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western内参GAPDH

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刚开始接触western,看了很多和内参有关的资料,越来越迷惑。

请教园子里的高手:1 内参的主要作用是什么,是必须的吗? 2 内参是和样品一起加,还是单独加,抗体孵育时是分着加,还是一起,条件一致吗?3 单是证明是否样品中存在某蛋白,不用内参可以吗?

请赐教!

1、在实验中,可能存在总蛋白浓度测定不准确;或者蛋白质样品在电泳前上样时产生的样品间的

操作误差;这些误差需要通过测定每个样品中实际转到膜上的GAPDH 的含量来进行校正,所以一般的western实验都需要进行内参设置。具体校正的方法就是将每个样品测得的目的蛋白含量与本样品的GAPDH 含量相除,得到每个样品目的蛋白的相对含量。然后才进行样品与样品之间的比较。

所以有时候要用内参

2、和一抗一起加,按照内参的比例加

3、可以不用加内参

1.内参是样品中本身就有的,有其一定的分子量。一抗.二抗时得分开孵育。

2.只是定性的话不需要加内参

Western Blot除了能证明某样品中含有某种蛋白之外,其最为重要的作用是比较不同条件下或者不同组织中,目的蛋白表达量的相对多少。即为蛋白表达水平最直接的证据。

要衡量蛋白的表达水平,前提条件就是等量的上样量。内参的意义就是保证上样量的一致。内参即是内部参照(Internal Control),对于哺乳动物细胞来说一般是指由管家基因编码表达的蛋白(Housekeeping Proteins),它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测蛋白的表达水平变化时常用它来做参照物。如果内参的条带亮度基本一致,那么就可以认为上样量也基本一致。

常用的蛋白质内参有GAPDH(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)和细胞骨架蛋白beta-actin或beta-tubulin。最近发现tubulin的表达水平比其它看家基因更加恒定。因此人们越来越多的使用tubulin做为内参。

在Western Blotting实验过程中使用内参的方法有:

一、超级简便的标记内参使用法:只要在二抗孵育时加入HRP标记内参抗体,按照正常操作即可。

二、普通内参:当目的蛋白的分子量大小与选用的内参蛋白分子量相差不大时,可以先进行目的蛋白的抗体温育显色和检测。然后使用Strip缓冲液洗掉膜上的抗体,重新进行内参蛋白的抗体温育、显色检测。

三、(也是我们实验室用的方法)当目的蛋白的分子量大小与选用的内参蛋白分子量大小相差比较明显情况下,可以在转膜后预染,根据蛋白质Marker的大小将膜剪为大分子量和小分子量两部分,使内参蛋白与目的蛋白分开。然后两块膜分别与内参蛋白抗体以及目的蛋白抗体进行温育,二抗温育以及显色。

很感谢大家的帮助,现在总算明白了一些

ImageJ对WesternBlot进行灰度分析

Image J 对Western blot 条带进行灰度分析 Image J软件:Windows 版本 第一步:软件安装 1.下载地址:https://www.doczj.com/doc/0b13618282.html,/ij/download.html 2.下载windows 32位带Java版本,双击软件安装。 第二步:界面介绍 1.软件界面 第三步:图片分析 1.下图为样板图片 2.导入图片:File> Open> Sample1.jpg 图片导入后,Sample1.jpg在新的窗口中打开

3.图片类型设置:Image> Type> 8 bit 4.去除图片背景:Process> Subtract Background> …

4.1Subtract Background 窗口:Rolling ball radius 设为50 pixels, 勾选light background,可选preview,点击“OK”确定 5.工具栏:选择“矩形选框”

6.最大化“Sample1.jpg”窗口,便于矩形选择,矩形选择第一个泳道 7.标记“矩形选框”为1:矩形选择后,调整矩形至合适大小,按下数字键 “1”,或者Analyze> Gels> Select Fist Lane。 8.选择“泳道2”:拖动“1”的矩形框,会出现两个矩形选框,拖动矩形框 至泳道2,调整位置,并按下数字键“2”,Image J 会自动调整大小使“矩形框2”与“矩形框1”保持同一水平。 9.继续拖动,会出项新的“矩形选框”,调增至泳道3,并按下数字键“2” (注意:是按下数字键“2”),重复9至6个泳道全部选择。 10.所有泳道选择后,按下数字键“3”,出现分析图谱。

western blot条带分析

近几天回答了蛋白版几个有关压片和显影的帖子,发现在这一块还没有比较系统的论述。特贡献了western显影常见问题及解决方案,是我的经验总结,以供大家参考。其中绝大部分问题是我所遇到过的,其他个别我没遇到过的是参照pierce公司的说明书。限于字数,语言比较简洁,如对其中内容有疑问或建议可跟帖。 Western荧光检测取决于抗原含量—一抗敏感度—二抗敏感度—底物敏感度—显影和定影效率这一系统。我的经历认为确保万无一失的做法是如果看到荧光则压10~30s,看不到则同时压两张,10~30min洗一张,如果无则再补一张,1h后洗。再无,则压过夜。共3张片,根据每次结果调整。 其中两张片子的压法如下描述: 先剪一张比膜长2~3厘米的片子(以供贴胶带),然后剪2片细小透明胶带贴到片子的左右两边(贴时胶带留一半用于粘到封口膜上),然后将片子压到膜上,并使透明胶带留出的一半粘到封口膜上。这样就固定了第一张胶片,就不会因为放、取第二张胶片而使第一张移动了。然后放第二张胶片,与第一张片子贴在一起就行,注意片子要干燥,压片前用纸擦干封口膜,以避免被底物液体污染导致与下面一张粘在一起。取时用手轻轻拂过就可以把上面片子与下面一张错开了,不要用手抠,否则下面一张也移动了。在洗下面一张片子时一定要取掉粘在片子上的胶带,否则在胶带的地方会影响显影。荧光经过下面一张胶片会稍微有些衰减,所以下面一张胶片感光稍微比上面一张强一些。 现象-- - - - - - - - - - - - - - - - - - --原因- - - - - - - - - - - - - - - - --- -- -- --- -- ---解决 反影(白色条带,黑色背景) ---- -- -1 HRP过高(背景较高) - - - - - - - - ---- - - - 至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注1 显影后膜上条带处变为黄色---- - -2 HRP过高(敏感性太高)- - - - - - - - - ---- -至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注2 信号弱或无---- - - - - - - - - - ---- 3 HRP过高引起底物迅速耗竭- - - - - -- - - -至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注3 --- - - - - - - - - - - - - - ---- - - - --4 抗体-抗原系统敏感性过低- --- - - - - - - 提高抗体浓度/蛋白上样量*注4 - - - - - - - - - - - - - - - ---- - - - --5 转膜不充分/过转- -- -- - - -- - - - - ---- -优化转膜条件*注5 -- - - - - - - - - - - - - - ---- - - - - -6 HRP或底物活性降低---- - - -- - - -- - ----测试活性或选用敏感底物*注6 高背景---- - - - - - - - - - - - - - - -7 HRP过高(背景较高) - -- - - - - - - - - - -- 至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注7 ---- - - - - - - - - - - - - - --- - - ----8 封闭时间不足- - - - - - - - - - - -- - - - -- 延长封闭时间4度过夜最好*注8 --- - - - - - - - - - - - - - --- - -- -- -9 抗体与封闭液有交叉----- - - - - - - - - - -更换封闭液(如3%BSA的TBST)*注9 --- - - - - - - - - - - - - - - -- - -- - -10 TBST洗脱不足- - - - - - - ---- - --- - - -增加洗脱时间、次数、用量*注10 ---- - - - - - - - - - - - - - -- - -- - --11 暴光时间过长- - - - - ---- - - ------ -- --降低暴光时间*注11 - - - - - - - - - - - - - - - - -- - - ----12 抗原-抗体浓度过高- - - - - - -- --- - - - 降低抗体浓度或蛋白上样量*注12

westernblot详细图解

Western免疫印迹(Western Blot)是将蛋白质转移到膜上,然后利用抗体进行检测的方法。对已知表达蛋白,可用相应抗体作为一抗进行检测,对新基因的表达产物,可通过融合部分的抗体检测。 与Southern或Northern杂交方法类似,但Western Blot采用的是聚丙烯酰胺凝胶电泳,被检测物是蛋白质,“探针”是抗体,“显色”用标记的二抗。 经过PAGE分离的蛋白质样品,转移到固相载体(例如硝酸纤维素薄膜)上,固相载体以非共价键形式吸附蛋白质,且能保持电泳分离的多肽类型及其生物学活性不变。以固相载体上的蛋白质或多肽作为抗原,与对应的抗体起免疫反应,再与酶或同位素标记的第二抗体起反应,经过底物显色或放射自显影以

检测电泳分离的特异性目的基因表 达的蛋白成分。该技术也广泛应用 于检测蛋白水平的表达。 实验材料蛋白质样品 试剂、试剂盒丙烯酰胺SDS Tris-HCl β-巯基乙醇 ddH2O 甘氨酸Tris 甲醇PBS NaCl KCl Na2HPO4 KH2PO4 ddH2O 考马斯亮兰乙酸脱脂奶粉硫酸镍胺H2O2 DAB试剂盒 仪器、耗材 电泳仪电泳槽离心机离心管硝酸纤维素 膜匀浆器剪刀移液枪刮棒 实验步骤一、试剂准备 1. SDS-PAGE试剂:见聚丙烯酰胺凝胶电泳实验。 2. 匀浆缓冲液:1.0 M Tris-HCl(pH 6.8) 1.0 ml;10%SDS 6.0 ml;β-巯基乙醇0.2 ml;ddH2O 2.8 ml。 3. 转膜缓冲液:甘氨酸2.9 g;Tris 5.8 g;SDS 0.37 g;甲醇200 ml;加ddH2O定容至1000 ml。

WesternBlot结果条带分析

W e s t e r n B l o t结果条带 分析 Revised final draft November 26, 2020

W e s t e r n B l o t结果条带全面分析 1.空白 原因:比较多,如果单纯一张没有任何显色,最可能是一抗加成其他抗体,或者二抗种属加错了,比如兔的加成鼠的。 解决办法:仔细检查抗体是否加错,确认转膜没有问题。上面的图片展示的是一点信号都没有,如果是这样大部分情况是抗体加错了。如果中间出现了细微的条带,可能原因是蛋白上样量太少,一抗浓度过低,显色液失效。另外如果转膜出现了问题,比如膜放反了,自然是一个白片。 2.高背景 原因:封闭不够好,一抗浓度高,洗膜时间和次数不够。 解决办法:降低一抗浓度,增加洗膜时间和次数。 3.非特异性条带 原因:一抗非特异性与蛋白结合 解决办法:更换一抗 4.条带中出现边缘规则的白圈 原因:电转中膜和胶之间存在气泡。 解决办法:转膜前去掉膜和胶之间的气泡 5.出现黑点和黑斑 原因:膜上其他部位与一抗或者二抗非特异性结合 解决办法:封闭结束之后要洗。 6.条带拖尾 原因:蛋白量太大,一抗浓度和时间太长 解决办法:根据情况调整蛋白量,同时一抗浓度和时间也可以缩短。 7.出现非均一性背景 原因:膜可能曾经干过 解决办法:在每一步的操作过程中,都需要注意不要让膜干。 8.某个条带变形 原因:SDSPAGE胶中存在气泡或者某不溶性颗粒 解决办法:配胶过程中要小心,使用无杂质的液体。另外配胶用的水,SDS,Tris缓冲液要注意不要有杂质。 9.条带呈哑铃状 原因:配置胶有问题,胶凝固后不均一 解决办法:把胶配好,不合格的胶坚决不用 10.最边缘条带弯曲 原因:电泳电流不均一 解决办法:换用新的电泳槽;不使用两边的两孔 其他问题 (1)蛋白分子量偏高或者偏低。可能是胶的浓度与目的蛋白的浓度不对应。 (2)蛋白质降解。蛋白质降解后很可能会在比原来位置低的地方出现主带,然后会出现一些其他带,最主要特点是所有的条带比正常的都低,并且条带模糊不清晰。 (3)所有条带连成一片没有间隔。原因最可能是上样量过多,其次是样品弥散(比如电泳长时间停止样品弥散)。 (4)整个条带呈“︶”状:凝胶冷却不均一,电泳槽老化。 (5)整个条带呈“︵”:凝胶左右两头没有凝固好 (6)溴酚蓝拖尾:样品溶解不好。 (7)纵向的纹理:上样样品中存在不溶性颗粒 (8)溴酚蓝很粗:浓缩胶浓缩效果不好,可能是浓缩胶太短,或者是浓缩胶配错。

蛋白质印迹法westernblot

蛋白质印迹法 蛋白质印迹法(免疫印迹试验)即Western Blot。它是分子生物学、生物化学和免疫遗传学中常用的一种实验方法。 其基本原理是通过特异性抗体对凝胶电泳处理过的细胞或生物组织样品进行着色。通过分析着色的位置和着色深度获得特定蛋白质在所分析的细胞或组织中表达情况的信息。 蛋白免疫印迹(Western Blot )是将电泳分离后的细胞或组织总蛋白质从凝胶转移到固相支持物NC膜或PVDF膜上,然后用特异性抗体检测某特定抗原的一种蛋白质检测技术,现已广泛应用于基因在蛋白水平的表达研究、抗体活性检测和疾病早期诊断等多个方面。 中文名蛋白质印迹法外文名Western Blot 蛋白免疫印迹Western Blot 类似方法1 Southern Blot 杂交方法 类似方法2 Northern Blot 杂交方法 使用材料聚丙烯酰氨凝胶电泳⑴

原理 与Southern Blot 或Northern Blot 杂交方法类似,但Western Blot法采用的是聚丙烯酰胺凝胶电泳,被检测物是蛋白质,“探针”是抗体,“显色”用标记的二抗。经过PAG(聚丙烯酰胺凝胶电泳)分离的蛋白质样品,转移到固相载体(例如硝酸纤维素薄膜)上,固相载体以非共价键形式吸附蛋白质,且能保持电泳分离的多肽类型及其生物学活性不变。以固相载体上的蛋白质或多肽作为抗原,与对应的抗体起免疫反应,再与酶或同位素标记的第二抗体起反应,经过底物显色或放射自显影以检测电泳分离的特异性目的基因表达的蛋白成分。该技术也广泛应用于检测蛋白水平的表达。⑴ 分类 Western Blot 显色的方法主要有以下几种: i. 放射自显影 ii. 底物化学发光ECL iii. 底物荧光ECF iv. 底物DAB呈色

westernblot详细图解详细版.docx

Western免疫印迹(Western Blot) 是将蛋白质转移到膜上,然后利用 抗体进行检测的方法。对已知表达 蛋白,可用相应抗体作为一抗进行 检测,对新基因的表达产物,可通 过融合部分的抗体检测。 与Southern或Northern杂交方法 类似,但Western Blot采用的是聚 丙烯酰胺凝胶电泳,被检测物是蛋 白质,“探针”是抗体,“显色”用标记 的二抗。 经过PAGE分离的蛋白质样品,转 移到固相载体(例如硝酸纤维素薄 膜)上,固相载体以非共价键形式 吸附蛋白质,且能保持电泳分离的 多肽类型及其生物学活性不变。以 固相载体上的蛋白质或多肽作为抗 原,与对应的抗体起免疫反应,再 与酶或同位素标记的第二抗体起反 应,经过底物显色或放射自显影以 检测电泳分离的特异性目的基因表 达的蛋白成分。该技术也广泛应用 于检测蛋白水平的表达。 实验材料蛋白质样品 试剂、试剂盒丙烯酰胺SDS Tris-HCl β-巯基乙醇 ddH2O 甘氨酸Tris 甲醇PBS NaCl KCl Na2HPO4 KH2PO4 ddH2O 考马斯亮兰乙酸脱脂奶粉硫酸镍胺H2O2 DAB试剂盒 仪器、耗材电泳仪电泳槽离心机离心管硝酸纤维素膜匀浆器剪刀移液枪刮棒 实验步骤一、试剂准备 1. SDS-PAGE试剂:见聚丙烯酰胺凝胶电泳实验。 2. 匀浆缓冲液:1.0 M Tris-HCl(pH 6.8) 1.0 ml;10%SDS 6.0 ml;β-巯基乙醇0.2 ml;ddH2O 2.8 ml。 3. 转膜缓冲液:甘氨酸2.9 g;Tris 5.8 g;

SDS 0.37 g;甲醇200 ml;加ddH2O定容至1000 ml。 4. 0.01 M PBS(pH7.4):NaCl 8.0 g;KCl 0.2 g;Na2HPO4 1.44 g;KH2PO4 0.24 g;加ddH2O至1000 ml。 5. 膜染色液:考马斯亮兰0.2 g;甲醇80 ml;乙酸2 ml;ddH2O118 ml。包被液(5%脱脂奶粉,现配):脱脂奶粉1.0 g 溶于20 ml的0.01 M PBS中。 6. 显色液:DAB 6.0 mg;0.01 M PBS 10.0 ml;硫酸镍胺0.1 ml;H2021.0 μl。 二、蛋白样品制备 1. 单层贴壁细胞总蛋白的提取 (1)倒掉培养液,并将瓶倒扣在吸水纸上使吸水纸吸干培养液(或将瓶直立放置一会儿使残余培养液流到瓶底然后再用移液器将其吸走)。 (2)每瓶细胞加3 ml 4℃预冷的PBS (0.01M pH7.2~7.3)。平放轻轻摇动1 min 洗涤细胞,然后弃去洗液。重复以上操作两次,共洗细胞三次以洗去培养液。将PBS弃净后把培养瓶置于冰上。 (3)按1ml裂解液加10 μl PMSF(100 mM),摇匀置于冰上。(PMSF要摇匀至无结晶时才可与裂解液混合。) (4)每瓶细胞加400 μl含PMSF的裂解液,于冰上裂解30 min,为使细胞充分裂解培养瓶要经常来回摇动。 (5)裂解完后,用干净的刮棒将细胞刮于培养瓶的一侧(动作要快),然后用枪将细胞碎片和裂解液移至1.5 ml离心管中。(整个操作尽量在冰上进行。) (6)于4℃下12000 rpm离心5 min。(提

western-blot条带分析及解决方法

*注1其具体问题有二:一是背景较高,二是没有条带?形成机制为条带处HRP很快将底物耗竭,则不发光不使胶片感光而为白色,周围因背景H R P较低而持续发光一段时间使胶片感光为黑色。这种常见于高浓度抗体并且封闭/洗脱不好的情况下。如果没有背景则就是原因3的现象。在暗室可以看到

条带周围荧光而条带处为暗。如是则要么通过降低抗体解决,要么动作迅速早期未耗竭底物时压片,否则一旦耗竭通过减少压片时间不能解决问题。也可以过一段时间鼿RP稍减后重加底物迅速压片。还有另外一种反影现象就是压出条带粗大模糊,但条带中心是空的白色,原因和上面的一样,主要是条带中心耗竭底物引起的,也可以在暗室看到中空的荧光带,但与上面的区别主要在于特异性要好一些,若继续发展则就是原因3的现象。其分析和解决同上。 *注2其原因主要是HRP太高超速催化底物生成的产物使膜发黄,压出的片子可以是正常的或和原因1或原因3的现象同时存在,只是一种现象,在压过的膜可以看出来(只在加底物后一段时间出现,几小时后可能还会消退,有时甚至刚加底物1~2min就可以看出来,所以要把握时机)。如果没有 达到原因1和原因3的程度,那么这种情况一定能够看到很强的荧光,是一种良好的状态,是我们所期盼的。如果压出正常片子而不出现原因1和原因3的现象,可以不予处理。但因为荧光太强极易导致条带增粗变大,所以也可以不稀释抗体而通过调整压片时间来解决,一般压10s~30s,甚至可以3~5s,即时根据结果在暗室调整,荧光持续时间长的话都可连续压十数张片子而效果良好。但也有这种情况,就是由于HRP过强无论怎么减少压片时间条带都依然粗大(如果时间过短如<3s则可因感光不足导致条带太淡,这样就不可取了,但依然是粗大的、非条带的本来面目),那么如果想获得漂亮条带则必须通过降低抗体浓度(减少上样量很不稳定且能力有限,故很少使用)来解决。原因1和3若如是则解决也是一样的。 *注3这是与1类似但抗体特异性较好时的一种表现,经常与下面的原因4、5、6混淆,特别需要注意。主要出现在HRP极高的情况下,来不及压片就已耗竭底物,往往伴有原因2的现象。可通过加入底物后迅速进入暗室观察荧光确定,也可以根据原因2的现象确定,以区分于原因4、5、6。 除非动作迅速早期未耗竭底物时压片,否则一旦耗竭通过减少压片时间不能解决问题。也可以过一段时间待HRP稍减后TBST简单洗膜重新加底物压片。这种情况下一/二抗稀释可高达10倍而依然荧光明显。 *注4提高抗体上样量以及下述的使用敏感底物/延长压片时间比较简单,在此不赘述,只提醒一下随抗体浓度增高背景和非特异性可能会增加。关于上样量的极限在此发表我的看法:对于裂解的混合蛋白以上样孔底面积(平方毫米)乘30ug作为极限上样量,而落实到每一个具体条带(同一分子量的 所有蛋白或仅做单一蛋白电泳),则以0.3ug/平方毫米底面积作为极限上样量。(见《抗体技术实验指南》的免疫印迹一章),超过此量可能会导致条带变形。条带信号弱可以通过加大上样量/提高抗体浓度/使用敏感底物/延长压片时间解决。但实际上样量的极限并不以我说的极限上样量为准,因为这个极限上样量是确保所有分子量的条带都跑的很漂亮的极限,而上样超量的表现是随量的加大变形的条带由低分子量逐渐往高分子量延伸。 所以western极限上样量的真正操作标准是以目的条带不变形作为极限。比如对于150kd,完全可以超出我所说的极限上样量的2倍而不变形(此时中低分子量条带早已融合或挤为棒槌形了)

Westernblot实验步骤及注意事项

Westernblot实验步骤及注意事项 Westernblot 实验步骤 1. 组织块称重 2. 利用液氮、研钵粉碎组织块 3. 加入RIPA缓冲液(每克组织3 ml RIPA),PMSF(每克组织30μl,10 mg/ml PMSF),利用Polytron进一步匀浆(15,000转/分*1分钟)维持4℃ 4. 加入PMSF(每克组织30μl,10 mg/ml PMSF),冰上孵育30分钟 5. 移入离心管4℃约20,000 g(约15,000转)15分钟 6. 上清液为细胞裂解液可分装-20℃保存 7. 进行Bradford比色法测定蛋白质浓度 8. 取相同质量的细胞裂解液(体积*蛋白质浓度),并加等体积的2×电泳加样缓冲液 9. 沸水浴中3分钟 10. 上样 11. 电泳(浓缩胶20mA,分离胶35mA) 12. 电转膜仪转膜(100mA 40分钟) 13. 膜用丽春红染色,胶用考马斯亮蓝染色 14. Westernblot 试剂盒显色 15. 分析比较记录 western blot的实验步骤及注意事项的资料 1. 把聚丙烯酰胺凝胶中的蛋白质电泳转移到硝酸纤维膜上。 1)转移缓冲液洗涤凝胶和硝酸纤维素膜,将硝酸纤维素膜铺在凝胶上,用5ml移液管在凝胶上来回滚动去除所有的气泡。 2)在凝胶/滤膜外再包一张3mm滤纸(预先用转移缓冲液浸湿),将凝胶夹在中间,保持湿润和没有气泡。薄膜滤纸按照厂家建议方法放入电泳装置中,凝胶面向阴极。/凝胶/)将此滤纸3.

4)将上述装置放入缓冲液槽中,并灌满转移缓冲液以淹没凝胶。 5)按照厂家所示接通电源开始电泳转移。 6)转移结束后,取出薄膜和凝胶,弃去凝胶。 2. 将薄膜漂在氨基黑中快速染色,直至分子量标准显现时取出,记录下标准位置。 3. 用100ml水洗涤纤维素膜,必要时可用脱色缓冲液。 4. 膜置印迹缓冲液中于37℃保温1小时。 5. 室温下,用PBS-Tween缓冲液洗涤薄膜。 6. 用封口机将薄膜封入塑料袋中,尽可能不留空气。 7.袋的一角剪一缓冲液的小口,用透析袋夹紧。 8.混合:NGS(100微升),印迹缓冲液中的抗体(10毫升),加在装薄膜的袋中,于室温下摇动2小时(或4℃过夜) 9.用总体积300ml PBS-Tween缓冲液,分4次在一浅盘中洗涤薄膜,每次75ml。 10.将连接生物素的羊抗兔IgG(40微升溶于10毫升印迹缓冲液/100微升NGS)加在袋内,于室温下摇动1小时。 11.按步骤9洗涤。 12.加入抗生素蛋白-HRP(40微升溶于10毫升印迹缓冲液/100微升NGS),于室温下摇动。 注意事项: western blot中转移在膜上的蛋白处于变性状态,空间结构改变,因此那些识别空间表位的抗体不能用于western blot检测。这种情况可以将表达目的蛋白的细胞或细胞裂解液中的所有蛋白先生物素化,再用酶标记亲和素进行western blot。实验中取胶和膜需带手套。 Western实验步骤 Western,也称Western blot、Western blotting、Western印迹,是用抗体检测蛋白的重要方法之一。Western 可以参 考如下步骤进行操作。 1. 收集蛋白样品(Protein sample preparation) O 可以使用适当的裂解液,例如碧云天生产的Western及IP细胞裂解液,裂解贴壁细胞、悬浮细胞或组织样品。对于某些特定的亚 细胞组份蛋白,例如细胞核蛋白、细胞浆蛋白、线粒体蛋白等,可以参考相关文献提取这些亚细胞组份蛋白,也可以使用试剂盒 进行抽提,例如碧云天生产的细胞核蛋白与细胞浆蛋白抽提试剂盒。 O 收集完蛋白样品后,为确保每个蛋白样品的上样量一致,需要测定每个蛋白样品的蛋白浓度。根据所使用的裂解液的不同,需要 采用适当的蛋白浓度测定方法。因为不同的蛋白浓度测定方法对于一些去垢剂和还原剂等的兼容性差别很大。如果使用碧云天生

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条带周围荧光而条带处为暗。如是则要么通过降低抗体解决,要么动作迅速早期未耗竭底物时压片,否则一旦耗竭通过减少压片时间不能解决问题。也可以过一段时间鼿RP稍减后重加底物迅速压片。还有另外一种反影现象就是压出条带粗大模糊,但条带中心是空的白色,原因和上面的一样,主要是条带中心耗竭底物引起的,也可以在暗室看到中空的荧光带,但与上面的区别主要在于特异性要好一些,若继续发展则就是原因3的现象。其分析和解决同上。 *注2 其原因主要是HRP太高超速催化底物生成的产物使膜发黄,压出的片子可以是正常的或和原因1或原因3的现象同时存在,只是一种现象,在压过的膜可以看出来(只在加底物后一段时间出现,几小时后可能还会消退,有时甚至刚加底物1~2min就可以看出来,所以要把握时机)。如果没有达到原因1和原因3的程度,那么这种情况一定能够看到很强的荧光,是一种良好的状态,是我们所期盼的。如果压出正常片子而不出现原因1和原因3的现象,可以不予处理。但因为荧光太强极易导致条带增粗变大,所以也可以不稀释抗体而通过调整压片时间来解决,一般压10s~30s,甚至可以3~5s,即时根据结果在暗室调整,荧光持续时间长的话都可连续压十数张片子而效果良好。但也有这种情况,就是由于HRP过强无论怎么减少压片时间条带都依然粗大(如果时间过短如<3s则可因感光不足导致条带太淡,这样就不可取了,但依然是粗大的、非条带的本来面目),那么如果想获得漂亮条带则必须通过降低抗体浓度(减少上样量很不稳定且能力有限,故很少使用)来解决。原因1和3若如是则解决也是一样的。 *注3 这是与1类似但抗体特异性较好时的一种表现,经常与下面的原因4、5、6混淆,特别需要注意。主要出现在HRP极高的情况下,来不及压片就已耗竭底物,往往伴有原因2的现象。可通过加入底物后迅速进入暗室观察荧光确定,也可以根据原因2的现象确定,以区分于原因4、5、6。除非动作迅速早期未耗竭底物时压片,否则一旦耗竭通过减少压片时间不能解决问题。也可以过一段时间待HRP稍减后TBST简单洗膜重新加底物压片。这种情况下一/二抗稀释可高达10倍而依然荧光明显。 *注4 提高抗体上样量以及下述的使用敏感底物/延长压片时间比较简单,在此不赘述,只提醒一下随抗体浓度增高背景和非特异性可能会增加。关于上样量的极限在此发表我的看法:对于裂解的混合蛋白以上样孔底面积(平方毫米)乘30ug作为极限上样量,而落实到每一个具体条带(同一分子量的所有蛋白或仅做单一蛋白电泳),则以0.3ug/平方毫米底面积作为极限上样量。(见《抗体技术实验指南》的免疫印迹一章),超过此量可能会导致条带变形。条带信号弱可以通过加大上样量/提高抗体浓度/使用敏感底物/延长压片时间解决。但实际上样量的极限并不以我说的极限上样量为准,因为这个极限上样量是确保所有分子量的条带都跑的很漂亮的极限,而上样超量的表现是随量的加大变形的条带由低分子量逐渐往高分子量延伸。所以western极限上样量的真正操作标准是以目的条带不变形作为极限。比如对于150kd,完全可以超出我所说的极限上样量的2倍而不变形(此时中低分子量条带早已融合或挤为棒槌形了) 文案大全

最详细的WesternBlot过程步骤详解

最详细的W e s t e r n B l o t 过程步骤详解

最详细的W e s t e r n B l o t 过程步骤详解 Pleasure Group Office【T985AB-B866SYT-B182C-BS682T-STT18】

Western Blot详解(原理、分类、试剂、步骤及问题解答) Western免疫印迹(Western Blot)是将蛋白质转移到膜上,然后利用抗体进行检测。对已知表达蛋白,可用相应抗体作为一抗进行检测,对新基因的表达产物,可通过融合部分的抗体检测。 本文主要通过以下几个方面来详细地介绍一下Western Blot技术: 一、原理 二、分类 i.放射自显影 ii.底物化学发光ECL ECF iv.底物DAB呈色 三、主要试剂 四、主要步骤 五、实验常见的问题指南 1.参考书推荐 2.针对样品的常见问题 3.抗体 4.滤纸、胶和膜的问题 的相关疑问 6.染色的选择 7.参照的疑问

8.缓冲液配方的常见问题 9.条件的摸索 10.方法的介绍 11.结果分析 一、原理 与Southern或Northern杂交方法类似,但Western Blot采用的是聚丙烯酰胺凝胶电泳,被检测物是蛋白质,“探针”是抗体,“显色”用标记的二抗。经过PAGE分离的蛋白质样品,转移到固相载体(例如硝酸纤维素薄膜)上,固相载体以非共价键形式吸附蛋白质,且能保持电泳分离的多肽类型及其生物学活性不变。以固相载体上的蛋白质或多肽作为抗原,与对应的抗体起免疫反应,再与酶或同位素标记的第二抗体起反应,经过底物显色或放射自显影以检测电泳分离的特异性目的基因表达的蛋白成分。该技术也广泛应用于检测蛋白水平的表达。 二、分类 现常用的有底物化学发光ECL和底物DAB呈色,体同水平和实验条件的是用第一种方法,目前发表文章通常是用底物化学发光ECL。只要买现成的试剂盒就行,操作也比较简单,原理如下(二抗用HRP标记):反应底物为过氧化物+鲁米诺,如遇到HRP,即发光,可使胶片曝光,就可洗出条带。

Western Blot结果条带分析

Western Blot结果条带全面分析 1.空白 原因:比较多,如果单纯一张没有任何显色,最可能是一抗加成其他抗体,或者二抗种属加错了,比如兔的加成鼠的。 解决办法:仔细检查抗体是否加错,确认转膜没有问题。上面的图片展示的是一点信号都没有,如果是这样大部分情况是抗体加错了。如果中间出现了细微的条带,可能原因是蛋白上样量太少,一抗浓度过低,显色液失效。另外如果转膜出现了问题,比如膜放反了,自然是一个白片。 2.高背景 原因:封闭不够好,一抗浓度高,洗膜时间和次数不够。 解决办法:降低一抗浓度,增加洗膜时间和次数。 3.非特异性条带 原因:一抗非特异性与蛋白结合 解决办法:更换一抗 4.条带中出现边缘规则的白圈 原因:电转中膜和胶之间存在气泡。 解决办法:转膜前去掉膜和胶之间的气泡 5.出现黑点和黑斑 原因:膜上其他部位与一抗或者二抗非特异性结合 解决办法:封闭结束之后要洗。 6.条带拖尾 原因:蛋白量太大,一抗浓度和时间太长 解决办法:根据情况调整蛋白量,同时一抗浓度和时间也可以缩短。 7. 出现非均一性背景 原因:膜可能曾经干过 解决办法:在每一步的操作过程中,都需要注意不要让膜干。 8.某个条带变形 原因:SDSPAGE胶中存在气泡或者某不溶性颗粒 解决办法:配胶过程中要小心,使用无杂质的液体。另外配胶用的水,SDS,Tris 缓冲液要注意不要有杂质。 9. 条带呈哑铃状 原因:配置胶有问题,胶凝固后不均一 解决办法:把胶配好,不合格的胶坚决不用 10.最边缘条带弯曲 原因:电泳电流不均一

解决办法:换用新的电泳槽;不使用两边的两孔 其他问题 (1)蛋白分子量偏高或者偏低。可能是胶的浓度与目的蛋白的浓度不对应。(2)蛋白质降解。蛋白质降解后很可能会在比原来位置低的地方出现主带,然后会出现一些其他带,最主要特点是所有的条带比正常的都低,并且条带模糊不清晰。 (3)所有条带连成一片没有间隔。原因最可能是上样量过多,其次是样品弥散(比如电泳长时间停止样品弥散)。 (4)整个条带呈“ ︶” 状:凝胶冷却不均一,电泳槽老化。 (5)整个条带呈“ ︵”:凝胶左右两头没有凝固好 (6)溴酚蓝拖尾:样品溶解不好。 (7)纵向的纹理:上样样品中存在不溶性颗粒 (8)溴酚蓝很粗:浓缩胶浓缩效果不好,可能是浓缩胶太短,或者是浓缩胶配错。 (9)在分离胶中跑不动:Tris-HCl PH值不对,或者忘记加SDS。

western-blot条带分析及解决方法

western-blot条带分析及解决方法

*注1 其具体问题有二:一是背景较高,二是没有条带.形成机制为条带处HRP很快将底物耗竭,则不发光不使胶片感光而为白色,周围因背景HRP较低而持续发光一段时间使胶片感光为黑色。这种常见于高浓度抗体并且封闭/洗脱不好的情况下。如果没有背景则就是原因3的现象。在暗室可以看到条带周围荧光而条带处为暗。如是则要么通过降低抗体解决,要么动作

迅速早期未耗竭底物时压片,否则一旦耗竭通过减少压片时间不能解决问 题。也可以过一段时间鼿RP稍减后重加底物迅速压片。还有另外一种反 影现象就是压出条带粗大模糊,但条带中心是空的白色,原因和上面的一 样,主要是条带中心耗竭底物引起的,也可以在暗室看到中空的荧光带,但与上面的区别主要在于特异性要好一些,若继续发展则就是原因3的 现象。其分析和解决同上。 *注2 其原因主要是HRP太高超速催化底物生成的产物使膜发黄,压出的片子可以是正常的或和原因1或原因3的现象同时存在,只是一种现象,在压 过的膜可以看出来(只在加底物后一段时间出现,几小时后可能还会消退,有时甚至刚加底物1~2min就可以看出来,所以要把握时机)。如果没有 达到原因1和原因3的程度,那么这种情况一定能够看到很强的荧光, 是一种良好的状态,是我们所期盼的。如果压出正常片子而不出现原因1

和原因3的现象,可以不予处理。但因为荧光太强极易导致条带增粗变大,所以也可以不稀释抗体而通过调整压片时间来解决,一般压10s~30s, 甚至可以3~5s,即时根据结果在暗室调整,荧光持续时间长的话都可连续 压十数张片子而效果良好。但也有这种情况,就是由于HRP过强无论怎 么减少压片时间条带都依然粗大(如果时间过短如<3s则可因感光不足导 致条带太淡,这样就不可取了,但依然是粗大的、非条带的本来面目), 那么如果想获得漂亮条带则必须通过降低抗体浓度(减少上样量很不稳定 且能力有限,故很少使用)来解决。原因1和3若如是则解决也是一样 的。 *注3 这是与1类似但抗体特异性较好时的一种表现,经常与下面的原因4、5、6混淆,特别需要注意。主要出现在HRP极高的情况下,来不及压片就 已耗竭底物,往往伴有原因2的现象。可通过加入底物后迅速进入暗室

WesternBlot实验详解(--)

Western Blot 实验详解 、实验材料 Western Blot 相关试剂: 甘氨酸,最后加入 200ml 甲醇。4 C 保存。 文档收集自网络,仅用于个人学习 30%储备胶:丙烯酰胺 Acr 29.0g 、亚甲双丙烯酰胺(Bis ) 1.0g ,混匀后加入去离子水 37 C 溶解,定容至100ml 。4C 避光保存。 文档收集自网络,仅用于个人学习 10%AP (过硫酸铵):称取1gAP ,加入10ml 去离子水搅拌。分装,-20C 保存。 Western BIot 相关仪器: 电泳仪;转移仪;摇转仪。 二、实验原理 经过 PAGE 分离的蛋白质样品,转移到固相载体 (例如硝酸纤维素薄膜) 上,固相载体 以非共价键形式吸附蛋白质, 且能保持电泳分离的多肽类型及其生物学活性不变。 以固相载 体上的蛋白质或多肽作为抗原, 与对应的抗体起免疫反应, 再与酶或同位素标记的第二抗体 起反应, 经过底物显色或放射自显影以检测电泳分离的特异性目的基因表达的蛋白成分。 该 技术也广泛应用于检测蛋白水平的表达。 文档收集自网络,仅用于个人学习 2X Sample Buffer : 1ml Glycerol (甘油);0.5ml Beta mercaptoethanol (B -巯基乙醇);3ml 10%SDS; 1。25ml 4 X Upper buffer; 4.25ml dH 2O; Add bromop he nol blue (溴酚蓝)to color 。 文档收集自网络,仅用于个人学习 10X 电泳缓冲液(pH 8.3 ):在1L 大烧杯中加入800ml 去离子水,称取 Tris 30.2g 、甘氨酸 188g ,混匀,加入100ml 10%SDS ,定容至1L 。(注:SDS 在68C 水浴中溶解)。工作液:1 X 电泳缓冲液 去离子水稀释 室温保存。 文档收集自网络,仅用于个人学习 1.5M Tris-HCl (pH8.8) : Tris 181。7g 去离子水溶解,用浓盐酸调至 pH8.8,定容至1L 室温 保存。 文档收集自网络,仅用于个人学习 1M Tris-HCl (pH6.8) : Tris 121.1g 去离子水溶解,用浓盐酸调至 pH7.5,定容至1L 存。 文档收集自网络,仅用于个人学习 10X TS (洗膜液):在 800ml 去离子水,加入 NacI 90g , 1M Tris-HCl (pH7.5) 100ml , 水定容至1L 。工作液:1 X TS 室温保存。文档收集自网络,仅用于个人学习 1M Tris-HCl (pH7.5) : Tris 121.1g 去离子水溶解,用浓盐酸调至 存。 文档收集自网络,仅用于个人学习 10%SDS :称取十二烷基磺酸钠(SDS )10g,加入约80ml 去离子水, 调 pH 至 7.2,定容至 100ml 。 文档收集自网络,仅用于个人学习 1X Transfer Buffer : 在 1L 大烧杯中加入 800ml 去离子水,加入 pH7.5 ,定容至 1L 室温保 去离子 室温保 68 C 加热溶解。用10%HCI 3.03g Trisgrams , 14.43g

WesternBlot基本原理过程及注意事项

W e s t e r n B l o t基本原理 过程及注意事项 The latest revision on November 22, 2020

W e s t e r n B l o t基本原理、过程及注意事项 原理 是将蛋白质转移到膜上,然后利用抗体进行检测。对已知表达蛋白,可用相应抗体作为一抗进行检测,对新基因的表达产物,可通过融合部分的抗体检测。 主要有三个过程:蛋白质电泳、转膜、检测。 样品的准备 样品种类主要有培养的细胞、组织(需磨碎)、特殊细胞(切割下来的肿瘤细胞)等。 1、裂解液主要有RIPA和三去污两种,RIPA适用于细胞质中蛋白检测,而三去污适用 于总蛋白。三去污又分为离子型和非离子型。离子型的裂解能力较强如SDS等,非离子 型的包括NP-40、Tritonx-100。 2、裂解液的成分, 3、样品缓冲液samplebuffer 备注: 1、样品应保持低温,且实验过程应低温操作,此举为了抑制酶的活性。裂解完后样品液 会显得粘稠是长结构DNA所致,故需要匀浆,打断DNA。一般不用超声,因为容易引起 蛋白不可逆的变性。

2、用2X样品缓冲液与样品1:1混匀。4度保存。 3、样品混合液加样前需要100℃或沸水浴加热3-5分钟并迅速插入冰中,以充分变性蛋 白。 配胶: 胶的主要成分为丙烯酰胺和N,N’-亚甲双丙烯酰胺,应以温热(以利于溶解双丙稀酰胺)的去离子水配制含有29%(w/v)丙稀酰胺和1%(w/v)N,N’-亚甲双丙烯酰胺储存液丙稀酰胺29g,N,N-亚甲叉双丙稀酰胺1g,加H2O至100ml。)储于棕色瓶,4℃避光保存。 4、分离胶的配方:以20ml的8﹪分离胶为例: 5、浓缩胶配方:6ml为例 备注: 1、制胶是避免产生气泡,空气会影响胶的聚合,在蛋白质表观分子量分析时影响大。 2、因为有SDS,每次混匀时不应剧烈以免产生过多气泡。 3、蛋白容易与SDS脱离而失去负电荷,因此胶中加入SDS为了给蛋白持续的负电荷。 4、垫条清洗干净,与制胶板压紧,避免漏胶。 5、制胶时,加水应缓慢不要破坏胶面,其作用:可以平衡胶面,赶气泡等。胶固定后用 滤纸吸除干净,有水跑胶时条带会歪。 6、先插梳子再灌浓缩胶。溴酚蓝快跑出胶时停止。 转膜 根据杂交方案、被转移蛋白的特性以及分子大小等因素,选择合适材质、孔径和规格的杂交膜。用于Westernblot的膜主要有两种:硝酸纤维素膜(NC)和PVDF膜。NC膜是蛋白印迹实验的

Western Blot实验步骤及关键分析

【分享】个人整理Western Blot!!! 1、丙烯酰胺和N,N’-亚甲双丙烯酰胺,应以温热(以利于溶解双丙稀酰胺)的去离子水配制含有29%(w/v)丙稀酰胺和1%(w/v)N,N’-亚甲双丙烯酰胺储存液丙稀酰胺29g,N,N-亚甲叉双丙稀酰胺1g,加H2O至100ml。)储于棕色瓶,4℃避光保存。严格核实PH不得超过7.0,因可以发生脱氨基反应是光催化或碱催化的。使用期不得超过两个月,隔几个月须重新配制。如有沉淀,可以过滤。 2、十二烷基硫酸钠SDS溶液:10%(w/v)0.1gSDS,1mlH2O去离子水配制,室温保存。 3、分离胶缓冲液:1.5mmol/LTris-HCL(pH8.8):18.15gTris和48ml1mol/LHCL 混合,加水稀释到100ml终体积。过滤后4°C保存。 4、浓缩胶缓冲液:0.5mmol/LTris-HCL(pH6.8):6.05gTris溶于40mlH2O中,用约48ml 1mol/L HCL调至pH6.8加水稀释到100ml终体积。过滤后4°C保存。这两种缓冲液必须使用Tris碱制备,再用HCL调节PH值,而不用Tris.CL。 5、TEMED原溶液四甲基乙二胺催化过硫酸铵形成自由基而加速两种丙稀酰胺的聚合。PH太低时,聚合反应受到抑制。AP提供两种丙稀酰胺聚合所必须的自由基。去离子水配制数ml,临用前配制. 6. 10%过硫酸铵溶液:称取1g过硫酸铵,加超纯水溶解并定容至10ml,分装到1.5ml微量离心管中,冻存。 7、SDS-PAGE加样缓冲液:在沸水终煮3min混匀后再上样,一般为20-25ul,总蛋白量100μg。 8、Tris-甘氨酸电泳缓冲液:30.3gTris,188g甘氨酸,10gSDS,用蒸馏水溶解至1000ml,临用前稀释10倍。PH8.3 9、转移缓冲液:2.9g甘氨酸、5.8gTris碱、0.37g SDS(可不加),200ml 甲醇(临用前加),加水至总量1L。 10、丽春红染液储存液:丽春红S 2g 三氯乙酸30g 磺基水杨酸30g 加水至100ml 用时上述储存液稀释10倍即成丽春红S使用液。使用后应予以废弃。 11、脱脂奶粉5%(w/v)。 12、NaN3 0.02% 叠氮钠(有毒,戴手套操作),溶于磷酸缓冲盐溶液(PBS)。 4.2.4 22. 聚丙烯酰胺凝胶溶液: 分离胶12.5% ,PH8.8 5ml 10ml 15ml

Western Blot 结果条带全面分析

Western Blot 结果条带全面分析 Q1. 啥也没有 [原因]:比较多,如果单纯一张没有任何显色的X光片,最可能是一抗加成其他抗体,或者二抗种属加错了,比如兔的加成鼠的。 [解决办法]:仔细检查抗体是否加错,确认转膜没有问题。 [经验]:上面的图片展示的是一点信号都没有,如果是这样大部分情况是抗体加错了。如果中间出现了细微的条带,可能原因是蛋白上样量太少,一抗浓度过低,ECL发光液失效。另外如果转膜出现了问题,比如膜放反了,自然是一个白片。 Q2. 高背景 [原因]:封闭不够好,一抗浓度高,洗膜时间和次数不够 [解决办法]:降低一抗浓度,增加洗膜时间和次数。 [经验]:高背景可能是WB中最常见出现的问题,目的条带单一清晰,但是其他地方又弥漫性较为均一的背景(比较连续的)。其实只要我们注意操作规范,不偷工减料就很容易避免,洗膜按照规定来5min*5次或者10min*3次,不要改成5min*3次,或者10min*2次。 Q3. 非特异性条带 [原因]:一抗非特异性与蛋白结合 [解决办法]:更换一抗 [经验]:此种情况绝大多数是因为一抗不好,你无法判断那一条是目的条带。如果实在没有更好的抗体,建议采用阴性对照和阳性对照来确定上述哪个条带是目的条带。当然这种情况下有一种很小几率的可能是一抗浓度太高引起的非特异性结合。 Q4. 条带中出现边缘规则的白圈 [原因]:电转中膜和胶之间存在气泡。 [解决办法]:转膜前去掉膜和胶之间的气泡 [经验]:我们常常将电转液倒入一个盘子里,倒入的液体不能太多也不能太少,最好的高度是与放上第一层滤纸齐平,然后往滤纸上浇点转膜液,把电泳胶用清水清洗下,将电泳胶平铺到滤纸上,仔细检查滤纸与胶之间是否有气泡,可以左右前后观察,不同方向观察之后确认无气泡,然后再往胶上面浇点电转液,用两只手的拇指和食指轻轻夹住PVDF膜的两侧中间,使膜成U型,然后将U型的底部接触胶的中间,慢慢往两边放下膜,这样一般气泡很少。然后上层滤纸同样用U型的放置方法,用玻璃棒稍微贴实下,然后盖上海绵。注意不要来回赶气泡,这样反而会带入气泡。 Q5. 条带中间出现白色(反白) [原因]:中心部位高浓度HRP把底物消耗过快,中间部位底物消耗结束之后就不发光了[解决办法]:降低蛋白量,降低一抗和二抗的浓度。 [经验]:如果你足够迅速,可以在中间部位底物消耗之前就把X光片给定影出来,但是时间很难把握,建议还是从降低蛋白量,降低一抗二抗浓度入手。

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