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丹江口水库赤眼鳟遗传多样性的RAPD和ISSR 分析

丹江口水库赤眼鳟遗传多样性的RAPD和ISSR 分析
丹江口水库赤眼鳟遗传多样性的RAPD和ISSR 分析

第39卷 第2期 海 洋 与 湖 沼

Vol.39, No.2 2008年

3月

OCEANOLOGIA ET LIMNOLOGIA SINICA

Mar., 2008

* 河南省科技攻关项目资助, 0524030005号; 河南省动物学重点学科资助项目, 200602号。杨太有, 副教授, E-mail: yang-taiyou@https://www.doczj.com/doc/fd2187335.html,

收稿日期: 2006-12-28, 收修改稿日期: 2007-03-18

丹江口水库赤眼鳟(Squaliobarbus curriculus )遗传

多样性的RAPD 和ISSR 分析*

杨太有1 关建义1, 2 陈宏喜1 汪亚平3

(1. 河南师范大学生命科学学院 新乡 453007; 2. 新乡医学院生命科学技术系 新乡 453003;

3. 中国科学院水生生物研究所 武汉 430072)

提要 利用RAPD 和ISSR 两种分子标记技术, 分析了丹江口水库野生赤眼鳟30个个体的遗传多样性。用11个RAPD 引物对其基因组DNA 进行扩增, 共获得101个重复性好且谱带清晰的扩增位点, 片段大小在100—3000bp 之间, 其中多态性位点63个, 多态位点比例为62.38%; 个体间遗传距离在0.1049—0.3417之间, 平均为0.1742。用10个ISSR 引物共检测到88个位点, 其中多态性位点61个, 多态位点比例为69.32%; 个体间遗传距离在0.1088—0.3847之间, 平均为0.1907。结果显示, 丹江口水库野生赤眼鳟群体的多态位点比例和平均遗传距离均较大, 说明其有较高的遗传多样性。 关键词 赤眼鳟, 遗传多样性, RAPD, ISSR 中图分类号 Q346

赤眼鳟(Squaliobarbus curriculus Richardson)属鲤形目, 鲤科, 雅罗鱼亚科, 赤眼鳟属, 是重要的经济鱼类之一(伍献文, 1964)。该鱼具有肉质肥厚, 味道鲜美, 易于人工驯化养殖, 生长速度较快, 抗病力强, 耐缺氧, 适宜于高密度养殖及混养等特点。近年来, 作为新的养殖品种越来越受到人们的重视, 对其地理分布、生长和繁殖等生物学方面的研究已有报道(Fu et al , 2003; 杨明生等, 2006; 孙际佳等, 2006; 龙光华等, 2005), 人工养殖与繁殖技术在我国也已经获得成功。但国内外对赤眼鳟遗传多样性的研究未见报道。

RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)是建立在PCR 基础上的分子标记技术, 具有灵敏、快速、特异性强和检测容易等优点, 既有大量的随机引物可供选择, 又不受种属限制, 自该技术诞生以来, 已被广泛地应用于物种生物多样性、种属分类、亲缘关系分析和系统研究。ISSR(Inter-Simple Sequence Repeat)是由SSR(Simple Sequence Repeat)发展而来的一种新的分子标记。该技术可以特异地扩增出微卫星区域及其相邻区域的DNA 序列。相对于RAPD 技术,

ISSR 技术有相当高的可重复性, 其实验的稳定性比较可靠(Qian et al , 2001, Luis et al , 2001), 现已广泛应用于动植物的种质鉴定和遗传多样性的分析。但在鱼类中的研究较少(许广平等, 2005; 张媛等, 2006; Maltagliati et al , 2006; Liu et al , 2006)。本文利用RAPD 和ISSR 技术, 对丹江口水库野生赤眼鳟群体的遗传多样性进行分析, 旨在阐明其遗传多样性水平, 为其种质资源的评价、保护和合理利用提供参考依据。

1 材料与方法

1.1 材料

实验用赤眼鳟(Squaliobarbus curriculus )于2006年8月分别在丹江口水库汉江库区的肖川和丹江库区的香花和马蹬采集, 共30尾, 均为野生。取背部肌肉, 用液氮贮存运回实验室, ?70℃保存备用。 1.2 基因组DNA 的提取与定量

取0.5g 肌肉提取基因组DNA, 方法参考Sambrook 等(1995), 略有改动。提取后的DNA 用

158 海洋与湖沼39卷

0.8%琼脂糖凝胶电泳检测其质量, 用紫外分光光度计检测其浓度和纯度, 调整浓度至30ng/μl, 4℃保存备用。

1.3RAPD扩增及其产物检测

RAPD随机引物购自上海生工生物工程技术公司, 采用S系列的两组引物(S101—S120, S1101—S1120)。PCR扩增反应体系为:总反应体积25 μl, 内含10×Taq Buffer (Mg2+ free) 2.5 μl, 25mmol/L Mg2+ 2.0 μl, 10mmol/L dNTPs 0.5 μl, 10 μmol/L Primer 1 μl, 5U/μl Taq酶 0.2 μl, 30ng/ μl模板DNA 1 μl。用Biometra PCR仪进行扩增, 程序为:95℃预变性5min, 然后按94℃变性30s, 36℃退火45s, 72℃延伸90s进行38个循环, 最后72℃终延伸10min, 4℃维持。设有不加模板的空白对照。扩增产物用1.5%琼脂糖凝胶电泳, 0.5 μg/ml溴化乙锭染色。上样量12 μl, 其中上样缓冲液2 μl, 扩增产物10 μl。用ChampGel-1000型数码凝胶图像分析仪紫外检测并成像。

1.4ISSR扩增及其产物检测

ISSR引物(ISSR-1—ISSR-77)购自南京生兴生物技术有限公司。除30ng/μl的模板DNA 加1.5μl外, ISSR-PCR扩增反应体系与RAPD-PCR扩增反应体系相同。扩增程序为95℃预变性5min, 然后进入PCR 循环, 即94℃变性45s, 52℃退火40s, 72℃延伸90s, 共38个循环; 循环结束后72℃终延伸7min, 4℃保存。设有不加模板的空白对照。扩增产物检测同RAPD扩增产物检测。1.5数据分析

RAPD与ISSR都是显性标记, 同一引物扩增产物中电泳迁移率一致的条带被认为属于同一位点(钱韦等, 2001)。扩增阳性记为1, 扩增阴性记为0, 形成RAPD和ISSR表型数据矩阵, 对下列参数进行统计分析。

(1) 多态位点比例:P = 多态位点数/位点总数×100%。

(2) 个体间遗传相似度(Nei, 1978):S xy = 2N xy/(N x + N y)。N x和N y分别为第x和y个体拥有的DNA扩增的阳性标记数, N xy是x、y两个个体共有的阳性标记数。群体内的遗传距离D = 1-S, S是群体内所有的两个个体间相似系数的平均值。群体内的遗传距离利用TFPGA软件统计。

2结果

2.1RAPD扩增结果分析

从40个RAPD随机引物中, 筛选出扩增重复性好、条带清晰且多态性高的11个引物, 对30个赤眼鳟样本的基因组DNA进行扩增, 结果如表1。共检测出101个位点, 片段大小在100—3000bp之间。每个引物检测到的位点数从7—11不等, 平均每个引物可检测到的位点数为9.2个。其中多态位点为63个, 多态位点比例为62.38%。个体间的遗传距离为0.1049—0.3417, 平均为0.1742。图1为引物S112和S1107的扩增图谱。

表1筛选出的RAPD引物序列及扩增结果

Tab.1 Sequence of RAPD primers elected and the amplification results

引物序列5′—3′扩增位点多态位点数多态位点比例(%)

S103 AGACGTCCAC 8 5 62.50

S104 GGAAGTCGCC 8 4 50.00

S107 CTGCATCGTG 9 5 55.56

S112 ACGCGCATGT 7 6 85.71

S115 AATGGCGCAG 11 8 72.73

S118 GAATCGGCCA 11 7 63.64

S1104 GAGGGACCTC 9 6 66.67

S1107 AACCGCGGCA 11 9 81.82

S1109 TGCCGGTTCA 10 6 60.00

S1114 TGGTTGCGGA 9 6 66.67

S1116 TGGCGGTTTG 8 3 37.50

总数 101

63

62.38

2期 杨太有等: 丹江口水库赤眼鳟(Squaliobarbus curriculus )遗传多样性的RAPD 和ISSR 分析

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图1 引物S112(上)和S1107(下)的RAPD 扩增图谱

Fig.1 The amplification patterns of primer S112 and S1107

M 代表分子量标记(GeneRuler TM 100bp DNA Ladder Plus), 1—30代表不同个体

2.2 ISSR 扩增结果分析

77个ISSR 引物有40个引物都产生扩增条带, 再从中筛选出10个扩增位点多、清晰、多态型高的引物用于基因组DNA 的扩增。扩增结果如表2。共检测到88个位点, 片段大小在100—3000bp 之间, 其中多态性位点为61个, 多态位点比例为69.32%。每个引物检测出的位点数5—11个不等, 平均每个引物为8.8个。个体间的遗传距离为0.1088—0.3847, 平均为0.1907。图2为引物ISSR74和ISSR63的扩增图谱。

表2 筛选出的ISSR 引物序列及扩增结果

Tab.2 Sequence of ISSR primers elected and the amplification

results

引物

序列5′—3′

扩增位点

多态 位点数

多态位点 比例(%)

ISSR-33 (AG)8AT 10 7 70.00 ISSR-58 (AG)8GA 11 7 63.64 ISSR-59 (AG)8GC 10 6 60.00 ISSR-61 (AG)8GT 8 5 62.50 ISSR-62 (AG)8CA 9 6 66.67 ISSR-63 (AG)8CT 11 10 90.91 ISSR-64 (AG)8CG 8 6 75.00 ISSR-65 (AG)8CC 9 5 55.56 ISSR-74 (ACTG)4 5 4 80.00 ISSR-75 (AGTG)4 7 5 71.43 总数

88 61 69.32

3 讨论

对于RAPD 和ISSR 技术所反映的物种遗传多样

性的定性, 迄今还没有一个明确的定量标准, 也没有系统的研究记录可作比较。本研究结果显示, 丹江口水库野生赤眼鳟群体的RAPD 和ISSR 的多态性比例分别为62.38%和69.32%, 其平均遗传距离分别为0.1742和0.1907。表3结果显示, 与其他鱼类比较, 丹江口水库野生赤眼鳟群体有较高的遗传多样性。虽然由于鱼类的分类地位不同及海洋鱼类与淡水鱼类在基因交流方面的差异, 可能导致它们彼此之间在遗传分化水平上存在差异, 但其多态性比例和平均遗传距离的数值的比较, 在一定程度上仍能反映出某种鱼类遗传多样性的水平。丹江口水库是亚洲第一大人工水库, 水域面积为750km 2, 其上游水源流域面积大, 水系发达, 包括汉江和丹江两大水系, 河流数以千计。这些环境特点使丹江口水库野生赤眼鳟的种群大, 个体数量多, 基因交流的机会相对较多, 遗传多样性丰富。推测这一群体蕴藏着比较丰富的育种和遗传改良的潜力, 具有优良亲本的潜能, 因此对其不断进行选育, 将能获得可用于育种的优良赤眼鳟亲本。

本研究中ISSR 分析获得多态位点比例与平均遗传距离均高于RAPD 分析。这可能与用于RAPD 分析的引物较少和样本数量较少有关。如前所述, ISSR 比RAPD 在扩增多态性与稳定性上更具优点。因此,

它所揭示的群体遗传多样性更加丰富, 反映的遗传

结构也更加真实。本研究中获得的赤眼鳟的遗传多样性数据作为一种相对的指标, 对今后我国各主要水域中赤眼鳟的遗传变异水平的检测及其种质资源数据库的建立和评价具有参考价值。

160 海洋与湖沼39卷

图2 引物ISSR-74(上)和ISSR-63(下)的ISSR扩增图谱

Fig.2 The amplification patterns of primer ISSR-74 and ISSR-63

M代表分子量标记(GeneRuler TM 100bp DNA Ladder Plus), 1—30代表不同个体

表3不同鱼类遗传多样性研究结果比较

Tab.3 Comparison in genetic diversity of different fishes

多态位点比例(%) 平均遗传距离

种类来源地

RAPD ISSR RAPD ISSR

文献

牙鲆(Paralichthys olivaceus) 威海近海59.09 68.94 0.17427 0.19996 房新英等, 2006

小黄鱼(Pseudosciaena polyactis) 黄海南部—65.63 —0.2187 许广平等, 2005 真鲷(Pagrosomus major) 胶州湾——0.1056 —江世贵等, 2004

台湾海峡——0.1151 —

北部湾——0.1350 —

刀鲚(Coilia ectenes) 横沙岛58.25 68.18 0.1309 0.1467 张媛等, 2006

崇明岛49.02 57.58 0.1195 0.1296

崇明岛65.74 61.19 0.1454 0.1169 胭脂鱼(Myxocyprinus长江宜昌——0.0726 —孙玉华等, 2003 asiaticus) 长江金口——0.0687 —

丁(Tinca tinca) 新疆朱家湖24.00 —0.1033 —凌去非等, 2006

新疆73水库22.67 —0.0965 —

捷克18.42 —0.0691 —

黄颡(Pelteobagrus fulvidraco) 鄱阳湖18.4 —0.0667 —周秋白等, 2006

长须黄颡(Pelteobagrus eupogon) 鄱阳湖27.0 —0.0938 —周秋白等, 2006

赤眼鳟(Squaliobarbus curriculus) 丹江口水库62.38 69.32 0.1742 0.1907 本文

参考文献

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许广平, 仲霞铭, 丁亚平等, 2005. 黄海南部小黄鱼群体遗传

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杨明生, 陈金安, 黄孝湘等, 2006. 府河赤眼鳟的生长和种群结构特征. 水利渔业, 26(6): 59—60, 63

张媛, 胡则辉, 周志刚等, 2006. 利用RAPD-PCR与ISSR-PCR标记技术分析长江口刀鲚的群体遗传结构. 上

2期杨太有等: 丹江口水库赤眼鳟(Squaliobarbus curriculus)遗传多样性的RAPD和ISSR分析 161

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GENETIC DIVERSITY IN RAPD AND ISSR ON SQUALIOBARBUS CURRICULUS IN

DANJIANGKOU RESERVOIR

YANG Tai-You1, GUAN Jian-Yi1, 2, CHEN Hong-Xi1, WANG Ya-Ping3

(1. College of Life Sciences, Henan Normal University, Xinxiang, 453007; 2. Department of Life Science and Technology, Xinxiang

Medical University, Xinxiang, 453003; 3. Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, 430072)

Abstract Two types of molecular markers, Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) and Inter-Simple Se-quence Repeat (ISSR) were used to detect the genetic diversities among 30 wild individuals of Squaliobarbus curriculus collected from Danjiangkou Reservoir, Hubei of China in August 2006. Using 11 RAPD primers screened from 40primers, a total of 101 reproducible and stable bands, ranging from 100 to 3000bp, were amplified from 30 individuals. 63 of 101 loci detected were polymorphic, of which polymorphic loci took 62.38%. Genetic distance among the individuals was from 0.1049 to 0.3417, averaged at 0.1742. Using 10 ISSR primers selected from 77 primers, 88 reproducible and stable bands were observed, ranging from 100 to 3000bp, and 69.32% of them were polymorphic. The genetic distance among the indi-viduals was from 0.1088 to 0.3847, in average of 0.1907. These results show that the genetic diversification of S. curricu-lus in the reservoir was high.

Key words Squaliobarbus curriculus, Genetic diversity, RAPD, ISSR

丹江口库区区域中心城市

丹江口库区区域中心城市目录 地理位置丹江口库区位于长江中游支流汉江的上游,伏牛山南麓,豫、鄂、陕三省交界处。丹江口水库水源地库区流域地理位置是北纬32°36′-33°48′,东经110°59′-111°49′之间。库区流域涉及南阳市的有淅川、西峡、内乡、邓州的36个乡镇,其中包括淅川的全部乡镇,有荆紫关、西簧、毛堂、寺湾、盛湾、仓房、城关镇、上集、马蹬、香花、厚坡、九重、金河、老城、大石桥、滔河等16个乡镇,西峡的桑坪、石界河、米坪、军马河、双龙、二郎坪、太平镇、寨根、陈阳坪、西坪、重阳、丁河、五里桥、回车、城关等15个乡镇,内乡的西庙岗、瓦亭及曲、师岗的一部分,邓州的彭桥镇的杏山小流城。 自然条件 地形地貌丹江口水库库区流域位于南阳盆地中西部,是一个相对独立的自然地理单元,地形复杂,地貌多姿。地势呈西、北高,东南低。西部、北部被伏牛山所环绕,东部自北向南依次为山地、丘陵、垄岗、平原、南部开敞与江汉平原相连。丹江两岸为红色狭长盆地,属白垩及第三纪,主要是红色泥沙岩、页岩、砾石。北部山区,为元古界及下震旦统变岩系,主要岩性为片岩、片麻岩、混合岩、石灰岩,并有花岗岩和基性岩脉分布。海拔分布范围121-212.5米之间,构成地形起伏多变、交差悬殊、气候明显的地貌特征。

气候水文丹江口库区地处北亚热带向暖温带过渡地带,属于典型的季风型大陆性半湿润气候。冬季严寒,夏季较热,春季温暖,秋季凉爽,四季分明,雨量比较充沛。年平均气温14.4-15.7℃,极端最高温度42.6℃,极端最低温度-13.2℃,最冷月平均气温2.4℃,最热月平均气温28.4℃,≥10℃的年积温平均为5123.2℃,年平均日照时数2121小时,年无霜期225-240天,年平均降雨量800-1000mm,但自然降水时间分布不均,主要集中在7-9月,基本上雨热同季。 库区流域水系发达,河流众多。河流均由北向南流向丹江口水库,主要河流有丹江、鹳河、淇河、滔河等,大部分河道深,坡降大,水流湍急。部分小河道属于季节性河流,汛期洪水陡涨陡落,春季则枯水甚至断流。 生物植被该区地处北亚热带和北暖温带的过渡地带,自然条件优越,适宜多种植物生长,尤其是北部山区地形复杂多样,垂直高差悬殊,为亚热带和暖温带的各种植物提供了繁衍生存的良好环境条件,植物种类繁多,植物资源丰富,据初步调查,植物种类达1000多种,可分为药用型、工业原料型、生态型及种质资源植物等。主要森林类型有:常绿落叶阔叶林、针阔混交林、马尾松和杉木纯林等。森林植被区以北亚热带森林植被景观为主,呈现出南北东西成份交汇变化的特色。地带性植被有:以栓皮栎、麻栎、锐齿栎为建群树种的落叶阔叶林,以马尾松为建群树种的针叶林。海拔800-1200米有油松林,海拔1200米以上有

丹江口市基本概况

丹江口市概况 丹江口市位于鄂西北、汉江中上游。全市总面积3121平方公里,辖武当山旅游经济特区和16个乡镇办事处,总人口50.11万人,其中农业人口32万人。1983年经国务院批准撤县设市,1985年被国务院批准为甲类开放城市,1986年被省政府批准为工业旅游型城市,先后荣获"全国科技工作先进县市"、"全国文化工作先进县市"、"全国体育工作先进县市"、"全国武术之乡"、"全国平安畅通县市"、"全省文明创建先进县市"、"全省最佳金融信用县市"、"全省农村党的建设先进县市"等荣誉称号。 历史悠久,文化底蕴深厚。建置达2200余年,秦设武当县,隋、唐改为均州,民国始称均县,1948年解放,1958年因修建丹江口水利枢纽,县城搬迁至现址依坝而建;由于地处江汉平原与秦巴山区结合部,楚文化、中原文化、汉水文化、道教文化在这里有机融合,人杰地灵,民风纯朴。伍家沟故事村被联合国教科文专家誉为"中国民间文学的半坡遗址",吕家河民歌村被誉为"汉族民歌第一村"。 贫困县市,移民大市。全市90%以上为山地,市域以汉江为界划分为江南、江北两大自然区域,江南以秦岭余脉大巴山系为主,武当山天柱峰是最高峰;江北以秦岭余脉石灰岩山区为主,喀斯特地貌特征明显。1958年动工修建的新中国第一个大型水利枢纽工程-丹江口水库1967年下闸蓄水后,淹没我市面积347平方公里,包括23万亩耕地及均州古城和大量的基础设施,形成了百里库区;先后动迁移民6批次16.04万人,其中8.8万余人在市内沿山后靠安置,库区行路难、上学难、就医难和发展生产困难,群众生活贫困,移民遗留问题较多,至今仍属国家新阶段扶贫开发重点县(市);南水北调中线丹江口大坝加高工程又将动迁移民9.9万人。全市新老移民人数占全市总人口的一半以上,淹没综合指标占湖北、河南两省五县市区的三分之一以上,占湖北省四县市区的三分之二以上。 资源丰富独特,利用潜力较大。境内著名的世界文化遗产武当山和南水北调中线工程调水源头丹江口水库,名山秀水,珠联璧合。丹江口水库水电站装机105万千瓦,年均发电量40亿度;已探明的矿藏达40余种,其中钛铁、钒等储量居湖北省之首。 经济社会协调推进,发展初具规模。坚持实施"生态立市、工业兴市"战略,初步形成了以冶金、汽车零部件、生物医药、绿色食品、高新技术为主的工业格局。依托水电优势,汉江集团名列全国大型重点企业520家之列;依托东风公司,发展规模以上汽车零部件生产企业20多家,以湖北神力锻造公司、丹传公司和志成铸造公司等企业为龙头的汽车零部件产业集群初具雏形;依托资源优势,吸引农夫山泉公司等知名企业落户发展;创造条件,引进台湾阿里山公司、江苏雨润集团,着力培植新的经济增长点;农业产业化步伐加快,已形成以柑桔、畜牧、水产为主的优势农产品基地。2007年,全市实现生产总值54.3亿元,同比增长13%;财政总收入7.18亿元,同比增长15.9%,其中地方一般预算收入2.55亿元,同比增长26.7%。 新华社签约摄影师“中国水都杯”摄影采风点简介 牛河森林公园千岛画廊景区

丹江口水库水环境问题研究

生态水利学结业论文 指导老师:宋林旭 姓名:黄辉 学号:2012101204 网选班级:2班 院系:水环学院水利水电工程 2015年6月14日

丹江口水库水生态环境分析 摘要:丹江口水库是南水北调中线工程的水源地,水环境保护工作十分重要。从丹江口水库的自然状况出发,通过查阅相关文献,分析了丹江口水库的水环境现状与变化趋势。分析结果表明:目前,丹江口水库水质良好,但由于流域内社会经济快速发展,存在着水质恶化的潜在风险。因此从宏观上提出了加强流域内水环境保护与管理等相关措施。 关键词:水环境问题;保护措施;丹江口水库;南水北调中线工程 南水北调是20世纪初我国水资源调整的一项伟大战略性基础工程,从生态环境角度来看,它不仅仅是一项跨流域调水工程,而且还是一项规模宏大的生态环境工程。中线工程水源地丹江口水库库区跨越鄂、豫、陕3省,总干渠将从河南省南阳市淅川县陶岔渠首向北引水,重点解决北京、天津、石家庄等20多座大中城市的缺水问题,并兼顾沿线生态环境和农业用水,这将大大改善用水区水环境和投资条件,推动我国中部地区的经济发展。因此,输水水质安全保障极为重要,对水源供水质量的要求既要有相对的高标准,又要有长期的稳定。 1.水库概况 丹江口水利枢纽位于汉江与其支流丹江汇合口下游800 m处,坝顶高程162 m( 吴淞高程,下同) ,正常蓄水位157 m,相应库容174.5 亿m3,水面面积745 km2。大坝加高后,坝顶高程176.6 m,正常蓄水位170 m,相应库容290. 5 亿 m3,水面面积1 050 km2。丹江口水库具有防洪、供水、发电、航运等功能。 丹江口水库自河源至丹江口为汉江上游河段,河谷狭长,长925 km。丹江是汉江的主要支流,全长378.6 km,是丹江口水库的重要集水区。汉江流域水资源总量为582 亿m3,丹江口以上为388亿m3,占全流域的66.7%。汉江两岸支流密布,其中较大者自上而下有:褒河、子午河、任河、旬河、甲河、堵河、丹江等。 丹江口水利枢纽坝址多年平均径流量379亿m3,其中陕西来水247亿m3,汉江干流来水占87.4% ,丹江来水占12.6%。丹江口水库水环境质量受上游来水、库区自然环境及库区污染物的共同影响。 2.水环境问题研究现状 近10年来水质监测资料的分析表明,汉江上游( 丹江口水库以上)的水质除个别项目个别江段劣于地表水环境质量Ⅲ类标准外,其余都达到了Ⅲ类以上标准,Ⅰ~Ⅲ类水河长占90.3%; 丹江Ⅰ~Ⅲ类水河长占93.2%。根据多年水质评价分析结果,丹江口水库属于中营养型水库。 目前,丹江口水库是丹江口市的生活饮用水源以及河南、湖北两省部分工业、农业的灌溉水源。近年监测资料表明,丹江口水库水质达Ⅰ~Ⅱ类的监测断面占86%,

遗传多样性与起源研究

西北农林科技大学 2009级硕博连读研究生学位论文开题报告 黄牛、水牛和牦牛Y染色体分子遗传多样性与起源研究Y-chromosome Molecular Genetic Diversity and Origins in Cattle, Buffalo and Yak 学院:动物科技学院 学科、专业:动物遗传育种与繁殖 研究方向:动物遗传学 研究生:XX 指导教师:雷初朝教授

黄牛、水牛和牦牛Y染色体分子遗传多样性与起源研究 一、选题的目的与意义 黄牛、水牛和牦牛是我国3个重要的牛种,具有对周围环境的高度适应性、耐粗放管理、抗病力强、繁殖力高、肉质好等特点。这些地方牛种本身就是一座天然的基因库,正是进行杂种优势利用和进一步培育高产品种的良好原始材料。在当今世界畜禽品种资源日趋匮乏,品种逐步单一化的情况下,对我国这些牛种遗传资源的保护将对今后的育种工作产生很大的影响,起到难以估量的作用[1]。 中国黄牛的起源进化与遗传多样性一直是国内外动物遗传学家感兴趣的课题之一。一般认为,中国黄牛是多元起源的,并主要受普通牛和瘤牛的影响,但究竟起源于哪几个牛种,观点不一[2, 3]。在黄牛遗传多样性方面,自二十世纪八十年代以来,众多研究者分析了中国地方黄牛的核型,发现不同黄牛品种的Y 染色体形态具有明显的多态性,普通牛为中着丝粒或亚中着丝粒,瘤牛为近端着丝粒[4-6]。常振华等发现中国黄牛Y染色体主要属于Y2(普通牛)和Y3(瘤牛)单倍群[7],但事实上黄牛的每种Y染色体单倍群下都可细分为多种单倍型,而中国黄牛由哪些Y染色体单倍型组成,有无优势单倍型以及单倍型的品种分布有无地理特点,与国外黄牛品种有何不同,这些问题都亟待阐明,以期为黄牛品种资源保护和杂交育种工作提供参考依据。 中国也拥有丰富的水牛资源。水牛的驯化时间,地点尚无定论,国内一些学者在形态学和考古学方面进行了一些研究,给中国水牛的驯化历史提供了一些参考[8, 9],但仅靠形态学和考古学的研究是远远不够的,还需要分子遗传学的更多证据。目前国内外对水牛的起源研究主要是在线粒体DNA的母系起源方面,认为水牛有两个母系起源(A支系和B支系)[10-12],近年来,也有中国学者对水牛的常染色体微卫星多态性进行了研究,其结果都表明中国水牛的遗传多样度丰富,倾向于支持中国水牛的本土起源假说[13, 14]。对Y染色体遗传多样性的研究,将提供更多的分子遗传学信息,会有助于评估水牛的遗传资源状况,也有助于阐明中国水牛的驯化历史。 牦牛主要分布于我国的青藏高原,俗称“万能种”,通常皆为兼用,如乳、肉、毛、皮、役力,是经济价值极高的珍贵畜种[1]。家牦牛是在青藏高原驯化的,藏族自古以来生息于西藏,是驯化牦牛之主,因此牦牛的驯化始终与藏族文化的发展休戚相关,是当地人民不可分离的生产和生活资料[15]。从牦牛生活的特定气候地带的适应性和生态地理、生理特征的表现看,牦牛是地球之巅特有的高寒环境中生存的一个宝贵的特化种,牦牛的驯化与繁衍有着与其他牛种极其不同的种类特点,牦牛对高寒山区的气候和贫瘠的草地所具有的特殊的适应性也是世界

丹江水库简介

丹江口水库的简单介绍和水源的保护对策 摘要: 首先论述丹江口水库上游水质现状, 并以此为切入点详细分析水污染产生的原因, 然后从水资源保护的角度探讨分析丹江口水库水源保护的对策及其实施后产生的效益, 进一步明确了只有合理开发利用其上游水资源,才能保证丹江口水库水源达到国家南水北调引水工程对其水质标准的要求, 以确保流域内经济社会的永续发展。 关键词: 水质现状; 水源保护; 丹江口水库 1丹江口水库水源保护刻不容缓 丹江口水库是南水北调中线引水工程的重要水源, 而陕西省境内丹江、汉江水系作为其上游水域,是该水库的主要来水水源, 其水质的好坏, 直接关系到国家南水北调工程的成败, 更与受水地区国民经济和人民群众生活密切相关。然而, 随着丹江、汉江流域国民经济的快速发展, 陕西省汉中、安康、商洛等中小城市的发展速度进一步加快, 加之西康铁路已建成通车, 西渝铁路西汉、西康高速公路、西安至武汉高速公路等工程的相继开工, 丹汉江上游不再是偏僻落后无人问津的地区; 工业、农业、旅游业、城市化等高速发展, 同时工业废水、城市生活污水、大气污染、工业及城市生活垃圾数量将会明显增加, 这些污染物直接或间接排入河道, 使丹、汉江的水环境污染程度不断加剧直接威胁丹江口水库的水质, 给国家重点工程—南水北调中线引水带来重大隐患。因此, 丹江、汉江流域的水污染治理刻不容缓。 2流域概况 丹江、汉江是陕西省南部的主要河流, 其特点是: 山溪性河流, 河床狭窄, 比降大, 水流湍急, 水量丰富, 含沙量小, 水质良好。汉江又称汉水, 汉江是长江较大的一级支流, 发源于陕西省宁强县的蟠冢山,由西向东横贯秦岭、大巴山之间, 流经汉中市辖的勉县、南郑、汉台、城固、洋县、西乡以及安康市的石泉、紫阳、汉阴、岚皋、安康、旬阳等县(区) 市, 于白河县流入湖北省境内, 在武汉市注入长江, 全长1 577 km, 干流在陕西省内河长656 km , 在省内流域面积为54 783 km2 (不包括丹江水系) , 占汉江全流域面积的37. 1 %。汉江蜿蜒曲折, 穿行于秦巴山地之间, 北岸支流较多, 河流长, 水量大, 较大的支流有褒河,胥水河、子午河、月河、旬河等。南岸支流相对较短, 主要支流有牧马河、任河、岚河、坝河等。汉江多年平均径流量为265. 50×108 m3, 多年平均输沙量约0. 50×108 t。 丹江发源于商洛市秦岭东南凤凰山, 有两个源头, 北源出于秦岭南坡的东峡, 经铁炉子至黑龙口与西源汇合。西源出于牧护关以东秦岭南麓的七盘河, 向东南和北源相会。黑龙口以下大致成东南流向, 经商州、丹凤、商南于商南县汪家店乡月亮湾出境。流经河南、湖北注入丹江口水库。全长443 km、总流域面积16 812 km2。在陕西省境内全长249. 6 km , 流域面积7 510 km2, 占总流域面积的44. 5 % , 年平均径流量17. 1×108m3, 年输沙量0. 04×108 t。 3水污染现状及原因分析 3. 1水污染现状 根据陕西省水环境中心及汉中、安康、商洛分中心的2005年水质监测结果分析, 丹江、汉江超过? 类标准的河长已达10. 5 % , 有28. 1 % 的评价河长不能达到国家对丹江口水库水质 Ⅱ类标准的要求。 从近年来的监测成果显示, 在汉江支流牧马河的西乡断面、月河长枪铺、丹江东龙山、张村断面都出现了劣í类水质, 丹江上大部分断面都有超标现象, 而且污染趋势有所上升。 3. 2水库目标要求

什么是遗传多样性

什么是遗传多样性、物种多样性、生态系统多样性? 遗传多样性是指存在于生物个体内、单个物种内以及物种之间的基因多样性。一个物种的遗传组成决定着它的特点,这包括它对特定环境的适应性,以及它被人类的可利用性等特点。任何一个特定的个体和物种都保持着大量的遗传类型,就此意义而言,它们可以被看作单独的基因库。基因多样性,包括分子、细胞和个体三个水平上的遗传变异度,因而成为生命进化和物种分化的基础。一个物种的遗传变异愈丰富,它对生存环境的适应能力便愈强;而一个物种的适应能力愈强,则它的进化潜力也愈大。 物种多样性是指动植物及微生物种类的丰富性,它是人类生存和发展的基础。物种资源为人类提供了必要的生活物质,特别是在医学方面,许多野外生物种属的医药价值对人类健康具有重大意义。随着医学科学的发展,许多目前人类未知的物种其医药价值也将不断被发现。 生态系统多样性是指生态系统类型的多种多样。地球上的生态类型极其繁多,但是所有生态系统都保持着各自的生态过程,这包括生命所必需的化学元素的循环和生态系统组成部分之间能量流动的维持。不论是对一个小的生态系统而言或是从全球范围来看,这些生态过程对于所有生物的生存、进化和持续发展都是至关重要的。维持生态系统多样性对于维持物种和基因多样性也是必不可少的。 简言之: 物种多样性,是从宏观方面来说的,指的是生物表现的性状多样性。 遗传多样性,是从微观方面来说的,指的是生物遗传物质DNA序列的多样性,也称为基因多样性。遗传多样性,决定了物种多样性。 例子:老虎、狮子、大象,属于不同的物种,反映了物种的多样性(性状有巨大差异)。决定这一切的,是它们细胞内的遗传物质的多样性,即DNA序列的多样性,它们的遗传物质是各自不同的。

遗传多样性的原因

产生遗传后代多样性的因素 2013012590高上涵经35 广义的遗传多样性是指地球上生物所携带的各种遗传信息的总和。这些遗传信息储存在生物个体的基因之中,是指种内或种间表现在分子、细胞、个体3个水平的遗传变异度,在分子水平上,遗传多样性主要体现在基因的多样性;在细胞水平上,主要体现在细胞形态和功能的多样性;在个体水平上,主要体现在个体表现型的多样性。狭义上则主要是指种内不同群体或个体间的遗传多态性程度。遗传后代多样性是多层次多水平的。 产生遗传后代多样性的因素很多,从宏观角度来看,生物进化影响着遗传多样性;从微观角度来看,遗传物质的多样性、变异性和繁殖的复杂性也是产生遗传后代多样性的因素。 (一)从进化的角度来看,在生物的长期演化过程中,具有适合生存环境的性状的个体更容易存货,决定这些性状的基因也更容易留存下来,由于外界环境的多变,一个物种所包含的基因越丰富,它对环境的适应能力越强。环境的多变是产生遗传多样性的原因。 (二)从遗传后代多样性的物质基础来看,基因、蛋白质、染色体具有多样性。大多数生物的遗传物质是DNA,DNA由四种脱氧核糖核苷酸按照一定的排列顺序组成,每一种排列顺序都代表着一种遗传信息,因此DNA可以储存大量的遗传信息,具有多样性,不同个体具有不同的遗传物质。基因表达的产物一般是蛋白质,而蛋白质由氨基酸构成,氨基酸的排列顺序、肽链的折叠方式、蛋白质的空间结构都导致了蛋白质的多样性。遗传物质的多样性、表达产物的多样性是遗传后代多样性的物质基础。 (三)基因与性状的关系来看,基因具有选择性表达的性质,相同基因的表达并不完全相同,同一个体不同细胞内的基因表达情况不同,不同个体的基因表达情况差异更大,即使是同卵双胞胎,基因的表达也会有很大的差异。基因表达的多样性是产生遗传后代多样性的因素。基因存在不完全显性:一个杂合体的表型介于两个产生它的纯合体的表型的过渡状态,还存在共显性:一个性状的体现由不止一个显性等位基因的表达,一个性状由多个基因共同控制。此外染色体数目的差异也会导致性状的不同(如唐氏综合征),基因和性状的关系的复杂性也是遗传多样性的因素。 (五)从遗传物质的突变来看,遗传物质在某种因素的刺激下能够发生变化基因突变、基因重组、染色体变异。遗传物质的突变主要有两种类型,即染色体数目和结构的变化以及基因位点内部核苷酸的变化,此外,基因重组也可以导致生物产生遗传变异。遗传物质的突变的概率较高,也是遗传多样性的根本原因。 (六)从繁殖方式来看,多数生物是有性繁殖,个体通过减数分裂产生配子,配子结合产生合子,个体从父母双方各继承一半的遗传信息。在产生配子的过程中,同源染色体分离,非同源染色体自由组合,姐妹染色单体的交叉互换等导致了配子的多样性。另外,配子是随机结合的,又增加了合子的多样性。 遗传物质的多样性、多变性,基因和性状关系的复杂性、环境的多变性等都是遗传后代多样性的因素。

中国主要东方蜜蜂种群的遗传多样性分析

中国主要东方蜜蜂种群的遗传多样性分析 任勤1,曹联飞2,赵红霞3,,王瑞生1,程尚1,罗文华1,曹兰1,姬聪慧*1 (1.重庆市畜牧科学院,重庆 402460;2.浙江省农业科学院,浙江杭州 310021;3. 广东 省生物资源应用研究所,广东广州 510260) 摘要:对中国具代表性的东方蜜蜂遗传资源中7个种群的线粒体DNA tRNA leu~ CO Ⅱ基因进行扩增和测序,并进行遗传多样性比较及亲缘关系分析。结果表明,共发现43个单倍型,其中10个单倍型在GenBank数据库对比确认属于新发现单倍型;7个群体中,阿坝中蜂、滇南中蜂和海南中蜂遗传多样性水平较高,长白山中蜂遗传多样性水平较低,其他群体遗传多样性居中;不同种群间遗传距离变化较大,其中海南中蜂与滇南中蜂、阿坝中蜂间的遗传距离最大,长白山中蜂与云贵中蜂、北方中蜂、华南中蜂间的遗传距离最小;聚类分析显示7个种群可聚为4个类群。 关键词:东方蜜蜂;遗传多样性;线粒体DNA 中图分类号:文献标志码:A Analysis of genetic diversity of Apis cerana populations in China REN Qin1, CAO Lianfei2,ZHAO Hongxia3,WANG Ruisheng1,CHENG Shang1,LUO Wenhua1,CAO Lan1, JI Conghui*1 (1.Chong Qing Academy of Animal Science,Chongqing 402460,China;2.Zhejiang Academy of Agricultural Sciences,Zhejiang 310021,China; 3.Guangdong Institute of Applied Biological Resources, Guangdong 510260, China) Abstract:The mitochondrial DNA tRNA leu~CO II genes in 7 populations of Apis cerana Fabricius in China were amplified and sequenced, and their genetic diversity and phylogenetic relationships were analyzed. The results showed that a total of 43 haplotypes were identified, of which 10 haplotypes were identified new haplotypes in the GenBank database, Among 7 populations, Aba bee, Hainan bee and Yunnan bee have higher level of genetic diversity, Changbai Mountain bee has lower level of genetic diversity, other populationswere intermediate; The genetic distances between different populations varied greatly, of which Hainan bee andhave maximum genetic distance with Yunnan bee and Aba bee, The genetic distances between Changbai mountain bee and Yunnan bee, Middle China bee, Northern bee and Southern bee were small.; Cluster analysis showed that the 7 populations could be clustered into 4 taxa. Key words:Apis cerana Fabricius; genetic diversity; mitochondrial DNA 收稿日期: 基金项目:国家蜂产业技术体系基金项目(CARS-45SYZ15);重庆市畜牧科学院基金项目(16421). 作者简介:任勤(1979-), 男, 宁夏固原人,助理研究员, 硕士研究生,主要从事蜜蜂方面的研究。 通信作者:姬聪慧(1980-),女,河南平顶山人,助理研究员,硕士研究生。

湖北十堰丹江口水库导游词

丹江口水库 有句话说的好,“百年修的同船渡”,今天能与各位同船共赏这悠悠汉江水,实在是李某的荣幸。自我介绍一下,我是江汉旅行社的导游李珍,大家叫我小李就好。今天将由我为大家提供导游讲解服务,希望我的服务能让你度过美好愉快的一天。 美丽的丹江水,从商洛山的崇山峻岭中索绕迂回,怀着对大山深深的眷恋,缓缓地流到豫、鄂、陕交界的湖北省丹江口和河南省淅川县境内。 丹江口水库域跨豫鄂两省,坐落在群山环绕之中,这里气候适宜,空气清新,日照量很高。水质透明,水面宽阔,风平浪静,是目前中国功能最全、效益最佳的特大型水库之一,在防洪、发电、航运、灌溉、养殖以及旅游等方面都发挥着巨大的优势。它是20世纪50年代末期国家兴建的综合开发和治理汉水流域的大型水利枢纽工程,共分为汉江和丹江两大库区,蓄水174亿立方米,目前为亚洲库容最大的人工淡水湖。 丹江口水库的自然景色是旅游的最佳去处,江面上有四通八平的航线,库区内有自成体系的公路。从这里西上过荆紫关可通秦川,南下可达荆楚,东进可入中原大地。丹江水面碧波千顷,天水一色,山清水秀,美丽如画,奇山异石,独具姿彩。游艇鱼舟荡漾在绿波之上,人绕水转,山随人移,人如画中行,山似水上飘。令人心旷神怡,乐

趣无穷。水库的雁口一带有几十里狭长的江面,夹岸奇峰对峙,陡壁峭拔,野藤倒挂,山环水绕,这就是著名的丹江“小三峡”(云岭峡、大自峡、雁口峡),可与长江三峡媲美。狮子山壁上有一天然石佛,高达15米,面向江面,平视前方,神态安详,正襟危坐,颇有乐山大佛之雄姿。其慈颜端庄肃穆,两手合掌于胸前,好像正在给坐艇、荡舟的游人祝福。 在丹江旅游区的湖光山色之间,大量文物古迹的点缀,给游览区更是锦上添花,使之魅力大增。在这座大型“水晶博物馆”中,珍藏着“豫西走廊”的古老历史。库区的45里顺阳川上,古迹名胜苔革,既是楚文化的发祥地,又是楚文化与中原文化的交融地。 库区淹没的腑地就是楚国的古都丹阳。屈原流放时在这里写下了许多诗篇,其中《国殇》里描写的秦楚丹阳之战就发生在这里。水库岸边有春秋战国古墓群,发掘的25座楚墓中出上的7000余件珍贵文物记载着顺阳川的昔日繁荣,其中楚令尹子庚墓中出上的编钟是全国出上编钟干青质最好的一套。彼定为国玉的铜禁,府排萧等文物,反映了几千年前这里的悠久历史和文明盛况。众多的文物古迹和自然景观融汇在一起,使丹江更加神秘瑰丽。 好,游客朋友们,现在我们就登上了大家期待已久的大坝坝顶。俯视着悠悠汉江水,心中顿生无限感概。

丹江口水库

丹江口水库简介 丹江口水库位于湖北省丹江口市和河南省淅川县毗邻处,域跨鄂豫两省,是20世纪50年代末期国家兴建的综合开发和治理汉水流域的大型水利枢纽工程,分为湖北境内、河南境内两大库区,蓄水174亿立方米,目前为亚洲库容最大的人工淡水湖。水库总面积846平方千米,库区水面最宽处在李官桥一带,东西宽为20多千米,最窄处在关防滩一带,两岸夹峙不足300米;库区水位最深处在湖北丹江口与河南淅川之间台子下的省界江心,深达80多米。 丹江口水库的枢纽工程由拦江大坝、发电站、升船机和两个灌溉引水渠渠首四部分组成,大坝高为162米,混凝土大坝坝高97米,大坝总长2494米(其中混凝土坝长1141米),设计蓄水水位157米,相应库容为174亿立方米,泄洪能力为9200立方米/秒,电站装机6台,单机容量为15万千瓦时,年发电量为40亿千瓦时。升船机经过改造升级后一次可载重300吨级驳船过坝。两个引水渠渠首分别是位于河南淅川的陶岔(即南水北调中线工程的取水口,设计流量为500立方米/秒)和位于湖北的清泉沟隧洞,设计流量为100立方米/秒。这座水库是目前中国功能最全、效益最佳的特大型水库之一,在防洪、发电、航运、灌溉、养殖以及旅游等方面都发挥着巨大的优势。丹江口水库为南水北调中线工程的水源区和取水处。南水北调中线工程,供水直达京、津、冀、豫四省市,年调水130亿立方米。 1.防洪 自水库建成几十年来,共拦蓄、削滞汉江、丹江上游发生的上万立方米每秒的洪水59次。解除了武汉、襄阳等23个县市1亿多人口及1860多万亩耕地的洪水威胁,其抵御暴洪的能力达到了百年一遇的标准。 2.发电 装机6台,总容量为90万千瓦时的强大电网,担负着华中电网主要的调峰电量和调频、调相、负载备用、事故备用等任务。不仅解决了武汉襄樊等城市的工农业用电,还为豫西南地区的大部分工农业用电提供了有力的保障。 3.航运 在水库建成后,水库上下的河道全年可通航300吨级船舶。其中从武汉到襄樊由原来的季节通航变为全年通航,大大改善了鄂西北以及豫西南地区交通落后的面貌。 4.灌溉 从水库引水渠首引水,年均引水9亿立方米。常年灌溉耕地360多万亩。

遗传多样性产生的原因

遗传多样性产生的原因 遗传多样性产生的原因 (一)从进化的角度来看,在生物的长期演化过程中,具有适合生存环境的性状的个体更容易存货,决定这些性状的基因也更容易留存下来,由于外界环境的多变,一个物种所包含的基因越丰富,它对环境的适应能力越强。环境的多变是产生遗传多样性的原因。 (二)从遗传后代多样性的物质基础来看,基因、蛋白质、染色体具有多样性。大多数生物的遗传物质是dna,dna由四种脱氧核糖核苷酸按照一定的排列顺序组成,每一种排列顺序都代表着一种遗传信息,因此dna可以储存大量的遗传信息,具有多样性,不同个体具有不同的遗传物质。基因表达的产物一般是蛋白质,而蛋白质由氨基酸构成,氨基酸的排列顺序、肽链的折叠方式、蛋白质的空间结构都导致了蛋白质的多样性。遗传物质的多样性、表达产物的多样性是遗传后代多样性的物质基础。 (三)基因与性状的关系来看,基因具有选择性表达的性质,相同基因的表达并不完全相同,同一个体不同细胞内的基因表达情况不同,不同个体的基因表达情况差异更大,即使是同卵双胞胎,基因的表达也会有很大的差异。基因表达的多样性是产生遗传后代多样性的因素。基因存在不完全显性:一个杂合体的表型介于两个产生它的纯合体的表型的过渡状态,还存在共显性:一

个性状的体现由不止一个显性等位基因的表达,一个性状由多个基因共同控制。此外染色体数目的差异也会导致性状的不同(如唐氏综合征),基因和性状的关系的复杂性也是遗传多样性的因素。 (四)从遗传物质的突变来看,遗传物质在某种因素的刺激下能够发生变化基因突变、基因重组、染色体变异。遗传物质的突变主要有两种类型,即染色体数目和结构的变化以及基因位点内部核苷酸的变化,此外,基因重组也可以导致生物产生遗传变异。遗传物质的突变的概率较高,也是遗传多样性的根本原因。 (五)从繁殖方式来看,多数生物是有性繁殖,个体通过减数分裂产生配子,配子结合产生合子,个体从父母双方各继承一半的遗传信息。在产生配子的过程中,同源染色体分离,非同源染色体自由组合,姐妹染色单体的交叉互换等导致了配子的多样性。另外,配子是随机结合的,又增加了合子的多样性。 遗传多样性的研究意义 对遗传多样性的研究具有重要的理论和实际意义。 首先,物种或居群的遗传多样性大小是长期进化的产物,是其生存适应和发展进化的前提。一个居群或物种遗传多样性越高或遗传变异越丰富,对环境变化的适应能力就越强越;容易扩展其分布范围和开拓新的环境。即使对无性繁殖占优势的种也不例外。理论推导和大量实验证据表明,生物居群中遗传变异的大小与其进化速率成正比。因此对遗传多样性的研究可以揭示物种或居群的进化历史(起源的时间、地点、方式),也能为进一步分析其进化潜力和未来的命运提供重要的资料,尤其有助于物种稀有或濒危原因及过程的探讨。

ntsys-pc遗传多样性分析软件使用说明

NTSYS-PC使用说明 1 数据的录入方法: 1.1 利用Ntedit直接录入数据 0、1二元数据中的数据缺失记为2。其中列标可以写为样品编号,在No.rows 栏中写入0、1数据总数,No.cols 栏中写入样品总数。文件另存为*.nts格式。 1.2 从excel表中直接读入数据 Excel表中输入数据格式如下图。A1必须为1,B1为0、1数据总数,C1为样品总数。 打开Ntedit程序,选择从Excel表输入,结果见上图。文件另存为*.Nts格式 1.3 Ntsys-pc可以直接运行*.phy格式的文件(由phylip和phytool产生) 1.4 DNA序列数据Ntsys-PC也可以分析,但好像用的人较少。建议大家使用phylip或者其他的软件。DNA序列数据在Excel 中输入格式如下:

1.5 其他数据的Excel输入如下: 2 聚类分析 Ntsys-pc2.02界面如下: 以下以图中数据为例介绍聚类过程: 2.1 首先用similarity程序组中的SimQual计算形似系数矩阵。Coefficient通常选用SM 或DICE,结果输出到另一文件

2.2 以上步的结果作为input file利用Clustering程序组中的SHAN或者Njoin进行计算,聚类分法选用UPGMA,ties选用FIND,Maximum no. tied trees至少大于样品数。 Njoin程序组界面如下,rooting method可以选用Outgroup,但需输入外元。 2.3 将SHAN或NJoin方法得到的tree file文件输入到Graphics程序组中的tree plot程序中计算

丹江口库区及上游地区经济社会发展规划

附件: 丹江口库区及上游地区经济社会发展规划 二○一二年十月

目录 前言 (1) 第一章发展背景 (2) 第一节基础条件 (2) 第二节机遇挑战 (3) 第二章总体要求 (4) 第一节指导思想 (4) 第二节发展原则 (4) 第三节发展目标 (5) 第三章空间布局 (6) 第一节功能分区 (6) 第二节重点城镇发展 (7) 第四章生态安全 (8) 第一节加大污染防治力度 (9) 第二节防治农村面源污染 (10) 第三节加强生态保护与建设 (11) 第五章产业发展 (12) 第一节大力发展高效生态农业 (12) 第二节加快推进工业结构调整 (14) 第三节积极发展以旅游业为主的服务业 (17)

第六章基础设施 (18) 第一节加快交通设施建设 (18) 第二节加强水利设施建设 (19) 第三节推进电力设施建设 (20) 第四节完善广电和通讯网络 (20) 第七章社会事业 (21) 第一节优先发展教育事业 (21) 第二节加快发展医疗卫生事业 (22) 第三节积极发展文化事业 (23) 第四节大力促进就业 (23) 第五节完善社会保障制度 (24) 第六节加强社会管理 (25) 第八章保障措施 (26) 第一节创新体制机制 (26) 第二节加大政策支持 (26) 第三节开展对口协作 (27) 第四节强化组织实施 (27)

前言 丹江口库区及上游地区位于秦巴、伏牛山区,是南水北调中线工程的水源区,承担着保障调水水质安全和实施移民搬迁安置的历史性任务。为保障南水北调中线工程顺利实施,促进丹江口库区及上游地区经济社会可持续发展,特制定本规划。 本规划范围包括河南、湖北、陕西3省的43个县(区、市),以河南省南阳市的淅川县、西峡县、内乡县、邓州市和湖北省十堰市的张湾区、茅箭区、丹江口市、郧县、郧西县9个库区县(市、区)为核心区,以河南省洛阳市的栾川县、三门峡市的卢氏县,湖北省十堰市的竹山县、竹溪县、房县及神农架林区,陕西省安康市的汉滨区、镇坪县、平利县、旬阳县、白河县、汉阴县、石泉县、宁陕县、紫阳县、岚皋县和汉中市的汉台区、南郑县、城固县、洋县、西乡县、勉县、略阳县、宁强县、镇巴县、留坝县、佛坪县以及商洛市的商州区、洛南县、丹凤县、商南县、山阳县、镇安县、柞水县34个县(市、区)为影响区。规划面积11.13万平方公里,其中核心区2.26万平方公里。规划期到2020年。 本规划是当前和今后一个时期指导丹江口库区及上游地区经济社会发展的行动纲领和编制相关规划的重要依据。

遗传多样性空间格局分析软件spagedi简介

SPAGeDi1.3 a program for S patial P attern A nalysis of Ge netic Di versity by Olivier J. H ARDY and Xavier V EKEMANS with the contribution of Reed A. C ARTWRIGHT Copyright (c) 2002-2009 Olivier Hardy and Xavier Vekemans User’s manual Address for correspondence: Service Eco-éthologie Evolutive, CP160/12 Université Libre de Bruxelles 50 Av. F. Roosevelt B-1050 Brussels, Belgium e-mail: ohardy@ulb.ac.be Last update: 22 March 2009

Contents 1. Note about SPAGeDi 1.3 and installation 2. What is SPAGeDi ? 2.1. Purpose 2.2. How to use SPAGeDi – short overview 2.3. Data treated by SPAGeDi 2.4. Three ways to specify populations 2.5. Statistics computed 3. Creating a data file 3.1. Structure of the data file 3.2. How to code genotypes? 3.3. Example of data file 3.4. Note about distance intervals 3.5. Note about spatial groups 3.6. Note about microsatellite allele sizes 3.7. Using a matrix to define pairwise spatial distances 3.8. Defining genetic distances between alleles 3.9. Defining reference allele frequencies for relatedness coefficients 3.10. Present data size limitations 4. Running the program 4.1. Launching the program 4.2. Specifying the data / results files 4.3. Selecting the appropriate options 4.4. Information displayed during computations 5. Interpreting the results file 5.1. Basic information 5.2. Allele frequency analysis 5.3. Type of analyses 5.4. Distance intervals 5.5. Computed statistics 5.6. Permutation tests 5.7. Matrices of pairwise coefficients/distances 6. Technical notes 6.1. Statistics for individual level analyses 6.2. Statistics for population level analyses 6.3. Inference of gene dispersal distances 6.4. Estimating the actual variance of pairwise coefficients for marker based heritability and Q ST estimates 6.5. Testing phylogeographic patterns 7. References 8. Bug reports

遗传多样性

生物多样性学习单一 学习任务一、生物多样性 1、生物的多样性是指来源于各种各样生态系统的形形色色的活的生物体,包含、、三个层次。 2、遗传多样性是指内___ _______的多样性。检测遗传多样性的方法有和 ________________________二种。 3、物种多样性是指地球上_________________等生物物种的________。包括某一特定区域内物种__________和物种__________。物种多样性是衡量一定区域中生物______________的指标。 物种多样性常用测量方法是对某分布区域种群密度调查。其中动物种群估算的方法常用__________法,植物群落的多样性的计算方法是。 4、生态系统多样性是指。其中生境是指。 5、生物多样性的价值体现在以下、、、等方面。 A、食用性 B、药用性 C、工业生产原料 D、观赏性 E、涵养水源、保持水土 F、净化环境、维持生态稳定 G、改良种、养殖品种的品质 H、控制病虫害 I、科学研究中的模式生物 J、仿生学的模仿对象 检测3、下列关于遗传多样性的叙述,正确的是() A、物种间基因和基因型的多样性 B、生物的脱氧核苷酸的排列顺序 C、整个生物群落中的基因和基因型的多样性 D、物种内基因和基因型的多样性 检测4、下列生物之间的差异不属于遗传多样性的是() A、五彩斑斓的金鱼 B、红花、黄花、紫花的郁金香 C、早稻、晚稻和中稻 D、无籽番茄、正常的番茄 检测5.遗传多样性在生物中普遍存在,下列关于遗传多样性的意义,正确的是 ( ) ①遗传多样性能有效地增大种群基因库;②遗传多样性有利于物种适应环境而长期生存;③产生新物种;④为物种提供进化的材料 A.①②④ B.②③④ C.①②③ D.①②③④ 检测6.我国苔藓植物、蕨类植物和种子植物共有3万多种,居世界第三位。我国还是世界上裸子植物物种最多的国家。我国脊椎动物种类约占世界脊椎动物总数的14%,我国还是世界上鸟类种类最多的国家之一。这段话与下列哪项相符( ) A.特有种和古老物种多 B.物种多样性 C.遗传多样性 D.生态系统多样性 检测7.地球上的物种很多,而且同一物种的生物虽然很相像,但也存在一定的差异,下列各组生物不属于同一物种的是 ( ) A.华南虎和东北虎 B.早稻和糯稻 C.长江蟹和辽河蟹D.驴和马

丹江口水库调研

丹江口水库调度自动化系统开发及应用 胡永光董付强 丹江口水利枢纽管理局,湖北丹江口(442700) E-mail:djksq@https://www.doczj.com/doc/fd2187335.html, 摘要:水调自动化系统是电网调度自动化的一个重要组成部分,是充分发挥水库综合效益的有力支撑。主要进行与水库运行有关的监视、预报、调度和管理。系统基于对历史资料的收集整理,通过对实时水文、气象、水库运行等信息的自动采集,利用数据库管理技术,进行实时水文预报、调洪演算、优化调度和水务综合管理等,提供满足防洪、发电、灌溉及其他综合利用要求的水库调度决策方案。本文对丹江口水库调度自动化系统的开发内容做了主要介绍,并对系统建成以来的效益做了简要分析,认为系统的应用为水库带来了巨大的社会效益和经济效益,是值得大力推广的非工程措施。 关键词:水调自动化系统;开发;效益;非工程措施 1.引言 1.1 流域概况 丹江口水利枢纽位于汉江与支流丹江汇合口下的丹江口市,水库控制流域面积95200 Km2,占汉水流域面积的60%。丹江口水利枢纽工程是一座以防洪为主,兼顾发电、灌溉、航运、养殖等综合利用效益的大型水利工程,它不仅是治理开发汉水的关键工程,又是南水北调工程中线方案的水源地,在国民经济中起十分重要的作用。 汉江是长江中游最大的支流[1],发源于陕西省秦岭南麓,干流流经陕西、湖北两省,于武汉市汇入长江,全长1577Km,落差1964m。北以秦岭及外方山与黄河流域为界;东北以伏牛山及桐柏山与淮河流域为界;西南以大巴山及荆山与嘉陵江和沮漳河等相邻;东南为汉江平原,水系纷繁。流域面积为15.9万Km2。 汉江流域地势西北高,东南低。水系成叶脉状,自上而下主要支流有任河、洵和、甲河、堵河、丹江、南河、唐白河等。丹江口以上为上游,干流河段长925Km,集水面积9.52万Km2;丹江口至钟祥河段称中游,河长270Km,集水面积4.68万Km2,多为丘陵与河谷盆地;钟祥以下至汉江河口为下游,河长382Km,集水面积1.7万Km2,是汉江平原地带,河道弯曲,水流较缓。 干流沿岸有汉中、安康、十堰、襄樊、荆门、潜江、仙桃、武汉等大中城市。汉江中下游沿岸平原和河谷阶地及上游汉中盆地是重要农业区。流域内交通运输发达,是我国重要的内河水运通道。汉江流域示意图见图1。 图1 汉江流域示意图

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