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４期刘新春等：ＰＣＲ—ＤＧＧＥ法用于活性污泥系统中微生物群落结构变化的解析８４５较明显，充分显示了两种系统中的微生物多样性。应用系统软件对这些条带进行分析，便能得到一系列的结果。
图３ＰＣＲ扩增产物凝胶电泳图象Ｆｉｇ．３Ａｇａｒｏｓｅｇｅｌ（２．Ｏ％）ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓｏｆＰＣＲａｍｐｌｉｆｉｅｄ１６ＳｒＤＮＡｏｆ６ｓａｍｐｌｅｓＭ１００～６００ｂｐＤＮＡＩａｄｄｅｒ，Ｎｃ阴性对照ＮｅｇａｔｉｖｅｃｏｎｔｒｏＩ，１～６号条带为６个样品的ＰｃＲ扩增产物（２３３ｂｐ）ＡｍｐｌｉｆｉｅｄＤＮＡｆｒａｇｍｅｎｔｓｏｆ６ｓａｍｐｌｅｓ图５是以第３泳道为标准做出的各泳道比较图，并以第３泳
道为标尺放在图表两边作参照。泳道中条带粗细不一，对应其在ＤＧＧＥ胶上的密度大小不同。密度大，则条带比较粗黑；密度小，则条带比较细。从图中可对各样品的条带多样性及均匀分布程度作一直观了解。２．２．２样品相似性分析表３是用戴斯系数（Ｄｉｃｅｃｏｅｆｆｉｃｉｅｎｔ）
计算出的各样品相似性的矩阵图。用该图可以对各样品之间的相似性进行比较。表３相似性矩阵图
ＴａｂＩｅ３Ｄｉｃｅｃｏｅｆｆｉｃｉｅｎｔｓ（Ｃｓ）ｃｏｍｐａｒｉｎｇｔｈｅｓｉｍｉｌａｒｉｔｉｅｓｏｆＰＣＲ—ＤＧＧＥｆｉｎｇｅｒｐｒｉｎｔｓ１１００３８．１５６．９４１．６３１．８４７．１２３８．１１００３１．８５３．２５０．２２０．１３５６．９３１．８１００３２．６４５．６５９．３４４１．６５３．２３２．６１００５２．４２３．７５３１．８５０．２４５．６５２．４１００２１．９６
４７．１
２０．１
Ｓ９．３
２３．７２１．９１００
图４ＤＧＧＥ凝胶电泳图象
Ｆｉｇ．４ＤＧＧＥｐａｔｔｅｒｎｓｐｒｏｄｕｃｅｄｆｒｏｍ６ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｓａｍｐｌｅｓ
１～３：低温菌在常温下运行样品ｓａｍｐｌｅｓｒｕｎｎｉｎｇａｔ４～６Ｃ（１ｓｔ，４ｔｈ，２０ｔｈｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ）；４～６：常温菌在常温下运行样品ｓａｍｐＪｅｓｒｕｎｎｉｎｇａｔ２０±１Ｃ；其取样时间分别为系统运行的第１、４、２０天１ｓｔ，４ｔｈ，２０ｔｈｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ
从表３中可以看出：样品ｌ与４相似性为４１．６％（第ｌ天），样品２与５相似性为５０．２％（第４天），样品３与６相似性最高，为５９．３％（第２０天），表明在相同的操作条件下，随着系统运行时间的增加，两个系统中菌群结构相似程度越来越高，既接种的不同来源的活性污泥在相同的工艺和操作条件下其优势菌群的结构会变得越来越相似。３６ｌ５４２
１００．Ｏ％５９．３％５６．９％４５．６％３２．６％３１．８％
戴斯系数Ｄｉｃｅｃ∞ｍｃｉ∞ｔ
图５泳道比较图
Ｆｉｇ．５Ｌａｎｅｃｏｍｐａｒｅ
２．２．３族群归属分析用Ｔｈｅｃｏｍｐｌｅｔｅ１ｉｎｋａｇｅ算法对样品进行了聚类分析，结果如图６所示。该图显示：６个样品共分为两
大族群，族群间的相似性为２０％，族群内的相似性分别为４７％。样品３与６相似性最高，即在两个系统运行的第２０天，相似性达到了５９．３％。样品１，２，３未归为单独的一族，样品４，５，６也未归为单独的一族，说明在处理过程中，菌群结构发生了较为复杂的变化。另外，用ｗＰＧＭＡ（Ｔｈｅｗｅｉｇｈｔｅｄｐａｉｒｇｒｏｕｐｍｅｔｈｏｄｗｉｔｈａｒｉｔｈｍｅｔｉｃａｖｅｒａｇｅｓ）算法和ｕＰＧＭＡ（Ｔｈｅｕｎｗｅｉｇｈｔｅｄｐａｉｒｇｒｏｕｐ
ｍｅｔｈｏｄｗｉｔｈａｒｉｔｈｍｅｔｉｃａｖｅｒａｇｅｓ）算法做出的系统树状图（图略）与下图基本相同，差异较小。说明用系统树状图来说明不同样品之间微生物群落的同源性，虽然应用的计算方法不同，但所得出的结论相对来说还是比较一致的。
●２３４５
６７
８
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PCR-DGGE法用于活性污泥系统中微生物群落结构变化的解析
作者：刘新春， 吴成强， 张昱， 杨敏， 李红岩， LIU Xin-chun， WU Cheng-qiang， ZHANG Yu， YANG Min， LI Hong-Yan
作者单位：中国科学院生态环境研究中心,环境水质学国家重点实验室,北京,100085
刊名：
生态学报
英文刊名：ACTA ECOLOGICA SINICA
年，卷(期)：2005,25(4)
被引用次数：44次
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