1996年（1－42）
1 云霄飞车杀人事件 B/S
2 董事长千金绑架事件
3 偶像密室杀人事件
4 大都会暗号地图事件
5 新干线大爆破事件
6 情人节杀人事件◆
7 每月一件礼物威胁事件
8 美术馆杀人事件
9 天下第一夜祭杀人事件
10 足球选手恐吓事件
11 钢琴奏鸣曲《月光》杀人事件★
12 步美被绑架事件
13 奇怪的寻亲杀人事件
14 谜样的讯息狙击事件◆
15 消失的尸体杀人事件
16 古董收藏家杀人事件
17 百货公司挟持事件◆
18 六月新娘杀人事件
19 电梯杀人事件◆
20 鬼屋杀人事件
21 电视台外景队杀人事件◆
22 豪华客轮连续杀人事件（前篇）
23 豪华客轮连续杀人事件（后篇）
24 丧失记忆的美女事件◆
25 真假人质绑票事件◆
26 爱犬约翰杀人事件◆
27 小五郎同学会杀人事件（前篇）
28 小五郎同学会杀人事件（后篇）
29 计算机杀人事件◆
30 不在场证明杀人事件◆
31 电视台杀人事件
32 咖啡厅杀人事件
33 侦探团生还事件◆
34 山庄绷带怪人杀人事件（前篇）
35 山庄绷带怪人杀人事件（后篇）
36 星期一晚上7:30杀人事件◆
37 仙人掌花杀人事件◆
38 赤鬼村火祭杀人事件
39 企业家千金杀人事件（前篇）
40 企业家千金杀人事件（后篇）
41 优胜锦旗被割事件◆
42 卡拉OK厅杀人事件
1997年（43－85）
43 江户川柯南诱拐事件
44 堀田三兄弟杀人事件◆
45 敷面膜杀人事件◆
46 雪山山庄杀人事件
48 外交官杀人事件（前篇） X
49 外交官杀人事件（后篇） S/X
50 图书馆杀人事件
51 高尔夫练习场杀人事件◆
52 雾天狗传说杀人事件★
53 神秘凶器杀人事件◆
54 电玩公司杀人事件 B
55 列车手法杀人事件◆
56 清洁车杀人事件◆
57 福尔摩斯迷杀人事件（前篇） X
58 福尔摩斯迷杀人事件（后篇） X
59 首次跑腿杀人事件◆
60 插画画家杀人事件
61 幽灵船杀人事件（前篇）◆
62 幽灵船杀人事件（后篇）◆
63 大怪兽哥梅拉杀人事件
64 第三个指纹杀人事件◆
65 螃蟹和鲸鱼绑架事件◆
66 夜路杀人事件◆
67 舞台女演员杀人事件◆
68 暗夜男爵杀人事件（事件篇）
69 暗夜男爵杀人事件（疑惑篇）
70 暗夜男爵杀人事件（解决篇）
72 三胞胎别墅杀人事件
73 少年侦探队遇难事件◆
74 死神阵内杀人事件◆
75 金融公司社长杀人事件
76 柯南VS怪盗基德★ K
77 名门连续惨死事件（前篇） X
78 名门连续惨死事件（后篇） X
79 银行强盗杀人事件◆
80 流浪画家杀人事件◆
81 当红歌星绑架事件（前篇）
82 当红歌星绑架事件（后篇）
83 综合医院杀人事件◆
84 滑雪别墅杀人事件（前篇）
85 滑雪别墅杀人事件（后篇）
1998年（86－128）
86 诱拐现场特定事件◆（注：该集根据漫画《名侦探柯南特别篇》第1
卷改编，并非青山刚昌的原作）
87 白鹤报恩杀人事件◆
88 德休拉别墅杀人事件（前篇）◆
89 德休拉别墅杀人事件（后篇）◆
90 花香杀人事件◆
91 抢匪住院事件
92 恐怖登山杀人事件（前篇）◆
93 恐怖登山杀人事件（后篇）◆
94 雪女传说杀人事件◆
95 小五郎约会杀人事件◆
96 走投无路的名侦探！连续两大杀人事件★
97 离别美酒杀人事件◆
98 名陶艺家杀人事件（前篇）
99 名陶艺家杀人事件（后篇）
100 初恋情人回忆事件（前篇）
101 初恋情人回忆事件（后篇）
102 古装演员杀人事件（前篇）
103 古装演员杀人事件（后篇）
104 盗贼集团别墅事件（前篇）
105 盗贼集团别墅事件（后篇）
106 新闻照片杀人事件◆
107 鼹鼠星人之谜事件（前篇）◆
108 鼹鼠星人之谜事件（后篇）◆
109 侦探团大追击事件◆
110 烹饪教室杀人事件（前篇）◆
111 烹饪教室杀人事件（后篇）◆
112 帝丹小学七大离奇事件
113 白色海滩杀人事件◆（注：该集根据漫画《名侦探柯南特别篇》第1卷改编，并非青山刚昌的原作）
114 有氧潜水杀人事件（前篇）
115 有氧潜水杀人事件（后篇）
116 推理小说家失踪事件（前篇）
117 推理小说家失踪事件（后篇） X
118 浪花连续杀人事件★ X
119 假面超人杀人事件◆
120 蜜蜂鸡尾酒杀人事件◆
121 浴室密室事件（前篇）
122 浴室密室事件（后篇）
123 天气预报小姐绑架事件◆
124 神秘的狙击者杀人事件（前篇）◆
125 神秘的狙击者杀人事件（后篇）◆
126 旅行戏团杀人事件（前篇）◆
127 旅行戏团杀人事件（后篇）◆
128 黑衣组织10亿元抢劫事件◆ B（注：部分情节来自漫画第2卷，但主体案件为原创）
1999年（129－173）
129 来自黑衣组织的女子大学教授杀人事件★ B
130 竞技场无差别胁迫事件（前篇）
131 竞技场无差别胁迫事件（后篇）
132 魔术爱好者杀人事件（事件篇） K
133 魔术爱好者杀人事件（疑惑篇） K
134 魔术爱好者杀人事件（解决篇） K
135 消失的凶器搜索事件◆
136 蓝色古堡探索事件（前篇）
137 蓝色古堡探索事件（后篇）
138 最终播映杀人事件（前篇）
139 最终播映杀人事件（后篇）
140 SOS！步美传达的讯息◆
141 结婚前夕密室事件（前篇） X 142 结婚前夕密室事件（后篇） X 143 疑惑的天体观测◆
144 上野出发的北斗星3号（前篇）145 上野出发的北斗星3号（后篇）146 本厅刑事恋爱物语（前篇）
147 本厅刑事恋爱物语（后篇）
148 路上电车紧急刹车事件◆
149 游乐园高空弹跳事件◆
150 汽车爆炸事件的真相（前篇）◆151 汽车爆炸事件的真相（后篇）◆152 神秘老人失踪事件◆
153 园子危险的夏日物语（前篇）154 园子危险的夏日物语（后篇）155 水中钥匙密室事件◆
156 本厅刑事恋爱物语2（前篇）157 本厅刑事恋爱物语2（后篇）158 沉默的环状线◆
159 诡异的五重塔传说（前篇）◆160 诡异的五重塔传说（后篇）◆161 流经流水亭的杀机◆
162 飞天密室工藤新一最初的事件★ S
163 月亮、星星与太阳的秘密（前篇）
164 月亮、星星与太阳的秘密（后篇）
165 少年侦探队消失事件◆
166 鸟取县蜘蛛公馆的怪事（事件篇） X
167 鸟取县蜘蛛公馆的怪事（疑惑篇） X
168 鸟取县蜘蛛公馆的怪事（解决篇） X
169 维纳斯之吻◆
170 黑暗中的死角（前篇）
171 黑暗中的死角（后篇）
172 复活的死亡讯息（前篇）
173 复活的死亡讯息（后篇）
2000年（174－218）
174 二十年的杀意新佛尼号连续杀人事件★ X 175 惨遭四次杀害的男子◆
176 与黑衣组织的再会（灰原篇） B
177 与黑衣组织的再会（柯南篇） B
178 与黑衣组织的再会（解决篇） B
179 咖啡厅卡车撞入事件◆
180 红色杀机梦幻曲（前篇）◆
181 红色杀机梦幻曲（后篇）◆
182 九道门大搜查◆
183 危险的食谱◆
184 诅咒假面的冷笑★◆
185 名侦探遇害记（前篇）◆
186 名侦探遇害记（后篇）◆
187 黑暗中传来的神秘枪响◆
188 危命的复活侦探队洞窟遇难记
189 危命的复活名侦探负伤记 X
190 危命的复活第三个选择 X
191 危命的复活黑衣骑士 S/X
192 危命的复活新一回来了 S/X
193 危命的复活约定的地点 S
194 别有玄机的八音盒（前篇）
195 别有玄机的八音盒（后篇）
196 看不见的凶器小兰的初次推理◆
197 超级跑车的陷阱（前篇）◆
198 超级跑车的陷阱（后篇）◆
199 毛利小五郎涉嫌记（前篇）
200 毛利小五郎涉嫌记（后篇）
201 第十位乘客（前篇）◆
202 第十位乘客（后篇）◆
203 黑色伊卡洛斯之翼（前篇）◆
204 黑色伊卡洛斯之翼（后篇）◆
205 本厅刑事恋爱物语3（前篇）
206 本厅刑事恋爱物语3（后篇）
207 太顺利的推理◆
208 通往迷宫的入口巨大神像的愤怒★◆
209 龙神山坠崖事件◆
210 五彩传说的水中豪宅（前篇）◆
211 五彩传说的水中豪宅（后篇）◆
212 蘑菇、熊与侦探队（前篇）
213 蘑菇、熊与侦探队（后篇）
214 怀古饭店的神秘事件◆
215 复仇海滩（前篇）◆
216 复仇海滩（后篇）◆
217 目暮警官尘封的秘密（前篇）
218 目暮警官尘封的秘密（后篇）
2001年（219－262）
219 被召集的名侦探！工藤新一VS怪盗基德★ S/K（注：前半集“钟楼对决”根据《魔术快斗》漫画第4卷“漆黑之星”篇改编，并非改编自《名侦探柯南》漫画）
220 满口谎言的委托人（前篇）
221 满口谎言的委托人（后篇） X
222 人鱼失踪记（事件篇） X
223 人鱼失踪记（推理篇） X
224 人鱼失踪记（解决篇） X
225 生意兴隆的秘密◆
226 格斗游戏的陷阱（前篇） F
227 格斗游戏的陷阱（后篇） F
228 暗藏杀机的陶艺教室（前篇）
229 暗藏杀机的陶艺教室（后篇）
230 神秘的乘客（前篇） B/F
231 神秘的乘客（后篇） B/F
232 公寓坠楼事件◆
233 未消失的证据（前篇）
234 未消失的证据（后篇）
235 地下酒窖密室◆
236 南纪白滨的神秘之旅（前篇）◆237 南纪白滨的神秘之旅（后篇）◆238 大阪3K事件（前篇） X
239 大阪3K事件（后篇） X
240 新干线护送事件（前篇） X 241 新干线护送事件（后篇）
242 元太的灾难
243 毛利小五郎的冒充者（前篇）244 毛利小五郎的冒充者（后篇）245 向日葵馆的枪声◆
246 陷入网中的谜团（前篇）
247 陷入网中的谜团（后篇）
248 疗养森林的不在场证明◆
249 偶像们的秘密（前篇）
250 偶像们的秘密（后篇）
251 OK牧场的悲剧◆
252 画中的绑匪◆
253 本厅刑事恋爱物语4（前篇）
254 本厅刑事恋爱物语4（后篇） F
255 松江玉造连句大战十四回合（前篇）◆
256 松江玉造连句大战十四回合（后篇）◆
257 匪夷所思的天谴◆
258 来自芝加哥的男子（前篇） F
259 来自芝加哥的男子（后篇） F
260 摇晃的餐厅◆
261 雪夜的恐怖传说（前篇）◆
262 雪夜的恐怖传说（后篇）◆
2002年（263－303）
263 大阪双重谜团浪花剑士和太阁城★ X 264 法庭的对决妃英理vs小五郎（前篇）◆
265 法庭的对决妃英理vs小五郎（后篇）◆
266 情人节的真相（事件篇）
267 情人节的真相（推理篇） F
268 情人节的真相（解决篇）
269 犯罪的遗物（前篇）
270 犯罪的遗物（后篇） F
271 情急之下的应变之道（前篇） F
272 情急之下的应变之道（后篇） B/F
273 猜谜婆婆失踪事件◆
274 幽灵屋的真相（前篇） B
275 幽灵屋的真相（后篇）
276 警察手册丢失事件◆
277 英语教师VS西部名侦探（前篇） F/X
278 英语教师VS西部名侦探（后篇） F/X 279 疯狂足球迷（前篇）
280 疯狂足球迷（后篇）
281 小小的目击者◆
282 水流石庭的玄机（前篇）◆
283 水流石庭的玄机（后篇）◆
284 中华街的雨中幻影（前篇） F
285 中华街的雨中幻影（后篇）
286 工藤新一纽约事件（事件篇） B/S
287 工藤新一纽约事件（推理篇） B/S
288 工藤新一纽约事件（解决篇） B/F/S 289 光彦森林迷失记（前篇） B
290 光彦森林迷失记（后篇） B
291 孤岛的公主与海龙宫（事件篇） X
292 孤岛的公主与海龙宫（探索篇） X
293 孤岛的公主与海龙宫（解决篇） X
294 爱与决断的冲击（前篇）◆
295 爱与决断的冲击（后篇）◆
296 屋形船海钓记◆
297 法庭的对决Ⅱ妃英理VS九条（前篇）◆298 法庭的对决Ⅱ妃英理VS九条（后篇）◆299 关门海峡的友情与杀机（前篇）◆
300 关门海峡的友情与杀机（后篇）◆
301 恶意与圣者的游行（前篇）
302 恶意与圣者的游行（后篇）
303 被害人回来了◆
2003年（304－344）
304 震动的警视厅 1200万名人质★305 看不见的嫌疑犯（前篇）
306 看不见的嫌疑犯（后篇）
307 残留下来的无声证言（前篇） B
308 残留下来的无声证言（后篇） B/F
309 与黑衣组织的接触（交涉篇） B/F
310 与黑衣组织的接触（追踪篇） B
311 与黑衣组织的接触（决死篇） B/F
312 夕阳染红的女儿节娃娃（前篇）
313 夕阳染红的女儿节娃娃（后篇）
314 扶手损毁的瞭望台◆
315 阳光普照的地方◆
316 被玷污的蒙面英雄（前篇）
317 被玷污的蒙面英雄（后篇）
318 幸运的雪茄盒（前篇）◆
319 幸运的雪茄盒（后篇）◆
320 忍术制造不在场证明之法◆
321 消失的绑架逃逸车（前篇）◆
322 消失的绑架逃逸车（后篇）◆
323 服部平次一筹莫展！（前篇） X
324 服部平次一筹莫展！（后篇） X
325 火焰中的红马（事件篇） X
326 火焰中的红马（搜查篇） X
327 火焰中的红马（解决篇） X
328 生日葡萄酒之谜◆
329 金钱买不到的友情（前篇）
330 金钱买不到的友情（后篇）
331 充满疑惑的辣味咖喱（前篇）
332 充满疑惑的辣味咖喱（后篇）
333 相似的两位公主（前篇）
334 相似的两位公主（后篇）
335 东都现象所的秘密（前篇） F
336 东都现象所的秘密（后篇） F
337 坠落事件的内幕◆
338 四辆保时捷（前篇） F
339 四辆保时捷（后篇） B/F
340 厕所里隐藏的秘密（前篇） B
341 厕所里隐藏的秘密（后篇） B
342 豪斯登堡的新娘★◆
343 便利商店的陷阱（前篇） F
344 便利商店的陷阱（后篇） F
2004年（345－383）
345 与黑衣组织直面对决满月之夜的双重谜案★ B/F/X 346 寻找屁股上的印记（前篇） F
347 寻找屁股上的印记（后篇） F
348 爱、幽灵和地球遗产（前篇）◆
349 爱、幽灵和地球遗产（后篇）◆
350 被遗忘的手机（前篇）
351 被遗忘的手机（后篇）
352 钓鱼大赛的悲剧（前篇）◆
353 钓鱼大赛的悲剧（后篇）◆
354 小小的委托人（前篇）
355 小小的委托人（后篇）
356 怪盗基德令人惊异的空中漫步★ K 357 恋人是春天的幻影◆
358 本厅刑事恋爱物语5（前篇）
359 本厅刑事恋爱物语5（后篇）
360 不可思议的春季甲虫◆
361 帝丹高中校园灵异事件（前篇）
362 帝丹高中校园灵异事件（后篇） F 363 都市的乌鸦◆
364 共时性事件（前篇）◆
365 共时性事件（后篇）◆
366 众目睽睽之下的码头惨剧（前篇）367 众目睽睽之下的码头惨剧（后篇）368 魔女栖息的糖果之家◆
369 好运男子的历险◆
370 失而复得的游戏软件◆
371 沉默的航线（前篇）
372 沉默的航线（后篇）
373 剧毒蜘蛛的陷阱◆
374 星星和香烟的暗号（前篇）
375 星星和香烟的暗号（后篇）
376 限时15时◆
377 桃太郎解谜之旅（前篇）◆
378 桃太郎解谜之旅（后篇）◆
379 温泉雪夜长袖和服事件（前篇）◆
380 温泉雪夜长袖和服事件（后篇）◆
381 谁的推理秀（前篇） X
382 谁的推理秀（后篇） X
383 甲子园的奇迹！绝不能输给看不见的恶魔★ X 2005年（384－424）
384 目标毛利小五郎◆
385 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音（前奏曲）
386 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音（间奏曲）
387 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音（尾奏曲）
388 醉倒在萨摩的小五郎（前篇）◆
389 醉倒在萨摩的小五郎（后篇）◆
390 本厅刑事恋爱物语6（前篇）
391 本厅刑事恋爱物语6（后篇）
392 谜样的身高差距20厘米◆
393 疑似绑架案件◆
394 奇异屋宇大冒险（封印篇） K
395 奇异屋宇大冒险（机关篇） K
396 奇异屋宇大冒险（解决篇） K
397 辛辣苦口的甜美果汁◆
398 奇妙一家的委托（前篇）
399 奇妙一家的委托（后篇）
400 心存疑惑的小兰◆ S（注：部分剧情改编自漫画第47卷，但主要案件为动画原创，因此归为原创类）
401 珠宝强盗现行犯（前篇）
402 珠宝强盗现行犯（后篇）
403 诡异的天使之馆（前篇）◆
404 诡异的天使之馆（后篇）◆
405 去叫救护车的男子◆
406 柯南和平次的推理魔术（机关篇） X
407 柯南和平次的推理魔术（宅第篇） X
408 柯南和平次的推理魔术（解决篇） X
409 舞台剧和绑架案同步进行（前篇）◆
410 舞台剧和绑架案同步进行（后篇）◆
411 神社鸟居之惊人暗号（前篇）
412 神社鸟居之惊人暗号（后篇）
413 完全半分犯罪之谜◆
414 侦探团青鸟追踪记◆
415 佛灭日出现的恶灵（事件篇）
416 佛灭日出现的恶灵（疑惑篇）
417 佛灭日出现的恶灵（解决篇）
418 米花町阁楼之家◆
419 八岐大蛇的剑（前篇）◆
420 八岐大蛇的剑（后篇）◆
421 银杏色的初恋（前篇）
422 银杏色的初恋（后篇）
423 侦探团和毛虫四兄弟◆
424 小丑发来的彩信◆
2006年（425－459）
425 黑色冲击！组织魔爪伸来的瞬间★ B/F/C 426 给小兰的情书◆
427 充满神秘的上学路（前篇）
428 充满神秘的上学路（后篇）
429 无法回头的二人（前篇） C
430 无法回头的二人（后篇）
431 本厅刑事恋爱物语7（前篇）
432 本厅刑事恋爱物语7（后篇）
433 柯南怪小孩◆
434 名犬库儿的功劳◆
435 侦探团的特别专访（前篇）
436 侦探团的特别专访（后篇）
437 上户彩与新一 4年前的约定◆ S
438 鱼邮件追踪记
439 然后谁都无须存在了◆
440 极限赛车表演◆
441 通向死亡的“啊”◆
442 被钢筋阻止的男人◆
443 叹气拾潮（前篇）
444 叹气拾潮（后篇）
445 俄罗斯蓝猫的秘密
446 被封印的欧式窗（前篇）
447 被封印的欧式窗（后篇）
448 目黑的秋刀鱼事件◆
449 本厅刑事恋爱物语虚假的婚礼★
450 诡计VS魔术（前篇）◆
451 诡计VS魔术（后篇）◆
452 金毗罗剧院魅影★◆
453 因缘与友情的试映会
454 颠倒的结局（前篇）
455 颠倒的结局（后篇）
456 我最爱的推理◆
457 园子的红手帕（前篇）
458 园子的红手帕（后篇）
459 怪人循规蹈矩的男人◆
2007年（460－490）
460 一年B班大作战
461 消失的一页◆
462 黑衣组织的影子小小的目击者 B/F/C
463 黑衣组织的影子奇妙的照明