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前言（INTRODUCTION） ....................................................................3 第一章 DISPLAY WINDOWS..............................................................4
一. 顯示 DNA 序列及圖形 ...........................................................5 二. 顯示蛋白質序列的方式 .......................................................10 第二章 MOLECULE OPERATIONS................................................13
一. 對 PBR322’S 的常用資料（GENERAL DATA）進行編輯 ....13 三. 插入新的序列片段 ..................................................................15 四. 編輯 TC(R) 圖示 .................................................................16 五. 刪除 P2_P 標示，並加入新的序列特徵標示 ....................17 六. 修改 MY PBR322 的起始座標 .............................................18 第三章 GRAPHICAL REPRESENTATION ....................................19
一. 爲 PBR322 圖形建立一個展示視窗 ....................................19 二. 修改圖形的自動排列設置 ...................................................19 三. 修改圖形的編碼區信號（ CDS SIGNALS）設置 ...............19 四. 打開圖片編輯方式 ...............................................................20 五. 修改 TC(R)圖形 ....................................................................20 六. 加入註解注釋 .......................................................................22 七. 將 PBR322 分子顯示結果保存到文檔文件中 ...................22 第四章 BLAST SEARCH AND BLAST VIEWER ..........................24
一. 簡介 .......................................................................................24 二. BLAST 搜尋視窗 ..................................................................24 三. BLAST SEARCH RESULTS .......................................................28 四. SAVING BLAST SEARCH RESULTS ..........................................29
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第五章
ALIGNX ..................................................................................31
一. 開啟與執行： .......................................................................31 二. 參數設定與調整： ...............................................................35 三. 資料輸出與列印 ...................................................................39 第六章 ALIGNX-BLOCKS ................................................................40
一. 開啟與執行： .......................................................................40 二. 參數設定與調整： ...............................................................42 三. 資料輸出與列印 ......................................................................44 第七章 BIOPLOT ................................................................................45
一. 開啟與執行： .......................................................................45 二. 資料輸出與列印 ...................................................................49 第八章 CONTIGEXPRESS ................................................................50
一. INTRODUCTION ........................................................................50 二. PROJECT EXPLORER .................................................................50 三. WORKING IN FRAGMENT WINDOW ..........................................54 四. WORKING IN THE CONTIG WINDOW .........................................60 第九章 MISCELLANEOUS VECTOR NTI TOOLS ......................63
一. INTRODUCTION ........................................................................63 二. PUBMED/ENTREZ SEARCH .......................................................63 三. CITATION VIEWER ....................................................................66 附記：如何執行反安裝……………………………………………….69
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前言（Introduction）
程式附帶的資料庫 （Vector NTI database） 包括：DNA/RNA 序列、 蛋白質序列、限制酶、寡核苷酸、電泳 marker。此外程式還提供資料 庫開發（Database Explorer）功能，使用者可以自己修改、添加、拷 貝感興趣的各類資料庫。 建立新序列資料（有四種方法） 用 GenBank/GenPept， EMBL/SWISS-PROT 或 FASTA、ASCII 等格式輸入 DNA 或氨基酸序列。 以 Copy/Paste 方式貼入，然後存到資料庫中。 從其他序列檔、linker、載體中剪切、拼接而成新序列 從 DNA 或 RNA 序列轉譯成蛋白質序列 關於新序列的內部特徵圖譜(例如 CDS、motif 等資訊)，若是利 用 GenBank/GenPept， EMBL/SWISS-PROT or FASTA 等格式輸入的 序列，因為內含註解，所以都能直接顯示，但自己手工粘帖的沒有， 需要自己編輯
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第一章
Display Windows
目的：建立顯示視窗，並對載體圖、序列及註解進行操作 1.登錄 Vector NTI 安裝後首次登錄，系統將提示是否允許將新資料填入 Vector NTI 資料庫中，點 OK。這樣 DNA molecules， proteins ， enzymes， oligos， and gel markers 將組成 NTI 的資料庫。並出現下列兩個窗口。 2. 觀察出現的 Vector NTI 工作視窗 和 Database Explorer 視窗
這個視窗爲工作視窗，由功能表欄和工具列兩欄，移動滑鼠到工 具欄任意選項處，滑鼠將會自動顯示每個工具列的功能。
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這個視窗爲 Database Explorer 視窗——local vector NTI database， 顯示的是上次打開的 DNA/RNA 或蛋白分子。
一. 顯示 DNA 序列及圖形
1. Create a Display Window for pBR322 打開 Database Explorer 視窗——local vector NTI database 視窗中 的 DNA/RNA Molecules (MAIN) 資料庫 ， 找到 pBR322 分子並雙擊打 開。顯示如下視窗：
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2. . 觀察 pBR322 顯示視窗 上面的視窗由註解區（對該分子資訊的文字描述，雙擊文件夾可 以看到） 、圖形區（標住限制酶位置等）和序列區（序列本文及限制 限制酶切位位）三個部分組成。 3. 顯示視窗的管理（透過拖拉尺規，改變視窗、或每個顯示區 的相對大小） 4. 轉換 pBR322’s 圖形區：在工具欄左邊的 active pane 右側有 三個按鈕，用滑鼠點當中那個（graphics pane） 5. 對 pBR322’s 結構圖進行操作：使用者可以嘗試點選 、
、 ，此時圖形的大小會發生變化。選取設定 功能表 Edit set selection，輸入 100bp–1000bp，然後按 OK.可以看到 所輸入的選取區間在圖形中以扇型框圈了起來.將滑鼠移到選 取的 5’端，可以看到 ，通過拖拉可以延長或縮短選區範 圍，同樣在 3’端也能做到。如果使用者一次只想移動一個鹼 基用直接拖拉就可能不方便，假如使用者想在 5’端移動一個 鹼基，首先將滑鼠放到 處，然後按住 shift 和鍵盤右側的 或 箭頭，則可以按一次箭頭移動一個鹼基距離。如果一 次想移動 10 個鹼基，則同時按住 shift+ctrl+箭頭。如果使用 者只是粗略選擇，可以直接將滑鼠移到圖中，用十字花拖動。 將滑鼠移到圖的 TCr 處，此時滑鼠箭頭變成 ，並顯示 TCr 代表的含義，如果使用者此時按下滑鼠，則 TCr 的 coding region 將被選取。 6. 檢查 pBR322’s nucleotide 序列 移動尺規，盡可能將更多的 PBR322 序列顯示出來，並點選序列 （Display 中任何一處。現在對序列顯示的樣式進行設定：點選 Setup ） 按 鈕 ， 顯 示 molecular display setup 對 話 方 塊 ：
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使用者可以對序列的顔色、大小、10 個一組顯示還是 15 個一組 （原始設定是 10 個鹼基一組） ，結構圖的顔色、限制酶圖譜（注意剛 開始顯示的 PBR322 上限制酶並不多） 、ORF、Motif 等進行設置。現 在我們打算把序列字體的顔色由黑色變成綠色，顯示全部 PBR322 的 限制限制酶切位位。操作如下：在剛才的視窗中點 restriction map 下 面的 RMap setup 按鈕，在出現的對話方塊中點 Add，再在出現的對 話方塊中點 select all，然後 OK。點 sequence 下面的 sequence setup， 可以看到序列長度的設置等，在 color 欄中選 green，一路點 OK。此 時顯示如下：
可以發現所顯示的限制限制酶切位位變多了，不過美中不足的是
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序列顯示的是兩條股（正股和互補股） ，實際上一條股就夠了，還有 最好再和編碼的氨基酸一起顯示。修改的方式如下：先選取全序列 （Ctrl-A） ，點選工具列中的 （Translate Direct）圖示即可將 DNA
左右兩側的圖示。 序列轉譯成蛋白質序列。此外也可以試著點選 若是覺得限制酶的切位會干擾顯示的情形，也可以將它去掉，如下圖
7. 對 pBR322’s text 註解描述進行操作 拖動尺規，使註解區盡可能拉大。選取 Restriction Map 文件夾， Expand Branch 按鈕，點它。其實這和雙擊 然後找到工具列中的 restriction map 文件夾是一樣的，都是打開的意思，還有它左邊的按 鈕。在找到 Feature Map 文件夾，然後按 這是一個四環素抗性基因。 按鈕。可以看到 TC(R),
8. 將 pBR322’s 註解區和圖區、序列區連接起來 （Link Panes）按鈕，點選它可以將 啟動註解區，然後找到 PBR322 的圖區上的所有標記都去除，成了一個圓圈。還有，序列區
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的限制酶切位標記也沒了。要重新顯示則請先點註解區的 Restriction Map 文件夾，然後點 按鈕打開文件夾裏面的分支。現在看看，限
（ Standard 制酶切位又重新顯示出來了。啟動圖形區，找到 Arrangement）按鈕了沒，點它。會發現限制酶切位圖譜顯示的方式 和剛才不一樣了，這是標準方式。在註解區中選取 feature map 文件 夾，點 打開，可以發現圖形又變了。再依次關掉 feature map 中 的其他文件夾，只留 TCR，此時圖中只有 TCR 一個標記了。若是希 望圖形回到原樣,可以點選鏈條 ，如下圖：
9.
列 印 pBR322’s 註 解 description ， 圖 形 map ， 和 序 列 sequence
列印註解：先啟動註解區， （就是 active pane 右邊的第一個按鈕， 或者直接用滑鼠在註解區點一下） ，然後按 expand branch 按鈕打開註 列印。同樣的方式,若要想列印圖 解區內的所有文件夾，然後點 形或序列，先點選其所在的選取區，然後按印表機圖示即可。
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二. 顯示蛋白質序列的方式
1. 開啟 41BB_HUMAN 點選視窗下面的 Database exploring——local vector NTI database 圖示 ， 打開 Explorer 視窗 ， 點選視窗左上角的下拉式功能表 ， 選 Protein Molecules (MAIN)資料庫。找到 41BB_HUMAN’s 並雙擊。打開窗口 如下：
視窗顯示結構和 DNA 序列的顯示視窗一致，也包括註解區，圖 形區和序列區三部分。功能表和工具列也基本一樣。在註解區中雙擊 Analysis 文件夾 ， 則蛋白自動分析結果以表格的形式在下面顯示出來 。 下面我們把這兩個表格拷貝到 word 文檔中 ， 先用 shift+滑鼠將兩 個表格選取，然後點工具列中的照相機（camera） ，在出現的對話方 塊中可以看到序列的 range 中的 selection 已被選取，點 Copy.，然後 打開一個 word 文檔，按貼上（ctrl-V） ，則表格被完整的拷貝到 word 文檔中了。如下所示：
Length Molecular Weight 1 microgram =
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255 aa 27897.66 m.w. 35.845 pMoles
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Molar Extinction coefficient 1 A[280] corr. to A[280] of 1 mg/ml Isoelectric Point Charge at pH 7
11250 2.48 mg/ml 0.40 AU 8.13 3.72
Amino Acid(s) Charged (RKHYCDE) Acidic (DE) Basic (KR) Polar (NCQSTY) Hydrophobic (AILFWV) A Ala C Cys D Asp E Glu F Phe G Gly H His I Ile K Lys L Leu M Met N Asn P Pro Q Gln R Arg S Ser T Thr
Number count 83 25 29 90 67 11 25 11 14 16 21 2 7 13 21 3 12 18 12 16 22 17
- 11 -
% by weight 36.68 10.85 14.43 34.08 27.06 3.02 9.33 4.51 6.34 8.14 4.85 0.96 2.83 5.85 8.48 1.38 4.88 6.38 5.40 8.58 7.12 6.24
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% by frequency 32.55 9.80 11.37 35.29 26.27 4.31 9.80 4.31 5.49 6.27 8.24 0.78 2.75 5.10 8.24 1.18 4.71 7.06 4.71 6.27 8.63 6.67
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V Val W Trp Y Tyr B Asx Z Glx X Xxx
11 1 2 23 26 0
3.97 0.63 1.12 9.39 11.74 0.00
4.31 0.39 0.78 9.02 10.20 0.00
2. 爲 1B14_HUMAN 建立顯示視窗 重新回到 Database exploring——local vector NTI database 窗口， 找到 1B14_HUMAN 分子並雙擊打開。如下圖：
可以看到該蛋白分子圖形上的各種特徵顯示的十分緊湊，爲了顯 示方便起見，可以按剛才介紹的 link 命令來逐一顯示各個 feature。操 作方法和 DNA 分子一致。 關閉視窗，結束，當最後一個視窗關閉是螢幕提示 this will end your vector NTI session，點確定（OK）關閉。
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第二章
Molecule Operations
目的：對 pBR322 的 general data， feature map， and sequence 進行 編輯（注意!! 蛋白質和 DNA 分子的操作是一樣的） 登錄 Vector NTI 程式 打開 pBR322 的顯示視窗（程式 vector NTI Exploring local vector NTI Database DNA/RNA Molecules (MAIN) PBR322 ，雙 擊。）
一. 對 pBR322’s 的常用資料（general data）進行編輯
在註解區的最上面，雙擊 PBR322，彈出下面窗口：
給 PBR322 加關鍵字點 keywords，在彈出的關鍵字視窗中輸入 My own plasmid，點 Add。回到 DNA/RNA Molecular 視窗，將最下 面的 description 中的內容替換成 My pBR322。點 OK（確定） 。注意 螢幕的左上角 pBR322*，在 PBR322 的後面有一個星號，說明現在顯 示的是修改過的 PBR322。現在我們要在資料庫中保存這一結果：
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功能表 molecular save as ， 在彈出的對話方塊中輸入序列的名字 My pBR322，點 OK。這時發現星號不見了，說明結果已保存到資料 庫中，這時資料庫中關於 PBR322 的 DNA 分子有兩個，一個是原始 的 PBR322（就是最初打開的那個） ，另一個就是我們保存的那個 my PBR322。
二. 編輯 My pBR322’s 序列
啟動序列區，功能表 edit set selection，在對話方塊中輸入範圍 21-40，點 OK。會發現序列選區內含有 ClaI 和 HindIII 兩個限制酶 切位。點選功能表 edit new Replace Sequence 21 bp–40 bp，將視窗 中第 23 和 24 位的 TC 刪除分別用 AA 代替，視窗將顯示如下：
注意該視窗左下角顯示有：inserted 2，delete 2。點 OK，注意序 列中的 ClaI 位點立刻消失了。如下圖所示：
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將 My pBR322 的修改結果取消，不保存到資料庫 注意剛才修改完後，在螢幕左上角 My pBR322 的後面，有一個星 號，說明當前顯示的分子已經修改，下面將修改結果取消，點選功能 表 molecular——Revert To Saved，點 OK 確定。此時資料庫將剛才的 修改結果取消了。 （如果需要保存修改結果則在 molecular 功能表中選 save as 命令）
三. 插入新的序列片段
通常在編輯序列的時候需要在序列圖譜中插入一段基因或者一 段特徵序列，先找到序列中的 AP(R) 標誌（ 3293 bp–4156 bp）和 TC(R) 標誌（ 86 –1276 bp） ，功能表 edit Set Caret Position，輸入 200 ， 將游標移到 200bp 處 ， 下面我們要在此位置處輸入 10 個 T 鹼基 。 點功能表 edit new insert sequence 200bp，在出現的對話方塊中輸 入 10 個 T，點 OK，然後會出現一個對話方塊，問你是否確認當前的 序列已經修改（CDS TC(R) is affected by sequence editing，Delete， Delete All， Keep， and Keep All） ，點 keep.可以發現在 200bp 序列 處多了 10 個 T。我們將滑鼠移到 AP（R）處，可發現其位置已經順 時針移了 10 個鹼基（3303 bp–4166 bp） 。其實，在原始序列中一旦插 入一段序列後，系統會自動改變圖譜中各註解的相對位置，如果插入 的序列位於某一特徵序列的內部，我們點 Keep，NTI 會自動向 3’端 移動。現在我們將滑鼠移到 TCR 處，發現其 3’端已經後移了 10 個鹼 基（1286） ，不過 5’端並沒有受影嚮。如下圖所示：
注意200后面的逗号
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四. 編輯 TC(R) 圖示
將滑鼠移到圖形的 TCr 處，當箭頭變成“手”的形狀時雙擊 （或 者點滑鼠右鍵，選 feature properties） ，在出現的對話方塊中使用者可 以修改 TCr 的位置、名稱和描述。我們將名稱（name）由 TC(R)改成 Old TC(R)，然後在最下面的 description 中輸入描述：“10 bp fragment inserted”，點 OK。則圖形結構變成：
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五. 刪除 P2_P 標示，並加入新的序列特徵標示
在圖譜中找到 P2P，選取，點滑鼠右鍵，選 Delete Feature From Fmap （或者從 edit 功能表中選擇此命令） ，此時 NTI 將提示 P2_P will be deleted from the feature map，點 OK（確定） 。我們發現圖譜中 P2P 已經沒有了。下面我們我爲 PBR322 序列加入一個新的註解： edit set selection 輸入 3000-3500bp，點 OK。在工具列中找到 （add features）按鈕，點它。 （也可以從 edit new add feature to FMap 進入） 。在出現的對話方塊 feature name 中輸入 New Feature， 注意 NTI 原始設定的特徵類型（feature type）爲 Misc. Feature，使用 者 可 以 從 列 表 中 選 擇 自 己 認 可 的 特 徵 。 最 後 點 OK 。 如 圖 ：
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更改为File
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下 面 將 My pBR322 的 修 改 結 果 保 存 到 資 料 庫 中 ： 功 能 表 molecular——save as， （如果不想改名的話）點 OK，NTI 將提示 My pBR322 已經存在，是否覆蓋，點 overwrite.
Edit---molecule operation-----change starting coordinate
六. 修改 My pBR322 的起始座標
這樣可使剛才插入的 10bp 片段和最初的 PBR322 具有一致的坐標 系。功能表 Molecule operations Advanced (DNA/RNA) Change Starting Coordinate。在出現的對話方塊 new start(新的起始點位置)輸 入：11（因爲剛才插入了 10bp，所以起始點是 1+10=11） 。點 OK， 此時 NTI 會提示當前座標已被修改，是否繼續，點 OK 確定。現在我 們會發現顯示視窗中 TCR 的位置已經變成了（76bp–1276bp） ，還有 AP（R）的位置（3293 bp–4156 bp） ，這都和最初的 PBR322 一致。 如下圖：
退出顯示視窗，關閉 NTI
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第三章
Graphical Representation
目的：以 DNA 分子爲例，對分子圖形的展示進行操作（蛋白質 的操作和 DNA 類似） ，爲 pBR322 圖形建立一個展示視窗，並保存到 分子註解檔中
一. 爲 pBR322 圖形建立一個展示視窗
1. 登錄 Vector NTI 程式 2. 通過新視窗打開 PBR322（與前兩章的打開方式略有不同）, 在 NTI 主窗口中，點選工具列最左邊的打開文件夾（或者 molecular —— Open ） ，在彈出的 Open 窗口中點選 database DNA/RNAs，在列表中找到 PBR322，然後 OK。 3. 顯示視窗的調整,比如我們想觀察圖像的詳細情況，首先用尺 規拖動圖形視窗，至於序列和註解區，可以很小，因爲我們 或 讓圖形放大或縮小，直到滿 的目的是看圖。然後點 意爲止，如果使用者想一步步的看放大效果，可以按住 shift 的同時點 。
二. 修改圖形的自動排列設置
按住 ctrl 的同時，點 （Standard Arrangement） ，使用者可以 根據彈出的小功能表，來選擇圖形線條的粗細和字體的大小，直到滿 意爲止。
三. 修改圖形的編碼區信號（ CDS signals）設置
點中圖形中任意編碼區（粗箭頭） ，然後按滑鼠右鍵，在彈出的 下拉功能表中，選 CDS Display Setup，使用者可以在彈出的 Graphics Display Setup 對話方塊中修改所選編碼區的名稱、顔色標記、箭頭的 粗細等， （實際上 NTI 默認的就很好了） 。使用者也可以通過點 more 來進行更多的修改（比如字體和大小等，和 word 中字體的處理很相 似） ，修改完後一路 OK 點下去即可。注意這種修改只是針對本窗口 中的分子，對其他分子沒有影響。
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比如我們將箭頭填充成蘭色。下面我們保存這一設置：點選 （ display setup ）右側的小三角形符號，在彈出的功能表中選 Save Settings As，然後在彈出的視窗中給剛才的設置風格取個名字，不妨 叫 blue，點 OK，注意此時 NTI 會提示是否保存其他沒用過的風格， 點 NO。現在再點選 （display setup）右側的小三角形符號我們會 發現 blue 已經在下拉功能表上了。
四. 打開圖片編輯方式
NTI 提供了兩種編輯圖片的方式，分子編輯方式 (原始設定)和圖 （edit picture）按鈕。然後點中 片編輯方式。啟動圖形區然後按 圖形中任意標記或者箭頭，按住滑鼠右鍵，在彈出的下拉功能表中選 properties(屬性)或者 style(風格)等，進行設置，注意此時設置的僅僅 是所選的箭頭或者標記，而不是整個分子（在之前所設的是整個分 子，請注意比較，兩種方式的轉換可通過 按鈕進行） 。
五. 修改 TC(R)圖形
1. 將 TC(R)箭頭變成蘭色網格 操作如下：點中 按鈕，點中 TCR 箭頭，按住滑鼠右鍵，選 properties fill，按右圖方式選擇：
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嘿，大家好，这是我的小木虫论坛邀请好友链接： https://www.doczj.com/doc/5011467014.html,/bbs/index.php?friend=1014881 希望大家多多支持，邀请好友能得金币！ 小木虫论坛是国内学术科研第一论坛，你的许多问题在里面都往往能找到答案！ Science.General通用科学工具软件 CAD计算机辅助设计 CAE计算机辅助工程 CAM计算机辅助制造 CFD计算流体动力学 EDA电子设计自动化（Electronic Design Automation) EFD (Engineering Fluid Dynamics 工程流体动力学), 属于CFD 软件的一个分支 FDA（Flight Data Analysis)飞行数据分析 FEA有限元分析Finite Element Analysis MCU(Micro Control Unit)中文名称为微控制单元 Others其他 Reverse.Engineering逆向工程 Virtual.Protot虚拟。。 Virtual.Reality虚拟现实，虚拟现实是利用电脑模拟产生一个三维空间的虚拟世界
CAD： 一、Product.Development.Aids 1.Cadenas Partsolutions v8.1.06 中文版(工模具三维零部件): 2.INNEO Startup TOOLS v2009 (产品开发辅助环境) 二、tools 1.AllyCAD v3.5 R12 1CD(专业CAD软件) 2.《智能工程绘图工具包》(CAD SCHROER STHENO ADVANCED V 3.1.1) 3.ITI_TRANSCENDATA_CADFIX，CADFIX能够找出并评估模型中几何以及拓扑的缺陷 4.TRANSCENDATA.CADfix 7.1-MAGNiTUDE CAD修复，它支持多种格式之间的转换 5.Transmagic.Expert.v7.0.SP2-SHooTERS 三维CAD转换软件 三、《CAD/CAE/CAM一体化软件》(DASSAULT SYSTEMES CATIA V5R18 SP6)...CATIA是法国达索飞机公司开发的高档CAD/CAM 软件 四、PTC 1.PTC.InterComm.Expert.v5. 2.F000-ZWTiSO 电子设计协同 2.ProE零件库 3.PTC.Mathcad.v1 4.0.M030 工程计算 4.《PTC PRO ENGINEER WILDFIRECAD/CAM/CAE集成软件》
生物材料也称为生物医学材料，是指以医疗为目的，用于与生物组织接触以形成功能的无生命的材料。 自20世纪80年代以来，以医疗、保健、增进生活质量、造福人类为目的的生物材料取得了快速的发展。目前，生物材料主要包括医用高分子材料、生物陶瓷、医用金属材料等。具有主动诱导生物组织自身修复、再生，从而达到使病变或受损器官、组织最终完全或主要是由再生的自身天然健康的组织或器官所取代；以及利用靶向给药载体并控制药物释放速度达到治疗和杀死病原体或癌细胞，实现这些功能的生物材料复合技术和纳米技术成为最有发展活力的研究方向。 生物医用材料是材料学重要研究领域之一，目前较活跃的研究内容有用于人工心脏、人工血管和人工心脏瓣膜的高抗凝血材料；用于人工骨、人工关节、人工种植牙的生物陶瓷和玻璃；用于骨科修补及矫形外科的钛及其合金；用于局部控制释放的药物载体的高分子材料；用于替代外科手术的缝合及活组织结合的生物粘合剂，以及血液净化材料等。 生物材料学的研究日新月异，全国许许多多科研院所都在致力于生物材料研究。虫子们来自于全国各地，对于生物材料的研究也是方方面面，您想知道自己当下的研究内容、所关注的热点处于什么水准吗？为了充分发挥虫子们的力量，开拓虫子们的眼界，为了让您更准确地把握研究动态，让您的研究处于最前沿，那么就请把您的研究内容、或是您所关注的热点内容拿出来晒一晒，看看自己的研究方向，比比别人的研究内容，小木虫生物材料版为您构建一个互相交流的平台，大家共同提高、共同进步~ 1、【研究方向】TiNi表面改性及其生物相容性研究 【现状】表面涂层法、氧化法、激光熔覆、离子注入、高分子复合改性等不同的表面改性方法被用在TiNi表面改性上，使其耐腐蚀性和生物相容性得到不同程度的改善。 【热点及难点】作为长期植入人体的材料，Ni离子的溶出及潜在的毒性问题是大家关注的重点，也是亟待解决的难点问题之一。 【前景】由于TiNi合金具有的独特的形状记忆效应和超弹性，加以适当的改性，使其Ni离子的溶出降低，生物相容性提高，必将在生物医学领域得到广泛的应用。 【代表文献】这个领域代表文献很多，就不一一列出了，下面是一篇综述，个人认为总结的比较全面。 Critical overview of Nitinol surfaces and their modifications for medical applications 2、【研究方向】软骨组织工程支架材料 【现状】用于支架材料的天然高分子主要有胶原蛋白、纤维蛋白、甲壳素、透明质酸、壳聚糖以及纤维素衍生物等。天然高分子的优点在于可以作为组织填充物而长期存在，有较好的组织相容性和亲和性。广泛研究的组织工程用合成高分子材料主要为聚己酸内酯(PCL)、聚羟基乙酸(PGA)、聚羟基丙酸(聚乳酸，PLA)及它们的共聚物(PLGA)等聚酯类材料。合成高分子材料适合批量生产，易于加工，结构和性能可以按需修饰和调控。 【热点及难点】目前组织工程用支架材料还存在许多缺点，如力学强度有限、降解速率与新生组织的生成速率不匹配、材料与宿主的整合性差、材料缺乏表面特异性等。 【前景】随着组织工程研究的深入，人们越来越认识到单一材料难以构建理想支架，复合支架可提高材料性能。 【代表文献】[1] Y.-L.Chen, H.-P.Lee, H.-Y. Chan，et al. Composite chondroitin-6-sulfate/dermatan sulfate/chitosan scaffolds for cartilage tissue engineering，Biomaterials，2007，28，2294-2305. [2] B. Grigolo，L. Roseti，M. Fiorini，et al. Transplantation of chondrocytes seeded on a hyaluronan derivative (Hyaff®；-11) into cartilage defects in rabbits，Biomaterials，2001，
认识一个朋友，他对有机化学投稿十分有经验，最近有幸邀请到他谈了谈对有机化学高档次期刊投稿过程中的一些看法和意见，十分的给力，希望能对小木虫上学有机化学乃至化学的同仁们起到一定帮助。再次感谢这位友人的热情应邀。 在小木虫潜水多年，也获益非浅。抽空写了如下的个人感受，希望对大家有所帮助。 曾经见过的JACS和ANGEW CHEM投稿不下50 篇.其他化学2区的文章投稿可能就更多了.总而言之,看过的审稿意见不下100 篇。下面就我的所见，总结一下我对有机化学投稿的一些个人看法。主要是JACS, ORG LETT。只是个人的感受，如有失偏颇，敬请原谅。其次文章写的比较流水，大家轻拍。 虽然主题是有机化学杂志投稿，但我认为对其他专业的期刊投稿也都很有借鉴意义。 1. JACS和ANGEW CHEM比较 许多人可能都知道,JACS (IF=是纯化学期刊中的老大(CNS除外).虽然影响因子(IF)没有ANGEW CHEM (IF=12)高,但由于ANGEW CHEM只有通讯无全文(一般通讯的引用次数会比全文的期刊高:如ORG LETT比JOC高; ANGEW CHEM比其全文的CHEM. EUR. J.高,等等 ),还有ANGEW CHEM有REVIEW ARTICL (REVIEW的引用次数一般都很高,如CHEM. REVIEW, ACC. CHEM. RES., CHEM. SOC. REV. ), 还有ANGEW CHEM有德文版本(会有双重引用). 可能很多人认为JACS比ANGEW CHEM难中.但我不完全这么认为.毕竟文章能否接收和很多因素有关.虽然的确有一些JACS拒掉的文章改投ANGEW CHEM却接受了(我见过4篇左右).但我也有见过很多投JACS没有中的,投ANGEW CHEM也没有中.而一些投ANGEW CHEM没有中的,改投JACS却反而被接收了(我见过的3篇).但总体来说,可能ANGEW CHEM中的发表的有机化学的文章比例比JACS中的比例高,所以可能ANGEW CHEM接收可能还是会比JACS简单一点. 2. JACS很难投中 JACS很难投中,他对工作的新颖性要求很高.最近几年由于JACS偏重材料和生物化学,所以有机的想发JACS, 难度就更大了. 现在JACS每年收到的稿件太多,且逐年增长,所以他们肯定会尽量来拒你的稿子,拒稿率高于80%.很多很优秀的有机合成工作最后只能在ORG LETT, CHEM COMMUN, CHEM EUR J, JOC, ADV. SYNTH. CATAL.等杂志上发表. 我有一个朋友,他是负责HIGHLIGHT化学期刊上的优秀的研究工作的.有一次他就说:ORG LETT上有些工作很好,但由于有些审稿人员太STUPID,所以JACS被拒了,最后只能无奈改投并发表在ORG LETT. 一般我们看到发在JACS上的有机合成工作,大部分都集中于不对称催化和过渡金属催化的有机反应两个领域. 所有如果能向这两个方向靠的话,JACS可能会容易发一些.
分享两篇SCI发表的经历 三年前对于我来说SCI就是天书一样，在我踏进博士的门槛后我以为自己进入了地狱，也纠结也彷徨，整天刷虫友们对于博士、SCI的帖子，我选择了虫友们鼓励的那一部分来激励自己继续前行。我告诉自己坚持就是胜利，当然那是积极的坚持。在好几月之前就有这个想法，今天早上收到第二篇的接收通知后，我便想今天一定要在小木虫上谢谢那些给予我帮助的虫友们。 话不多说，我把自己这两篇投稿的经历与大家共享，希望能给大家带来一点点用处。 第一篇发表在Fitoterapia Cover letter Dear Editor Verotta: We would like to submit the manuscript entitled "××××××题目" by ××××××所有作者姓名which we wish to be considered for publication in Journal of Fitoterapia. All authors have read and approved this version of the article, and due care has been taken to ensure the integrity of the work. Neither the entire paper nor any part of its content has been published or has been accepted elsewhere. It is not being submitted to any other journal. We believe the paper may be of particular interest to the readers of your journal as it is the first time of ××××××研究的精华所在 Thank you very much for your reconsidering our revised manuscript for potential publication in Fitoterapia. We are looking forward to hearing from you soon. Correspondence should be addressed to Jinhui Yu at the following address, phone and fax number, and email address. 地址、学院、学校名称 Phone: + 86×××××× Fax number: + 86571××××××
首先将所要进行分析的数据整理成fasta格式的，整理成一个TXT文档的，然后进行clustalx比对，会生成两个文件和这两种格式的，然后打开MEGA4.0，File----convert to MEGA format----选择之前clustal生成的这个文件，按照提示点击OK，将转换好的 文件格式再次保存，file ---save –选择一个保存地点，会在你选定的保存地点生成一个， 然后关闭生成的文件，再次file---open data---选择之前存的该文件，打开后，按照默认提示选择pro or nucleotide，然后再次MEGA 主窗口中的phylogeny---bootstrap test of phylogeny---NJ—按照默认提示选择compute，系统树就建好了， 如果想对数的外部结构等等进行一系列改造，可以选择不同形状的树谱结构，然后view下面的一系列参数也是可以改变树谱本身的一些特点的，比如字体大小颜色等等 系统发育树的构建及其后期编辑
又到了研究生写毕业论文的时候了，这几天两个师妹相继让我教他们构建系统发育树。索性就做一个图文的帖子，方便大家。纯技术贴，不涉及建树序列的选择、系统发育树如何看等理论性问题。要问的话，送一句话，自己多找几篇文章看看人家怎么分析系统发育树的。 1) FASTA 格式序列文本 FASTA是最为常用的序列格式，几乎所有序列分析软件都能识别这种格式的序列。构树之前先将所选的序列都粘贴在一个txt文本文件中，然后每条序列以>开头，后面可以接序列描述性语言，比如属名，种名等。然后换行粘贴序列，序列的最后用空格结束，这就是一个FASTA格式的序列了。需要注意的一点是每条序列的名字的前10个字符不要完全相同。为了方便起见，最好将此文件放在桌面上。编辑后的序列见下图： 2) Clustal X进行多序列比对 下载此软件，解压之后直接用。解压图如下：
有机化学高档次杂志投稿之我见（JACS, ORG LETT等） 认识一个朋友，他对有机化学投稿十分有经验，最近有幸邀请到他谈了谈对有机化学高档次期刊投稿过程中的一些看法和意见，十分的给力，希望能对小木虫上学有机化学乃至化学的同仁们起到一定帮助。再次感谢这位友人的热情应邀。 在小木虫潜水多年，也获益非浅。抽空写了如下的个人感受，希望对大家有所帮助。 曾经见过的JACS和ANGEW CHEM投稿不下50 篇.其他化学2区的文章投稿可能就更多了.总而言之,看过的审稿意见不下100 篇。下面就我的所见，总结一下我对有机化学投稿的一些个人看法。主要是JACS, ORG LETT。只是个人的感受，如有失偏颇，敬请原谅。其次文章写的比较流水，大家轻拍。 虽然主题是有机化学杂志投稿，但我认为对其他专业的期刊投稿也都很有借鉴意义。 1. JACS和ANGEW CHEM比较 许多人可能都知道,JACS (IF=8.7)是纯化学期刊中的老大(CNS除外).虽然影响因子(IF)没有ANGEW CHEM (IF=12)高,但由于ANGEW CHEM只有通讯无全文(一般通讯的引用次数会比全文的期刊高:如ORG LETT比JOC高; ANGEW CHEM 比其全文的CHEM. EUR. J.高,等等),还有ANGEW CHEM有REVIEW ARTICL (REVIEW的引用次数一般都很高,如CHEM. REVIEW, ACC. CHEM. RES., CHEM. SOC. REV. ), 还有ANGEW CHEM有德文版本(会有双重引用).
可能很多人认为JACS比ANGEW CHEM难中.但我不完全这么认为.毕竟文章能否接收和很多因素有关.虽然的确有一些JACS拒掉的文章改投ANGEW CHEM 却接受了(我见过4篇左右).但我也有见过很多投JACS没有中的,投ANGEW CHEM也没有中.而一些投ANGEW CHEM没有中的,改投JACS却反而被接收了(我见过的3篇).但总体来说,可能ANGEW CHEM中的发表的有机化学的文章比例比JACS中的比例高,所以可能ANGEW CHEM接收可能还是会比JACS简单一点. 2. JACS很难投中 JACS很难投中,他对工作的新颖性要求很高.最近几年由于JACS偏重材料和生物化学,所以有机的想发JACS, 难度就更大了. 现在JACS每年收到的稿件太多,且逐年增长,所以他们肯定会尽量来拒你的稿子,拒稿率高于80%.很多很优秀的有机合成工作最后只能在ORG LETT, CHEM COMMUN, CHEM EUR J, JOC, ADV. SYNTH. CATAL.等杂志上发表. 我有一个朋友,他是负责HIGHLIGHT化学期刊上的优秀的研究工作的.有一次他就说:ORG LETT上有些工作很好,但由于有些审稿人员太STUPID,所以JACS被拒了,最后只能无奈改投并发表在ORG LETT. 一般我们看到发在JACS上的有机合成工作,大部分都集中于不对称催化和过渡金属催化的有机反应两个领域. 所有如果能向这两个方向靠的话,JACS可能会容易发一些. 3. 投稿与稿件接收过程 投稿后,稿件首先会到主编P J Stang手上;过几天后,他们会对稿件进行第一轮的初步筛选,可能有10%的稿件会在他手上拒掉.但P J Stang不是有机方面的专家,
小木虫XRD问题集锦
（第一期）
2006 年 10 月 1 日
小木虫荣誉出品
目录
前言 ……………………………………………………………………………………… 问题－：XRD 数据分析讨论 …………………………………………………………… 问题二：双相合金晶胞参数的测定 …………………………………………………… 问题三：很少的粉末样品怎么做粉末XRD …………………………………………… 问题五：XRD拆峰问题如何解决 ……………………………………………………… 问题六：关于XRD知识的问题 ………………………………………………………… 问题八：纳米复合物怎么测XRD ……………………………………………………… 问题九：怎样在origin中处理XRD图………………………………………………… 1 2 8 9 12 13 16 16
问题四：不同掺杂金属量的TiO2 看晶形的变化与是否将金属离子掺进去怎么做 … 11
问题七：XRD样品相组成分析…………………………………………………………… 13
问题十：XRD峰强度问题 ………………………………………………………………… 17 问题十一：样品量少能做XRD粉末衍射吗……………………………………………… 17 问题十二：4 种xrd分析软件功能优劣评比…………………………………………… 问题十四：使用XRD衍射是否可以得到某粉末中的金属含量………………………… 问题十五：如何扣除粉末XRD仪器固有半高宽………………………………………… 问题十六：用XRD测织构，样品如何制备 …………………………………………… 问题十七： 小角度XRD与介孔有序的关系 ……………………………………………… 问题十八：XRD分析时候主要看哪几个指标…………………………………………… 18 20 21 21 22 22 问题十三：用origin做好看的XRD图…………………………………………………… 19
问题十九：EDS与XRD的区别 …………………………………………………………… 23 问题二十：xrd的文本导入excle中的问题 …………………………………………… 23
1
昨晚最后一篇文章接收，科研工作暂告一段落。这个月连续接收了4篇文章。 分别中的 Journal of Macromolecuar Science Part A Analytical Letters Journal of Biomedical Materials Research Part A Polymer Chemistry 做的方向各不一样，其中既有自己比较满意的，也有垃圾文章，都是去年下半年到今年上半年写出来的，之前被连续拒掉11次！ 虽然杂志档次一般，但投稿经验尚可一谈。 先介绍一下背景。小弟是做功能高分子材料方向的。去年已经有一篇Journal of Membrane Science保底，毕业无忧。我希望读书期间多涉及些方向，拓宽知识面，而不是只局限于组上擅长的工作，老板便同意我按自己思路自由发挥。以后的实验课题都是我自己设计的。我们老板人很好，十分为学生个人发展着想，即使是不喜欢搞科研的学生，老板也同意其出去做自己的事情，只要有利自己前途，还帮助其达到毕业最其要求。（***应当事人要求，此段略去***） 呵呵扯远了，回归正题。 先说说11连拒的故事，就以接收这四篇文章的杂志给四篇文章编号 Journal of Macromolecuar Science Part A这篇是垃圾文章，是为辅助以前课题做的个小实验，关于溶液聚合制备微凝胶，数据挺全，但没多少创意。老板意思是既然做了，就把写出来投了，好歹算篇文章。这篇文章就按照老板意思，从上到下，投到第五个杂志才接收，之前只被COLLOID AND POLYMER SCIENCE审过稿，其它都是直接拒，最后找了个IF1一下的，终于送出去了。这篇文章贡献4次拒搞，且讨论价值不大。 Analytical Letters这篇是最坎坷的，最无奈的，让我深感时运不济。这篇文章是关于分子印迹的，实验很简单，完全是靠一点新意。最早投Analyst，主编认为方向不合适。直接改投Langmuir，送审。只有1个审稿人，可能方向不对位，给的审稿意见都不在点子上，问题不大，但给拒了。遂按照审稿人意思修改文章，继续投Langmuir，并且在cover letter中请编辑送个分子印迹专业的审稿人。再次送审。结果这次审稿意见回来，被批得一无是处、毫无创意。遭打击，修改后投Talanta。就在这时，一篇国内分子印迹大牛做的、核心内容相似的文章在Journal of Materials Chemistry上见刊，顿时，我的文章意义全无。而这位大牛也是我之前投Langmuir推荐的审稿人之一。。。。也不得不承认，别人做得更精细，不过中间也有个不做这个的人很难看出来的缺陷。合情合理地被Talanta拒掉。然后我跟这位大牛发了封邮件，指出这个缺陷并请教我的文章，大牛很平易近人地帮我分析了文章中的不足，并提出很多建议。修改，投了个IF1点几的Analytical Letters，大修后接收。这篇文章也贡献了4次拒搞。 Journal of Biomedical Materials Research Part A这篇相对比较顺利，这个实验和最后一个是同时做的。这篇是关于材料表面抗蛋白污染和血液相容性的。先往高处投，投了Acta Biomaterialia，送审，被拒。按照审稿意见修改，投JBMR-A，小修，接收。这是我所有文章中，包括以前的和以前参与的，最顺利的一篇，只贡献了1次被拒。 Polymer Chemistry这篇是我最寄予希望的一篇。是个偶然发现的现象，发现还没人专门研究，于是迅速设计了个实验。先投的Chemical Communications，送审，3个审稿人，1个大修，2个拒，当然被拒掉了。3个审稿人或多或少赞同新意 但指出个致命缺陷——理论深度不够，像实验报告。。。。提的意见一大堆，我尽量修改，但是有几个要求补充的关键实验，我实在没有条件。想着文章不长，就投了Rapid Macromolecular Communications，这次居然被主编人无任何理由直接卡擦了。拿着文章好
金币，是小木虫论坛最为重要地一个元素. 使用金币，您可以在小木虫论坛更好地进行附件资源下载、文献求助、悬赏问问题、祈福、散金、送他人小红花等等功能.资料个人收集整理，勿做商业用途 可以说，不想要金币地虫子不是好虫子. 如何获得金币，是所有虫子都关心地问题. 我们针对常见地获得金币地途径进行了总结，特别提供给您： 坚持每天访问论坛领取红包 每天坚持访问小木虫论坛，就可以每天领取一次金币红包.连续天后，还可以一次性获得个金币. 另外，在特殊地日子里，我们会全论坛公告，额外派发节日红包. 领取每日红包来这里： 您也可以通过微信领取红包，每天可以领取个金币哦 微信设置向导参考这里： 首次设置自己地研究方向 成为小木虫会员后，请设置自己地研究方向，这可以让您更好地找到志同道合地学术之友.首次设置，可以获得个金币地奖励.资料个人收集整理，勿做商业用途 可以来这里设置自己地研究方向： 首次成功订阅小木虫每周邮件 小木虫会摘录每周最精彩地资源和话题，发送到您地邮箱里面.成功订阅小木虫论坛每周邮件后，阅读每期内容，都可以获得个金币地奖励.资料个人收集整理，勿做商业用途 可以来这里进行邮件地订阅： 邀请好友来小木虫论坛 复制属于自己地邀请地址，通过、、邮件，或者发到其他论坛上面，邀请好友加入小木虫. 只要有人通过自己地邀请链接访问小木虫，并注册成为小木虫地合格会员，您就可以获得个金币奖励. 来这里获取自己地邀请地址： 领取金币彩蛋 金币彩蛋会在您访问论坛地时候，随机出现.您访问论坛地时间越长，碰到金币彩蛋地概率就越大.每天最多可以获得个金币地彩蛋.资料个人收集整理，勿做商业用途 来这里查看彩蛋获取地榜单： 祈福散金贴里面快速跟帖 论坛中有大量地祈福类、散金类地帖子，这样地帖子，一般跟帖就有金币到手. 所以，要多在论坛呆着，多逛逛，看着有自动散金币地帖子，就立马跑过去捞一点吧，晚了估计就没有了.一般会得到个金币地奖励.资料个人收集整理，勿做商业用途 来这里查看热门地悬赏贴： 提供优秀地资源下载 手头有好地资源，就赶快分享给大家吧.发布主题地时候，记得选择“资源贴”类型. 别人下载后，可以对您地资源进行不同星级地评价.评价一次，您就可以获得最高个金币.一
小木虫Diamond软件问题集锦 1. Diamond出图时怎么设置dpi数目 我在使用Diamond出图时分辨率并不算小,可是编辑说我的图只有96dpi,但杂志要求至少600dpi,请问我该怎么设置? 答: 在picture/layout.../对话框的Targets中选择Bitmap,然后就可以自己输入需要的分辨率了.要保存为位图格式才可以.如果是JPG格式,还是96dpi. 答: 呵呵,发现在tools 下拉菜单的option 里. 2. Diamond椭球图阴影画图如图中所示,怎么画出每个椭球中的阴影部分?我用的是 3.1d 版本. 答: 这个是在diamond中的' 原子设置中' 中选的, 具体如下: picture-------atoms design-------style and colors-------style 中选择octant 即可. 3.怎样建立氢键我这儿有一个cif 文件,一个tab 文件和两个已经用diamond作好的图,但不知道这两个图是怎么画出来的,想知道作图过程,请diamond高手用word 或pdf 写出作图过程. 答:没什么技术含量的吧,堆积一下,删掉多余的原子,创建氢键就好. 4.怎样建立单个分子 diamond一打开cif,就是堆积图,怎么才能显示一个分子. 答:好像最新的更新包已经改过这个bug 了.但是因为没有对应的破解程序,所以俺还是用以前的 3.0,经常遇到这个问题.如果你的分子间没有作用,即:没有乱七八糟的键连在一起,选中一个原子,然后,ctrol+M, 选中一个分子,然后,反选,即选中除该分子之外的所有分子,然后一键delete, 就ok 了.如果分子连成片,就删吧. 对于非中心分子,即含反离子的分子结构要小心,不要把反离子漏掉了.当然,如果不用画就没问题了.以上拙见,仅供参考. 答:diamond打开cif 时选"建立单个分子",然后点完成,不要点下一步. 请教diamond画C60 遇到的问题(1)我这个C60 在画多面体的时候,中间inset 的atom 的半径在每个面上都要自己一个一个去设定radium,有没有同类原子半径一起设置的?里面没有找到. (2)当我把中间的dummy 原子(就是为了画多面体的时候新加入的)的半径设为0 后,如果想改C60 的每个面的颜色的画,这个怎么改的? (3)最后问一下,我保存的图片中背景的diamond demonstrator 如何去掉. 另献上我第一幅diamond图,如下. 6. 7. 答:1. 可以在atom 设置里找到假原子直接设置 2. 以假原子为中心画多面体 3. 你用的应该是未破解版本. diamond中如何在螺旋链中插入一根棒diamond中如何在螺旋链中插入一根棒,以及如何看结构是单螺旋还是双螺旋结构,如何画出单,双螺旋结构? 答:插入几个哑原子,然后连键,进行一些设置就可以了.前段时间有人传了一些Diamond的说明,其中有一个文件就是详细说明这个棒怎么画的. 找到了这个文件,感谢原作者Crystalsnet,我把它上传到纳米盘,你自己下载下来看看就知道怎么做了. 答:在孔道两侧虚拟两个原子,然后在这两个原子间成建,设置一下键参数就可以了! 答:具体说,选择两端的几个院子,再找这几个的中心位置,分别insert atoms , 再连接心连接, insert bond, 在按你的意思edit the bond. 如何去掉M-C,M-H 连接打开一个晶体数据后,在connectivity 中把M-C,M-H 去掉后.再点complete fragments 第3 页共13 页
催化基础知识普及、探讨帖之五：催化期刊及投稿 催化知识普及、探讨系列帖第 5 帖——催化期刊及投稿
此帖主题相信大家平时了解的比较多， 恐怕也是大家最为关心的问题之一。 小木虫论文 投稿专版关于此方面的介绍比较多也比较详细， 且我们催化专版也有几个帖子专门进行了探 讨和讨论，而我对这方面了解比较少（主要是没发过什么文章，哈哈） ，此帖内容主要是对 网络上的一些投稿知识进行汇总（加入了少的可怜的自己对催化期刊的认识及投稿经验） 。 目的还是办此系列帖的主旨：介绍催化相关基础知识、抛砖引玉、相互学习、分享经验及教 训。 催化是一门跨学科、跨专业的科学，按理论上讲化学类，甚至物理等类的期刊都可以收 录催化相关的文章，因此本贴并不打算介绍诸如《科学》《自然》《德国应用化学》 、 、 、JACS 等等这些高等次的通用型期刊，此帖只局限于催化专业期刊。简而言之：只介绍含有“催化” 两字的相关期刊。 具体介绍各个催化期刊之前，有必要对现今几大出版社或数据库 简要介绍一下（一般 催化期刊都是这四个出版社或数据库名下的） ：
（1）Elsevier Science 出版社
Elsevier 出版的期刊是世界公认的高品位学术期刊，且大多数为核心期刊，被世界上 许多著名的二次文献数据库所收录。SDOS 目前收录 1700 多种数字化期刊，该数据库涵盖 了食品、数学、物理、化学、生命科学、商业及经济管理、计算机科学、工程技术、能源科 学、环境科学、材料科学和社会科学等众多学科。该数据库不仅涵盖了以上各个学科的研究 成果，还提供了简便易用的智能检索程序。通过 Science Direct Onsite（SDOS）中国集团的 数据库支持，用户可以使用 Elsevier Science 为其特别定制的科学、技术方面的学术期刊并 共享资源。 目前 (截止到 2005 年 11 月 16 日)该数据库已有期刊种数 1,734,期刊期数 145,078 ， 文章篇数 2，576，316，最早年份为 1995 年。这个数据库的服务器是通过专线对中国大陆 用户提供服务的。Elsevier Science 是一家非常好的电子出版商，从 2001 年 1 月起，就已有 28 家杰出的学术机构加入了 Elsevier SDOS 中国集团。
（2）Springer 出版社
德国施普林格 Springer-Verlag ） （ 是世界上著名的科技出版公司， 通过 Springer Link 系 统提供学术期刊及电子图书的在线服务。全文期刊数据库所收录的 学科范围较广，包括： 行为科学、生物医药与生命科学、化学与材料科学、计算机科学、商业与经济学、工程学、 地球和环境科学、人文科学、社会科学与法律、数学、医学、物理与天文学等 11 个学科， 其中许多为核心期刊。
（3）ACS 数据库
美国化学学会 ----ACS(American Chemical Society)成立于 1876 年，现已成为世界上最 大的科技协会之一，多年来，ACS 一直致力于为全球化学研究机构、企业及个人提供高品 质的文献及服务，在科学、教育、政策等领域提供了多方位的专业支持，成为享誉全球的科 技出版机构。ACS 的期刊被 ISI 的 Journal Citation Report(JCR)评为：化学领域中被引用次数 最多的化学期刊。 ACS 出版 34 种期刊，内容涵盖以下领域：生化研究方法、药物化学、 有机化学、普通化学、环境科学、材料学、植物学、毒物学、食品科学、物理化学、环境工 程学、工程化学、应用化学、分子生物化学、分析化学、无机与原子能化学、资料系统计算
速度快并且容易中的材料类SCI期刊(更新中) 推荐： 1. Journal of alloy and compounds 影响因子IF 1点多，1个月给消息，容易中，现在几乎成为中国人的专刊了，哈哈； 2. applied surface science 影响因子IF 1点多，发表容易， 3. Materials Letter 1.7 速度快，快报一般都要求有新意（当然，新意太高可以投APL了） 4. Materials & Design 影响因子不到1，很快，快点一个月就接受的！适合特别想要文章毕业或者评奖学金的。 5. Physica B 影响因子不到1，很快，我一个同学已经在上面发了2篇了，最快不到一个月就接受了，还是容易中的，最好是工作全面细致些。 6. Materials science and engineering B 影响因子1点多，从投稿到接受一般3-4个月，相对容易中。 7. Optoelectronics and Advanced Materials-Rapid Communications, 罗马尼亚期刊，影响因子0.2，很快，一个月可以搞定，适合灌水和急需文章。 8. Optical materials 发光材料期刊，影响因子1点多，相对容易中，速度也快。 9. Journal of Luminescence 发光方面专业期刊，老牌杂志，虽然影响因子只有1点多，但很多发光方面的经典文章出自此期刊，相对容易中，速度也可以。 10. Journal of Physics D: Applied physics 偏物理材料方面，影响因子2 左右，速度快，也不难中，中国人投稿还比较多。 黑名单： 1. Thin solid films 影响因子1点多，但审稿巨慢，不推荐； 2. Materials Characterization 影响因子不高，容易中，但速度慢，如果不急着要文章，也可以投的； 3. Materials Chemistry and Physics 影响因子1点多，速度巨慢，我一个同学投稿半年还没消息，现在1年过去了还没查到这篇文章，估计没戏了吧。 4. Journal of Physics and Chemistry of Solids, 影响因子1点多，速度较慢，接受难度较易。
心得：如何选择SCI刊物 ★ 小木虫(金币+1):奖励一下，鼓励发有价值的话题 cxksama:设置为普通贴,0.6个金币收益被收回请去https://www.doczj.com/doc/5011467014.html,/bbs/viewthread.php?tid=1639969&fpage=1申请2011-01-26 07:49 我在科研期间发了4篇文章，1篇中文，3篇英文，还有1篇英文准备投。我觉得算对得起老师和自己了。呵呵，自恋一下。 快要毕业了，想把我科研的一个重要的经验跟大家分享，那就是如何发论文（从学生角度来说）。当然，这涉及到如何构思，如何写，如何选刊物，如何回答审稿人问题，如何和编辑交流，等等。 涉及面太广了，一口气说不完，所以说下如何选择刊物，因为我发现在小木虫里很多人讲到如何写，如何与审稿人等交流。但很说说如何选刊物。呵呵~~~ 进入主题吧。发表SCI论文是扩大学者及团队知名度和业绩的一个重要指标，尤其是发表高水平的文章。对于学生而言也是如此。因此，选择一个合适的刊物，是至关重要的。那么，如何选择呢？最直接的是通过论文阅读锁定刊物。但我认为，在这这个方法的基础上，还应该从以下角度辩证地看问题： 第一，从学生的志愿考虑： First：如果一个学生是想以后从事学术工作的，那不用说了，发表真正意义上的高水平文章太关键了。但是，高水平的刊物仅仅是高影响因子吗？答案当然不是！有些刊物的影响因子较高，但是并不代表它是高水平的刊物。为什么？因为有些刊物影响因子高是自引率高导致的，如危险废物等，自引率高达31%！根据ISI权威统计，没有自引率的贡献，影响因子只有2.832。所以，想投高水平的刊物，最基本的要排除高自引率的刊物；同时，也要保证影响因子不低。这是刷选高水平刊物的一个方法。TIPs：想要知道刊物自引率，到ISI官方网站查询即可。 当然，并不是每个学生在一开始就能发表高水平文章的，所以，在刷选刊物时可以选择中等水平的。注意，方法与上述的差不多。 Second：如果一个学生是想以后从事非学术的工作，那我认为，不用考虑了，自引率了。So easy！ 第二，从刊物口碑考虑 所谓口碑，就是众人对某刊物的看法，如刊物论文质量，刊物审稿速度，刊物要求高低等。如JACS，众人皆知其论文质量高，审稿速度快。所以刊物一级棒~~~值得考虑。又如Materials letters，众人皆知其论文质量居中，但审稿速度总体较快（平均而言，也有慢的例子；插一句，自引率也不高，7%），所以期刊可接受，对于刚进入学术领域的学生而言，是个不错的选择。呵呵。
今年是博士第四年了，毕业要在明年了，在这三年里，有过酸甜苦辣，各种滋味都有，感触颇深，有些感想，想写在这里和大家一起分享，希望能够那些准备读博的人和正在读博的人一些提示和建议。 首先，谈一下该不该读博士！ 1、明确读博士的目的。虽然现在博士扩招也挺多的，但是博士毕业确实不像硕士那么容易，当然与专业也有关系，但总体来说，博士是进来容易出去难。如果你仅仅是想混个文凭，为以后评职称或当公务员提升自己的资本，那么我劝你还是不要读博士了，这是对于应届博士来说的，如果你是公司的老总或单位的领导，那就另当别论了。 2、如果以后想继续走科研这条路，那么我觉得读博士非常重要。读博士过程中你可以学到许多科研方法，接触许多很有水平的同领域的专家，开阔自己的眼界，这些，对以后自己的科研道路的确很重要，所以说，立志以后去高校或研究所的朋友们，劝你们最好读个博士，这个对以后的人生道路是一笔很大的财富。 3、如果为了找个好工作，或者为了赚钱，那么最好别来读博士。读博士并不能给你带来直接的经济效益，相反，博士的待遇现在很可怜，能够维持基本的生活就不错了，现在的状况是就算你博士毕业也很难找到合适的单位，大部分人都去高校，因为去企业实在不划算，辛辛
苦苦这么几年，到企业，待遇和一个硕士的差不了多少，而且人家进去的比你要早，资历要深，可能混的比你好多了；对于你来说，一个是心理很难平衡，另外一个是博士所学的东西可能从此无用武之地。如果去高校，大家也知道，现在的高校待遇是什么样子，和前几年相差太远了，一年一个样，反正是越来越差，与我当初读博的时的待遇简直是天壤之别，别说房子，家属，就是一个一般的学校，你能够进去就不错了。 4、如果你是为了其他目的来读博士，那么在读之前请三思而后行，做好一定的心里准备，因为它可能比你想象的要艰苦许多，困难许多。不管你是处于什么目的，如果读了博士，而且想早点毕业的人，那么我想就我的体会谈一点想法，提一点建议，希望对大家有用。 1、选一个好的研究方向，这个很重要。同一个专业，如果你方向选的好，那么你和别人付出一样的努力，你可能三年就毕业了，别人估计需要四年甚至五年才能毕业。方向不能选的太大，太大就显得很空洞，不能深入，也不能选的太小，太小就可能陷入死胡同，不能出成果。如果你研究生的方向很有意义，那么接着做下去，对于自己来说就非常好，有基础又有积累，还可以深入，为以后的提早毕业就打下了很好的基础。另外一个就是选方法论，这些东西容易写，容易创新，不要选一些算法之类，既很难创新又很难出成果。
期刊投稿、审稿过程以及常用术语 2010-03-15 23:08 国外期刊投稿、审稿过程以及常用术语 1. Author 作者 如何在线投稿？在线投稿大致步骤： Step 1: Log In 登陆 The login page gives you three options: 1. Log in with your known User ID and Password 用户名和密码 2. Check to see if you have an existing account 确认是否已经注册过 3. Create a new account 没有就注册一个 Step 2: Enter your Author Center 进入作者中心 To begin a new submission, check a previous submission, continue a submission begun earlier, or submit a revised manuscript, choose Author Center. 确认是新投，还是投修改稿 Step 3: Inside Your Author Center 在个人的作者中心里面 Existing manuscripts are found in one of three areas: 包括三个区域（这个每个杂志可能有区别的） Manuscripts to be Revised 需修改稿 Partially Submitted Manuscripts 部分上传稿 Submitted Manuscripts 已上传稿 To start a NEW manuscript submission, choose “Submit First Draft of New Manuscript” link. 开始上传新稿 Step 4: Entering Data 输入资料 The following screens ask you to enter each piece of data associated with your manuscript. Most of this data will also be included in the text of your manuscript, but needs to be entered in this format in order to make the system searchable by these fields. It is used for screen display and e-mail notifications only. You cannot enter text into the Manuscript Data Summary table –scroll down each screen to enter the required information. 按照提示一步一步输入 Pre ss “Save and Continue” at the bottom of each screen in order to save all of your work. If you press the "Back" or "Forward" button on your browser your work will not be saved. 继续时选择保存和继续，如果点击back 或者forward，原来输入的内容会消失。 Step 5: Upload Your Manuscript 上传文稿 The File Manager is the area where you upload your files. Click on the Save and Continue button to get to the upload page. Click on the Browse button in step #1. Locate your file and click on the name of the file to place it in the box. Select a file designation that