应用SSR技术进行白菜品种纯度鉴定的研究

利用SSR分子标记研究白菜类亚种资源的遗传多样性李光光;黄红弟;张华;郑岩松;李荣华【摘要】In order to analyze the evolution of Chinese cabbage [ssp. chinensis (L.) Makino] resource, a total of 94 Chinese cabbage [ssp. chinensis (L.) Makino] materials were used to assess the genetic diversity. The results showed that, nineteen cabbage SSR primers combinations amplified 137 alleles, 7.16 loci on average for each pair of primers. The average of polymorphism loci percentage ( P), genetic heterozygosity ( He), effective number of alleles (Ne), Shannon-Wiener index (H') and polymorphism information content (PIC) was 99.9%, 0.897, 11.598, 2.454, 0.886, respectively, and there were extremely significant correlation among them except P value. 94 Chinese cabbage [ssp. chinensis (L.) Makino] materials were clustered into three groups by UPGMA when GSC was 0.58, much of local Chinese cabbage was closer relationships with pakchoi. The order of genome amplification polymorphism by Chinese cabbage SSR primers was (small) cabbage, red bolt second lowest and wild mustard.%为研究几种白菜类亚种资源的演变过程,利用白菜SSR引物对94份白菜类亚种种质资源进行遗传多样性分析.结果表明,19对SSR引物扩增出137个条带,平均每对引物可扩增出7.16个;多态性位点百分率(P)、基因杂合度(He)、有效等位基因数(Ne)、Shannon-Wiener指数(H')和多态信息含量(PIC)的均值分别为:99.9%、0.897、11.598、2.454、0.886,除P值外,4个指标间相关性极显著;94份白菜类亚种种质资源的UPGMA聚类结果表明:在遗传相似系数为0.58时实验材料分为3类,多数地方种菜心与小白菜亲缘关系更近.白菜SSR引物对大(小)白菜基因组具有较好的多态性、红菜苔次之、野生芥菜最低.【期刊名称】《热带作物学报》【年(卷),期】2017(038)007【总页数】7页(P1316-1322)【关键词】白菜类亚种资源;SSR;遗传多样性;亲缘关系【作者】李光光;黄红弟;张华;郑岩松;李荣华【作者单位】广州市农业科学研究院, 广东广州 510308;广州市农业科学研究院,广东广州 510308;广州市农业科学研究院, 广东广州 510308;广州市农业科学研究院, 广东广州 510308;广州大学生命科学学院, 广东广州 510006【正文语种】中文【中图分类】S330doi10.3969/j.issn.1000-2561.2017.07.021芸薹属白菜类蔬菜[Brassica campestris L.ssp. chinensis（L.）Makinomunis Tsen et Lee]为A基因组，除了大白菜外，其亚种有5个变种：普通白菜变种（munis Tsen et Lee）、乌塌菜变种（var.rosularis Tsen et Lee）、菜薹变种（var. utilize Tsen et Lee）、紫菜薹变种（var.purpurea Bailey）及薹菜变种（var.tai-tsai Hort），经过自然及人工选择形成了类型丰富的群体。

SSR标记技术在种子纯度鉴定中的研究 随着我国农业经济的发展和种子市场的逐步规范，种子的真假和纯度对种子生产具有越来越重要的影响。

下面是编辑老师为大家准备的SSR标记技术在种子纯度鉴定中的研究。

 为了保护农民以及育种者的利益，发展快速、稳定、可靠的品种纯度鉴定方法具有重要的意义。

种子品种纯度鉴定主要包括品种真实性和品种纯度鉴定两个方面。

品种鉴定主要指对供检样品的真实性进行鉴定。

品种纯度就是对品种的一致性进行分析。

种子纯度是种子质量的核心指标，是衡量种子质量的主要标准，种子纯度的高低对农业生产的产量和品质有较大的影响，因此在种子生产、加工、贮藏和经营贸易中有重要的意义，历来受到种子管理部门、种子生产者和用种者的密切关注。

 品种纯度检验的方法很多，有籽粒形态鉴定，幼苗鉴定，蛋白质电泳鉴定和田间小区种植鉴定等[1]，但这些方法均有不足之处。

籽粒形态鉴定可以鉴别性状差异明显的，但这种差异性状较少，准确性差;幼苗鉴定适用于性状表现差异较大的品种，能够鉴定的品种少;蛋白质电泳由于遗传种质资源的狭窄，品种间的差异越来越小，难以鉴定。

纯度鉴定最可靠的方法是田间小区种植鉴定，但是这种方法需要一个生长季节，时间较长，耗费较多的人力物力。

而且上述方法受人为因素的影响较大，导致检测结果产生误差。

为了克服这些缺陷，人们不断地探索新的方法。

 随着科学技术的进步，分子生物技术逐渐应用于品种纯度的检验，以遗传物质DNA 为基础的分子标记技术也逐渐受到人们的亲睐。

DNA分子标记技术本质上是指能反映生物个体或种群间基因组中某种差异的特异性DNA片段[2]，由于其快速、准确、可靠、不受环境因素的影响，越来越多地被应用到种子纯度检测中。

 SSR是近年来发展起来的一种DNA分子遗传标记技术，是建立在PCR(Polymerase Chain Reaction)基础上的，在植物基因组中的应用非常活跃，已被广泛应用于基因定位，种子进化及遗传多样性的研究[3]。

不结球白菜品种鉴定 ssr分子标记法不结球白菜是一种重要的蔬菜作物，具有高营养价值和经济价值。

为了研究不同的不结球白菜品种，可以使用SSR分子标记法进行品种鉴定。

SSR分子标记法包括先从DNA中扩增核苷酸序列，然后根据DNA序列特性，使用引物对PCR扩增产物进行分析。

这种技术广泛应用于分子遗传学和生物技术领域，可以提供快速而准确的品种鉴定和基因检测。

使用SSR分子标记法进行不结球白菜品种鉴定的步骤包括：
1.提取不结球白菜DNA。

2.选择适当的SSR引物和PCR反应体系。

3.通过PCR扩增获得DNA片段。

4.电泳分析PCR产物，评估基因型差异。

5.根据结果进行不结球白菜品种鉴定和分析。

通过SSR分子标记法进行品种鉴定，可以帮助种植者和消费者确定不同品种的不结球白菜，从而提高种植效率和产品质量。

白菜SSR分子标记的研究进展简述了SSR分子标记的基本原理和特点，从白菜种质资源遗传多样性分析、SRR指纹图谱的构建、杂交种纯度的鉴定、遗传图谱构建和分子标记在辅助育种上的应用等几个方面介绍了近年来白菜研究中SSR分子标记的研究进展及应用前景。

标签：白菜；分子标记；SSR；遗传分析引言白菜（Brassica campestris L. ssp. Pekinensis）原产于我国北方，现广泛种植于全国的标志性蔬菜种类之一，分为结球白菜、不结球白菜两个亚种。

由于不同的白菜品种之间可以进行天然的杂交，如隔离不当以至于品种之间混淆，形成了很多栽培亚种或变种，且现今大量的白菜新品种涌入市场，因此，品种差异的鉴定在蔬菜生产和使用中显得尤为重要。

对于商用种子的品种鉴别，新品种登记测试以及资源种质遗传多样性分析，都非常需要发展一种高效、快速、准确和经济实用的品种鉴别方式[1]。

近年来生化和分子标记技术的快速发展使得其在鉴别能力、速度及准确性方面都比传统的种植鉴别有明显的优势，并且这些技术已经应用于茄子、黄瓜、玉米、水稻等蔬菜作物种质资源的鉴定，指纹图谱的构建，分子标记辅助选择育种及杂交种纯度的检测。

利用分子技术已经在白菜的研究中进行了遗传多样性的分析，SSR指纹图谱的构建，品种真实性的鉴定及纯度的检测等大量工作[2-4]。

在新品种审定及新品种的品种权授予前需要进行DUS测试，确定该品种的特异性（Distinctness）、一致性（Uniformity）和稳定性（Stability），由于在各项研究中运用了分子标记技术，大大减少了实际中对于白菜种子检测的工作量。

现阶段在蔬菜研究中应用较广泛的DNA分子标记主要包括扩增片段长度多态性（amplified fragment length polymorphism，AFLP）、随机扩增的多态性（random amplified polymorphic DNA，RAPD）、相关序列扩增多态性（sequence-related amplified polymorphism，SRAP）、简单重复序列区间扩增多态性（simple sequence repeats，SSR）。

46份大白菜种质资源SSR标记的遗传多样性分析作者：段丽丽郑永胜李华孙加梅王东建王雪梅仙丽娜王秀娟张晗来源：《山东农业科学》2016年第05期摘要：利用30对SSR引物分析了46 份大白菜品种的遗传多样性。

结果表明，30对引物共检测到170个多态性位点，平均每对引物检测到5.667个，变化范围为2～10个；引物的多态信息含量分布范围为0.367～0.793，平均值为0.633，等位基因多样性指数分布范围为0.485～0.817，平均值为0.685。

UPGMA 聚类分析将 46 份大白菜品种划分为五大类，说明本研究中的大白菜品种具有较为丰富的遗传多样性。

关键词：大白菜；遗传多样性；SSR；聚类分析中图分类号：S634.103.6文献标识号：A文章编号：1001-4942（2016）05-0005-04Abstract Thirty primers of SSR molecular markers were used to analyze the genetic diversities of 46 Chinese cabbage varieties. The results showed that a total of 170 alleles were identified with an average of 5.667 alleles per locus， which varied from 2 to 10. The polymorphism information content （PIC） varied widely from 0.367 to 0.793 with an average value of 0.633. And the allelic diversity index varied from 0.485 to 0.817 with an average value of 0.685. Cluster analysis with UPGMA showed that the 46 Chinese cabbage varieties could be classified into five groups， which reflected that they owned abundant genetic diversities.Key words Chinese cabbage； Genetic diversity； SSR； Cluster analysis大白菜Brassica campestris L. ssp. pekinensis （Lour） Olsson是世界范围内的主要蔬菜品种之一，原产于我国，在我国蔬菜栽培面积中占第一位，栽培历史悠久，品种丰富。