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Genome and virulence determinants of high virulence community-acquired MRSA

Genome and virulence determinants of high virulence community-acquired MRSA
Genome and virulence determinants of high virulence community-acquired MRSA

Kawasaki, Japan), and mutually overlapping orfs were identified and removed in some cases. We searched a non-redundant protein database with ORFs—peptides encoded by orfs —with BLAST software.7We identified transfer RNA and tmRNA 8genes by tRNAscan-SE 9and with a procedure available online.10

The best-hit entries identified by BLASTP 7searches with e-values of 1·0?10–5or less were classified into taxonomic groups in accordance with the NCBI (National Center for Biotechnology Information) taxonomy database.11We excluded hits against entries for Staphylococcus genus from this analysis.

We calculated bias in SYNONYMOUS CODON USAGE against averages of all orfs longer than 150 bp (B all

) and of ribosomal proteins (B rp

) and GC content at the third codon position (GC3), as described previously.4With these values, we defined putative highly expressed genes and alien genes as orfs with B rp

<0·35 and B all

>0·30, and B rp

>0·52 and B all

>0·345, respectively. We also regarded orfs as possible alien genes when their GC3 values differed more than 1·5 SD from the average of all orfs longer than 150 bp, which corresponds to GC3<0·16 or GC3>0·29. To compare the MW2 genome with those of other S aureus strains, we first processed homologous regions of the two chromosomes with bl2seq (blast for two sequences),12and we visualised them for gross comparison. To do this, we divided a 2·8-Mb genome into three 1-Mb fragments, and blast homology was calculated for the nine pairs of fragments. Then, we processed blast results by a script written in Perl (https://www.doczj.com/doc/d715348990.html,) and visualised with Mathematica (Wolfram Research, Champaign, IL, USA). Similarity between the two virtual chromosomes—which are obtained by removal of all genomic islands and the mobile genetic elements IS 1181, Tn 554, and Tn 5801from the chromosomes—was assessed by AVID whole genome alignment as the proportion of matched nucleotides in the entire aligned nucleotides including gaps.13To verify some of the ideas derived from the comparison, we compared the genome sequence of MW2 with those of NCTC8325,14E-MRSA-16 (strain 252),15and MRSA strain COL.16

To assess spontaneous excision of genomic islands,LightCycler PCR was done with the LightCycler-FastStart DNA Master SYBR Green I kit (Roche Diagnostics, Mannheim, Germany) with specific primers designed in and around the genomic islands. To calculate frequency of the chromosome from which the island in question was precisely cut out, and to ascertain copy number of closed circular DNA formed by the excised island, we did quantitative PCR amplification, and then established the relative copy numbers of each PCR product with LightCycler software.

Role of the funding source

The sponsors of the study had no role in study design,data collection, data analysis, data interpretation, or writing of the report.

Results

Strains used for comparison

N315 is a MRSA strain named after Nagasaki University Hospital, Japan, isolate number 315. Mu50 is a vancomycin-resistant MRSA (VRSA) isolate from the pus of a postoperative wound. NCTC8325 is a registered strain of the National Collection of Type Cultures and has been widely used as laboratory S aureus strains. E-MRSA-16 (strain 252) is an epidemic MRSA from an outbreak in 1991–92 in the UK. The classification of number 16 was

2·5

0·5

2·0

1·51·0

0·52·51·01·52·0(Mb)

N315(Mb)

SCC mec

Type II

SCC mec Type IVa

Type II ?Sa ?

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MW2:

Type IVa

N315:

Type II

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orfs associated with mecA gene orthologous orfs

orfs associated with ccr genes others

Functional direct repeats

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35

Figure 3:Comparison of three allelic forms of SCC mec, in MW2, N315, and NCTC10442 strains Arrows with gaps indicate frameshifted orfs.

not carried by any ?Sa3 prophages found in comparator genomes. Alignment of some of these prophages highlights their mosaic structures that have been generated by multiple crossovers, which is reminiscent of the case of SCC mec(figure 4, C). This finding shows clearly that prophages also exist in allelic forms.

The other prophage on MW2 chromosome, ?Sa2mw, carries genes lukF-PV and lukS-PV, which encode PANTON-VALENTINE LEUKOCIDIN components, which have a potent toxic effect on human white-blood cells. The toxin is strongly associated with severe forms of pneumonia (necrotic pneumonia) caused by community-acquired S aureus strains.27The?Sa2 attachment site is present in all six chromosomes, and three strains MW2, NCTC8325, and E-MRSA-16 (strain 252) do have integrated prophages. However, again they exist in

Common to all

Common to MW2 and NCTC8325 Common to N315 and Mu50 Unique to N315

Common to all but N315Unique to Mu50 Deletions Enterotoxin genes Phage attachment site

N315

Type I ?Sa?Mu50

Type I ?Sa?MW2

Type II ?Sa?NCTC8325 Type I ?Sa?

N315/Mu50 Type I ?Sa?MW2

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Figure 4: Staphylococcal genomic islands in strains N315, Mu50, NCTC8325, and MW2

tnp=transposase gene. Arrows and arrowheads=orfs and their direction of transcription. Broken lines=missing orfs. No orf number has been assigned to NCTC8325 coding regions. Superantigen genes are filled in red. Regions with greater than 90% of their nucleotide sequences identical are filled with the same colour. (A) Genomic island ?Sa?. (B) Genomic island ?Sa?. (C) Prophage ?Sa3. For (A) and (B), red=toxins; yellow=lipoproteins; orange=serine proteases; light green=bacteriocin-related genes. Other unique colours are given by the gene names. Colour for hsdS differs by ?Sa type. Grey

arrows=functionally unknown orfs. Dark grey=identical orfs to all strains shown; light grey=orfs not identical to all strains. (C) see key.

of other S aureus strains. The culture supernatant of MW2contained ten times stronger human T cell proliferation activity than N315, and its activity is directed towards distinct T-cell subsets compared with those activated by N315 (T Uchiyama, unpublished observation). This strong stimulation of distinct T-cell subsets might be correlated with high virulence of MW2.

Some of the virulence genes on MW2 probably contribute to its pathogenicity in healthy human hosts, but it is not clear which of these virulence factors is most important. For example, although work in animals shows that MW2 has an LD 50

that is five times less than N315,results of gene knockout studies show that no single gene,such as lukS-PV, lukF-PV ,cna , or seh , accounts for this difference (T Baba, unpublished). Therefore, it is likely that the total pathogenic potential of MW2 is a result of synthetic contribution of many virulence genes listed in this study (table 2, figure 2). Moreover, although some genes (eg, cna ) arise singly in the chromosome, most virulence genes tend to exist as a set of allelic genes carried by genomic islands. This fact was first noticed from scrutiny of ?Sa ?, in which the set gene cluster encoded a totally different range of superantigens between N315 and MW2. This finding strongly suggests that the pathogenic potential of S aureus is established first, by the genomic island families it is part of, and second, by whatever allelic form of each island family it takes. Since most of the genomic islands are potentially mobile, pathogenic potential of each strain of S aureus is not an intrinsic trait and is likely to change as a result of intraspecies exchange of virulence genes via lateral gene transfer.

On the basis of our findings, we propose that GENOMIC ISLAND ALLOTYPING is a novel approach to S aureus genome typing. This process allows us to predict the pathogenic capability of an S aureus clinical strain, and would even help us predict the symptom, severity, and prognosis of the illness that it causes. Genomic island allotyping, done either by PCR, microarray hybridisation, or nucleotide sequence determination of certain regions of genomic islands, would add medically relevant information to extant genotypings, such as pulsed-field gel electrophoresis or multilocus sequence typing,34which indicate only the physical genomic information of S aureus chromosome.

Contributors

All investigators contributed to design of the study. K Hiramatsu was responsible for overall experimental design and interpretation of data.

T Baba did comparative genome analysis and interpretation of structures of the pathogenicity islands and prophages of MW2. F Takeuchi and K Yamamoto did computer-directed analysis on MW2 genome and its comparison with other strains. M Kuroda constructed the genomic library and annotated the MW2 genome. H Yuzawa analysed structural differences of SCC mec between MW2 and other strains. A Oguchi,

Y Nagai, and N Iwama established the MW2 genomic sequence. K Aoki and K Asano assembled contigs and did the BLAST search. H Kuroda-Murakami studied mobile capability of genomic islands by PCR with a Light Cycler. T Naimi did clinical and epidemiological

characterisation of MW2 and associated mid-western community-acquired MRSA strains. L Cui analysed allelic genes of MW2 and comparator strains.

Conflict of interest statement

None declared.

Acknowledgments

We thank Hisashi Kikuchi, chairman of National Institute of Technology and Evaluation, for his support; Chuntima Tiensasitorn, Rika Nishiko and Satomi Suzuki for technical assistance; Susan Johnson, Kathy LeDell, Ruth Lynfield, Richard Danila, and Michael Osterholm (Minnesota Department of Health), Larry Shireley (North Dakota Department of

Health), and Fred C Tenover (Centers for Disease Control and Prevention,Atlanta, USA) for clinical and epidemiological characterisation of MW2strain; Hiroyuki Takase and Ken-ichi Sato (Daiichi Pharmaceutical Co,Japan) for virulence evaluation of MW2 in animal infection model; and Yuh Morimoto for help in preparation of computer graphics.

different allelic forms, and only ?Sa2mw has Panton-Valentine leukocidin genes.

Virulence genes of MW2 found outside genomic islands Collagen-adhesin protein (CNA)28is uniquely encoded in the MW2 genome near the origin of replication (orf MW2612, indicated by green arrow in figure 2). This protein is reported to be implicated in pathogenesis of osteomyelitis and septic arthritis.29,30Small direct repeat sequences are found around cna , but there is no evidence that the gene is a part of a mobile genetic element.

Discussion

Transposons and insertion sequences can integrate themselves into any chromosome loci by illegitimate recombination.31Thus, they tend to shuffle genome structure and are thought to contribute much to adaptability of S aureus to the adverse environment. From this viewpoint, it is curious to note that MW2 has scarcely any transposons or insertion sequences, whereas N315 and Mu50 have many (table 1).

It would be reasonable to assume that hospitals are a severe environment for microorganisms to survive in,because they are constantly exposed to various antiseptics and new antibiotics. Multiple insertions of transposons and insertion sequences in hospital-acquired MRSA genomes might be testament to the evolutionary ordeal they have gone through. In support of this view, we have previously shown that the copy number of insertion sequences of an MRSA strain increases in time during its propagation within a hospital.32By contrast, MW2 is thought to represent a successful clone of S aureus in the community. The bacteriocin operon in MW2 might be indispensable for community-acquired S aureus strains; in this environment, competition with many other bacterial species for colonisation serves as a big selective pressure for survival.

Growth rate is also important. In fact, MW2 grows much faster than hospital-acquired MRSA strains, as doubling time shows, which—in drug-free Mueller-Hinton broth—is 23·5, 34·8, and 46·8 min for MW2, N315, and Mu50, respectively. As an already successful part of the natural flora of healthy human beings, MW2 seems to establish an additional advantage by acquisition of a simple and less encumbering allelic version of SCC mec (type IVa)to survive sporadic exposure to limited varieties of antibiotics prescribed in the outpatients’ clinic.

MW2 has a total of 18 toxins, which are not recorded in any of the five comparative S aureus genomes (N315,Mu50, E-MRSA-16 [strain 252], NCTC8325, and COL).The Panton-Valentine leukocidin components recorded on ?Sa2mw should at least partly contribute to virulence of MW2, since results of an epidemiological study showed a close association of Panton-Valentine leukocidin with necrotic pneumonia,27a symptom that is seen in patients infected with MW2 and related strains.1

The superantigen staphylococcal enterotoxin H, which is reported to have the highest binding affinity to major histocompatibility complex class II molecules among staphylococcal enterotoxins, is also uniquely reported in MW2 genome.33Besides this superantigen,MW2 has 15 unique superantigen genes: 11 exotoxin (set )genes on ?Sa ? island and four enterotoxin genes on ?Sa3and ?Sa3 genomic islands. These putative superantigens have at least 2% aminoacid differences compared with their extant homologues, and together with staphylococcal enterotoxin H, constitute an unique allelic superantigen range in MW2. These superantigens are expected to trigger human T cells in a quite distinct fashion from those

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34Enright MC, Spratt BG. Multilocus sequence typing. Trends Microbiol

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数据库简答题 (2)

章一 1、简述数据库管理技术发展的三个阶段。各阶段的特点是什么? 答:数据库管理技术经历了人工管理阶段、文件系统阶段和数据库系统阶段。 (1)、人工管理数据的特点: A、数据不保存。 B、系统没有专用的软件对数据进行管理。 C、数据不共享。 D、数据不具有独立性。 (2)、文件系统阶段的特点: A、数据以文件的形式长期保存。 B、由文件系统管理数据。 C、程序与数据之间有一定的独立性。 D、文件的形式已经多样化 E、数据具有一定的共享性 (3)、数据库系统管理阶段特点: A、数据结构化。 B、数据共享性高、冗余度底。 C、数据独立性高。 D、有统一的数据控制功能。 3、简述数据库、数据库管理系统、数据库系统三个概念的含义和联系。 答:数据库是指存储在计算机内、有组织的、可共享的数据集合。 数据库管理系统是软件系统的一个重要组成部分,它通过借助操作系统完成对硬件的访问,并对数据库的数据进行存取、维护和管理。 数据库系统是指计算机系统中引入数据库后的系统构成。它主要由数据库、数据库用户、计算机硬件系统和计算机软件系统几部分组成。 三者的联系是:数据库系统包括数据库和数据库管理系统。数据库系统主要通过数据库管理系统对数据库进行管理的。 4、数据库系统包括哪几个主要组成部分?各部分的功能是什么?画出整个数据库系统的层次结构图。 答:数据库系统包括:数据库、数据库用户、软件系统和硬件系统。 数据库主要是来保存数据的。 数据库用户是对数据库进行使用的人,主要对数据库进行存储、维护和检索等操作。 软件系统主要完成对数据库的资源管理、完成各种操作请求。 硬件系统主要完成数据库的一些物理上的操作,如物理存储、输入输出等。

GenomeStudio分析软件流程

GenomeStudio分析软件使用简单流程 一、导入数据简单分析 双击GenomeStudio软件图标,打开软件,进入如下界面,在软件界面的右侧中有相应的说明书和模块进行下载安装。 根据需要分析的要求选择相应的模块分析,下面已Genotyping为例介绍。 单击,进入数据导入窗口,导入数据的流程与KaryoStudio相类似,在最后的进入如下界面:

选择相应的栏目,如下图所示:

点击“Finish”,完成数据导入流程,软件自动运算,运算完成之后出现如下界面: 选择:tool菜单下的Show Genome Viewer…等待运算后,软件自动跳出相应的选择界面:

选择需要分析的标本和需要看到相关的参数,点击ADD 将所选择的栏目添加到右侧的空白栏中,界面如下: 点击OK ,进入如下界面: 选择updata ,软件自动运算显示染色体相应信息 可以逐个样本进行分析: 选择相应的样本后,点击updata ,右侧的对话框中会显示全部染色体的相关信息,右侧的对 话框的可以显示全部染色体的信息,点击可以选择需要显示染色体的信息, 也可以对显示信息进行编辑。 分析数据时可以逐个染色体分析,发现有异常区域时,可以双击异常区域在染色体上相应的位置,进行进一步的放大观察分析,具体步骤如下面图解:

图中放大的区域部分为缺失,在B allele Freq.图中缺少了中间杂合的信息。下图显示的是重复的情况:

二、输出报告 点击下面界面上的analysis菜单下的reports 下面的report wizard 选择final report 点击NEXT,进入一级菜单,根据实验需要选择,在如下对话框中,可以根据需要输出的数据选择hide 或者show

音响入门到高手必看知识

音响入门到高手必看知识音箱作为声频的终端器材,仿佛人的嗓门,在很大程度上决定了一套音响的好坏。可以毫不夸张地说:选择一对好的音箱是一套音响成功的关键所在,来不得半点马虎。然而纵观当今音响市场,成品音箱品牌不下数百种,其中不乏著名的国际品牌:如美国的BOSE(博士)、JBL、INFINITY(燕飞利仕)、Westlake Audio(西湖)、PolkAudio(音乐之声):英国的ATC(皇牌)、B&W、T annoy(天朗)、MonitorAudio(猛牌)、KEF、HARBETH(雨后初晴):丹麦的(皇冠)DYNAUD10(丹拿)、DALI(丹尼)、Jamo(尊宝):德国的Heco(德高)、密力(Maagnat)、ELAC(意力);法国的梦幻之声(VIS10NACOUSTIQUE)、JMLab(劲浪):国产精品有美之声战神系列、金琅、惠威、新德克、福音、小旋风等等,林林总总、不胜枚举。质量参差不齐,价格天差地别。即便是同品牌同系列的音箱,往往音质高出一丁点,价格就会成几何积数倍上升。这正是因为自人类发明电子声频工程以来,唯音箱进步最慢、技术最薄弱。据英国《发烧天书》记载:一部成名多年的英国老牌长青树音相Rogersls 3/5自六十年代推出,畅销近四十年,其音色这纯正优雅,至今仍为众多资深Hi-Fi发烧友视为炙手可热的抢手货。在音响科技高度发展的今天,实在有些令人费解。所以您可千万别小看了音箱的打造,别以为音箱只不过是把几个喇叭与几个Hi-Fi或Hi-END箱。音箱的学问大了,大到没法用

书写,各家各派众说纷纭。正如医学界的中医与西医之争,或如医治一些疑难杂症:说得明白的治不好病,治得好病的却说不明白。然而对消费者而言,我们只要学会如何鉴别与挑选就成。那么有没有一种通俗简便的方法,让毫无经验的大多数消费者不是凭贵价、不是碰运气,而是凭下面介绍的音箱试听“七要点”来学会判断一对音箱的好坏: 1.试听前对音箱的初步了解 对于一对音箱的最初了解,可用“观、掂、敲、认”的步骤来鉴别:即一观工艺,二掂重量、三敲箱体、四认铭牌。 外观工艺就是从音箱外表的第一部象来判断该次和品质优劣:用天然原木精工打造的音箱当然最好,许多天价级的世界名牌至尊音箱,包括意大利的Chario(卓丽)、Guarneri Homage(名琴)等,但此类好箱因环保、资源匮乏加工工艺难度大,时间长等因素,绝不会普及得象随处可见的“飘柔”洗发水,价格肯定没法低。故常见的音箱均是以MDF中密度纤维板表面敷以一层薄薄的木皮做装饰:敷真木皮精工外饰的音箱,尤其是如酸枝、雀眼、花梨、胡桃、桢楠、红橡等珍稀木皮,其天然木纹视觉效果极好,手感滑腻舒适。尤其以对称蝴蝶花纹真木皮经多层涂复打磨钢琴亮漆者,大多均可视为中高档精品音箱,仿冒品极少。用PVC塑料贴皮的箱子属大路货,虽做工精细,最好也只能算中低档货色。而以本纹纸贴面装饰的箱子虽然看上去极时应多注意箱体背后的贴皮接缝和喇叭安装位挖扎工艺是否精确到位。假冒伪

数据库期末考试填空题及答案

1 .数据库数据具有__________、__________和__________三个基本特点。 2.数据库管理系统是数据库系统的一个重要组成部分,它的功能包括__________、__________、__________、__________。 3. 数据库系统是指在计算机系统中引入数据库后的系统,一般由__________、__________、__________和__________构成。 4. 数据库管理技术的发展是与计算机技术及其应用的发展联系在一起的,它经历了三个阶段:__________阶段,__________阶段和__________阶段。 5. 数据库具有数据结构化、最小的__________、较高的__________等特点。 6. DBMS还必须提供__________保护、__________检查、__________、__________等数据控制功能。 7. 模式(Schema)是数据库中全体数据的__________和__________的描述,它仅仅涉及到__________的描述,不涉及到具体的值。 8. 三级模式之间的两层映象保证了数据库系统中的数据能够具有较高的__________和__________。 9. 根据模型应用的不同目的,可以将这些模型划分为两类,它们分别属于两个不同的层次。第一类是__________,第二类是__________。 10. 数据模型的三要素是指__________,__________,__________。实际数据库系统中所支持的主要数据模型是__________,__________,__________。 11. 数据模型中的__________是对数据系统的静态特征描述,包括数据结构和数据间联系的描述,__________是对数据库系统的动态特征描述,是一组定义在数据上的操作,包括操作的涵义、操作符、运算规则及其语言等。 12. 用树型结构表示实体类型及实体间联系的数据模型称为__________模型,上一层的父结点和下一层的子结点之间的联系是的联系。 13. 用有向图结构表示实体类型及实体间联系的数据模型称为__________模型,数据之间的联系通常通过__________实现。 14. 关系的完整性约束条件包括三大类:__________、__________和__________。 15. 关系数据模型中,二维表的列称为________,二维表的行称为________。 16. 用户选作元组标识的一个候选码为________,其属性不能取________。 17. 关系代数运算中,传统的集合运算有_____,_____,_____,_____。 18. 关系代数运算中,基本的运算是________,________,________,________,________。 (问答题) 19. 关系代数运算中,专门的关系运算有________,________,________。 20. 关系数据库中基于数学上的两类运算是________和________。 21. 关系代数中,从两个关系中找出相同元组的运算称为________运算。 22. R S表示R与S的________。 23. 设有学生关系:S(XH,XM,XB,NL,DP)。在这个关系中,XH表示学号,XM表示姓名,XB表示性别,NL表示年龄,DP表示系部。查询学生姓名和所在系的投影操作的关系运算式是________________。 24. 在“学生-选课-课程”数据库中的3个关系如下:S(S#,SNAME,SEX,AGE);SC(S#,C#,GRADE); C(C#,CNAME,TEACHER),查找选修“数据库技术”这门课程学生的学生名和成绩,若用关系代数表达式来表示为________________。 25. 已知系(系编号,系名称,系主任,电话,地点)和学生(学号,姓名,性别,入学日期,专业,系编号)两个关系,系关系的主码是________,系关系的外码是________,学生关系的主码是________,学生关系的外码是________。

功放与音箱匹配技巧与注意事项

功放与音箱匹配技巧与注意事项 对功放与音响之间的匹配问题,除了音色软搭配之外(音色搭配常说软硬之分,是根据设计者对音色走向的设计和用料,而具有的特征和个性)还有一些技术指标上的硬搭配。软搭配是经验积累和个人爱好以实际感受为主,硬搭配则以数据和基本技术常识来定夺,下列就来简述硬搭配有关方面的问题。 阻抗匹配 1. 真空管功放(胆机)与音箱匹配时,放大器的输出阻抗应与音箱阻抗相等,否则会出现降低输出功率和增大失真等现象。好在大都胆机都有可变输出阻抗匹配接口如4-8-16欧,与音箱阻抗匹配已趋简单。 2. 对于晶体管功放(石机)与音箱阻抗的匹配 A) 音箱阻抗比功放输出阻抗高时,除了输出功率不同程度的降低外,无其它影响。 B) 音箱阻抗比功放输出阻抗低时,输出功率相应成比例增加,失真度一般不会增加或增加一点点可忽略。但匹配时音箱阻抗不能太低,如低至2奥姆(指2只4奥姆音箱并联时),此时只有功放功率富裕量大,并使用性能良好的大功率管和多管并联推挽,一般对这样的功放无影响。反之,一般普通功放富裕量不大,而功放管的pcm、lcm不大,当音量又开得很大时,这时失真会明显增大,严重时机毁箱亡,切切注意。 功率匹配

1、从原则上来讲,音箱额定功率与功放额定功率不一致时,对于功放来说,它的功率大小只与音箱阻抗有关,而与音箱额定功率无关。无论音箱功率与功放功率是否相同,对功放工作无影响,只是对音箱本身安全有关。 2、如果音箱阻抗符合匹配要求,而承受功率比功放功率小,则推动功率充足,听起来很舒服。这就是常说的功放储备功率要大,才能充分地表现出音乐全部内涵,尤其是音乐中的低频部分,表现更为生动、有力。这是一种较好的匹配。 3、如果音箱的额定阻抗大于功放的额定功率,虽然二者都能安全的工作,但这时功率放大器推动功率显得不够,会觉得响度不足,往往出现已经开到饱和状态,失真加剧,仍感到力不从心。这是一种较差的匹配。 按阻尼系数匹配

SQL数据库应用原理题库

D 1 逻辑模型不包括(),它是按计算机系统的观点对数据建模,主要用于DBMS 的实现。A、层次模型B、网状模型 C、关系模型 D、文件模型 D 2 数据模型的组成要素不包括()。 A、数据结构 B、数据操作 C、完整性约束 D、数据定义 D 3 数据库管理系统的主要功能不包括()。 A、数据定义功能 B、数据组织、存储和管理 C、数据操纵 D、数据结构C 4 人工管理数据的特点不包括()。 A、数据不保存 B、应用程序管理数据 C、数据共享 D、数据不具有独立性A 5 文件系统管理数据的特点不包括()。 A、数据不能长期保存 B、由文件系统管理数据 C、数据共享性差 D、数据独立性差 D 6 数据库系统的特点不包括()。 A、数据结构化 B、数据共享性高 C、数据独立性高 D、数据由DBA统一管理 D 7 数据库系统的核心和基础是()。 A、物理模型 B、逻辑模型 C、概念模型 D、数据模型 D 8 数据模型不包括()。 A、数据结构 B、数据操作 C、完整性约束 D、数据应用 C 9 以下不是数据库领域中常用的逻辑数据模型的是()。 A、层次模型 B、网状模型 C、物理模型 D、关系模型 C 10 位于用户和操作系统之间的数据管理软件称为()。 A、数据库 B、数据库系统 C、数据库管理系统 D、DBA A 11 以下数据模型中是非关系模型的是()。 A、层次模型 B、关系模型 C、面向对象模型 D、对象关系模型 A 12 有且只有一个结点没有双亲节点,这个节点称为()。 A、根节点 B、兄弟节点 C、子节点 D、叶结点 A 13 一个数据库可以有多个()。 A、外模式 B、模式 C、内模式 D、逻辑模式 C 14 数据库系统是采用了数据库技术的计算机系统,数据库系统由数据库、数据库管理系统、应用系统和()组成。 A、系统分析员 B、程序员 C、数据库管理员 D、操作员 A 15 数据库(DB),数据库系统(DBS)和数据库管理系统(DBMS)之间的关系是()。 A、DBS包括DB和DBMS B、DBMS包括DB和DBS C、DB包括DBS和DBMS D、DBS就是DB,也就是DBMS B 16 数据库系统的数据独立性体现在()。 A、不会因为数据的变化而影响到应用程序 B、不会因为数据存储结构与数据逻辑结构的变化而影响应用程序 C、不会因为存储策略的变化而影响存储结构 D、不会因为某些存储结构的变化而影响其他的存储结构 A 17 描述数据库全体数据的全局逻辑结构和特性的是()。 A、模式 B、外模式 C、内模式 D、子模式 C 18 要保证数据库的数据独立性,需要修改的是() A、模式与外模式 B、模式与内模式 C、三级模式之间的两层映射 D、三层模式

人类基因组计划HumanGenomeProject硕士班

人类基因组计划 (Human Genome Project,HGP)1.什么是人类基因组计划: 人类基因组计划是由美国能源部和NIH联合做出的,自1990年开始,争取在15年内完成的目标。 即:鉴定人体DNA估计约8万个基因,测序构成人DNA的30亿个碱基,贮存这些信息于databases(数据库)并发展data analysis 的工具。 (1)实际包括两部分工作,一是mapping,一是sequencing,故先前叫做“Mapping and Sequencing the human genome”.而Mapping又分为遗传连锁图谱和物理图谱。 (2)HGP是第一个庞大的科学事业,会引起一些由此计划暴发出来的伦理、法律、社会学上的诸多争论。(DOE熟悉大科学模式; 生物学家习惯小科学模式,应完美结合。该计划会引发出许多商业和法律,社会学和论理学方面的问题。) (3)为了有助于这些目标的实现,还要研究一些非人生物体的遗传图谱。(包括E.coli、酵母、秀丽隐杆线虫、果蝇、实验用小鼠等模式生物。) (4)在植物方面,美国农业部集中研究玉米和南芥菜(Arabidopsis)基因组,我国科学家提出了水稻基因组计划。 2.背景:

早在1984年Utah州Alta城的专业会议(DOE环境与健康研究办公室,OHER和国际环境诱变剂和致癌物防护委员会,ICPEMC协办)。开始讨论HG DNA全序列测定的前景。 1985年5月由Sinsheimer组织专门会议提出测定HG全序的动议。 DOE为何操办:(1)DOE承担低水平辐射和其它环境因素引起的遗传性损伤的监测,即需要在108bp的DNA中检测出一个碱基的改变,此项任务与HG全序列测定有关并且任务同等艰巨;(2)DOE 已在两个国家实验室对复杂基因开展了工作,即1988年的国家基因文库计划(NG Library Project),在Laurence Livermore国家实验室(LLNL)中纯化单种染色体并构建单个染色体文库。另一个基础性工作是1983年在Los Alamos National Laboratory(LANL)建立DNA顺序信息库Gene Bank。DOE特别在信息科学上具有经验和优势,还是大科学模式计划上的内行。 NIH 的参与又是必不可少的。(习惯于资助对特定科学进行检验的小型项目。还未主持过大科学模式的Project)。 终于1988年10月DOE与NIH在HGP的实施管理上达成协议(Science 241,1596 1988)。这样,同年二月由国家科学委员会(NRC)的专家组拟定的“人类基因组的图谱和测序”的专题报告才得以走向实现。 在1984-1989年间,在HGP从动议到实施这一漫长岁月里,许多有关技术上的进步和成就也是促成此事的重要因素。

音响和音箱有什么区别_音响和音箱的区别介绍

音响和音箱有什么区别_音响和音箱的区别介绍 一、音箱简介音箱指可将音频信号变换为声音的一种设备。通俗的讲就是指音箱主机箱体或低音炮箱体内自带功率放大器,对音频信号进行放大处理后由音箱本身回放出声音,使其声音变大。 音箱是整个音响系统的终端,其作用是把音频电能转换成相应的声能,并把它辐射到空间去。它是音响系统极其重要的组成部分,担负着把电信号转变成声信号供人的耳朵直接聆听的任务。 音箱的组成:市面上的音箱形形色色,但无论哪一种,都是由喇叭单元(术语叫扬声器单元)和箱体这两大最基本的部分组成,另外,绝大多数音箱至少使用了两只或两只以上的喇叭单元实行所谓的多路分音重放,所以分频器也是必不可少的一个组成部分。当然,音箱内还可能有吸音棉、倒相管、折叠的迷宫管道、加强筋/加强隔板等别的部件,但这些部件并非任何一只音箱都必不可少,音箱最基本的组成元素只有三部分:喇叭单元、箱体和分频器。 音箱是的分类:音箱的分类有不同的角度与标准,按音箱的声学结构来分,有密闭箱、倒相箱(又叫低频反射箱)、无源辐射器音箱、传输线音箱之分,它们各自的特点详见相关问答。倒相箱是目前市场的主流;从音箱的大小和放置方式来看,有落地箱和书架箱之分,前者体积比较大,一般直接放在地上,有时也在音箱下安装避震用的脚钉。落地箱由于箱体容积大,而且便于使用更大、更多的低音单元,其低频通常比较好,而且输出声压级较高、功率承载能力强,因而适合听音面积较大或者要求较全面的场合使用。书架箱体积较小,通常放在脚架上,特点是摆放灵活,不占空间,不过受箱体容积以及低音单元口径和数量的限制,其低频通常不及落地箱,承载功率和输出声压级也小一些,适合在较小的听音环境中使用;按重放的频带宽窄来分,有宽频带音箱和窄频带音箱之分,大多数音箱其设计目标都是要覆盖尽量宽的频带,属于宽频带音箱。窄频带音箱最常见的就是随家庭影院而兴起的超低音音箱(低音炮),仅用于还原超低频到低频很窄的一个频段;按有无内

数据库的基本原理和sql语言的主要特点

The basic principle of database is the professional basic course of Comeputer science and technology ,it mainly discuss the basic concept ,basic princple,basic methods and applications involved.Its main contents include the structure and characteristics of database,the composition of databse system and function of every parts,the relational database,the object-oriented database, SQL, design of database and protection of data,meanwhile it explain a kind of important application of database system.Students can learn a lot by studing the course such as understand basic concept of database system,master the query,update and relational technology of database,master the design method of database initially,and build new database and simple application with database system. SQL is a kind of coumputer language for database only,it can not only query database but selection also can be done on the database, add or delete, update, and jump and other various operations. SQL include DDL,DML,DCL,with the same language style and all of activities of life cycle of database can be done. Users dont have to know about access path,the selection of it and the operation of SQL are automatic done by system.It reduces users’pressure and improve the independence of data It adopt operation mode of collection ,it is a self-contained and embedded language,and supply two different operarion way with a same grammer structure,it makes users feel flexible and convenient. SQL is a language which is similar to oral English , it is easy to be studied and used.

功放与音箱的阻抗匹配

浅析功放与音箱匹配技巧与注意事项 6月2日报道对功放与音响之间的匹配问题,除了音色软搭配之外(音色搭配常说软硬之分,是根据设计者对音色走向的设计和用料,而具有的特征和个性)还有一些技术指标上的硬搭配。软搭配是经验积累和个人爱好以实际感受为主,硬搭配则以数据和基本技术常识来定夺,下列就来简述硬搭配有关方面的问题。 一、阻抗匹配 1、电子管功放(胆机)与音箱匹配时,放大器的输出阻抗应与音箱阻抗相等,否则会出现降低输出功率和增大失真等现象。好在大都胆机都有可变输出阻抗匹配接口如4-8-16欧,与音箱阻抗匹配已趋简单。 2、对于晶体管功放(石机)与音箱阻抗的匹配 ①音箱阻抗比功放输出阻抗高时,除了输出功率不同程度的降低外,无其它影响。 ②音箱阻抗比功放输出阻抗低时,输出功率相应成比例增加,失真度一般不会增加或增加一点点可忽略。但匹配时音箱阻抗不能太低,如低至2欧(指2只4欧音箱并联时),此时只有功放功率富裕量大,并使用性能良好的大功率管和多管并联推挽,一般对这样的功放无影响。反之,一般普通功放富裕量不大,而功放管的pcm、lcm不大,当音量又开得很大时,这时失真会明显增大,严重时机毁箱亡,切切注意。 二、功率匹配 1、从原则上来讲,音箱额定功率与功放额定功率不一致时,对于功放来说,它的功率大小只与音箱阻抗有关,而与音箱额定功率无关。无论音箱功率与功放功率是否相同,对功放工作无影响,只是对音箱本身安全有关。 2、如果音箱阻抗符合匹配要求,而承受功率比功放功率小,则推动功率充足,听起来很舒服。这就是常说的功放储备功率要大,才能充分地表现出音乐全部内涵,尤其是音乐中的低频部分,表现更为生动、有力。这是一种较好的匹配。 3、如果音箱的额定阻抗大于功放的额定功率,虽然二者都能安全的工作,但这时功率放大器推动功率显得不够,会觉得响度不足,往往出现已经开到饱和状态,失真加剧,仍感到力不从心。这是一种较差的匹配。 三、按阻尼系数匹配 对于选一对hi-fi音箱来讲,应有最佳的特定的电阻尼要求(负责任的音箱厂家应该提供此数据,指的是对功放阻尼系数的要求。说清楚点就是如要配此音箱,要求所配的功放阻尼系数要达到多少)。一般情况下,功放的阻尼系数高一点为好,低档功放阻尼系数小于10时,音箱的低频特征,输出特征,高次谐波特征等都会变坏。(家用功放的阻尼数一般在几十至几百之间。) 四、线材的匹配。 进口发烧线、神经线林林总总,贵至万余元,次之也要千元至数千元,(当然也有百元以下的),使用效果那是见仁见智的事。好的线材一般情况下都会改善音响器材中某系不足。它的传输理论说起来太复杂,只能简述了。传输线的材料与结构,决定了三个重要参数,即电阻、电容、电感(还有电磁效应、集肤效应、近接效应、电抗等)别看这些参数微小的差距,会直接影响到音响系统频率特征,阻尼特征,信号速率,相位精度,也及音色取向和声场定位等。它的主要作用是,高速传输(尽可能减小信号损失)、抗震动、防杂讯、抗干扰(主要是无线电波rf1射频干扰和em1电磁波干扰等) 音箱功放匹配原则(摘自网络) 功放与音箱配接四要素功放与音箱配接讲究冷暖相宜、软硬适中,以实现整套器材还原音色

数据库原理及应用教学目的内容重点难点

《数据库原理及应用》课程授课目的、内容、方法、重点、难点及学时分配 一、课程的性质、目的与任务: 1 本课程的性质: 《数据库原理及应用》是信息管理专业开设的专业基础必修课之一。 2 本课程的目的: 本课程的主要目的是使学生掌握数据库的基本原理,应用规范化的方法进行数据库的开发和设计,并和具体的一种大型数据库管理系统相结合,熟练掌握数据库管理系统的管理、操作和开发方法。b5E2RGbCAP 3 本课程的任务: 通过本课程的学习,学生应能针对具体的案例进行数据调查分析、数据库逻辑结构设计、关系规范化及数据库物理结构设计,并能使用高级语言进行数据库应用程序开发。p1EanqFDPw 二、基本教案要求 了解数据库的基本概念、发展、结构体系及数据库新技术的发展方向等。 理解数据库的安全性、完整性、并发控制及数据恢复等概念。 掌握数据库的查询语言、关系理论及数据库的设计方法,掌握对数据库的安全性、完整性、并发控制及数据恢复的应用。DXDiTa9E3d

三、教案内容: <一)绪论4学时 1、数据库系统概述 (1)数据库的地位:数据库在信息领域的作用和地位 (2)四个基本概念:数据、数据库、数据库管理系统、数据库系统四个概念及相互间的关系。 (3)据管理技术的产生和发展:数据管理技术发展的三个阶段及每个阶段的环境、特点。 2、数据模型 (1)数据模型的组成要素:数据结构、数据操作、数据的约束条件 (2)概念模型:信息世界中的基本概念、实体之间的联系、概念模型的表示方法E-R图。 常用数据模型:层次模型、网状模型、关系模型,每种 模型从数据结构、完整性结束、数据存储、优缺点及典 型的数据库系统几个方面介绍。RTCrpUDGiT 3、数据库系统结构 数据库系统内部的模式结构:模式结构的概念、三级模式结构、二级映象功能及数据独立性 4、数据库系统的组成 (1)硬件平台:数据库平台对硬件平台的要求。

基于EST和Genome序列设计SSR引物的步骤

EST-SSR 引物开发步骤 1、首先计算机安装PC 版perl 程序,然后从GenBank/dbEST (http://www.ncbi.nlm.nih/entrez)中以FASTA 格式下载该种中所有的EST 序列,共29830 条。 2、利用Blastclust(v.2.2.10;http://www. https://www.doczj.com/doc/d715348990.html,/web/newsltr/spring04/blastlab.htm)软件,对这些EST 序列进行冗余性查找,利用CD_HIT(http:// https://www.doczj.com/doc/d715348990.html,/cd-hit/)快速批量去冗余序列。 3、利用est_timmer(http://pgrc.ipk-gatersleben.de/misa/)去除EST 序列中过短的序列(<100bp)和过长的序列(>700bp)以及mRNA 的“帽子”和“尾巴”(A或T)。 4、利用misa.pl(http://pgrc.ipk-gatersleben.de/misa/)识别和定位SSR,其中配置文件misa.ini 用来设置识别SSR 标记的标准。 5、利用primer3 模块批量设计SSR 引物,引物设计的主要参数是,引物长度20~26bp;退火温度Tm 值48℃~65℃;(G+C)含量30%~70%;PCR 扩增产物长度大于150bp。 6、利用MacV ector7.0 软件对所设计的引物进行验证,引物由上海生工生物技术有限公司合成。

Genome-SSR 的引物开发步骤 1、通过Genbank数据库,检索相近种的全基因组序列。保存成FAST格式。 2、利用SSRHunter1.3搜索基因组序列中的简单重复序列信息位点。 3、选取信息位点核苷酸重复基序为2~6个的序列为靶标序列,利用软件Primer Premier 5.0设计SSR引物,引物设计的主要参数是,引物长度20~26bp;退火温度Tm 值48℃~65℃;(G+C)含量30%~70%;PCR 扩增产物长度大于150bp。并用Oligo 6.65验证引物各项指标的适合度,看有没有引物二聚体、发卡结构等。 4、挑选满足一定条件的引物序列用于合成。 5、挑选不同居群的3-4个个体,对引物的可扩增性进行检测。对可扩增性的引物还要进行下一步的筛选工作。

音响参数分析及图片大全

音响 扬声器材质与尺寸 低档塑料音箱因其箱体单薄、无法克服谐振,无音质可言(也有部分设计好的塑料音箱要远远好于劣质的木质音箱);木制音箱降低了箱体谐振所造成的音染,音质普遍好于塑料音箱。 通常多媒体音箱都是双单元二分频设计,一个较小的扬声器负责中高音的输出,而另一个较大的扬声器负责中低音的输出。 挑选音箱应考虑这两个喇叭的材质:多媒体有源音箱的高音单元现以软球顶为主(此外还有用于模拟音源的钛膜球顶等),它与数字音源相配合能减少高频信号的生硬感,给人以温柔、光滑、细腻的感觉。多媒体音箱现以质量较好的丝膜和成本较低的PV膜等软球顶的居多。 低音单元它决定了音箱的声音的特点,选择起来相对重要一些,最常见的有以下几种:纸盆,又有敷胶纸盆、纸基羊毛盆、紧压制盆等几种。 纸盆音色自然、廉价、较好的刚性、材质较轻灵敏度高,缺点是防潮性差、制造时一致性难以控制,但顶级HiFi系统中用纸盆制造的比比皆是,因为声音输出非常平均,还原性好。 防弹布,有较宽的频响与较低的失真,是酷爱强劲低音者之首选,缺点是成本高、制作工艺复杂、灵敏度不高轻音乐效果不甚佳。 羊毛编织盆,质地较软,它对柔和音乐与轻音乐的表现十分优异,但是低音效果不佳,缺乏力度与震撼力。 PP(聚丙烯)盆,它广泛流行于高档音箱中,一致性好失真低,各方面表现都可圈可点。此外还有像纤维类振膜和复合材料振膜等由于价格高昂极少应用于普及型音箱中。 扬声器尺寸自然是越大越好,大口径的低音扬声器能在低频部分有更好的表现,这是在选购之中可以挑选的。用高性能的扬声器制造的音箱意味着有更低的瞬态失真和更好的音质。普通多媒体音箱低音扬声器的喇叭多为3~5英寸之间。用高性能的扬声器制造的音箱也意味着有更低的瞬态失真和更好的音质。 音箱: 有源和无源 有源音箱(ActiveSpeaker)又称为“主动式音箱”。通常是指带有功率放大器的音箱,如多媒体电脑音箱、有源超低音箱,以及一些新型的家庭影院有源音箱等。有源音箱由于内置了功放电路,使用者不必考虑与放大器匹配的问题,同时也便于用较低电平的音频信号直接驱动。

(完整版)试述数据库系统的特点

1、试述数据库系统的特点。 (1)、数据结构化数据库系统实现整体数据的结构化,这是数据库的主要特征之一,也是数据库系统与文件系统的本质区别。 (2)数据的共享性高,冗余度低,易扩充数据库的数据不再面向某个应用而是面向整个系统, (3)数据独立性高数据独立性包括数据的物理独立性和数据的逻辑独立性。 (4)数据由 DBMS 统一管理和控制数据库的共享是并发的共享,即多个用户可以同时存取数据库中的数据甚至可以同时存取数据库中同一个数据。 2、数据库管理系统的主要功能有哪些? 答: ( l )数据库定义功能; ( 2 )数据存取功能; ( 3 )数据库运行管理; ( 4 )数据库的建立和维护功能。 3、试述数据模型的概念、数据模型的作用和数据模型的三个要素。 数据模型是数据库中用来对现实世界进行抽象的工具,是数据库中用于提供信息表示和操作手段的形式构架。 因此数据模型通常由数据结构、数据操作和完整性约束三部分组成。 4、试述概念模型的作用。

概念模型实际上是现实世界到机器世界的一个中间层次。概念模型用于信息世界的建模,是现实世界到信息世界的第一层抽象,是数据库设计人员进行数据库设计的有力工具,也是数据库设计人员和用户之间进行交流的语言。 5、试述数据库系统三级模式结构 数据库系统的三级模式结构由外模式、模式和内模式组成。 特点:(1)数据结构化。(2)数据的共享性高,冗余度低,容易扩展。(3)数据独立性高。(4)数据有DBMS统一管理。 6、试述数据库系统的组成。 数据库系统一般由数据库、数据库管理系统(及其开发工具)、应用系统、数据库管理员和用户构成。 7、DBA 的职责是什么? 负责全面地管理和控制数据库系统。具体职责包括:①决定数据库的信息内容和结构;②决定数据库的存储结构和存取策略;③定义数据的安全性要求和完整性约束条件;④监督和控制数据库的使用和运行;⑤改进和重组数据库系统。 8、试述关系模型的三个组成部分。 答:关系模型由关系数据结构、关系操作集合和关系完整性约束三部分组成 9、试述关系数据语言的特点和分类。 答:关系数据语言可以分为三类: (1)关系代数语言。

浅谈音响功放的工作原理

浅谈音响功放的工作原理 音响中的功放是整个音响设备中的关键部件,所以音响发烧友们都在其上不惜花费人力物力财力进行"摩机",在电源部分,电路的整体布局,用料等方面进行不断改良.本人并不是超级发烧友,充其量算是一位音响爱好者吧,为此在这里我就以一个音响爱好者的身份谈一谈我对音响功放的看法. 功放分胆机与石机,先讨论石机.石机最初的功放为甲类功放,这类功放的功放管的工作点选在管子的线性放大区,所以就算在没有信号输入的情况下,管子也有较大的电流流过,且其负载是一个输出变压器,在信号较强时由于电流大,输出变压器容易出现磁饱和而产生失真,另外为了防止管子进入非线性区,此类放大器往往都加有较深度的负反馈,所以这种功放电路效率低,动态范围小,且频响特性较差.对此人们又推出了一种乙类推挽式功率放大器,这类功放电路其功放管工作在乙类状态,即管子的工作点选在微道通状态,两个放大管分别放大信号的正半周和负半周,然后由输出变压器合成输出.所以流过输出变压器的两组线圈电流方向相反,这就大大地减少了输出变压器的磁饱和现象.另外由于管子工作在乙类状态,这样不仅大大的提高了放大器的效率且也大大的提高了放大器的动态范围,使输出功率大大提高.所以这种功放电路曾流行一时.但人们很快发现,此种功电路由于其功放管工作在乙类工作状态,所以存在小信号交越失真的问题,而且电路需使用两个变压器(一个输出变压器,一个输入变压器),由于变压器是感性负载,所以在整个音频段内,负载特性不均衡,相移失真较严重.为此人们又推出了一种称为OTL的功率放大电路.这种电路的形式其实也是一种推挽电路形式,只不过是去掉了两个变压器,用一个电容器和输出负载进行藕合,这样一来大大的改善了功放的频响特性.晶体管构成的功放电路有了质的飞跃,后来人们又改良了此种电路,推出了OCL和BTL电路,这种电路将输出电容也去掉了,放大器与扬声器采取直接藕合方式,直到现在由晶体管组成的功放电路,其结构基本上是OCL电路或BTL电路.OCL电路与OTL电路不同之处是采取了正负电源供电法,从而能将输出电容取消掉.BTL电路是由两个完全独立的功放模块搭建组成,如图C所示.IC1放大输出的信号一部分通过IC2反相输入端,经IC2反相放大输出,负载(扬声器)则接在两放大器输出之间,这样扬声器就获得由IC1和IC2放大相位相差180度的合成信号了. 不论是OCL或BTL功放电路,由于其去除了输出变压器和输出电容器,使放大器的频响得到展宽。与扬声器配接方面,当功率放大器连接一个标称阻抗低于

数据库原理及应用(管理类)复习题

数据库原理及应用(管理类)复习题 一、单项选择1.实体和属性的关系是_________。 A.一个属性对应于若干实体 B.一个实体可以由若干个属性来刻画 C.一个属性包含有若干实体 D.一个实体仅可以由一个属性来刻画 2. 设有属性A,B,C,D,以下表示中不是关系的是_________。 A.R(A) B.R(A,D,C,D) C.R(A×B×C×D) D.R(A,B) 3.元组所对应的是_________。 A.表中的—行 B.表中的一列 C.表中的一个元素 D.位于表顶端的一行元素 4.在数据库的三级模式结构中,描述数据库中全体数据的全局逻辑结构和特征的是。A.外模式 B.内模式 C.存储模式 D.模式 5. 数据库中存储的是。 A.数据 B.信息 C.数据模型 D.数据以及数据之间的联系 6. 数据管理方法主要有。 A.文件系统与分布式系统 B.分布式系统与批处理 C.批处理与数据库系统 D.数据库系统与文件系统 7.在数据库设计中,用E-R图来描述信息结构是数据库设计的________阶段。 A.需求分析 B.概念设计 C.逻辑设计 D.物理设计 8.数据库物理设计完成后,进入数据库实施阶段,下列各项中不属于实施阶段的是。 A.建立库结构 B.扩充功能 C.加载数据 D.系统调试 9. 数据库三级模式体系的划分,有利于的保持。 A.数据独立性 B.数据安全性 C.操作可行性 D.结构规范化 10. 规范化过程主要为克服数据库逻辑结构中的插入异常,删除异常以及的缺陷。A.数据的不一致性 B.结构不合理 C.冗余度大 D.数据丢失 11. 已知两个关系,职工(职厂号,职工名,部门号,职务,工资),部门(部门号,部门名,部门人数,工资总额),职工号和部门号分别为职工关系和部门关系的主码。这两个关系的属性中,有一个属性是外码,它是。 A.职工关系的“职工号” B.职工关系的“部门号” C.部门关系的“部门号” D.部门关系的“部门名” 12.通常,SQL语言的一次查询结果是一个。 A.数据项 B.记录 C.元组D.表 13.下列实体类型的联系中,属于一对一联系的是。 A.班级与学生 B.公司与公司经理 C.学生与课程 D.供应商与工程项目 14. 保护数据库,防止未授权的或不合法的使用造成的数据泄漏、更改破坏。这是指数据______。 A.安全性 B .完整性 C .并发控制 D.恢复 15. SQL语言具有功能。 A.数据定义,数据操纵,数据控制 B.关系规范化,数据操纵,数据定义 C.关系规范化,数据定义,数据控制 D.关系规范化,数据操纵,数据控制 16.在数据管理技术的发展过程中,经历了人工管理阶段、文件系统阶段和数据库系统阶段。在这几个阶段中,数据独立性最高的是阶段。

UCSC Genome Browser

UCSC Genome Browser是由University of California Santa Cruz (UCSC) 创立和维护的,该站点包含有人类、小鼠和大鼠等多个物种的基因组草图,并提供一系列的网页分析工具。站点用户可以通过它可靠和迅速地浏览基因组的任何一部分,并且同时可以得到与该部分有关的基因组注释信息,如已知基因,预测基因,表达序列标签,信使RNA,CpG岛,克隆组装间隙和重叠,染色体带型,小鼠同源性等。用户也可以因为教育或科研目的加上他们自己的注释信息。UCSC Genome Browser目前应用相当广泛,比如Ensembl 就是使用它的人类基因组序列草图为基础的。 用户在使用数据库及其工具(Genome Browser、Table Browser、Gene Sorter、Proteome Browser、VisiGene、Genome Graphs、BLAT等)时可以从以下站点获得大量的适时帮助,包括http://genome.ucsc. edu/goldenPath/help、https://www.doczj.com/doc/d715348990.html,/FAQ、https://www.doczj.com/doc/d715348990.html,等。还可以写邮件到genome@https://www.doczj.com/doc/d715348990.html,获得帮助。 1 新物种信息 目前,GBD新增了13个新物种的基因组序列信息,包括猩猩、绒猴、豚鼠、斑胸草雀、八目鳗、文昌鱼和三种线虫品种——brenneri、remanei、japonica在内的9个以前没有收录的物种信息,以及牛、斑马鱼、海胆、秀丽隐杆线虫(C.elegans)这4个已收录物种的更新信息。GBD为每一个新信息都提供了注释,也将这些信息和GenBank中的其它物种序列进行了比对。此外,他们还对上述9种新物种信息中的7个物种进行了多重比对注释,还将6种蠕虫的序列和最新的秀丽隐杆线虫序列进行了比对。 2 UCSC基因组数据库的新注释信息 除了收录新物种序列之外,GBD还在去年新增了200多条注释信息。可以点击Genome Browser上的相应按钮获得更多新注释信息。 对人类基因组集合(数据库)hg18和基因及基因预测组(Genes and Gene Prediction Track Group)中的Pos Sel基因进行新的注释后发现了承受正向选择压力(positive selection)的基因。网站上显示了通过对人类、黑猩猩、猕猴、小鼠、大鼠和狗基因组进行多基因组比对后筛出的全基因组范围内承受正向选择压力的基因。同时,还使用了9种基于Yang和Nielsen发明的branch-site framework模型的似然比检验法(likelihood ratio test,LRT)对一些直系同源基因进行了检测来验证上述结论的正确性。 开放的调控元件注释项目(Open Regulatory Annotation,OregAnno)的研究已经取得了一定成果,获得了人类、小鼠、黑腹果蝇和酵母这四种模式生物调控元件的注释信息。每一条OregAnno的注释信息包括经过试验验证后公开的基因调控序列(如启动子、增强子等)、转录因子结合位点以及调控区域的多态性(regulatory polymorphism)等信息,同时每一条OregAnno的注释信息也都会链接到OregAnno数据库。 数据库中,人类目录下现在还收录了Kidd等人对国际人类基因组单体型图计划(HapMap Project)里8个人的序列同参考序列比对后获得的注释信息(HGSV Discordant Track)。这些注释信息显示了那些人类序列中与参考序列的不符之处,表明该处可能存在着大段的缺失或插入序列,这对寻找人类基因组中的变异具有非常重大的意义。 小鼠mm9集合(数据库)现在提供了小鼠与其它30种脊椎动物的比对信息。这些比对信息是通过多重比对和phastCons计算(phastCons computation)之后得出的,它们有助于了解不同物种之间在进化上的相关性。GBD还在小鼠mm9集合(数据库)中新增了一个子数据库用来收录从维尔康姆基金会桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)miRBase数据库中获取的microRNA信息。 在大鼠rn4集合(数据库)中GBD还提供了从RGD中获取的数量性状基因座(QTL)信息。这些QTL信息与大鼠基因组中1000多个与血压、血糖等处于持续动态波动之中的表型特征相关基因座有关。

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