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贵州省数字化生物标本馆的研究与建设

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2007年20卷5期

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文章编号:1001—4829(2007)05-0948—06

贵州省数字化生物标本馆的研究与建设

张伦1,林昌虎2,陈翔1,何凡锋3,李峰1,陈谦海1

(1.贵州省生物研究所.贵州贵阳550009;2,贵州科学院.贵州贵阳550001;3贵阳宏远计算机软件开发有限公司.贵州贵阳550001)

摘要:阐速了建立贵州省生物标本信患化标准体系的原则;应用powerbuilder9.0作为前嫱开发工具,井用SQLServer作为蜃务■开发工具建成了量州省教宇化生袖标幸馆蕾理系统和鼓据库,谖系统和数据库至少能存储40万甜标幸教据;数据录^记录数总计8435条(田慷7553撮).共计130科’382属、1291采种。实现了罔上生糟标本资霹信息发布。并对目前存在的问是进行了出讨论。

关键词:数字化;生物标奉馆;前墙开发工具Powerbuilder9.0;服务墙开盅工其sQLServe;贵州中田分类号:s04

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管理系统是Stoller和Vanbom于1958年提出的,其发展却足在60年代末70年代初,其中Dick.—t的《管理系统—决策系统)…是较优秀的一本著作。随着计算机科学的发展,信息系统日益成为独

立的研究部门,国内外在此方面的研究发展很快,并且广泛应用到企业管理、军事国防、现代农业、社会

发展、环境保护、航空航天等各个方面。我国生物多

样性信息系统的建设虽起步较晚,但由于我国政府

的重视和科研人员的努力。开展了一系列的研究和

建设工作,我国生物多样性数据库的开发已具有一

收稿日期:2007—05一15

基金项目:贵州省科技厅年度计捌项目。贵州省数字化生物标本馆的研究与建设。[附科合计字(2002)2006号]

作者葡介:张伦(1957一).男,副研究员,硬士,从事生物技术研究,E-mail:dumf)un570617@163.corn口

定的基础。有关专家指出,根据我国生物多样性数据库的开发现状及今后发展需要,应优先开发、完善和改造药用生物资源、生物标本等类型的数据库。数字化生物标本馆主要研究生物标本管理中信息化和网络化的理论和方法。它对于解决标本管理中存

在的数据分散、保存方法落后、查询困难、利用率低

等都具有重要意义。

贵州省生物标本信息资源是贵州省信息资源的重要组成部分,是基础性、战略性资源。是完成贵州

省委、省政府提出的实现“数字化贵州”的重要工作

内容之一。贵州省数字化生物标本馆的研究与建设

对贵州生物资源数字化建设具有积极的促进作用。

1研究方法

结合植物、动物、微生物学(真菌)研究基础和

5期张伦等:贵州省数字化生物标本馆的研究与建设

表I贵州省数字化生物标本馆植物标本表字段结构标准

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950●^袁t幸^∞卷

裹2贵州省数字化生翱标本馆动物标本寰宇段结构标准

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5期张伦等:贵州省数字化生物标本馆的研究与建设951

裹3贵州省数宇化生物标本馆微生袖标本寰宇段结构标准

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●南袁土●■20卷

传统标本管理方法,采用电子化、数字化的存贮技术,通过数据库计算机技术、多媒体处理技术和网络传输技术“。1,对已有的贵州省生物标本资源信息进行分析、筛选并数字化,初步探索建设贵州省数字化生物标本馆的有效途径,积累比较完整的科学资料;由此促进贵州省生物标本管理的信息化和网络化。

2结果与分析

2.1贵州省生物标本信息化标准体系的建立建立了贵州省生物标本信息化标准体系。包括馆藏信息、物种信息、形态、生境、用途、资源状况等。其中,植物标本部分包括46个字段信息.并采用了国家标准“植物分类物种代码”(GB/T14467-93)”1对标本物种信息进行编排;动物标本部分包括37个字段信息;微生物(真菌)标本部分包括44个字段信息。各部分标本表结构标准见表1一表3。2.2贵州省数宇化生物标本馆管理信息系统软件殛其局域网

在综合参考相关软件及应用系统的基础上,在充分考虑生物标本资源信息管理、科学研究和开发应用的基础上,开发了“贵州省数字化生物标本馆”管理信息系统软件,并建成一小型局域网。该系统是在Windows2000环境下进行研发的,系统以Pow.erbu//der9.0”。1作前端开发工具编写而成,并用SQLServer【91作为服务端开发工具。系统具有界面友好、功能众多、运行较快、可维护性强、兼容性好等特点.适合于大型数据库的管理。系统的功能模块结构图如下(图1):

田1贵州省数宇化生物标本馆管理系统功能模块结构圈

Fig1TheqkciallzedinformationmanagementgystemusedinGuizhouI)iotaBidodcaISpoelme,,Museum2.3贵州省生物标本管理信息系统和贵州省数字化生物标本馆的功能

建立了能存储40万个数据的贵州省生物标本管理信息系统和贵州省数字化生物标本馆。

其具有的功能是:用户管理;生物标本数据分类管理;标本数据的输人(添加、复制添加)、浏览、修改、保存及删除;标本图象和声音的输入、输出;数据录入记录数;标本数据的查询;标本数据的打印输出及数据转换;数据的备份和恢复;帮助文档和标本馆介绍。

现有数据植物标本资源信息61科、170属、712种(变种),动物标本资源信息41科、134属、296种和微生物(真菌)标本资源信息27科、69属、195种进行查询和名录生成。

2.4实现了网上生物标本资源信息发布

通过多媒体处理技术和网络传输技术的应用,对贵州省数字化生物标本馆数据库中现有数据进行了整合处理,将其按植物标本、动物标本、微生物标本三个模块分别设计成超文本文件html格式,并按科、属、种的镶套层次进行布局,放置于贵州科学院网站http://www.乎skxy.corn贵州省生物研究所网页上。使用者可通过网页上相关链接浏览到贵州省数字化生物标本馆的植物种类学名、中文名称、拉丁科名、中文科名、拉丁属名、中文属名、在省内的分布市(县)以及标本存放位置等信息i实现了网上生物标本资源信息发布。以植物标本为例,使用者通过点击网页上的“植物”一“银杏科”一“银杏属”.便可浏览到贵州省银杏属下的植物种类学名、中文名称、拉丁科名、中文科名、拉丁属名、中文名、在省内的分布市(县)以及标本存放位置等信息。

3讨论

数字生物标本馆是一个新生事物.它不可避免地存在一些缺陷,例如保存问题、网络安全问题等”…。保存问题,以植物标本为例,利用数字图像技术处理大量的腊叶植物标本或活的植物,再依靠计算机存储技术,对植物标本图像进行适当的格式转换和压缩处理,以刻录在光盘上或存储在VOD服务器大硬盘上.无疑是现在最先进的植物标本保存手段,它具有节省空间、资源共享等优点.这是传统植物标本馆望尘莫及的。但也是很容易忽视或者放弃对现存的植物标本的防虫防霉等传统的保护手段.以至于误人歧途。在数字生物标本馆中标本信息以l和0的方式依附在某种物理载体上,它的寿

5期张伦等:贵州省数字化生物标本馆的研究与建设

命完全依赖其物理载体的寿命了。一旦物理载体出现问题,大量的标本信息就有面临消失的可能。网络安全问题,数字生物标本馆本身就是一个局域网,计算机网络的安全直接决定了数字生物标本馆的安全,计算机网络病毒无所不在,已成为计算机网络系统的一大严重威胁。何况计算机系统赖以正常运转的操作系统还存在着这样或那样的不足,也影响着数字生物标本馆的安全。因此,数字生物标本馆的形势也是异常严峻。因此,数字化生物标本信息资源的大规模存储和长期保存以及网络安全问题是当前数字生物标本馆发展中的主要矛盾。这是在建设数字化生物标本馆中应考虑的问题。

在贵州省数字化生物标本馆的研究与建设过程中,还存在如下具体问题。首先是数据录入记录数较少。由于研究时间的限制和对馆藏标本有选择的取舍,还须有关专家在分类系统和标本鉴定上严格把关;因此,迄今为止数据录人记录数总计仅8435条(图像7553幅),共计130科、382属、1291余种。二是软件设计方面仍需完善。与其它的数据库软件相比,现有软件系统应该说是具有较多功能的。但是,该系统在数据库产品发布、阿络建设、网上数据交流、数据加密和图形图象处理上还有待进一步加强和完善。

阐述了建立贵州省生物标本信息化标准体系的原则;应用Powerbuilder9.O作为前端开发工具,并用SQLServer作为服务端开发工具建成了贵州省数字化生物标本馆管理系统和数据库,该系统和数据库至少能存储40万份标本数据。

数据录入记录数目前总计8435条(图像7553幅),共计130科、382属、1291余种;其中植物标本资源信息6l科、170属、712种(变种),动物标本资源信息4l科、134属、296种和微生物(真菌)标本资源信息27科、69属、195种。

实现了网上生物标本资源信息发布。

贵州省数字化生物标本馆正在获得明显的社会效益和潜在的经济效益.同时也为展示贵州的生物资源,扩大贵州的影响提供了良好的窗口。

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(责任编辑高缸卫)

贵州省数字化生物标本馆的研究与建设

作者:张伦, 林昌虎, 陈翔, 何凡锋, 李峰, 陈谦海, ZHANG Lun, LIN Chang-hu, CHEN Xiang, HE Fan-feng, LI Feng, CHEN Qian-hai

作者单位:张伦,陈翔,李峰,陈谦海,ZHANG Lun,CHEN Xiang,LI Feng,CHEN Qian-hai(贵州省生物研究所,贵州,贵阳,550009), 林昌虎,LIN Chang-hu(贵州科学院,贵州,贵阳,550001), 何凡锋

,HE Fan-feng(贵阳宏远计算机软件开发有限公司,贵州,贵阳,550001)

刊名:

西南农业学报

英文刊名:SOUTHWEST CHINA JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES

年,卷(期):2007,20(5)

被引用次数:1次

参考文献(10条)

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ZOU Rong.YU Xi-Xi广西植物标本馆标本数字化信息统计与分析-广西植物2008,28(2)

为更了解广西植物标本馆概况与各类标本构成情况,该文以标本馆信息数据库的标本信息为基础,分别从标本的种类、石山植物标本、采集地、采集年代及采集人等5个方面进行了统计与分析.结果显示,在统计的20万份维管植物标本中,共隶属314科2 504属11 452种;石山植物标本份数占45.35%,含205科1 021属2 700种;广西采集的标本份数最多,共100 372份占总份数的50.19%;在50年代标本采集量最大,达87 997份占总份数的44.00%.并提出了几点建议.

引证文献(1条)

1.姚虹.孔红.马建军廊坊师范学院植物标本室的现状与建设[期刊论文]-廊坊师范学院学报(自然科学版)

2009(5)

本文链接:https://www.doczj.com/doc/217775218.html,/Periodical_xnnyxb200705015.aspx

授权使用:河北农业大学(hbnydx),授权号:bcbc2276-55a8-4a34-b14d-9df3012a5d01

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