→催化部位得以暴露(酶原中已完整形成,但在中性环境中被阻隔) →此活性部位水解前体和酶本体间的肽键→切去氨基端前体部分(44个残基) →胃蛋白酶10. 药物设计: α1-抗胰蛋白酶中的Met358在催化中具有重要作用,此残基高度活泼,易被氧化.(p257) Ile(AUA)与Met(AUG)具有相当的侧链大小,同属疏水残基(替代后不致影响与被作用底物的结合),但比后者稳定得多.。
可编辑修改精选全文完整版第一章氨基酸一、名词解释1.氨基酸（amino acid）：含有氨基和羧基的一类有机化合物的通称。
生物功能大分子蛋白质的基本组成单位，是构成动物营养所需蛋白质的基本物质。
是含有一个碱性氨基和一个酸性羧基的有机化合物。
氨基连在α-碳上的为α-氨基酸。
组成蛋白质的氨基酸均为α-氨基酸。
出现在蛋白质中的氨基酸称为蛋白质氨基酸，又名标准氨基酸，目前发现22种，其中20种较常见。
2.蛋白质氨基酸（proteinogenic amino acid）:出现在蛋白质分子中的氨基酸。
3.亲水氨基酸（hydrophilic amino acid）：亲水氨基酸的R基团有极性，对水分子具有一定的亲和性，一般能和水形成氢键。
4.疏水氨基酸（hydrophobic amino acid）：疏水氨基酸的R基团呈非极性，对水分子的亲和性不高或者很低，但对酯溶性物质的亲和性较高。
5.必需氨基酸（essential amino acid）：必需氨基酸指的是人体自身（或其它脊椎动物）不能合成或合成速度不能满足人体需要，必须从食物中摄取的氨基酸。
它是人体（或其它脊椎动物）必不可少，而机体内又不能合成的，必须从食物中补充的氨基酸，称必需氨基酸。
必需氨基酸共有十种：Lys,Trp,Phe,Met,Thr,Ile,Leu,Val,Arg和His。
人体虽然能合成Arg和His,但合成的量在特定阶段不能满足正常需要。
因此这两种氨基酸又称为半必需氨基酸（semi-essential amino acid）。
6.非必需氨基酸（nonessential amino acid）：人体自身（或其它脊椎动物）自身可以进行有效的合成，它们是：Ala,Asn,Asp,Gln,Glu,Ser,Cys,Tyr 和Gly。
7.非蛋白质氨基酸（Non-protein amino acid）：不存在于蛋白质分子中而以游离状态和结合状态存在于生物体的各种组织和细胞的氨基酸。
