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生物信息学实验指导实验二ensemble使用

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实验二Ensemble 使用

1.1在Ensemble页面All genomes的下拉菜单中选择human,查看这个物种的具体信息,人的染色体和基因数量如图所示,基因数量主要看Alternative sequence 的图示。genetic variation有Short Variants (329,179,721)和Structural variants (5,955,877)。

生物信息学实验指导实验二ensemble使用

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1.2 在Ensemble 首页进行human for MAPK4搜索,在结果页面追加Restrict category to 为gene,筛选到117条序列,打开登录号为ENSG的目标序列,查看Gene-based displays。

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