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人参品种SNP分子标记的开发与鉴定

目录

摘要 ............................................................................................................................... I Abstract ............................................................................................................................... III 目录 ............................................................................................................................. V 符号说明 ......................................................................................................................... VIII 1 前言 (1)

1.1 人参概况 (1)

1.1.1 人参简介 (1)

1.1.2 人参分类学研究进展 (2)

1.1.3 人参的化学成分及药理学研究概况 (2)

1.2 DNA分子标记 (3)

1.2.1 第一代DNA分子标记 (4)

1.2.2 第二代DNA分子标记 (5)

1.2.3 第三代DNA分子标记 (6)

1.3 DNA分子标记技术的应用 (7)

1.3.1 DNA分子标记在药用植物种质资源研究中的应用 (7)

1.3.2 DNA分子标记在药用植物遗传多样性分析中的应用 (9)

1.3.3 DNA分子标记在药用植物亲缘关系研究中的应用 (10)

1.3.4 DNA分子标记在药用植物鉴别中的应用 (11)

1.3.5 DNA分子标记在中药真伪鉴别中的应用 (11)

1.3.6 DNA分子标记在道地药材研究中的应用 (12)

1.3.7 DNA分子标记在构建指纹图谱中的应用 (13)

1.4 国内外研究现状 (14)

1.4.1 外观性状鉴别 (14)

1.4.2 显微鉴别 (15)

1.4.3 理化鉴别 (15)

1.4.4 DNA分子鉴定 (16)

1.5 研究意义 (19)

1.6 主要研究内容和技术路线 (20)

1.6.1 研究内容 (20)

1.6.2 技术路线 (21)

2 大马牙品种分子鉴定方法的建立 (22)

2.1 试验材料 (22)

2.1.1 原料 (22)

2.1.2 试验仪器与设备 (22)

2.1.3 试剂 (23)

2.1.4 序列来源 (24)

2.2 试验设计与方法 (25)

2.2.1 植物基因组DNA的提取 (25)

2.2.2 线粒体cytochrome oxidase subunit II gene内含子侧翼引物的设计 (26)

2.2.3 线粒体cytochrome oxidase subunit II gene内含子的扩增 (26)

2.2.4 琼脂糖凝胶电泳 (27)

2.2.5 序列比对,发掘大马牙的SNP位点 (28)

2.2.6 SNP引物设计 (28)

2.2.7 人参品种大马牙的多重PCR鉴定 (29)

2.3 结果与讨论 (31)

2.3.1 植物基因组DNA的提取 (31)

2.3.2 线粒体cytochrome oxidase subunit II gene内含子的扩增 (32)

2.3.3 序列比对,发掘大马牙的SNP位点 (32)

2.3.4 特异性SNP引物设计 (32)

2.3.5 人参品种大马牙的多重PCR鉴定 (34)

2.4 小结 (34)

3 俄罗斯野山参分子鉴定方法的建立 (35)

3.1试验材料 (35)

3.1.1 原料 (35)

3.1.2 试验仪器与设备 (35)

3.1.3 试剂 (36)

3.1.4 序列来源 (36)

3.2试验设计与方法 (37)

3.2.1 植物基因组DNA的提取 (37)

3.2.2 线粒体Nad7基因3区域的内含子侧翼引物设计 (38)

3.2.3 线粒体Nad7基因3区域内含子的扩增 (38)

3.2.4 琼脂糖凝胶电泳 (39)

3.2.5 序列比对,发掘俄罗斯野山参的SNP位点 (40)

3.2.6 特异性SNP引物设计 (40)

3.2.7 建立俄罗斯野山参的多重PCR体系 (40)

3.3结果与讨论 (42)

3.3.1 植物基因组DNA的提取 (42)

3.3.2 线粒体Nad7基因3区域内含子的扩增 (42)

3.3.3 序列比对,发掘俄罗斯野山参的SNP位点 (43)

3.3.4 SNP引物设计 (45)

3.3.5 俄罗斯野山参的多重PCR鉴定 (47)

3.4 小结 (48)

4 结论 (49)

参考文献 (50)

攻读学位期间发表的学术论文目录 (56)

致谢 (57)

版权声明 (58)

符号说明

英文缩写中文全称英文全称

PCR 聚合酶链式反应Polymerase Chain Reaction

ARMS 扩增受阻突变体系Amplification Refractory Mutation System NCBI 美国国立生物技术信息中心National Center for Biotechnology

Information

RFLP 限制性片段长度多态性restriction fragment length polymorphism RAPD 随机扩增片段长度多态性Random Amplified Polymorphic DNA AFLP 扩增片段长度多态性Amplified fragment length polymorphism SSR 简单重复序列Simple Sequence Repeats

ISSR 简单重复序列间区Inter simple sequence repeats

SNP 单核苷酸多态性Single Nucleotide Polymorphism

HRM 高分辨率熔解曲线技术High Resolution Melting

LAMP 环介导等温扩增Loop-mediated Isothermal Amplification EB 溴化乙锭Ethidium Bromide

IPTG 异丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷Isopropyl β-D-1-Thiogalactopyranoside bp 碱基对Base pair

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