所需软件：GaussView
步骤：
1．从GaussView打开目标体系的.chk文件，如下图
图1
2逐步点选Results; surface，出现如下图对话框
图2
3.其中Cube Actions…一项，选择New Cub,跳出下图对话框，kind一栏选择Total Density，然后点击OK
图3
4.此时返回图2，稍等待空白栏中出现计算结果。Surface Actions…一项选择New Mapped Surface，跳出下图对话框，点击OK
图4
5.稍等，便出现下图漂亮彩色静电势图
图5
怎么样，简简单单就作出了漂亮的静电势图^-^
可能你作出来的和我的不一样，这是因为透明度不同，显示的效果不一样。
编辑显示效果，依次请点击File, Preferences,如下图示：点击Surface选项卡，Transparent就是用来调节透明度的。
图6
编辑制作：赵继阳，参考GaussView《help》
GaussView教程【1】——界面介绍 Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件，其主要用途有两个：构建高斯的输入文件；以图的形式显示高斯计算的结果。除了可以自己构建输入文件外，Gview还可读入Chem3D，HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。从而使其可以于诸多图形软件连用，大大拓宽了使用范围。 开启GaussView会看到一大一小两个窗口，后面灰色背景的窗口为选择窗口，在里面选择要输入的分子或基团；前面紫色的窗口为绘图窗口，使用鼠标绘制想要绘制的图形。 菜单栏 ?【File】主要功能是建立，打开，保存和打印当前的文件 ?【Edit】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等 ?【View】与显示分子相关的都在这个菜单下，如显示氢原子、键、元素符号、坐标等 ?【Calculate】直接向Gaussian提交计算 ?【Results】接收并显示Gaussian计算后的结果 ?【Windows】控制窗体，如关闭、恢复等 ?【Help】帮助 快速工具栏 【左面第一个】选择元素与价键，单击打开会看到一个元素周期表，通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。 【左面第二个】环工具，作用与上一个差不多，只是这里提供的都是环状化合物残基； 【左面第三个】提供常用的R基团模板，其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等 【左面第四个】氨基酸残基，使用它可以迅速绘制氨基酸 【左面第五个】用户自定义基团，您可以将常用的基团存放到此处 这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】 这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。
GaussView高级技巧（一）： 十个基本高级技巧 摘要 本文主要介绍了利用GaussView 分子模型的十个高级技巧，其中大多数技巧是鲜为人知的。这些技巧的组合能够使GaussView发挥巨大威力，可以快速方便地构造出复杂的分子结构。最后，以构造乙烷的重叠式构象和二茂铁结构为例进一步说明了这些高级技巧的具体应用。 本文主要介绍利用GaussView构建分子模型的高级技巧，希望对大家有所帮助。本文所使用的版本是GaussView 3。 1. 三个变形工具 上图的三个变形工具可以实现平移和旋转分子的某一部分以及断键成键和选择键型等功能，我们不妨将这些工具依次称为“键长”、“键角”和“二面角”工具。根据需要必须适当选择某些原子的移动方式，有“平移全组”（“T ranslate group”，默认），“平移原子”（“Translate atom”）和“固定”（“F ixed ”）三种，如下图所示。 2. 添加虚原子定义参考原子或参考旋转轴
在很多场合，我们可以利用添加虚原子X来定义参考原子或参考旋转轴，然后利用前述的三个变形工具对分子进行我们想要的操作。一旦操作完成，我们再删除掉原先添加的虚原子。我们可以用删除工具直接删除（见下图）： 但由于虚原子体积很小，有时会被其他原子覆盖，这时无法用删除工具直接删除。更通用的删除方法是：点击“原子列表”按钮（也可以选择菜单Edit > Atom List...），见下图。 在弹出的“Atom List Editor”窗口中选中要删除的原子，然后选择菜单Edit > Delete Atoms > Selected。 3. 利用加氢工具获得最佳成键位置 利用上图的加氢工具可以对某个原子添加一个氢原子。但这个氢原子的成键取向有时并非我们想要的。解决办法是：既然我们第一个加氢的取向不理想，那么我们就再添加一个，就这样连续不断地加氢，直到所加的氢原子的位置符合我们需要位置。然后利用删除工具将前面添加的氢原子全部删除即可。 加氢工具的另一个目的就是为后面添加其他基团做准备。用下面介绍的基团工具点击氢原子将氢原子取代掉后即可达到在一定的成键方向添加某个基团的目的。 4. 基团取代工具 如上图所示，基团取代工具有：元素基团、环状基团、R基团、生物基团和自定义基团。元素基团可以添加或取代各种杂化状态的原子基团，其余各种基团工具则提供许多常用基团的模板，在此基础上我们可以构建相当复杂的分子。我们可以点击当前基团（“Current Fragment”）面板中的“Hot”位置来选择取代位置，如下图所示。
Gaussview软件使用手册 GaussView是一个被设计来帮助准备输入进入高斯软件的文档以及以图形的形式来检验高斯软件完成并输出的结果的图形化的用户界面。GaussView是不在高斯软件的计算模块中，而是以前端/后端的模式来协助高斯软件的运行。GaussView为高斯用户提供了三种主要的便利。 首先，通过它先进的可视化工具，GaussView使得用户可以很快的做出大分子的结构图甚至是很大的分子，然后旋转，在这些分子的基础上经过简单的搜寻操作来编译和放大。它同样可以载入例如PDB类型的标准的分子结构文档。 第二，GaussView使得建立多种形式的高斯计算变得容易。它使得准备为普通工作模式以及如ONIOM，QST2/OST3转变结构优化方法，CASSCF计算方法，周期边缘状态计算方法（PBC）以及其他的许多前沿方法的复杂的载入更加简单。如果高斯软件被安装在了同一台电脑上的话，用户同样可以使用GaussView来进行工作。 最后，GaussView使得用户可以通过多种的图形技巧来检验高斯计算的结果。高斯的计算结果中可以用图形来表示的有下列几种： 1.经过优化的分子结构； 2.分子轨道 3.任何估算密度的电子密度表面； 4.静电潜在表面； 5.原子价； 6.与振动频率相符的一般模型； 7.IR,Raman,NMR,VCD以及其他的频谱； 8.结构优化，IRC反应途径的后续，能级表面的扫描以及ADMP和BOMD轨道的模拟； 9.整体能量的小部分以及其他来自于相同工作类型的数据； 这本书为所有的GaussView结构提供了一个参考。该软件的每一个程序的结构都被详细记录。将项目按照一般目的分类。在每一个分类中，项目是按照逻辑结构来排列的，开始于最简单的项目，然后是引用最广泛的项目，最后是更加复杂和不经常使用的项目。为了找出用户感兴趣的特殊信息，可以通过索引来打开有关主题或者是特殊的对话框。颜色收集以及对话在索引中的主题菜单下（下面直接中英语）显示了出来。菜单项目通过菜单=>项目的格式显示出来。按钮在索引中显示为“名称按钮”。如下图（从图1开始）显示了一系列的按钮名称，菜单途径—等价于按钮和键盘的快捷键。 在多种GaussView结构的基于指导的帮助包含在了网上帮助中。在主帮助窗口中选择指导主题来打开他们。 GaussView指导 基础分子创建 分子创建的例子和策略 下面举例说明怎样利用GaussView来创建分子。 创建维生素分子：利用不典型的原子 下面是一个使用GaussView创建维生素分子的例子： 1.在View窗口中的File菜单中选择New的选项来创建一个新的文件； 2.在Builder窗口中选择好Rings； 3.在Active Fragment button上面点击。在环碎片中选择苯。 4.返回到View窗口。点击一下演示苯。 5.在Builder窗口中点击Element选项，在氮上点击。 6.点击Active Fragment，点击氮原子。 7.在View窗口中，点击你想变成氮的碳原子。注意：不要选择杂交原子中的一个，通常选择不典型的原子 更加容易。 8.在创建窗口中点击Delete Atom键。
G a u s s v i e w软件使用手册GaussView是一个被设计来帮助准备输入进入高斯软件的文档以及以图形的形式来检验高斯软件完成并输出的结果的图形化的用户界面。GaussView是不在高斯软件的计算模块中，而是以前端/后端的模式来协助高斯软件的运行。GaussView为高斯用户提供了三种主要的便利。 首先，通过它先进的可视化工具，GaussView使得用户可以很快的做出大分子的结构图甚至是很大的分子，然后旋转，在这些分子的基础上经过简单的搜寻操作来编译和放大。它同样可以载入例如PDB类型的标准的分子结构文档。 第二，GaussView使得建立多种形式的高斯计算变得容易。它使得准备为普通工作模式以及如ONIOM，QST2/OST3转变结构优化方法，CASSCF计算方法，周期边缘状态计算方法（PBC）以及其他的许多前沿方法的复杂的载入更加简单。如果高斯软件被安装在了同一台电脑上的话，用户同样可以使用GaussView来进行工作。 最后，GaussView使得用户可以通过多种的图形技巧来检验高斯计算的结果。高斯的计算结果中可以用图形来表示的有下列几种： 1.经过优化的分子结构； 2.分子轨道 3.任何估算密度的电子密度表面； 4.静电潜在表面； 5.原子价； 6.与振动频率相符的一般模型； 7.IR,Raman,NMR,VCD以及其他的频谱； 8.结构优化，IRC反应途径的后续，能级表面的扫描以及ADMP和BOMD轨道的模拟； 9.整体能量的小部分以及其他来自于相同工作类型的数据； 这本书为所有的GaussView结构提供了一个参考。该软件的每一个程序的结构都被详细记录。将项目按照一般目的分类。在每一个分类中，项目是按照逻辑结构来排列的，开始于最简单的项目，然后是引用最广泛的项目，最后是更加复杂和不经常使用的项目。为了找出用户感兴趣的特殊信息，可以通过索引来打开有关主题或者是特殊的对话框。颜色收集以及对话在索引中的主题菜单下（下面直接中英语）显示了出来。菜单项目通过菜单=>项目的格式显示出来。按钮在索引中显示为“名称按钮”。如下图（从图1开始）显示了一系列的按钮名称，菜单途径—等价于按钮和键盘的快捷键。 在多种GaussView结构的基于指导的帮助包含在了网上帮助中。在主帮助窗口中选择指导主题来打开他们。 GaussView指导 基础分子创建 分子创建的例子和策略 下面举例说明怎样利用GaussView来创建分子。 创建维生素分子：利用不典型的原子 下面是一个使用GaussView创建维生素分子的例子： 1.在View窗口中的File菜单中选择New的选项来创建一个新的文件； 2.在Builder窗口中选择好Rings； 3.在Active Fragment button上面点击。在环碎片中选择苯。 4.返回到View窗口。点击一下演示苯。 5.在Builder窗口中点击Element选项，在氮上点击。 6.点击Active Fragment，点击氮原子。 7.在View窗口中，点击你想变成氮的碳原子。注意：不要选择杂交原子中的一个，通常选择不典型的原子 更加容易。 8.在创建窗口中点击Delete Atom键。 9.在View窗口上，通过点击该键删除与氮相连的氢。 10.在Builder窗口上点击Rebond按钮，然后点击Clean按钮。注意：通常在清除前应该重新成键。 维生素现在已经完成了。
Gaussview软件使 用手册
Gaussview软件使用手册 GaussView是一个被设计来帮助准备输入进入高斯软件的文档以及以图形的形式来检验高斯软件完成并输出的结果的图形化的用户界面。GaussView是不在高斯软件的计算模块中，而是以前端/后端的模式来协助高斯软件的运行。GaussView为高斯用户提供了三种主要的便利。 首先，经过它先进的可视化工具，GaussView使得用户能够很快的做出大分子的结构图甚至是很大的分子，然后旋转，在这些分子的基础上经过简单的搜寻操作来编译和放大。它同样能够载入例如PDB类型的标准的分子结构文档。第二，GaussView使得建立多种形式的高斯计算变得容易。它使得准备为普通工作模式以及如ONIOM，QST2/OST3转变结构优化方法，CASSCF计算方法，周期边缘状态计算方法（PBC）以及其它的许多前沿方法的复杂的载入更加简单。如果高斯软件被安装在了同一台电脑上的话，用户同样能够使用GaussView来进行工作。 最后，GaussView使得用户能够经过多种的图形技巧来检验高斯计算的结果。高斯的计算结果中能够用图形来表示的有下列几种： 1.经过优化的分子结构； 2.分子轨道 3.任何估算密度的电子密度表面； 4.静电潜在表面； 5.原子价； 6.与振动频率相符的一般模型； 7.IR,Raman,NMR,VCD以及其它的频谱； 8.结构优化，IRC反应途径的后续，能级表面的扫描以及ADMP和BOMD轨道
的模拟； 9.整体能量的小部分以及其它来自于相同工作类型的数据； 这本书为所有的GaussView结构提供了一个参考。该软件的每一个程序的结构都被详细记录。将项目按照一般目的分类。在每一个分类中，项目是按照逻辑结构来排列的，开始于最简单的项目，然后是引用最广泛的项目，最后是更加复杂和不经常使用的项目。为了找出用户感兴趣的特殊信息，能够经过索引来打开有关主题或者是特殊的对话框。颜色收集以及对话在索引中的主题菜单下（下面直接中英语）显示了出来。菜单项目经过菜单=>项目的格式显示出来。按钮在索引中显示为“名称按钮”。如下图（从图1开始）显示了一系列的按钮名称，菜单途径—等价于按钮和键盘的快捷键。 在多种GaussView结构的基于指导的帮助包含在了网上帮助中。在主帮助窗口中选择指导主题来打开她们。 GaussView指导 基础分子创立 分子创立的例子和策略 下面举例说明怎样利用GaussView来创立分子。 创立维生素分子：利用不典型的原子 下面是一个使用GaussView创立维生素分子的例子： 1.在View窗口中的File菜单中选择New的选项来创立一个新的文件； 2.在Builder窗口中选择好Rings； 3.在Active Fragment button上面点击。在环碎片中选择苯。
Gaussvi e w 软件使用手册 GaussView是一个被设计来帮助准备输入进入高斯软件的文档以及以图形的形式来检验高斯软件完成并输出的结果的图形化的用户界面。GaussView是不在高斯软件的计算模块中，而是以前端/后端的模式来协助高斯 软件的运行。GaussView为高斯用户提供了三种主要的便利。 首先，通过它先进的可视化工具，GaussView使得用户可以很快的做出大分子的结构图甚至是很大的分子， 然后旋转，在这些分子的基础上经过简单的搜寻操作来编译和放大。它同样可以载入例如PDB类型的标准的分子结构文档。 第二，GaussView使得建立多种形式的高斯计算变得容易。它使得准备为普通工作模式以及如ONIOM QST2/OST3转变结构优化方法，CASSCF十算方法，周期边缘状态计算方法（PBQ以及其他的许多前沿方法的复杂的载入更加简单。如果高斯软件被安装在了同一台电脑上的话，用户同样可以使用GaussView来进行工作。 最后，GaussView使得用户可以通过多种的图形技巧来检验高斯计算的结果。高斯的计算结果中可以用图形来表示的有下列几种： 1. 经过优化的分子结构； 2. 分子轨道 3. 任何估算密度的电子密度表面； 4. 静电潜在表面； 5. 原子价； 6. 与振动频率相符的一般模型； 7. IR,Rama n,NMR,VCD以及其他的频谱； 8. 结构优化，IRC反应途径的后续，能级表面的扫描以及ADM和BOMD^道的模拟； 9. 整体能量的小部分以及其他来自于相同工作类型的数据； 这本书为所有的GaussView结构提供了一个参考。该软件的每一个程序的结构都被详细记录。将项目按照一般目的分类。在每一个分类中，项目是按照逻辑结构来排列的，开始于最简单的项目，然后是引用最广泛的项目，最后是更加复杂和不经常使用的项目。为了找出用户感兴趣的特殊信息，可以通过索引来打开有关主题或者是特殊的对话框。颜色收集以及对话在索引中的主题菜单下（下面直接中英语）显示了出来。菜单项目通过菜单=> 项目的格式显示出来。按钮在索引中显示为“名称按钮”。如下图（从图1开始）显示了一系 列的按钮名称，菜单途径一等价于按钮和键盘的快捷键。 在多种GaussView结构的基于指导的帮助包含在了网上帮助中。在主帮助窗口中选择指导主题来打开他们。 GaussView 指导 基础分子创建 分子创建的例子和策略 下面举例说明怎样利用GaussView来创建分子。 创建维生素分子：利用不典型的原子 下面是一个使用GaussView创建维生素分子的例子： 1. 在View窗口中的File菜单中选择New的选项来创建一个新的文件； 2. 在Builder窗口中选择好Rings ； 3. 在Active Fragme nt butt on 上面点击。在环碎片中选择苯。 4. 返回到View窗口。点击一下演示苯。 5. 在Builder窗口中点击Element选项，在氮上点击。 6. 点击Active Fragment，点击氮原子。 7. 在View窗口中，点击你想变成氮的碳原子。注意：不要选择杂交原子中的一个，通常选择不典型的原子更加容 易。 8. 在创建窗口中点击Delete Atom键。 9. 在View窗口上，通过点击该键删除与氮相连的氢。